More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2713 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2713  50S ribosomal protein L4  100 
 
 		 204 aa  417  1e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2398  50S ribosomal protein L4  99.51 
 
 		 204 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000730975  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1573  ribosomal protein L4/L1e  60.19 
 
 		 207 aa  251  7e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000791532  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0759  50S ribosomal protein L4  58.94 
 
 		 207 aa  250  9.000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000566858  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0216  50S ribosomal protein L4  57.28 
 
 		 206 aa  249  2e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320704  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0108  50S ribosomal protein L4  60.39 
 
 		 207 aa  248  4e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0112  50S ribosomal protein L4  59.42 
 
 		 207 aa  246  2e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000123482  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0868  50S ribosomal protein L4  55.83 
 
 		 206 aa  240  1e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000685593  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0195  LSU ribosomal protein L4P  55.07 
 
 		 207 aa  238  2.9999999999999997e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00135777  normal  0.0747506 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2332  ribosomal protein L4/L1e  57.49 
 
 		 207 aa  238  2.9999999999999997e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000847375  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2904  50S ribosomal protein L4  53.37 
 
 		 208 aa  236  2e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000879055  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0287  50S ribosomal protein L4  54.37 
 
 		 206 aa  234  8e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0371511  hitchhiker  0.00627174 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0226  ribosomal protein L4/L1e  55.56 
 
 		 207 aa  233  2.0000000000000002e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0106  50S ribosomal protein L4  56.04 
 
 		 207 aa  231  8.000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000544936  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1523  ribosomal protein L4/L1e  53.66 
 
 		 207 aa  230  1e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.790483  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0111  50S ribosomal protein L4  55.56 
 
 		 207 aa  229  2e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000572324  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0111  50S ribosomal protein L4  55.56 
 
 		 207 aa  229  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000900585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0107  50S ribosomal protein L4  55.56 
 
 		 207 aa  229  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.56557e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0105  50S ribosomal protein L4  55.56 
 
 		 207 aa  229  2e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000256275  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0132  50S ribosomal protein L4  55.56 
 
 		 207 aa  229  2e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000136863  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5194  50S ribosomal protein L4  55.56 
 
 		 207 aa  229  2e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000834057  unclonable  1.98377e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0111  50S ribosomal protein L4  55.56 
 
 		 207 aa  229  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000163463  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0142  50S ribosomal protein L4  55.56 
 
 		 207 aa  229  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000690155  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0123  50S ribosomal protein L4  55.56 
 
 		 207 aa  229  2e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.21989e-61 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0105  50S ribosomal protein L4  56.04 
 
 		 207 aa  228  4e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000104823  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0423  50S ribosomal protein L4  53.62 
 
 		 207 aa  226  3e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000203712  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1744  50S ribosomal protein L4  53.37 
 
 		 208 aa  225  4e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000318286  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3666  50S ribosomal protein L4  53.88 
 
 		 206 aa  224  9e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000305367  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2710  ribosomal protein L4/L1e  53.88 
 
 		 206 aa  220  9.999999999999999e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000254915  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2459  50S ribosomal protein L4P  50.72 
 
 		 207 aa  214  5.9999999999999996e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0863955 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1183  ribosomal protein L4/L1e  51.21 
 
 		 208 aa  211  7.999999999999999e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000599505  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01180  ribosomal protein L4/L1e  49.52 
 
 		 209 aa  206  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000715314  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0292  50S ribosomal protein L4  48.31 
 
 		 205 aa  206  2e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000472593  unclonable  1.9716100000000001e-28 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1556  ribosomal protein L4/L1e  47.29 
 
 		 207 aa  201  7e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427554  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0059  50S ribosomal protein L4  48.31 
 
 		 207 aa  199  1.9999999999999998e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0599605  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1906  50S ribosomal protein L4  47.83 
 
 		 207 aa  196  2.0000000000000003e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000335339  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2560  50S ribosomal protein L4/L1e  46.04 
 
 		 210 aa  196  3e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0559575  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2401  50S ribosomal protein L4  46.15 
 
 		 208 aa  195  5.000000000000001e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1482  50S ribosomal protein L4  46.86 
 
 		 207 aa  192  2e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000984788  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1830  50S ribosomal protein L4  49.49 
 
 		 207 aa  191  6e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0478396  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2276  50S ribosomal protein L4  48.98 
 
 		 207 aa  188  4e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000009811  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2317  50S ribosomal protein L4  48.98 
 
 		 207 aa  188  4e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000134967  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2064  50S ribosomal protein L4  47.29 
 
 		 206 aa  187  7e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000384651  normal  0.231159 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0695  50S ribosomal protein L4  46.86 
 
 		 208 aa  186  1e-46  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3011  50S ribosomal protein L4  46.04 
 
 		 212 aa  186  1e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00787083 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16230  ribosomal protein L4  46.6 
 
 		 207 aa  187  1e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.308573  decreased coverage  0.0000000146284 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0692  50S ribosomal protein L4  45.77 
 
 		 210 aa  186  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000477042  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl124  50S ribosomal protein L4  47.55 
 
 		 208 aa  185  3e-46  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000604234  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0596  50S ribosomal protein L4P  44.88 
 
