More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_1912 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_1912  50S ribosomal protein L4  100 
 
 
206 aa  411  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.224726 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2019  50S ribosomal protein L4  90.78 
 
 
206 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1934  50S ribosomal protein L4  91.75 
 
 
206 aa  360  7.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1945  50S ribosomal protein L4  91.75 
 
 
206 aa  357  6e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4004  ribosomal protein L4/L1e  53.11 
 
 
215 aa  211  7.999999999999999e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.070535  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2276  50S ribosomal protein L4  50.49 
 
 
207 aa  200  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000009811  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2317  50S ribosomal protein L4  50.49 
 
 
207 aa  200  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000134967  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0105  50S ribosomal protein L4  48.31 
 
 
207 aa  198  6e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000104823  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0108  50S ribosomal protein L4  48.31 
 
 
207 aa  197  7.999999999999999e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0112  50S ribosomal protein L4  46.86 
 
 
207 aa  194  6e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000123482  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0106  50S ribosomal protein L4  47.34 
 
 
207 aa  194  9e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000544936  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0111  50S ribosomal protein L4  47.34 
 
 
207 aa  193  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000572324  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0111  50S ribosomal protein L4  47.34 
 
 
207 aa  193  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000900585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0107  50S ribosomal protein L4  47.34 
 
 
207 aa  193  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.56557e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0105  50S ribosomal protein L4  47.34 
 
 
207 aa  193  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000256275  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0132  50S ribosomal protein L4  47.34 
 
 
207 aa  193  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000136863  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0111  50S ribosomal protein L4  47.34 
 
 
207 aa  193  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000163463  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0123  50S ribosomal protein L4  47.34 
 
 
207 aa  193  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.21989e-61 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5194  50S ribosomal protein L4  47.34 
 
 
207 aa  193  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000834057  unclonable  1.98377e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0142  50S ribosomal protein L4  47.34 
 
 
207 aa  193  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000690155  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0934  50S ribosomal protein L4  48.29 
 
 
207 aa  193  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000521211  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3327  50S ribosomal protein L4  48.29 
 
 
207 aa  193  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.78315e-16 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1830  50S ribosomal protein L4  47.34 
 
 
207 aa  191  5e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0478396  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0702  50S ribosomal protein L4  46.83 
 
 
206 aa  191  6e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000569503  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0868  50S ribosomal protein L4  45.05 
 
 
206 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000685593  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2459  50S ribosomal protein L4P  45.89 
 
 
207 aa  188  4e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0863955 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0195  LSU ribosomal protein L4P  45.81 
 
 
207 aa  187  8e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00135777  normal  0.0747506 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0627  50S ribosomal protein L4  46.83 
 
 
220 aa  186  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000530014  hitchhiker  0.00000000000031805 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0216  50S ribosomal protein L4  44.17 
 
 
206 aa  186  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320704  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0226  ribosomal protein L4/L1e  46.38 
 
 
207 aa  185  4e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2710  ribosomal protein L4/L1e  46.53 
 
 
206 aa  184  5e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000254915  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1183  ribosomal protein L4/L1e  44.83 
 
 
208 aa  184  6e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000599505  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2856  50S ribosomal protein L4  45.37 
 
 
207 aa  184  7e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400345  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2904  50S ribosomal protein L4  45.59 
 
 
208 aa  184  7e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000879055  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1068  50S ribosomal protein L4  45.37 
 
 
207 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000351414  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1573  ribosomal protein L4/L1e  45.81 
 
 
207 aa  182  2.0000000000000003e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000791532  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3666  50S ribosomal protein L4  45.05 
 
 
206 aa  180  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000305367  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2256  50S ribosomal protein L4  49.74 
 
 
206 aa  179  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000129639  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1764  50S ribosomal protein L4  49.48 
 
 
206 aa  179  2e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00135584  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1744  50S ribosomal protein L4  43.63 
 
 
208 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000318286  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0080  50S ribosomal protein L4  47.32 
 
 
206 aa  177  9e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.186923 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1556  ribosomal protein L4/L1e  42.93 
 
 
207 aa  177  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427554  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2398  50S ribosomal protein L4  42.08 
 
 
204 aa  176  2e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000730975  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0423  50S ribosomal protein L4  45.64 
 
 
207 aa  176  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000203712  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2713  50S ribosomal protein L4  42.08 
 
 
204 aa  176  3e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2332  ribosomal protein L4/L1e  43.35 
 
 
207 aa  175  3e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000847375  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0059  50S ribosomal protein L4  45.41 
 
 
207 aa  174  9e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0599605  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1523  ribosomal protein L4/L1e  43.69 
 
 
207 aa  174  9e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.790483  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0982  ribosomal protein L4/L1e  42.51 
 
 
209 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.532922  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01180  ribosomal protein L4/L1e  44.71 
 
 
209 aa  171  5.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000715314  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5048  50S ribosomal protein L4  49.23 
 
