More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_10010 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_10010  LSU ribosomal protein L4P  100 
 
 		 207 aa  423  1e-118  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000045126  hitchhiker  0.00000000148432 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0963  ribosomal protein L4/L1e  80.19 
 
 		 207 aa  333  1e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000403747  hitchhiker  0.0000000000267396 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16230  ribosomal protein L4  69.9 
 
 		 207 aa  303  1.0000000000000001e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.308573  decreased coverage  0.0000000146284 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1160  ribosomal protein L4/L1e  57.21 
 
 		 208 aa  240  1e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000738717  hitchhiker  0.000000590673 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0292  50S ribosomal protein L4  52.17 
 
 		 205 aa  213  9.999999999999999e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000472593  unclonable  1.9716100000000001e-28 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1830  50S ribosomal protein L4  51.21 
 
 		 207 aa  211  5.999999999999999e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0478396  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0108  50S ribosomal protein L4  48.31 
 
 		 207 aa  208  4e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0059  50S ribosomal protein L4  50.24 
 
 		 207 aa  207  9e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0599605  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1906  50S ribosomal protein L4  50.24 
 
 		 207 aa  206  2e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000335339  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0112  50S ribosomal protein L4  47.83 
 
 		 207 aa  204  6e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000123482  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2276  50S ribosomal protein L4  50.49 
 
 		 207 aa  204  7e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000009811  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2317  50S ribosomal protein L4  50.49 
 
 		 207 aa  204  7e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000134967  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0287  50S ribosomal protein L4  47.83 
 
 		 206 aa  202  3e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0371511  hitchhiker  0.00627174 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3666  50S ribosomal protein L4  47.34 
 
 		 206 aa  202  3e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000305367  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0106  50S ribosomal protein L4  47.83 
 
 		 207 aa  201  5e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000544936  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0111  50S ribosomal protein L4  47.83 
 
 		 207 aa  201  7e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000572324  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0111  50S ribosomal protein L4  47.83 
 
 		 207 aa  201  7e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000900585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0107  50S ribosomal protein L4  47.83 
 
 		 207 aa  201  7e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.56557e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0105  50S ribosomal protein L4  47.83 
 
 		 207 aa  201  7e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000256275  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5194  50S ribosomal protein L4  47.83 
 
 		 207 aa  201  7e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000834057  unclonable  1.98377e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0111  50S ribosomal protein L4  47.83 
 
 		 207 aa  201  7e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000163463  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0132  50S ribosomal protein L4  47.83 
 
 		 207 aa  201  7e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000136863  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0142  50S ribosomal protein L4  47.83 
 
 		 207 aa  201  7e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000690155  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0123  50S ribosomal protein L4  47.83 
 
 		 207 aa  201  7e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.21989e-61 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2401  50S ribosomal protein L4  50.72 
 
 		 208 aa  198  3.9999999999999996e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1482  50S ribosomal protein L4  47.83 
 
 		 207 aa  198  6e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000984788  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01180  ribosomal protein L4/L1e  49.52 
 
 		 209 aa  196  1.0000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000715314  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0423  50S ribosomal protein L4  47.12 
 
 		 207 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000203712  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0105  50S ribosomal protein L4  46.86 
 
 		 207 aa  196  3e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000104823  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2904  50S ribosomal protein L4  47.12 
 
 		 208 aa  195  4.0000000000000005e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000879055  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0226  ribosomal protein L4/L1e  48.31 
 
 		 207 aa  194  9e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0216  50S ribosomal protein L4  46.86 
 
 		 206 aa  192  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320704  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0716  ribosomal protein L4/L1e  51.79 
 
 		 223 aa  191  5e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0197  50S ribosomal protein L4  46.86 
 
 		 207 aa  191  5e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00203095  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0868  50S ribosomal protein L4  46.38 
 
 		 206 aa  191  8e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000685593  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2332  ribosomal protein L4/L1e  46.86 
 
 		 207 aa  190  1e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000847375  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0596  50S ribosomal protein L4P  47.09 
 
 		 207 aa  189  2e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000475036  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1523  ribosomal protein L4/L1e  49.03 
 
 		 207 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.790483  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2398  50S ribosomal protein L4  50.51 
 
 		 204 aa  186  2e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000730975  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2710  ribosomal protein L4/L1e  44.93 
 
 		 206 aa  186  3e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000254915  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2713  50S ribosomal protein L4  50.51 
 
 		 204 aa  186  3e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1573  ribosomal protein L4/L1e  43.2 
 
 		 207 aa  183  1.0000000000000001e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000791532  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2459  50S ribosomal protein L4P  44.44 
 
 		 207 aa  181  6e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0863955 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1708  50S ribosomal protein L4  47.09 
 
 		 218 aa  179  2e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00274066  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1183  ribosomal protein L4/L1e  45.63 
 
 		 208 aa  177  7e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000599505  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4025  ribosomal protein L4/L1e  46.6 
 
 		 221 aa  177  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000717748 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2645  50S ribosomal protein L4  47.98 
 
