More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3704 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3704  50S ribosomal protein L4  100 
 
 		 210 aa  427  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0248  50S ribosomal protein L4  73.33 
 
 		 211 aa  328  3e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.890563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0251  50S ribosomal protein L4  73.33 
 
 		 211 aa  328  3e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1293  50S ribosomal protein L4  72.12 
 
 		 210 aa  312  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000205733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0692  50S ribosomal protein L4  71.77 
 
 		 210 aa  312  1.9999999999999998e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000477042  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2560  50S ribosomal protein L4/L1e  71.29 
 
 		 210 aa  311  3.9999999999999997e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0559575  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3011  50S ribosomal protein L4  65.24 
 
 		 212 aa  299  2e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00787083 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2231  50S ribosomal protein L4  63.46 
 
 		 210 aa  281  6.000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.402946 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23031  50S ribosomal protein L4  60.48 
 
 		 211 aa  256  2e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16771  50S ribosomal protein L4  59.05 
 
 		 211 aa  252  3e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0375  50S ribosomal protein L4  57.14 
 
 		 211 aa  247  8e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1956  50S ribosomal protein L4  55.24 
 
 		 211 aa  241  3.9999999999999997e-63  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17391  50S ribosomal protein L4  59.7 
 
 		 210 aa  240  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20021  50S ribosomal protein L4  55.71 
 
 		 212 aa  239  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1128  50S ribosomal protein L4  55.71 
 
 		 211 aa  238  5e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1649  50S ribosomal protein L4  55.98 
 
 		 210 aa  230  9e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17641  50S ribosomal protein L4  55.5 
 
 		 210 aa  230  1e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17481  50S ribosomal protein L4  55.02 
 
 		 210 aa  228  4e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.533381  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3666  50S ribosomal protein L4  51.18 
 
 		 206 aa  205  3e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000305367  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0216  50S ribosomal protein L4  50.24 
 
 		 206 aa  203  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320704  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0868  50S ribosomal protein L4  48.34 
 
 		 206 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000685593  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2459  50S ribosomal protein L4P  47.87 
 
 		 207 aa  192  3e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0863955 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0287  50S ribosomal protein L4  48.34 
 
 		 206 aa  191  7e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0371511  hitchhiker  0.00627174 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40690  Plastid ribosomal protein L4 large ribosomal subunit  48.02 
 
 		 251 aa  190  2e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0226  ribosomal protein L4/L1e  48.33 
 
 		 207 aa  189  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1744  50S ribosomal protein L4  46.92 
 
 		 208 aa  187  1e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000318286  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1183  ribosomal protein L4/L1e  49.02 
 
 		 208 aa  184  6e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000599505  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0423  50S ribosomal protein L4  47.87 
 
 		 207 aa  184  8e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000203712  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0112  50S ribosomal protein L4  46.45 
 
 		 207 aa  183  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000123482  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1523  ribosomal protein L4/L1e  47.85 
 
 		 207 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.790483  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2713  50S ribosomal protein L4  47.03 
 
 		 204 aa  182  4.0000000000000006e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0108  50S ribosomal protein L4  49.05 
 
 		 207 aa  181  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2398  50S ribosomal protein L4  47.03 
 
 		 204 aa  181  9.000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000730975  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0111  50S ribosomal protein L4  45.5 
 
 		 207 aa  179  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000572324  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0111  50S ribosomal protein L4  45.5 
 
 		 207 aa  179  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000900585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0107  50S ribosomal protein L4  45.5 
 
 		 207 aa  179  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.56557e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0105  50S ribosomal protein L4  45.5 
 
 		 207 aa  179  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000256275  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0123  50S ribosomal protein L4  45.5 
 
 		 207 aa  179  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.21989e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0142  50S ribosomal protein L4  45.5 
 
 		 207 aa  179  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000690155  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0111  50S ribosomal protein L4  45.5 
 
 		 207 aa  179  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000163463  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0106  50S ribosomal protein L4  45.5 
 
 		 207 aa  180  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000544936  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5194  50S ribosomal protein L4  45.5 
 
 		 207 aa  179  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000834057  unclonable  1.98377e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0132  50S ribosomal protein L4  45.5 
 
 		 207 aa  179  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000136863  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0105  50S ribosomal protein L4  44.55 
 
 		 207 aa  175  4e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000104823  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2710  ribosomal protein L4/L1e  45.97 
 
 		 206 aa  175  4e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000254915  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0195  LSU ribosomal protein L4P  44.76 
 
 		 207 aa  175  4e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00135777  normal  0.0747506 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2332  ribosomal protein L4/L1e  44.08 
 
 		 207 aa  173  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000847375  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2904  50S ribosomal protein L4  46.34 
 
 		 208 aa  172  2.9999999999999996e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000879055  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0080  50S ribosomal protein L4  47.8 
 
 		 206 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.186923 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01180  ribosomal protein L4/L1e  46.77 
 
 		 209 aa  170  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000715314  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1556  ribosomal protein L4/L1e  43.27 
 
