More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0759 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0759  50S ribosomal protein L4  100 
 
 		 207 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000566858  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2904  50S ribosomal protein L4  71.63 
 
 		 208 aa  316  2e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000879055  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0868  50S ribosomal protein L4  67.63 
 
 		 206 aa  284  7e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000685593  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0287  50S ribosomal protein L4  62.8 
 
 		 206 aa  264  7e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0371511  hitchhiker  0.00627174 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0108  50S ribosomal protein L4  62.32 
 
 		 207 aa  263  8.999999999999999e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0112  50S ribosomal protein L4  61.84 
 
 		 207 aa  262  3e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000123482  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0226  ribosomal protein L4/L1e  58.94 
 
 		 207 aa  253  1.0000000000000001e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3666  50S ribosomal protein L4  56.52 
 
 		 206 aa  252  2.0000000000000002e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000305367  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2713  50S ribosomal protein L4  58.94 
 
 		 204 aa  250  9.000000000000001e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2398  50S ribosomal protein L4  58.94 
 
 		 204 aa  249  1e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000730975  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0216  50S ribosomal protein L4  59.42 
 
 		 206 aa  249  2e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320704  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1744  50S ribosomal protein L4  57.69 
 
 		 208 aa  246  2e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000318286  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0195  LSU ribosomal protein L4P  53.14 
 
 		 207 aa  242  3e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00135777  normal  0.0747506 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0106  50S ribosomal protein L4  57.97 
 
 		 207 aa  242  3e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000544936  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0111  50S ribosomal protein L4  57.49 
 
 		 207 aa  241  7e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000572324  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0111  50S ribosomal protein L4  57.49 
 
 		 207 aa  241  7e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000900585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0107  50S ribosomal protein L4  57.49 
 
 		 207 aa  241  7e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.56557e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0105  50S ribosomal protein L4  57.49 
 
 		 207 aa  241  7e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000256275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0111  50S ribosomal protein L4  57.49 
 
 		 207 aa  241  7e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000163463  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5194  50S ribosomal protein L4  57.49 
 
 		 207 aa  241  7e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000834057  unclonable  1.98377e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0142  50S ribosomal protein L4  57.49 
 
 		 207 aa  241  7e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000690155  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0123  50S ribosomal protein L4  57.49 
 
 		 207 aa  241  7e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.21989e-61 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0132  50S ribosomal protein L4  57.49 
 
 		 207 aa  241  7e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000136863  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0105  50S ribosomal protein L4  57.49 
 
 		 207 aa  237  1e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000104823  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2332  ribosomal protein L4/L1e  54.59 
 
 		 207 aa  236  1e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000847375  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2459  50S ribosomal protein L4P  51.69 
 
 		 207 aa  230  1e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0863955 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1573  ribosomal protein L4/L1e  51.46 
 
 		 207 aa  227  8e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000791532  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2710  ribosomal protein L4/L1e  52.66 
 
 		 206 aa  227  8e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000254915  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0423  50S ribosomal protein L4  53.14 
 
 		 207 aa  227  1e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000203712  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1523  ribosomal protein L4/L1e  52.2 
 
 		 207 aa  222  3e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.790483  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1183  ribosomal protein L4/L1e  50.72 
 
 		 208 aa  221  6e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000599505  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01180  ribosomal protein L4/L1e  52.88 
 
 		 209 aa  210  1e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000715314  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0292  50S ribosomal protein L4  45.89 
 
 		 205 aa  204  5e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000472593  unclonable  1.9716100000000001e-28 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0059  50S ribosomal protein L4  44.93 
 
 		 207 aa  199  1.9999999999999998e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0599605  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1906  50S ribosomal protein L4  45.41 
 
 		 207 aa  198  3.9999999999999996e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000335339  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1556  ribosomal protein L4/L1e  47.55 
 
 		 207 aa  199  3.9999999999999996e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427554  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0982  ribosomal protein L4/L1e  46.38 
 
 		 209 aa  197  7e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.532922  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1482  50S ribosomal protein L4  47.34 
 
 		 207 aa  196  2.0000000000000003e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000984788  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0716  ribosomal protein L4/L1e  42.65 
 
 		 223 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2276  50S ribosomal protein L4  47.32 
 
 		 207 aa  195  5.000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000009811  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2317  50S ribosomal protein L4  47.32 
 
 		 207 aa  195  5.000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000134967  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1830  50S ribosomal protein L4  45.89 
 
 		 207 aa  194  6e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0478396  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4916  ribosomal protein L4/L1e  46.77 
 
 		 209 aa  192  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.1186  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0954  50S ribosomal protein L4  43.89 
 
 		 221 aa  189  2e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000111144  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0452  50S ribosomal protein L4  44.12 
 
 		 210 aa  190  2e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000515236  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_418  ribosomal protein L4  43.63 
 
 		 210 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00538527  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0475  50S ribosomal protein L4  43.14 
 
 		 210 aa  188  5e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00700158  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2401  50S ribosomal protein L4  44.23 
 
 		 208 aa  187  8e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0596  50S ribosomal protein L4P  44.39 
 
