More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1945 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_1945  50S ribosomal protein L4  100 
 
 		 206 aa  408  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1934  50S ribosomal protein L4  98.06 
 
 		 206 aa  398  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2019  50S ribosomal protein L4  97.57 
 
 		 206 aa  397  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1912  50S ribosomal protein L4  91.75 
 
 		 206 aa  355  2.9999999999999997e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.224726 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4004  ribosomal protein L4/L1e  54.55 
 
 		 215 aa  217  7.999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.070535  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2317  50S ribosomal protein L4  49.03 
 
 		 207 aa  197  7e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000134967  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2276  50S ribosomal protein L4  49.03 
 
 		 207 aa  197  7e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000009811  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0108  50S ribosomal protein L4  47.34 
 
 		 207 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0112  50S ribosomal protein L4  46.38 
 
 		 207 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000123482  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0105  50S ribosomal protein L4  46.86 
 
 		 207 aa  195  3e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000104823  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0934  50S ribosomal protein L4  48.29 
 
 		 207 aa  195  4.0000000000000005e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000521211  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3327  50S ribosomal protein L4  48.29 
 
 		 207 aa  195  4.0000000000000005e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.78315e-16 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2856  50S ribosomal protein L4  46.83 
 
 		 207 aa  192  3e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400345  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0106  50S ribosomal protein L4  45.89 
 
 		 207 aa  191  6e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000544936  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0142  50S ribosomal protein L4  45.89 
 
 		 207 aa  191  8e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000690155  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0111  50S ribosomal protein L4  45.89 
 
 		 207 aa  191  8e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000572324  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0111  50S ribosomal protein L4  45.89 
 
 		 207 aa  191  8e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000900585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0107  50S ribosomal protein L4  45.89 
 
 		 207 aa  191  8e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.56557e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0105  50S ribosomal protein L4  45.89 
 
 		 207 aa  191  8e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000256275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0111  50S ribosomal protein L4  45.89 
 
 		 207 aa  191  8e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000163463  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5194  50S ribosomal protein L4  45.89 
 
 		 207 aa  191  8e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000834057  unclonable  1.98377e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0123  50S ribosomal protein L4  45.89 
 
 		 207 aa  191  8e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.21989e-61 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0132  50S ribosomal protein L4  45.89 
 
 		 207 aa  191  8e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000136863  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2459  50S ribosomal protein L4P  47.34 
 
 		 207 aa  191  9e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0863955 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0627  50S ribosomal protein L4  47.32 
 
 		 220 aa  190  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000530014  hitchhiker  0.00000000000031805 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1830  50S ribosomal protein L4  46.38 
 
 		 207 aa  189  2e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0478396  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1573  ribosomal protein L4/L1e  48.28 
 
 		 207 aa  189  2e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000791532  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1068  50S ribosomal protein L4  45.37 
 
 		 207 aa  189  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000351414  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0195  LSU ribosomal protein L4P  46.31 
 
 		 207 aa  189  2.9999999999999997e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00135777  normal  0.0747506 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0702  50S ribosomal protein L4  46.34 
 
 		 206 aa  188  4e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000569503  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0216  50S ribosomal protein L4  44.17 
 
 		 206 aa  187  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320704  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1183  ribosomal protein L4/L1e  45.81 
 
 		 208 aa  187  1e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000599505  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2710  ribosomal protein L4/L1e  46.04 
 
 		 206 aa  185  5e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000254915  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0868  50S ribosomal protein L4  44.06 
 
 		 206 aa  184  7e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000685593  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2904  50S ribosomal protein L4  45.59 
 
 		 208 aa  184  8e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000879055  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0226  ribosomal protein L4/L1e  45.41 
 
 		 207 aa  184  8e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0423  50S ribosomal protein L4  45.89 
 
 		 207 aa  182  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000203712  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3666  50S ribosomal protein L4  45.05 
 
 		 206 aa  179  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000305367  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2398  50S ribosomal protein L4  43.07 
 
 		 204 aa  179  2e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000730975  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2713  50S ribosomal protein L4  43.07 
 
 		 204 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1744  50S ribosomal protein L4  43.63 
 
 		 208 aa  178  4.999999999999999e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000318286  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1523  ribosomal protein L4/L1e  43.81 
 
 		 207 aa  175  3e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.790483  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1556  ribosomal protein L4/L1e  43.41 
 
 		 207 aa  175  4e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427554  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01180  ribosomal protein L4/L1e  45.71 
 
 		 209 aa  174  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000715314  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1764  50S ribosomal protein L4  47.94 
 
 		 206 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00135584  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2256  50S ribosomal protein L4  46.34 
 
 		 206 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000129639  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0080  50S ribosomal protein L4  46.34 
 
 		 206 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.186923 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0759  50S ribosomal protein L4  42.36 
 
 		 207 aa  171  5.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000566858  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0059  50S ribosomal protein L4  43.96 
 
 		 207 aa  171  7.999999999999999e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0599605  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2332  ribosomal protein L4/L1e  41.87 
 