 
218 aa  171  5.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.5122  normal  0.277146 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1347  50S ribosomal protein L4  39.51 
 
 
206 aa  169  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2401  50S ribosomal protein L4  45.19 
 
 
208 aa  169  2e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0596  50S ribosomal protein L4P  46.15 
 
 
207 aa  170  2e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000475036  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1906  50S ribosomal protein L4  44.93 
 
 
207 aa  170  2e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000335339  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0287  50S ribosomal protein L4  42.23 
 
 
206 aa  169  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0371511  hitchhiker  0.00627174 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0661  50S ribosomal protein L4  47.67 
 
 
210 aa  169  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000586581  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1482  50S ribosomal protein L4  43.54 
 
 
207 aa  167  9e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000984788  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2064  50S ribosomal protein L4  40.98 
 
 
206 aa  167  1e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000384651  normal  0.231159 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0954  50S ribosomal protein L4  42.73 
 
 
221 aa  165  4e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000111144  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0759  50S ribosomal protein L4  41.38 
 
 
207 aa  165  5e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000566858  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1227  50S ribosomal protein L4  46.6 
 
 
217 aa  164  8e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150568  unclonable  0.0000101553 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1306  50S ribosomal protein L4  49.46 
 
 
219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.265076  normal  0.163333 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2773  50S ribosomal protein L4  45.08 
 
 
206 aa  162  3e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0187174  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1014  50S ribosomal protein L4  48.37 
 
 
219 aa  162  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1041  50S ribosomal protein L4  48.37 
 
 
219 aa  162  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1031  50S ribosomal protein L4  48.37 
 
 
219 aa  162  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.658773 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0197  50S ribosomal protein L4  44.44 
 
 
207 aa  161  8.000000000000001e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00203095  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0716  ribosomal protein L4/L1e  41.45 
 
 
223 aa  160  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10716  50S ribosomal protein L4  47.45 
 
 
223 aa  159  2e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.311364 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3434  ribosomal protein L4/L1e  44.88 
 
 
217 aa  160  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2645  50S ribosomal protein L4  44.44 
 
 
222 aa  157  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264538  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2658  ribosomal protein L4/L1e  47.92 
 
 
228 aa  157  1e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0689  ribosomal protein L4/L1e  47.8 
 
 
234 aa  156  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.443511 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1087  50S ribosomal protein L4  44.71 
 
 
215 aa  156  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.10489 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0681  50S ribosomal protein L4  36.41 
 
 
207 aa  155  4e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.486374  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5125  ribosomal protein L4/L1e  44.44 
 
 
223 aa  154  6e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4314  ribosomal protein L4/L1e  45.45 
 
 
216 aa  155  6e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0292  50S ribosomal protein L4  40.58 
 
 
205 aa  154  6e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000472593  unclonable  1.9716100000000001e-28 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0193  ribosomal protein L4/L1e  40.85 
 
 
214 aa  154  7e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0563  50S ribosomal protein L4/L1e  44.12 
 
 
216 aa  154  7e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3922  ribosomal protein L4/L1e  45.45 
 
 
216 aa  154  8e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1708  50S ribosomal protein L4  45.23 
 
 
218 aa  154  8e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00274066  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1137  50S ribosomal protein L4  40.62 
 
 
223 aa  154  9e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000824266  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29730  LSU ribosomal protein L4P  45.83 
 
 
234 aa  152  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.379343 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0789  50S ribosomal protein L4  36.04 
 
 
221 aa  153  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2228  50S ribosomal protein L4  40.84 
 
 
208 aa  152  2e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169782  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1837  ribosomal protein L4/L1e  40.8 
 
 
215 aa  152  4e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00300997  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16230  ribosomal protein L4  39.81 
 
 
207 aa  151  5.9999999999999996e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.308573  decreased coverage  0.0000000146284 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2687  50S ribosomal protein L4  42.65 
 
 
206 aa  151  8e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0662732  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0709  50S ribosomal protein L4  41.46 
 
 
205 aa  150  1e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0382078  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2124  50S ribosomal protein L4  41.79 
 
 
206 aa  150  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0247  50S ribosomal protein L4  43.63 
 
 
205 aa  150  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.767965  normal  0.730186 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2163  50S ribosomal protein L4  41.29 
 
 
206 aa  149  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.591953 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0628  ribosomal protein L4/L1e  44.79 
 
 
232 aa  150  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2441  50S ribosomal protein L4  41.29 
 
 
206 aa  149  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.527594  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2737  ribosomal protein L4/L1e  44.12 
 
 
206 aa  149  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.508185  normal  0.224795 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1909  50S ribosomal protein L4  40.2 
 
 
206 aa  149  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00049189  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0695  50S ribosomal protein L4  41.87 
 
 
208 aa  149  4e-35  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2219  50S ribosomal protein L4  41.29 
 
 
206 aa  148  4e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.372251  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>