 		 222 aa  175  4e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264538  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2422  50S ribosomal protein L4  45.85 
 
 		 208 aa  174  6e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00578828  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5048  50S ribosomal protein L4  47.78 
 
 		 218 aa  174  7e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.5122  normal  0.277146 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0563  50S ribosomal protein L4/L1e  47.76 
 
 		 216 aa  174  8e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0759  50S ribosomal protein L4  42.51 
 
 		 207 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000566858  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0195  LSU ribosomal protein L4P  41.55 
 
 		 207 aa  173  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00135777  normal  0.0747506 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1041  50S ribosomal protein L4  47.24 
 
 		 219 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3994  ribosomal protein L4/L1e  45.28 
 
 		 212 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1184  ribosomal protein L4/L1e  46.07 
 
 		 223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1014  50S ribosomal protein L4  47.24 
 
 		 219 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1031  50S ribosomal protein L4  47.24 
 
 		 219 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.658773 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl124  50S ribosomal protein L4  43.69 
 
 		 208 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000604234  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0628  ribosomal protein L4/L1e  47.24 
 
 		 232 aa  172  2.9999999999999996e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3142  ribosomal protein L4/L1e  46.83 
 
 		 221 aa  171  5.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.083105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1306  50S ribosomal protein L4  45.28 
 
 		 219 aa  171  7.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.265076  normal  0.163333 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4916  ribosomal protein L4/L1e  45.96 
 
 		 209 aa  170  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.1186  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2228  50S ribosomal protein L4  46.63 
 
 		 208 aa  169  2e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169782  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1293  50S ribosomal protein L4  43.06 
 
 		 210 aa  169  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000205733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0251  50S ribosomal protein L4  42.18 
 
 		 211 aa  169  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0248  50S ribosomal protein L4  42.18 
 
 		 211 aa  169  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.890563  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3434  ribosomal protein L4/L1e  45.45 
 
 		 217 aa  169  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4314  ribosomal protein L4/L1e  46.5 
 
 		 216 aa  169  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1556  ribosomal protein L4/L1e  43.2 
 
 		 207 aa  169  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427554  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05720  50S ribosomal protein L4  42.23 
 
 		 208 aa  169  4e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.316206  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1744  50S ribosomal protein L4  40.67 
 
 		 208 aa  168  4e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000318286  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0193  ribosomal protein L4/L1e  41.15 
 
 		 214 aa  168  5e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0848  50S ribosomal protein L4P  44.44 
 
 		 207 aa  168  5e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000392239  decreased coverage  0.0000122182 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1764  50S ribosomal protein L4  43.2 
 
 		 206 aa  167  7e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00135584  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1087  50S ribosomal protein L4  44.83 
 
 		 215 aa  167  8e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10489 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0954  50S ribosomal protein L4  40.91 
 
 		 221 aa  167  9e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000111144  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0695  50S ribosomal protein L4  42.72 
 
 		 208 aa  167  1e-40  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0932  ribosomal protein L4/L1e  48.65 
 
 		 217 aa  167  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10716  50S ribosomal protein L4  45.45 
 
 		 223 aa  166  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.311364 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2231  50S ribosomal protein L4  46.45 
 
 		 210 aa  166  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.402946 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3922  ribosomal protein L4/L1e  46 
 
 		 216 aa  166  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3011  50S ribosomal protein L4  42.58 
 
 		 212 aa  166  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00787083 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2658  ribosomal protein L4/L1e  46.73 
 
 		 228 aa  165  4e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3704  50S ribosomal protein L4  43.6 
 
 		 210 aa  165  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1341  ribosomal protein L4/L1e  44.85 
 
 		 210 aa  164  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1850  50S ribosomal protein L4  47.15 
 
 		 208 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264817  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0702  50S ribosomal protein L4  41.26 
 
 		 206 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000569503  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5125  ribosomal protein L4/L1e  45.45 
 
 		 223 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1137  50S ribosomal protein L4  42.34 
 
 		 223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000824266  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29730  LSU ribosomal protein L4P  44.95 
 
 		 234 aa  162  3e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.379343 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4506  ribosomal protein L4/L1e  43.72 
 
 		 292 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2064  50S ribosomal protein L4  43.48 
 
 		 206 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000384651  normal  0.231159 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0583  50S ribosomal protein L4  47.28 
 
 		 245 aa  161  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0452  50S ribosomal protein L4  42.08 
 
 		 210 aa  161  6e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000515236  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0475  50S ribosomal protein L4  42.08 
 
 		 210 aa  160  1e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00700158  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03990  LSU ribosomal protein L4P  46 
 
 		 228 aa  160  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_418  ribosomal protein L4  41.58 
 
 		 210 aa  160  1e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00538527  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0692  50S ribosomal protein L4  41.15 
 
 		 210 aa  159  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000477042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2019  50S ribosomal protein L4  44.02 
 
 		 206 aa  159  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0603  ribosomal protein L4/L1e  41.26 
 
 		 209 aa  159  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>