 		 207 aa  171  1e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000847375  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1906  50S ribosomal protein L4  44.44 
 
 		 207 aa  170  1e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000335339  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0292  50S ribosomal protein L4  43.96 
 
 		 205 aa  169  3e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000472593  unclonable  1.9716100000000001e-28 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0287  50S ribosomal protein L4  42.23 
 
 		 206 aa  169  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0371511  hitchhiker  0.00627174 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1482  50S ribosomal protein L4  43.54 
 
 		 207 aa  168  6e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000984788  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0954  50S ribosomal protein L4  42.79 
 
 		 221 aa  167  8e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000111144  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0197  50S ribosomal protein L4  45.41 
 
 		 207 aa  167  1e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00203095  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5048  50S ribosomal protein L4  47.18 
 
 		 218 aa  166  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.5122  normal  0.277146 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2401  50S ribosomal protein L4  44.71 
 
 		 208 aa  166  2e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1227  50S ribosomal protein L4  47.57 
 
 		 217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150568  unclonable  0.0000101553 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2064  50S ribosomal protein L4  41.46 
 
 		 206 aa  165  5e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000384651  normal  0.231159 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0596  50S ribosomal protein L4P  44.17 
 
 		 207 aa  165  5e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000475036  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0982  ribosomal protein L4/L1e  41.06 
 
 		 209 aa  164  9e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.532922  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0661  50S ribosomal protein L4  44.83 
 
 		 210 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000586581  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1347  50S ribosomal protein L4  38.05 
 
 		 206 aa  160  8.000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0963  ribosomal protein L4/L1e  44.71 
 
 		 207 aa  160  1e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000403747  hitchhiker  0.0000000000267396 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16230  ribosomal protein L4  41.83 
 
 		 207 aa  159  2e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.308573  decreased coverage  0.0000000146284 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0789  50S ribosomal protein L4  36.94 
 
 		 221 aa  159  4e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1306  50S ribosomal protein L4  45.41 
 
 		 219 aa  158  6e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.265076  normal  0.163333 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10716  50S ribosomal protein L4  45.92 
 
 		 223 aa  157  8e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.311364 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0681  50S ribosomal protein L4  37.38 
 
 		 207 aa  157  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.486374  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1041  50S ribosomal protein L4  46.2 
 
 		 219 aa  156  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1014  50S ribosomal protein L4  46.2 
 
 		 219 aa  156  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1031  50S ribosomal protein L4  46.2 
 
 		 219 aa  156  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.658773 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2773  50S ribosomal protein L4  43.52 
 
 		 206 aa  155  3e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0187174  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1087  50S ribosomal protein L4  44.23 
 
 		 215 aa  155  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10489 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2658  ribosomal protein L4/L1e  47.92 
 
 		 228 aa  153  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10010  LSU ribosomal protein L4P  44.5 
 
 		 207 aa  153  1e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000045126  hitchhiker  0.00000000148432 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1137  50S ribosomal protein L4  37.89 
 
 		 223 aa  152  2e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000824266  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1837  ribosomal protein L4/L1e  40.3 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00300997  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29730  LSU ribosomal protein L4P  45.83 
 
 		 234 aa  152  4e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.379343 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0709  50S ribosomal protein L4  41.46 
 
 		 205 aa  152  5e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0382078  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0193  ribosomal protein L4/L1e  39.91 
 
 		 214 aa  151  5e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1708  50S ribosomal protein L4  44.22 
 
 		 218 aa  150  1e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00274066  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3142  ribosomal protein L4/L1e  45.03 
 
 		 221 aa  150  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.083105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2645  50S ribosomal protein L4  44.06 
 
 		 222 aa  150  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264538  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5125  ribosomal protein L4/L1e  42.79 
 
 		 223 aa  149  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0716  ribosomal protein L4/L1e  37.56 
 
 		 223 aa  150  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3434  ribosomal protein L4/L1e  43.9 
 
 		 217 aa  149  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0563  50S ribosomal protein L4/L1e  43.48 
 
 		 216 aa  149  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0628  ribosomal protein L4/L1e  43.75 
 
 		 232 aa  149  3e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2124  50S ribosomal protein L4  42.29 
 
 		 206 aa  148  5e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1909  50S ribosomal protein L4  41.18 
 
 		 206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00049189  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1186  50S ribosomal protein L4/L1e  47.42 
 
 		 217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0290  ribosomal protein L4/L1e  36.41 
 
 		 208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00437959  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2228  50S ribosomal protein L4  38.83 
 
 		 208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169782  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2737  ribosomal protein L4/L1e  46.12 
 
 		 206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.508185  normal  0.224795 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1293  50S ribosomal protein L4  40 
 
 		 235 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000803665  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2422  50S ribosomal protein L4  38.35 
 
 		 208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00578828  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1393  50S ribosomal protein L4  40 
 
 		 235 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000162338  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4506  ribosomal protein L4/L1e  42.78 
 
 		 292 aa  145  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>