 		 207 aa  168  6e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427554  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0716  ribosomal protein L4/L1e  46.31 
 
 		 223 aa  168  6e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0789  50S ribosomal protein L4  42.79 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1573  ribosomal protein L4/L1e  46.8 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000791532  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1764  50S ribosomal protein L4  46.12 
 
 		 206 aa  166  2e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00135584  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2773  50S ribosomal protein L4  43.27 
 
 		 206 aa  164  6.9999999999999995e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0187174  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0982  ribosomal protein L4/L1e  44.29 
 
 		 209 aa  163  1.0000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.532922  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0292  50S ribosomal protein L4  41.71 
 
 		 205 aa  162  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000472593  unclonable  1.9716100000000001e-28 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1830  50S ribosomal protein L4  44.55 
 
 		 207 aa  162  3e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0478396  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2256  50S ribosomal protein L4  43.96 
 
 		 206 aa  162  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000129639  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0759  50S ribosomal protein L4  44.55 
 
 		 207 aa  162  3e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000566858  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0848  50S ribosomal protein L4P  43.75 
 
 		 207 aa  162  4.0000000000000004e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000392239  decreased coverage  0.0000122182 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0193  ribosomal protein L4/L1e  42.92 
 
 		 214 aa  160  9e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl124  50S ribosomal protein L4  44.93 
 
 		 208 aa  160  1e-38  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000604234  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2422  50S ribosomal protein L4  45.05 
 
 		 208 aa  160  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00578828  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2645  50S ribosomal protein L4  41.06 
 
 		 222 aa  159  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264538  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5125  ribosomal protein L4/L1e  41.55 
 
 		 223 aa  159  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0059  50S ribosomal protein L4  43.2 
 
 		 207 aa  159  3e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0599605  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2276  50S ribosomal protein L4  44.5 
 
 		 207 aa  158  6e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000009811  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0695  50S ribosomal protein L4  41.87 
 
 		 208 aa  158  6e-38  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1137  50S ribosomal protein L4  42.22 
 
 		 223 aa  158  6e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000824266  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2317  50S ribosomal protein L4  44.5 
 
 		 207 aa  158  6e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000134967  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2228  50S ribosomal protein L4  45.54 
 
 		 208 aa  158  6e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169782  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4916  ribosomal protein L4/L1e  46.73 
 
 		 209 aa  157  7e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.1186  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10010  LSU ribosomal protein L4P  43.6 
 
 		 207 aa  158  7e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000045126  hitchhiker  0.00000000148432 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3142  ribosomal protein L4/L1e  43.84 
 
 		 221 aa  157  9e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.083105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2064  50S ribosomal protein L4  42.56 
 
 		 206 aa  157  1e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000384651  normal  0.231159 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0954  50S ribosomal protein L4  43.95 
 
 		 221 aa  157  1e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000111144  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1837  ribosomal protein L4/L1e  41.71 
 
 		 215 aa  156  2e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00300997  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0961  50S ribosomal protein L4  43.59 
 
 		 204 aa  156  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000392469  hitchhiker  0.00000164794 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4000  50S ribosomal protein L4  45.56 
 
 		 201 aa  156  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000185721  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0470  50S ribosomal protein L4  45.13 
 
 		 201 aa  157  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000163865  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0596  50S ribosomal protein L4P  41.15 
 
 		 207 aa  156  2e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000475036  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0872  50S ribosomal protein L4  48 
 
 		 201 aa  155  4e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.299152  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001741  LSU ribosomal protein L4p (L1e)  45 
 
 		 200 aa  155  5.0000000000000005e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000116803  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3821  50S ribosomal protein L4  45.56 
 
 		 201 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000757079  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1417  ribosomal protein L4/L1e  45.15 
 
 		 211 aa  155  6e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.977567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16230  ribosomal protein L4  41.15 
 
 		 207 aa  154  7e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.308573  decreased coverage  0.0000000146284 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0324  50S ribosomal protein L4  45.56 
 
 		 201 aa  154  8e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000187067  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0406  50S ribosomal protein L4  45.56 
 
 		 201 aa  154  8e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00340494  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0585  50S ribosomal protein L4  45.56 
 
 		 201 aa  153  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000207865  normal  0.110437 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3914  50S ribosomal protein L4  45.56 
 
 		 201 aa  153  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  8.05295e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3750  50S ribosomal protein L4  45 
 
 		 201 aa  152  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000124791  hitchhiker  0.00429034 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00446  50S ribosomal protein L4  43.08 
 
 		 201 aa  153  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000113118  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2063  50S ribosomal protein L4  46.08 
 
 		 208 aa  153  2e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000340203  normal  0.385687 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1906  50S ribosomal protein L4  41.63 
 
 		 207 aa  153  2e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000335339  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0284  50S ribosomal protein L4  45.56 
 
 		 201 aa  153  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000222015  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0394  ribosomal protein L4/L1e  45 
 
 		 201 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000162947  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3704  50S ribosomal protein L4  45 
 
 		 201 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112699  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3708  50S ribosomal protein L4  45 
 
 		 201 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00180602  normal  0.838559 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>