More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1068 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1068  50S ribosomal protein L4  100 
 
 		 207 aa  417  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000351414  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0934  50S ribosomal protein L4  77.29 
 
 		 207 aa  337  5.9999999999999996e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000521211  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3327  50S ribosomal protein L4  77.29 
 
 		 207 aa  337  5.9999999999999996e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.78315e-16 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0627  50S ribosomal protein L4  72.46 
 
 		 220 aa  314  5e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000530014  hitchhiker  0.00000000000031805 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2856  50S ribosomal protein L4  68.12 
 
 		 207 aa  295  5e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400345  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0681  50S ribosomal protein L4  59.51 
 
 		 207 aa  265  5e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.486374  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1347  50S ribosomal protein L4  57.28 
 
 		 206 aa  263  2e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0702  50S ribosomal protein L4  55.61 
 
 		 206 aa  238  5e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000569503  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1556  ribosomal protein L4/L1e  46.38 
 
 		 207 aa  202  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427554  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3666  50S ribosomal protein L4  43.56 
 
 		 206 aa  194  5.000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000305367  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0216  50S ribosomal protein L4  44.39 
 
 		 206 aa  193  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320704  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2276  50S ribosomal protein L4  48.56 
 
 		 207 aa  189  4e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000009811  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2019  50S ribosomal protein L4  45.37 
 
 		 206 aa  188  4e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2317  50S ribosomal protein L4  48.56 
 
 		 207 aa  189  4e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000134967  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0709  50S ribosomal protein L4  45.37 
 
 		 205 aa  188  5e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0382078  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1830  50S ribosomal protein L4  47.12 
 
 		 207 aa  185  5e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0478396  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1945  50S ribosomal protein L4  45.37 
 
 		 206 aa  184  9e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0868  50S ribosomal protein L4  46.04 
 
 		 206 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000685593  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0112  50S ribosomal protein L4  44.66 
 
 		 207 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000123482  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0108  50S ribosomal protein L4  44.66 
 
 		 207 aa  182  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1934  50S ribosomal protein L4  45.37 
 
 		 206 aa  182  3e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0106  50S ribosomal protein L4  43.2 
 
 		 207 aa  179  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000544936  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0759  50S ribosomal protein L4  44.33 
 
 		 207 aa  179  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000566858  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0287  50S ribosomal protein L4  42.44 
 
 		 206 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0371511  hitchhiker  0.00627174 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0105  50S ribosomal protein L4  43.2 
 
 		 207 aa  178  4e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000104823  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4004  ribosomal protein L4/L1e  43.33 
 
 		 215 aa  178  4e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.070535  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0111  50S ribosomal protein L4  42.72 
 
 		 207 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000572324  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0111  50S ribosomal protein L4  42.72 
 
 		 207 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000900585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0107  50S ribosomal protein L4  42.72 
 
 		 207 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.56557e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0105  50S ribosomal protein L4  42.72 
 
 		 207 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000256275  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0123  50S ribosomal protein L4  42.72 
 
 		 207 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.21989e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0111  50S ribosomal protein L4  42.72 
 
 		 207 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000163463  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5194  50S ribosomal protein L4  42.72 
 
 		 207 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000834057  unclonable  1.98377e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0132  50S ribosomal protein L4  42.72 
 
 		 207 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000136863  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0142  50S ribosomal protein L4  42.72 
 
 		 207 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000690155  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2904  50S ribosomal protein L4  43.9 
 
 		 208 aa  177  7e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000879055  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2459  50S ribosomal protein L4P  40.29 
 
 		 207 aa  177  9e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0863955 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2773  50S ribosomal protein L4  42.93 
 
 		 206 aa  176  3e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0187174  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0292  50S ribosomal protein L4  42.23 
 
 		 205 aa  175  5e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000472593  unclonable  1.9716100000000001e-28 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2064  50S ribosomal protein L4  40.49 
 
 		 206 aa  174  8e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000384651  normal  0.231159 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1744  50S ribosomal protein L4  41.67 
 
 		 208 aa  174  9e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000318286  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2710  ribosomal protein L4/L1e  39.6 
 
 		 206 aa  172  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000254915  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1912  50S ribosomal protein L4  45.37 
 
 		 206 aa  172  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.224726 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0226  ribosomal protein L4/L1e  42.23 
 
 		 207 aa  170  1e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0197  50S ribosomal protein L4  41.75 
 
 		 207 aa  170  2e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00203095  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1573  ribosomal protein L4/L1e  40.89 
 
 		 207 aa  167  1e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000791532  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2332  ribosomal protein L4/L1e  41.38 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000847375  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0596  50S ribosomal protein L4P  40.78 
 
 		 207 aa  166  2.9999999999999998e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000475036  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2398  50S ribosomal protein L4  41.09 
 
 		 204 aa  165  5.9999999999999996e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000730975  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2256  50S ribosomal protein L4  39.81 
 
 		 206 aa  164  8e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000129639  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2713  50S ribosomal protein L4  41.09 
 
