More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0292 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0292  50S ribosomal protein L4  100 
 
 		 205 aa  408  1e-113  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000472593  unclonable  1.9716100000000001e-28 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0108  50S ribosomal protein L4  58.94 
 
 		 207 aa  265  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0112  50S ribosomal protein L4  58.45 
 
 		 207 aa  262  3e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000123482  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1482  50S ribosomal protein L4  60.39 
 
 		 207 aa  261  6e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000984788  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0059  50S ribosomal protein L4  58.45 
 
 		 207 aa  251  7e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0599605  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0132  50S ribosomal protein L4  55.07 
 
 		 207 aa  249  1e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000136863  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0111  50S ribosomal protein L4  55.07 
 
 		 207 aa  249  1e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000572324  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0111  50S ribosomal protein L4  55.07 
 
 		 207 aa  249  1e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000900585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0107  50S ribosomal protein L4  55.07 
 
 		 207 aa  249  1e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.56557e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0105  50S ribosomal protein L4  55.07 
 
 		 207 aa  249  1e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000256275  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0142  50S ribosomal protein L4  55.07 
 
 		 207 aa  249  1e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000690155  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0123  50S ribosomal protein L4  55.07 
 
 		 207 aa  249  1e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.21989e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0111  50S ribosomal protein L4  55.07 
 
 		 207 aa  249  1e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000163463  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5194  50S ribosomal protein L4  55.07 
 
 		 207 aa  249  1e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000834057  unclonable  1.98377e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0106  50S ribosomal protein L4  55.07 
 
 		 207 aa  249  1e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000544936  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0105  50S ribosomal protein L4  55.07 
 
 		 207 aa  248  3e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000104823  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1830  50S ribosomal protein L4  57.97 
 
 		 207 aa  248  6e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0478396  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1906  50S ribosomal protein L4  57.97 
 
 		 207 aa  246  1e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000335339  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2317  50S ribosomal protein L4  56.8 
 
 		 207 aa  243  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000134967  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2276  50S ribosomal protein L4  56.8 
 
 		 207 aa  243  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000009811  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2401  50S ribosomal protein L4  57.69 
 
 		 208 aa  239  2e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0197  50S ribosomal protein L4  54.11 
 
 		 207 aa  229  2e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00203095  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0287  50S ribosomal protein L4  53.4 
 
 		 206 aa  228  7e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0371511  hitchhiker  0.00627174 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0596  50S ribosomal protein L4P  54.37 
 
 		 207 aa  226  1e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000475036  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3666  50S ribosomal protein L4  50.72 
 
 		 206 aa  218  6e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000305367  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0216  50S ribosomal protein L4  52.17 
 
 		 206 aa  216  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320704  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2459  50S ribosomal protein L4P  48.79 
 
 		 207 aa  216  2e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0863955 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0868  50S ribosomal protein L4  48.54 
 
 		 206 aa  212  2.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000685593  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1523  ribosomal protein L4/L1e  50.24 
 
 		 207 aa  211  4.9999999999999996e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.790483  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0963  ribosomal protein L4/L1e  52.17 
 
 		 207 aa  209  2e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000403747  hitchhiker  0.0000000000267396 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2904  50S ribosomal protein L4  47.6 
 
 		 208 aa  207  8e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000879055  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10010  LSU ribosomal protein L4P  52.17 
 
 		 207 aa  207  8e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000045126  hitchhiker  0.00000000148432 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2713  50S ribosomal protein L4  48.31 
 
 		 204 aa  206  2e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16230  ribosomal protein L4  50.49 
 
 		 207 aa  206  3e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.308573  decreased coverage  0.0000000146284 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2332  ribosomal protein L4/L1e  48.79 
 
 		 207 aa  205  4e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000847375  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0759  50S ribosomal protein L4  45.89 
 
 		 207 aa  204  5e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000566858  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2398  50S ribosomal protein L4  47.83 
 
 		 204 aa  204  1e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000730975  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0226  ribosomal protein L4/L1e  47.34 
 
 		 207 aa  203  2e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1744  50S ribosomal protein L4  48.08 
 
 		 208 aa  202  3e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000318286  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0716  ribosomal protein L4/L1e  48.04 
 
 		 223 aa  202  3e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0195  LSU ribosomal protein L4P  45.41 
 
 		 207 aa  201  5e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00135777  normal  0.0747506 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1573  ribosomal protein L4/L1e  49.51 
 
 		 207 aa  201  6e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000791532  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0423  50S ribosomal protein L4  44.44 
 
 		 207 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000203712  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2710  ribosomal protein L4/L1e  45.89 
 
 		 206 aa  198  5e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000254915  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1160  ribosomal protein L4/L1e  49.04 
 
 		 208 aa  196  2.0000000000000003e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000738717  hitchhiker  0.000000590673 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1556  ribosomal protein L4/L1e  45.37 
 
 		 207 aa  192  3e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427554  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0954  50S ribosomal protein L4  44.8 
 
 		 221 aa  191  5e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000111144  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0695  50S ribosomal protein L4  46.12 
 
 		 208 aa  191  7e-48  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4916  ribosomal protein L4/L1e  48.77 
 
