More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1227 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1227  50S ribosomal protein L4  100 
 
 		 217 aa  436  1e-121  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150568  unclonable  0.0000101553 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0112  50S ribosomal protein L4  44.66 
 
 		 207 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000123482  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0108  50S ribosomal protein L4  44.66 
 
 		 207 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0105  50S ribosomal protein L4  44.17 
 
 		 207 aa  180  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000104823  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2276  50S ribosomal protein L4  45.63 
 
 		 207 aa  180  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000009811  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2317  50S ribosomal protein L4  45.63 
 
 		 207 aa  180  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000134967  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0123  50S ribosomal protein L4  43.2 
 
 		 207 aa  177  8e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.21989e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0111  50S ribosomal protein L4  43.2 
 
 		 207 aa  177  8e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000572324  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5194  50S ribosomal protein L4  43.2 
 
 		 207 aa  177  8e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000834057  unclonable  1.98377e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0111  50S ribosomal protein L4  43.2 
 
 		 207 aa  177  8e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000900585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0107  50S ribosomal protein L4  43.2 
 
 		 207 aa  177  8e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.56557e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0105  50S ribosomal protein L4  43.2 
 
 		 207 aa  177  8e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000256275  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0132  50S ribosomal protein L4  43.2 
 
 		 207 aa  177  8e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000136863  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0142  50S ribosomal protein L4  43.2 
 
 		 207 aa  177  8e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000690155  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0111  50S ribosomal protein L4  43.2 
 
 		 207 aa  177  8e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000163463  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0106  50S ribosomal protein L4  43.2 
 
 		 207 aa  177  8e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000544936  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0868  50S ribosomal protein L4  44.22 
 
 		 206 aa  174  6e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000685593  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2459  50S ribosomal protein L4P  43.2 
 
 		 207 aa  174  8e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0863955 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2710  ribosomal protein L4/L1e  43.84 
 
 		 206 aa  173  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000254915  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1830  50S ribosomal protein L4  42.72 
 
 		 207 aa  172  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0478396  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0216  50S ribosomal protein L4  43.2 
 
 		 206 aa  170  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320704  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0287  50S ribosomal protein L4  44.17 
 
 		 206 aa  169  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0371511  hitchhiker  0.00627174 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0759  50S ribosomal protein L4  41.38 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000566858  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0197  50S ribosomal protein L4  42.23 
 
 		 207 aa  167  2e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00203095  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1523  ribosomal protein L4/L1e  43.2 
 
 		 207 aa  165  4e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.790483  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0226  ribosomal protein L4/L1e  42.23 
 
 		 207 aa  165  5.9999999999999996e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2401  50S ribosomal protein L4  41.55 
 
 		 208 aa  164  6.9999999999999995e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2019  50S ribosomal protein L4  47.09 
 
 		 206 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1482  50S ribosomal protein L4  40.29 
 
 		 207 aa  162  3e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000984788  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2904  50S ribosomal protein L4  40.69 
 
 		 208 aa  160  9e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000879055  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3666  50S ribosomal protein L4  40.89 
 
 		 206 aa  160  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000305367  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1906  50S ribosomal protein L4  40.29 
 
 		 207 aa  160  1e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000335339  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0292  50S ribosomal protein L4  37.86 
 
 		 205 aa  157  8e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000472593  unclonable  1.9716100000000001e-28 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0059  50S ribosomal protein L4  39.32 
 
 		 207 aa  157  2e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0599605  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0423  50S ribosomal protein L4  41.26 
 
 		 207 aa  156  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000203712  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1945  50S ribosomal protein L4  47.57 
 
 		 206 aa  156  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1934  50S ribosomal protein L4  47.57 
 
 		 206 aa  156  3e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2332  ribosomal protein L4/L1e  38.92 
 
 		 207 aa  155  3e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000847375  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1764  50S ribosomal protein L4  42.03 
 
 		 206 aa  154  8e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00135584  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1912  50S ribosomal protein L4  44.66 
 
 		 206 aa  151  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.224726 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2064  50S ribosomal protein L4  37.38 
 
 		 206 aa  149  4e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000384651  normal  0.231159 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0963  ribosomal protein L4/L1e  41.26 
 
 		 207 aa  149  4e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000403747  hitchhiker  0.0000000000267396 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0080  50S ribosomal protein L4  40.1 
 
 		 206 aa  149  4e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.186923 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0195  LSU ribosomal protein L4P  36.45 
 
 		 207 aa  148  5e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00135777  normal  0.0747506 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16230  ribosomal protein L4  40.58 
 
 		 207 aa  147  8e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.308573  decreased coverage  0.0000000146284 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1068  50S ribosomal protein L4  37.68 
 
 		 207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000351414  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10010  LSU ribosomal protein L4P  42.72 
 
 		 207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000045126  hitchhiker  0.00000000148432 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1573  ribosomal protein L4/L1e  35.96 
 
