More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0982 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_0982  ribosomal protein L4/L1e  100 
 
 		 209 aa  429  1e-119  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.532922  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0868  50S ribosomal protein L4  53.14 
 
 		 206 aa  222  4e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000685593  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1744  50S ribosomal protein L4  48.79 
 
 		 208 aa  206  2e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000318286  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0112  50S ribosomal protein L4  49.76 
 
 		 207 aa  206  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000123482  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0108  50S ribosomal protein L4  49.76 
 
 		 207 aa  205  3e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0216  50S ribosomal protein L4  49.76 
 
 		 206 aa  203  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320704  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0226  ribosomal protein L4/L1e  48.31 
 
 		 207 aa  197  7e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0759  50S ribosomal protein L4  46.38 
 
 		 207 aa  197  7e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000566858  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1523  ribosomal protein L4/L1e  49.76 
 
 		 207 aa  195  3e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.790483  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0195  LSU ribosomal protein L4P  46.15 
 
 		 207 aa  196  3e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00135777  normal  0.0747506 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0287  50S ribosomal protein L4  48.31 
 
 		 206 aa  194  7e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0371511  hitchhiker  0.00627174 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0716  ribosomal protein L4/L1e  45.67 
 
 		 223 aa  194  7e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3023  ribosomal protein L4/L1e  46.86 
 
 		 222 aa  194  8.000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443321  normal  0.0189884 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2904  50S ribosomal protein L4  43.48 
 
 		 208 aa  194  8.000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000879055  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3666  50S ribosomal protein L4  45.41 
 
 		 206 aa  194  9e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000305367  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4916  ribosomal protein L4/L1e  47.78 
 
 		 209 aa  193  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.1186  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2710  ribosomal protein L4/L1e  46.38 
 
 		 206 aa  192  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000254915  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0105  50S ribosomal protein L4  47.34 
 
 		 207 aa  193  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000104823  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0106  50S ribosomal protein L4  46.86 
 
 		 207 aa  192  4e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000544936  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0111  50S ribosomal protein L4  46.38 
 
 		 207 aa  190  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000572324  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0111  50S ribosomal protein L4  46.38 
 
 		 207 aa  190  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000900585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0107  50S ribosomal protein L4  46.38 
 
 		 207 aa  190  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.56557e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0105  50S ribosomal protein L4  46.38 
 
 		 207 aa  190  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000256275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0111  50S ribosomal protein L4  46.38 
 
 		 207 aa  190  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000163463  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5194  50S ribosomal protein L4  46.38 
 
 		 207 aa  190  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000834057  unclonable  1.98377e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0142  50S ribosomal protein L4  46.38 
 
 		 207 aa  190  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000690155  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0123  50S ribosomal protein L4  46.38 
 
 		 207 aa  190  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.21989e-61 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0132  50S ribosomal protein L4  46.38 
 
 		 207 aa  190  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000136863  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0954  50S ribosomal protein L4  45.45 
 
 		 221 aa  185  3e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000111144  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2459  50S ribosomal protein L4P  42.03 
 
 		 207 aa  185  5e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0863955 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2332  ribosomal protein L4/L1e  43.48 
 
 		 207 aa  183  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000847375  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1573  ribosomal protein L4/L1e  47.12 
 
 		 207 aa  182  3e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000791532  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0789  50S ribosomal protein L4  43.84 
 
 		 221 aa  181  5.0000000000000004e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1137  50S ribosomal protein L4  43.05 
 
 		 223 aa  177  9e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000824266  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1183  ribosomal protein L4/L1e  44.44 
 
 		 208 aa  176  3e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000599505  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0603  ribosomal protein L4/L1e  42.11 
 
 		 209 aa  175  4e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0290  ribosomal protein L4/L1e  43.63 
 
 		 208 aa  174  7e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00437959  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2713  50S ribosomal protein L4  44.44 
 
 		 204 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2398  50S ribosomal protein L4  44.44 
 
 		 204 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000730975  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0292  50S ribosomal protein L4  43.48 
 
 		 205 aa  172  3.9999999999999995e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000472593  unclonable  1.9716100000000001e-28 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4025  ribosomal protein L4/L1e  41.87 
 
 		 221 aa  171  5e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000717748 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1393  50S ribosomal protein L4  46.67 
 
 		 235 aa  171  1e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000162338  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1293  50S ribosomal protein L4  46.67 
 
 		 235 aa  171  1e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000803665  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0423  50S ribosomal protein L4  43 
 
 		 207 aa  169  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000203712  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1556  ribosomal protein L4/L1e  43.48 
 
 		 207 aa  169  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427554  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4344  50S ribosomal protein L4  42.16 
 
 		 209 aa  169  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000409516  normal  0.126717 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2317  50S ribosomal protein L4  45.13 
 
 		 207 aa  169  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000134967  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2276  50S ribosomal protein L4  45.13 
 
 		 207 aa  169  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000009811  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4004  ribosomal protein L4/L1e  44.02 
 