 		 209 aa  190  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.1186  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01180  ribosomal protein L4/L1e  47.76 
 
 		 209 aa  188  4e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000715314  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4025  ribosomal protein L4/L1e  46.15 
 
 		 221 aa  184  8e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000717748 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl124  50S ribosomal protein L4  42.72 
 
 		 208 aa  181  6e-45  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000604234  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0789  50S ribosomal protein L4  42.08 
 
 		 221 aa  181  7e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1184  ribosomal protein L4/L1e  45.88 
 
 		 223 aa  179  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0702  50S ribosomal protein L4  41.95 
 
 		 206 aa  177  8e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000569503  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0848  50S ribosomal protein L4P  43.96 
 
 		 207 aa  175  4e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000392239  decreased coverage  0.0000122182 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1068  50S ribosomal protein L4  42.23 
 
 		 207 aa  175  5e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000351414  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2856  50S ribosomal protein L4  44.17 
 
 		 207 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400345  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1137  50S ribosomal protein L4  42.34 
 
 		 223 aa  174  9.999999999999999e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000824266  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0248  50S ribosomal protein L4  42.65 
 
 		 211 aa  173  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.890563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2231  50S ribosomal protein L4  44.02 
 
 		 210 aa  174  9.999999999999999e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.402946 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0251  50S ribosomal protein L4  42.65 
 
 		 211 aa  173  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0857  50S ribosomal protein L4  42.65 
 
 		 205 aa  172  1.9999999999999998e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1393  50S ribosomal protein L4  44.25 
 
 		 235 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000162338  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1293  50S ribosomal protein L4  44.25 
 
 		 235 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000803665  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0982  ribosomal protein L4/L1e  43.48 
 
 		 209 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.532922  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3023  ribosomal protein L4/L1e  42.44 
 
 		 222 aa  171  7.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443321  normal  0.0189884 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001741  LSU ribosomal protein L4p (L1e)  45.13 
 
 		 200 aa  170  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000116803  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5078  50S ribosomal protein L4  44.56 
 
 		 200 aa  169  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000647229  normal  0.290105 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0627  50S ribosomal protein L4  41.75 
 
 		 220 aa  169  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000530014  hitchhiker  0.00000000000031805 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0470  50S ribosomal protein L4  42.86 
 
 		 201 aa  169  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000163865  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2019  50S ribosomal protein L4  43.96 
 
 		 206 aa  168  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1183  ribosomal protein L4/L1e  39.81 
 
 		 208 aa  168  7e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000599505  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0961  50S ribosomal protein L4  44.79 
 
 		 204 aa  167  7e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000392469  hitchhiker  0.00000164794 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2064  50S ribosomal protein L4  39.02 
 
 		 206 aa  167  1e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000384651  normal  0.231159 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00731  50S ribosomal protein L4  44.62 
 
 		 200 aa  167  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0838  50S ribosomal protein L4  45.26 
 
 		 200 aa  166  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33315  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_418  ribosomal protein L4  39.6 
 
 		 210 aa  166  2e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00538527  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08860  50S ribosomal protein L4  45.26 
 
 		 200 aa  166  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00776029  normal  0.0237616 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0934  50S ribosomal protein L4  41.26 
 
 		 207 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000521211  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3327  50S ribosomal protein L4  41.26 
 
 		 207 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.78315e-16 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0452  50S ribosomal protein L4  39.11 
 
 		 210 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000515236  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1945  50S ribosomal protein L4  43.48 
 
 		 206 aa  165  4e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0627  ribosomal protein L4  44.04 
 
 		 200 aa  164  8e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000698865  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4547  50S ribosomal protein L4  44.04 
 
 		 200 aa  164  8e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0714588  normal  0.0640617 
 
 
-
 
NC_002936  DET0475  50S ribosomal protein L4  39.11 
 
 		 210 aa  164  9e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00700158  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0193  ribosomal protein L4/L1e  40.19 
 
 		 214 aa  164  9e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1934  50S ribosomal protein L4  43.48 
 
 		 206 aa  163  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1347  50S ribosomal protein L4  38.05 
 
 		 206 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0321  50S ribosomal protein L4  43.59 
 
 		 200 aa  164  1.0000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0789186  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3523  50S ribosomal protein L4  43.35 
 
 		 201 aa  163  1.0000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.0000000876425  hitchhiker  0.00000726358 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2173  50S ribosomal protein L4  43.59 
 
 		 200 aa  163  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000174601  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3011  50S ribosomal protein L4  42.38 
 
 		 212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00787083 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3704  50S ribosomal protein L4  41.71 
 
 		 210 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0201  50S ribosomal protein L4  41.87 
 
 		 201 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000483773  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0197  50S ribosomal protein L4  41.87 
 
 		 201 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000174855  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3758  50S ribosomal protein L4  41.87 
 
 		 201 aa  162  3e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000815073  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4055  50S ribosomal protein L4  41.87 
 
 		 201 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000789198  unclonable  0.00000000000665609 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0171  50S ribosomal protein L4  41.87 
 
 		 201 aa  162  3e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000251  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4169  50S ribosomal protein L4  41.87 
 
 		 201 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170676  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>