 		 207 aa  145  3e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000791532  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1556  ribosomal protein L4/L1e  37.86 
 
 		 207 aa  145  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427554  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1708  50S ribosomal protein L4  39.51 
 
 		 218 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00274066  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0954  50S ribosomal protein L4  36.36 
 
 		 221 aa  145  6e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000111144  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4004  ribosomal protein L4/L1e  37.67 
 
 		 215 aa  144  7.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.070535  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1837  ribosomal protein L4/L1e  40 
 
 		 215 aa  144  8.000000000000001e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00300997  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2856  50S ribosomal protein L4  37.2 
 
 		 207 aa  144  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400345  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1417  ribosomal protein L4/L1e  39.11 
 
 		 211 aa  144  1e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.977567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0627  50S ribosomal protein L4  38.16 
 
 		 220 aa  144  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000530014  hitchhiker  0.00000000000031805 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0596  50S ribosomal protein L4P  36.41 
 
 		 207 aa  144  1e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000475036  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3327  50S ribosomal protein L4  38.65 
 
 		 207 aa  142  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.78315e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0934  50S ribosomal protein L4  38.65 
 
 		 207 aa  142  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000521211  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1293  50S ribosomal protein L4  35.32 
 
 		 235 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000803665  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1393  50S ribosomal protein L4  35.32 
 
 		 235 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000162338  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0563  50S ribosomal protein L4/L1e  42.25 
 
 		 216 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0716  ribosomal protein L4/L1e  38.97 
 
 		 223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5048  50S ribosomal protein L4  38.71 
 
 		 218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.5122  normal  0.277146 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0961  50S ribosomal protein L4  39.58 
 
 		 204 aa  139  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000392469  hitchhiker  0.00000164794 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0628  ribosomal protein L4/L1e  40.91 
 
 		 232 aa  137  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2323  ribosomal protein L4/L1e  41.58 
 
 		 201 aa  137  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00000658885  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1183  ribosomal protein L4/L1e  37.93 
 
 		 208 aa  137  1e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000599505  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1744  50S ribosomal protein L4  34.8 
 
 		 208 aa  136  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000318286  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0709  50S ribosomal protein L4  37.38 
 
 		 205 aa  136  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0382078  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2645  50S ribosomal protein L4  39.02 
 
 		 222 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264538  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0702  50S ribosomal protein L4  36.89 
 
 		 206 aa  134  7.000000000000001e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000569503  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05720  50S ribosomal protein L4  35.61 
 
 		 208 aa  134  8e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.316206  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2256  50S ribosomal protein L4  37.2 
 
 		 206 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000129639  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2398  50S ribosomal protein L4  36.95 
 
 		 204 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000730975  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0256  ribosomal protein L4/L1 family protein  37.38 
 
 		 221 aa  134  9.999999999999999e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2713  50S ribosomal protein L4  36.95 
 
 		 204 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2231  50S ribosomal protein L4  45.18 
 
 		 210 aa  132  3e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.402946 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0422  50S ribosomal protein L4  38.5 
 
 		 202 aa  132  3e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00655238  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0720  50S ribosomal protein L4  39.33 
 
 		 201 aa  133  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000427281  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1137  50S ribosomal protein L4  34.98 
 
 		 223 aa  132  5e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000824266  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2773  50S ribosomal protein L4  37.32 
 
 		 206 aa  132  6e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0187174  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0603  ribosomal protein L4/L1e  34.3 
 
 		 209 aa  131  6e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1041  50S ribosomal protein L4  37.75 
 
 		 219 aa  132  6e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1014  50S ribosomal protein L4  37.75 
 
 		 219 aa  132  6e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1031  50S ribosomal protein L4  37.75 
 
 		 219 aa  132  6e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.658773 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01180  ribosomal protein L4/L1e  37.32 
 
 		 209 aa  131  6.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000715314  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0692  50S ribosomal protein L4  41.06 
 
 		 210 aa  131  6.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000477042  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0475  50S ribosomal protein L4  35 
 
 		 210 aa  131  9e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00700158  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1616  ribosomal protein L4/L1e  38.19 
 
 		 212 aa  131  9e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06260  50S ribosomal protein L4  37.5 
 
 		 200 aa  131  9e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00260309  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0857  50S ribosomal protein L4  38.69 
 
 		 205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_418  ribosomal protein L4  34.5 
 
 		 210 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00538527  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3922  ribosomal protein L4/L1e  40.39 
 
 		 216 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4314  ribosomal protein L4/L1e  40.89 
 
 		 216 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08860  50S ribosomal protein L4  38 
 
 		 200 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00776029  normal  0.0237616 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0838  50S ribosomal protein L4  38 
 
 		 200 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33315  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0196  50S ribosomal protein L4  36.54 
 
 		 210 aa  129  3e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.371225 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3908  50S ribosomal protein L4  37 
 
 		 200 aa  129  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0610127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0396  50S ribosomal protein L4  35.27 
 
 		 209 aa  129  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>