 		 207 aa  183  1.0000000000000001e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000475036  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0197  50S ribosomal protein L4  46.31 
 
 		 207 aa  183  2.0000000000000003e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00203095  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3704  50S ribosomal protein L4  47.03 
 
 		 210 aa  182  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0716  ribosomal protein L4/L1e  45.27 
 
 		 223 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0963  ribosomal protein L4/L1e  46.63 
 
 		 207 aa  181  5.0000000000000004e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000403747  hitchhiker  0.0000000000267396 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0702  50S ribosomal protein L4  43.07 
 
 		 206 aa  181  6e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000569503  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2019  50S ribosomal protein L4  43.56 
 
 		 206 aa  181  9.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4916  ribosomal protein L4/L1e  44.78 
 
 		 209 aa  180  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.1186  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2231  50S ribosomal protein L4  44.5 
 
 		 210 aa  180  1e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.402946 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0193  ribosomal protein L4/L1e  45.85 
 
 		 214 aa  178  4.999999999999999e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0470  50S ribosomal protein L4  47.37 
 
 		 201 aa  177  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000163865  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10010  LSU ribosomal protein L4P  48.99 
 
 		 207 aa  177  1e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000045126  hitchhiker  0.00000000148432 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0251  50S ribosomal protein L4  43.07 
 
 		 211 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0248  50S ribosomal protein L4  43.07 
 
 		 211 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.890563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0954  50S ribosomal protein L4  44.34 
 
 		 221 aa  176  3e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000111144  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0681  50S ribosomal protein L4  41.18 
 
 		 207 aa  175  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.486374  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0872  50S ribosomal protein L4  47.4 
 
 		 201 aa  174  7e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.299152  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1293  50S ribosomal protein L4  45.23 
 
 		 210 aa  174  7e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000205733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1417  ribosomal protein L4/L1e  43.35 
 
 		 211 aa  174  9e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.977567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0321  50S ribosomal protein L4  46.84 
 
 		 200 aa  174  9e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0789186  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0982  ribosomal protein L4/L1e  44.44 
 
 		 209 aa  174  9.999999999999999e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.532922  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0452  50S ribosomal protein L4  43.41 
 
 		 210 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000515236  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2422  50S ribosomal protein L4  43.28 
 
 		 208 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00578828  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001741  LSU ribosomal protein L4p (L1e)  46.84 
 
 		 200 aa  172  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000116803  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0475  50S ribosomal protein L4  42.93 
 
 		 210 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00700158  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2856  50S ribosomal protein L4  43.14 
 
 		 207 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400345  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00446  50S ribosomal protein L4  45.79 
 
 		 201 aa  172  3.9999999999999995e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000113118  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1649  50S ribosomal protein L4  44 
 
 		 210 aa  172  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4004  ribosomal protein L4/L1e  43.69 
 
 		 215 aa  172  3.9999999999999995e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.070535  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_418  ribosomal protein L4  42.93 
 
 		 210 aa  171  5e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00538527  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1160  ribosomal protein L4/L1e  43.75 
 
 		 208 aa  171  5.999999999999999e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000738717  hitchhiker  0.000000590673 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2173  50S ribosomal protein L4  46.84 
 
 		 200 aa  171  7.999999999999999e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000174601  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0789  50S ribosomal protein L4  40.64 
 
 		 221 aa  171  1e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17641  50S ribosomal protein L4  44 
 
 		 210 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17391  50S ribosomal protein L4  44.5 
 
 		 210 aa  170  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1934  50S ribosomal protein L4  43.56 
 
 		 206 aa  169  3e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17481  50S ribosomal protein L4  43.5 
 
 		 210 aa  169  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.533381  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00731  50S ribosomal protein L4  46.32 
 
 		 200 aa  169  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0848  50S ribosomal protein L4P  44.93 
 
 		 207 aa  169  3e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000392239  decreased coverage  0.0000122182 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16771  50S ribosomal protein L4  41.63 
 
 		 211 aa  169  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3994  ribosomal protein L4/L1e  44.34 
 
 		 212 aa  169  3e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3523  50S ribosomal protein L4  45.99 
 
 		 201 aa  168  4e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.0000000876425  hitchhiker  0.00000726358 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0490  50S ribosomal protein L4  43.68 
 
 		 200 aa  168  5e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000109229  normal  0.0102301 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1945  50S ribosomal protein L4  43.56 
 
 		 206 aa  168  5e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0485  50S ribosomal protein L4  43.68 
 
 		 200 aa  168  5e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000238586  normal  0.0299035 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2063  50S ribosomal protein L4  42.16 
 
 		 208 aa  168  6e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000340203  normal  0.385687 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1347  50S ribosomal protein L4  40.1 
 
 		 206 aa  167  8e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2256  50S ribosomal protein L4  42.36 
 
 		 206 aa  167  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000129639  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1137  50S ribosomal protein L4  43.24 
 
 		 223 aa  166  2e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000824266  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2295  50S ribosomal protein L4  42.65 
 
 		 208 aa  166  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0333756  hitchhiker  0.00351228 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0627  50S ribosomal protein L4  41.58 
 
 		 220 aa  166  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000530014  hitchhiker  0.00000000000031805 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0563  50S ribosomal protein L4/L1e  42 
 
 		 216 aa  166  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>