 		 204 aa  164  8e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0848  50S ribosomal protein L4P  41.55 
 
 		 207 aa  164  8e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000392239  decreased coverage  0.0000122182 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1764  50S ribosomal protein L4  38.83 
 
 		 206 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00135584  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01180  ribosomal protein L4/L1e  38.65 
 
 		 209 aa  160  9e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000715314  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1482  50S ribosomal protein L4  39.32 
 
 		 207 aa  160  9e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000984788  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0195  LSU ribosomal protein L4P  35.96 
 
 		 207 aa  159  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00135777  normal  0.0747506 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0423  50S ribosomal protein L4  39.81 
 
 		 207 aa  158  6e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000203712  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0954  50S ribosomal protein L4  38.64 
 
 		 221 aa  158  6e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000111144  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0982  ribosomal protein L4/L1e  41.55 
 
 		 209 aa  157  1e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.532922  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0789  50S ribosomal protein L4  35.91 
 
 		 221 aa  157  1e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2687  50S ribosomal protein L4  39.51 
 
 		 206 aa  155  4e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0662732  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0059  50S ribosomal protein L4  37.86 
 
 		 207 aa  154  6e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0599605  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0080  50S ribosomal protein L4  36.89 
 
 		 206 aa  154  6e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.186923 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4916  ribosomal protein L4/L1e  40.1 
 
 		 209 aa  154  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.1186  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1906  50S ribosomal protein L4  37.86 
 
 		 207 aa  153  2e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000335339  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3666  50S ribosomal protein L4  38.81 
 
 		 206 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1183  ribosomal protein L4/L1e  38.92 
 
 		 208 aa  151  5.9999999999999996e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000599505  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1393  50S ribosomal protein L4  38.67 
 
 		 235 aa  150  1e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000162338  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1293  50S ribosomal protein L4  38.67 
 
 		 235 aa  150  1e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000803665  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3023  ribosomal protein L4/L1e  40.49 
 
 		 222 aa  150  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443321  normal  0.0189884 
 
 
-
 
NC_002978  WD0680  50S ribosomal protein L4  36.82 
 
 		 204 aa  150  2e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0323983  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0695  50S ribosomal protein L4  41.87 
 
 		 208 aa  149  2e-35  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3908  50S ribosomal protein L4  40.32 
 
 		 200 aa  150  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0610127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3183  50S ribosomal protein L4  36.82 
 
 		 206 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.611189 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1137  50S ribosomal protein L4  38.46 
 
 		 223 aa  149  3e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000824266  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2401  50S ribosomal protein L4  38.16 
 
 		 208 aa  149  3e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0716  ribosomal protein L4/L1e  37.62 
 
 		 223 aa  148  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1523  ribosomal protein L4/L1e  37.86 
 
 		 207 aa  149  4e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.790483  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0857  50S ribosomal protein L4  36.95 
 
 		 205 aa  148  5e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3447  50S ribosomal protein L4  37.81 
 
 		 206 aa  148  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.628566 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0603  ribosomal protein L4/L1e  38.92 
 
 		 209 aa  148  7e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2296  50S ribosomal protein L4  36.82 
 
 		 206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.214587 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0661  50S ribosomal protein L4  35.96 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000586581  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1227  50S ribosomal protein L4  37.68 
 
 		 217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150568  unclonable  0.0000101553 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1365  50S ribosomal protein L4  37.31 
 
 		 206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.65413  normal  0.580974 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2323  ribosomal protein L4/L1e  38.78 
 
 		 206 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0012561  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl124  50S ribosomal protein L4  40.98 
 
 		 208 aa  145  3e-34  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000604234  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5069  50S ribosomal protein L4  37.31 
 
 		 206 aa  145  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.312873  normal  0.444752 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1546  50S ribosomal protein L4  37.81 
 
 		 206 aa  145  3e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05720  50S ribosomal protein L4  39.81 
 
 		 208 aa  146  3e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.316206  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1184  ribosomal protein L4/L1e  37.31 
 
 		 223 aa  145  5e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0455  50S ribosomal protein L4  39.78 
 
 		 200 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.035261  unclonable  0.000000191468 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0485  50S ribosomal protein L4  39.78 
 
 		 200 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00632251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4748  50S ribosomal protein L4  39.78 
 
 		 200 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000074471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0488  50S ribosomal protein L4  39.78 
 
 		 200 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000114619  normal  0.070368 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0193  ribosomal protein L4/L1e  36.54 
 
 		 214 aa  144  7.0000000000000006e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06260  50S ribosomal protein L4  40.86 
 
 		 200 aa  144  9e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00260309  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4025  ribosomal protein L4/L1e  37.31 
 
 		 221 aa  143  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000717748 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0963  ribosomal protein L4/L1e  37.86 
 
 		 207 aa  143  2e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000403747  hitchhiker  0.0000000000267396 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2063  50S ribosomal protein L4  39.32 
 
 		 208 aa  142  3e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000340203  normal  0.385687 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>