 		 215 aa  169  4e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.070535  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1184  ribosomal protein L4/L1e  41.38 
 
 		 223 aa  167  8e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2019  50S ribosomal protein L4  41.55 
 
 		 206 aa  166  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0695  50S ribosomal protein L4  43.27 
 
 		 208 aa  166  2e-40  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1912  50S ribosomal protein L4  42.51 
 
 		 206 aa  166  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.224726 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0452  50S ribosomal protein L4  43.14 
 
 		 210 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000515236  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1830  50S ribosomal protein L4  43.41 
 
 		 207 aa  165  4e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0478396  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0059  50S ribosomal protein L4  39.22 
 
 		 207 aa  165  4e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0599605  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_418  ribosomal protein L4  42.65 
 
 		 210 aa  165  5e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00538527  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0596  50S ribosomal protein L4P  41.55 
 
 		 207 aa  165  5e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000475036  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1906  50S ribosomal protein L4  39.02 
 
 		 207 aa  165  5e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000335339  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2219  50S ribosomal protein L4  43.81 
 
 		 206 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.372251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2124  50S ribosomal protein L4  42.78 
 
 		 206 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_002936  DET0475  50S ribosomal protein L4  42.16 
 
 		 210 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00700158  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3704  50S ribosomal protein L4  44.29 
 
 		 210 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01180  ribosomal protein L4/L1e  43.06 
 
 		 209 aa  163  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000715314  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2441  50S ribosomal protein L4  42.27 
 
 		 206 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.527594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2401  50S ribosomal protein L4  38.35 
 
 		 208 aa  162  2.0000000000000002e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2163  50S ribosomal protein L4  42.27 
 
 		 206 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.591953 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0702  50S ribosomal protein L4  42.51 
 
 		 206 aa  162  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000569503  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2256  50S ribosomal protein L4  41.46 
 
 		 206 aa  162  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000129639  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1909  50S ribosomal protein L4  42.78 
 
 		 206 aa  162  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00049189  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1680  50S ribosomal protein L4  40.29 
 
 		 206 aa  161  8.000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.097299  hitchhiker  0.0000499421 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5786  ribosomal protein L4/L1e  39.71 
 
 		 209 aa  160  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.116422 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1482  50S ribosomal protein L4  36.71 
 
 		 207 aa  159  4e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000984788  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0709  50S ribosomal protein L4  41.35 
 
 		 205 aa  158  5e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0382078  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1934  50S ribosomal protein L4  41.55 
 
 		 206 aa  157  8e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3666  50S ribosomal protein L4  39.81 
 
 		 206 aa  157  9e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1365  50S ribosomal protein L4  38.35 
 
 		 206 aa  157  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.65413  normal  0.580974 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1068  50S ribosomal protein L4  41.55 
 
 		 207 aa  157  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000351414  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3011  50S ribosomal protein L4  39.05 
 
 		 212 aa  155  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00787083 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0352  50S ribosomal protein L4  40.51 
 
 		 206 aa  155  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0627  50S ribosomal protein L4  40.1 
 
 		 220 aa  155  4e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000530014  hitchhiker  0.00000000000031805 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1945  50S ribosomal protein L4  41.06 
 
 		 206 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl124  50S ribosomal protein L4  39.9 
 
 		 208 aa  154  8e-37  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000604234  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2856  50S ribosomal protein L4  41.18 
 
 		 207 aa  154  9e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400345  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3327  50S ribosomal protein L4  40.58 
 
 		 207 aa  154  9e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.78315e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0934  50S ribosomal protein L4  40.58 
 
 		 207 aa  154  9e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000521211  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2296  50S ribosomal protein L4  37.86 
 
 		 206 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.214587 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3183  50S ribosomal protein L4  37.38 
 
 		 206 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.611189 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1546  50S ribosomal protein L4  38.35 
 
 		 206 aa  153  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1148  50S ribosomal protein L4  38.28 
 
 		 209 aa  154  1e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000671055  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1293  50S ribosomal protein L4  40 
 
 		 210 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000205733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1764  50S ribosomal protein L4  40 
 
 		 206 aa  154  1e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00135584  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1347  50S ribosomal protein L4  39.13 
 
 		 206 aa  153  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0848  50S ribosomal protein L4P  43 
 
 		 207 aa  152  2.9999999999999998e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000392239  decreased coverage  0.0000122182 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1615  50S ribosomal protein L4  38.16 
 
 		 212 aa  152  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.140901 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0197  50S ribosomal protein L4  39 
 
 		 207 aa  152  4e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00203095  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16230  ribosomal protein L4  38.65 
 
 		 207 aa  152  5e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.308573  decreased coverage  0.0000000146284 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0251  50S ribosomal protein L4  39.05 
 
 		 211 aa  151  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0248  50S ribosomal protein L4  39.05 
 
 		 211 aa  151  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.890563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0266  50S ribosomal protein L4  44.39 
 
 		 200 aa  151  8.999999999999999e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000651042  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>