 		 207 aa  186  2e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000475036  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0681  50S ribosomal protein L4  43.41 
 
 		 207 aa  185  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.486374  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0848  50S ribosomal protein L4P  45.41 
 
 		 207 aa  183  1.0000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000392239  decreased coverage  0.0000122182 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0709  50S ribosomal protein L4  46.31 
 
 		 205 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0382078  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0695  50S ribosomal protein L4  45.89 
 
 		 208 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl124  50S ribosomal protein L4  45.89 
 
 		 208 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000604234  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3023  ribosomal protein L4/L1e  45.85 
 
 		 222 aa  181  5.0000000000000004e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443321  normal  0.0189884 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1393  50S ribosomal protein L4  47.77 
 
 		 235 aa  180  2e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000162338  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1293  50S ribosomal protein L4  47.77 
 
 		 235 aa  180  2e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000803665  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1068  50S ribosomal protein L4  44.33 
 
 		 207 aa  179  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000351414  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0197  50S ribosomal protein L4  42.86 
 
 		 207 aa  179  2e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00203095  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4025  ribosomal protein L4/L1e  45.13 
 
 		 221 aa  180  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000717748 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2064  50S ribosomal protein L4  43.14 
 
 		 206 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000384651  normal  0.231159 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1137  50S ribosomal protein L4  43.24 
 
 		 223 aa  178  4e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000824266  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0627  50S ribosomal protein L4  43.84 
 
 		 220 aa  178  4.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000530014  hitchhiker  0.00000000000031805 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0789  50S ribosomal protein L4  42.01 
 
 		 221 aa  177  9e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4004  ribosomal protein L4/L1e  44.66 
 
 		 215 aa  176  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.070535  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1184  ribosomal protein L4/L1e  44.1 
 
 		 223 aa  176  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1347  50S ribosomal protein L4  40.89 
 
 		 206 aa  174  6e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0702  50S ribosomal protein L4  41.87 
 
 		 206 aa  173  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000569503  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0963  ribosomal protein L4/L1e  43 
 
 		 207 aa  174  9.999999999999999e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000403747  hitchhiker  0.0000000000267396 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0290  ribosomal protein L4/L1e  43.69 
 
 		 208 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00437959  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2019  50S ribosomal protein L4  43.35 
 
 		 206 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2856  50S ribosomal protein L4  42.93 
 
 		 207 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400345  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2560  50S ribosomal protein L4/L1e  42.65 
 
 		 210 aa  171  5e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0559575  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1764  50S ribosomal protein L4  41.18 
 
 		 206 aa  171  1e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00135584  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0563  50S ribosomal protein L4/L1e  43 
 
 		 216 aa  169  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16230  ribosomal protein L4  40 
 
 		 207 aa  168  4e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.308573  decreased coverage  0.0000000146284 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3011  50S ribosomal protein L4  44.83 
 
 		 212 aa  169  4e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00787083 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2773  50S ribosomal protein L4  40.2 
 
 		 206 aa  168  5e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0187174  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3327  50S ribosomal protein L4  41.87 
 
 		 207 aa  167  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.78315e-16 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3994  ribosomal protein L4/L1e  43.4 
 
 		 212 aa  167  1e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2256  50S ribosomal protein L4  42.65 
 
 		 206 aa  167  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000129639  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0934  50S ribosomal protein L4  41.87 
 
 		 207 aa  167  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000521211  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1227  50S ribosomal protein L4  41.38 
 
 		 217 aa  166  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150568  unclonable  0.0000101553 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1934  50S ribosomal protein L4  43.35 
 
 		 206 aa  165  4e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1087  50S ribosomal protein L4  42.36 
 
 		 215 aa  165  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10489 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10010  LSU ribosomal protein L4P  42.51 
 
 		 207 aa  164  5.9999999999999996e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000045126  hitchhiker  0.00000000148432 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1945  50S ribosomal protein L4  40.89 
 
 		 206 aa  164  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3142  ribosomal protein L4/L1e  41.41 
 
 		 221 aa  164  6.9999999999999995e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.083105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0692  50S ribosomal protein L4  41.87 
 
 		 210 aa  164  8e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000477042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0251  50S ribosomal protein L4  42.18 
 
 		 211 aa  164  8e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0248  50S ribosomal protein L4  42.18 
 
 		 211 aa  164  8e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.890563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1124  ribosomal protein L4/L1e  40.59 
 
 		 248 aa  162  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20860  LSU ribosomal protein L4P  40.8 
 
 		 223 aa  162  3e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.699759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3704  50S ribosomal protein L4  44.55 
 
 		 210 aa  162  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1649  50S ribosomal protein L4  42.11 
 
 		 210 aa  162  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0193  ribosomal protein L4/L1e  42.44 
 
 		 214 aa  162  5.0000000000000005e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1837  ribosomal protein L4/L1e  41.35 
 
 		 215 aa  161  7e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00300997  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17391  50S ribosomal protein L4  41.63 
 
 		 210 aa  161  8.000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2231  50S ribosomal protein L4  39.02 
 
 		 210 aa  160  1e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.402946 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2422  50S ribosomal protein L4  39.71 
 
 		 208 aa  160  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00578828  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>