More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1573 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1573  ribosomal protein L4/L1e  100 
 
 		 207 aa  417  1e-116  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000791532  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2713  50S ribosomal protein L4  60.19 
 
 		 204 aa  251  7e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2398  50S ribosomal protein L4  60.19 
 
 		 204 aa  251  7e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000730975  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0195  LSU ribosomal protein L4P  55.56 
 
 		 207 aa  239  1e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00135777  normal  0.0747506 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0226  ribosomal protein L4/L1e  55.34 
 
 		 207 aa  236  1e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0108  50S ribosomal protein L4  55.83 
 
 		 207 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0216  50S ribosomal protein L4  57.28 
 
 		 206 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320704  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2904  50S ribosomal protein L4  53.62 
 
 		 208 aa  229  2e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000879055  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3666  50S ribosomal protein L4  56.31 
 
 		 206 aa  229  2e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000305367  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0112  50S ribosomal protein L4  54.85 
 
 		 207 aa  229  3e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000123482  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0868  50S ribosomal protein L4  54.37 
 
 		 206 aa  228  4e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000685593  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0759  50S ribosomal protein L4  51.46 
 
 		 207 aa  227  8e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000566858  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0287  50S ribosomal protein L4  53.4 
 
 		 206 aa  226  1e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0371511  hitchhiker  0.00627174 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2332  ribosomal protein L4/L1e  51.94 
 
 		 207 aa  226  2e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000847375  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2459  50S ribosomal protein L4P  51.94 
 
 		 207 aa  225  3e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0863955 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0106  50S ribosomal protein L4  53.88 
 
 		 207 aa  225  4e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000544936  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5194  50S ribosomal protein L4  53.88 
 
 		 207 aa  224  6e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000834057  unclonable  1.98377e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0111  50S ribosomal protein L4  53.88 
 
 		 207 aa  224  6e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000572324  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0111  50S ribosomal protein L4  53.88 
 
 		 207 aa  224  6e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000900585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0107  50S ribosomal protein L4  53.88 
 
 		 207 aa  224  6e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.56557e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0105  50S ribosomal protein L4  53.88 
 
 		 207 aa  224  6e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000256275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0111  50S ribosomal protein L4  53.88 
 
 		 207 aa  224  6e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000163463  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0123  50S ribosomal protein L4  53.88 
 
 		 207 aa  224  6e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.21989e-61 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0132  50S ribosomal protein L4  53.88 
 
 		 207 aa  224  6e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000136863  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0142  50S ribosomal protein L4  53.88 
 
 		 207 aa  224  6e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000690155  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2710  ribosomal protein L4/L1e  52.91 
 
 		 206 aa  219  1.9999999999999999e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000254915  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0105  50S ribosomal protein L4  52.91 
 
 		 207 aa  218  5e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000104823  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0423  50S ribosomal protein L4  51.46 
 
 		 207 aa  216  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000203712  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1523  ribosomal protein L4/L1e  52.43 
 
 		 207 aa  211  9e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.790483  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1744  50S ribosomal protein L4  50.24 
 
 		 208 aa  206  2e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000318286  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0292  50S ribosomal protein L4  49.51 
 
 		 205 aa  201  6e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000472593  unclonable  1.9716100000000001e-28 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1830  50S ribosomal protein L4  50 
 
 		 207 aa  201  7e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0478396  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1183  ribosomal protein L4/L1e  47.57 
 
 		 208 aa  196  3e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000599505  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2276  50S ribosomal protein L4  49.03 
 
 		 207 aa  195  4.0000000000000005e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000009811  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2317  50S ribosomal protein L4  49.03 
 
 		 207 aa  195  4.0000000000000005e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000134967  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1556  ribosomal protein L4/L1e  46.6 
 
 		 207 aa  194  9e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427554  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0059  50S ribosomal protein L4  47.09 
 
 		 207 aa  193  1e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0599605  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16230  ribosomal protein L4  45.63 
 
 		 207 aa  191  1e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.308573  decreased coverage  0.0000000146284 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1906  50S ribosomal protein L4  46.12 
 
 		 207 aa  189  2e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000335339  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4004  ribosomal protein L4/L1e  44.5 
 
 		 215 aa  188  5e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.070535  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1482  50S ribosomal protein L4  43.2 
 
 		 207 aa  186  2e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000984788  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2019  50S ribosomal protein L4  47.29 
 
 		 206 aa  186  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01180  ribosomal protein L4/L1e  46.38 
 
 		 209 aa  185  5e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000715314  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2401  50S ribosomal protein L4  45.41 
 
 		 208 aa  184  8e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0702  50S ribosomal protein L4  44.83 
 
 		 206 aa  182  3e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000569503  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0982  ribosomal protein L4/L1e  47.12 
 
 		 209 aa  182  3e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.532922  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0848  50S ribosomal protein L4P  46.57 
 
 		 207 aa  182  5.0000000000000004e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000392239  decreased coverage  0.0000122182 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2228  50S ribosomal protein L4  46.12 
 
 		 208 aa  181  8.000000000000001e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169782  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0596  50S ribosomal protein L4P  46.12 
 
 		 207 aa  178  4.999999999999999e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000475036  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1945  50S ribosomal protein L4  48.28 
 
 		 206 aa  177  8e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0193  ribosomal protein L4/L1e  47.34 
 
 		 214 aa  177  1e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1837  ribosomal protein L4/L1e  44.71 
 
 		 215 aa  177  1e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00300997  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1417  ribosomal protein L4/L1e  44.06 
 
 		 211 aa  176  2e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.977567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0954  50S ribosomal protein L4  45 
 
 		 221 aa  176  2e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000111144  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3994  ribosomal protein L4/L1e  45.97 
 
 		 212 aa  175  3e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2064  50S ribosomal protein L4  43.14 
 
 		 206 aa  176  3e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000384651  normal  0.231159 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0290  ribosomal protein L4/L1e  46.77 
 
 		 208 aa  175  3e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00437959  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3011  50S ribosomal protein L4  46.8 
 
 		 212 aa  176  3e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00787083 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2422  50S ribosomal protein L4  44.17 
 
 		 208 aa  175  4e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00578828  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0963  ribosomal protein L4/L1e  43.69 
 
 		 207 aa  174  7e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000403747  hitchhiker  0.0000000000267396 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2856  50S ribosomal protein L4  42.72 
 
 		 207 aa  174  8e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400345  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1912  50S ribosomal protein L4  45.81 
 
 		 206 aa  174  9e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.224726 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1934  50S ribosomal protein L4  47.29 
 
 		 206 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4916  ribosomal protein L4/L1e  44.06 
 
 		 209 aa  173  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.1186  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5125  ribosomal protein L4/L1e  42.93 
 
 		 223 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2560  50S ribosomal protein L4/L1e  45.32 
 
 		 210 aa  173  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0559575  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0197  50S ribosomal protein L4  44.33 
 
 		 207 aa  172  2.9999999999999996e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00203095  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_418  ribosomal protein L4  40.69 
 
 		 210 aa  171  9e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00538527  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0627  50S ribosomal protein L4  41.87 
 
 		 220 aa  171  9e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000530014  hitchhiker  0.00000000000031805 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10010  LSU ribosomal protein L4P  43.2 
 
 		 207 aa  170  1e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000045126  hitchhiker  0.00000000148432 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl124  50S ribosomal protein L4  42.65 
 
 		 208 aa  170  1e-41  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000604234  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1850  50S ribosomal protein L4  45.32 
 
 		 208 aa  170  1e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264817  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1160  ribosomal protein L4/L1e  43.48 
 
 		 208 aa  170  1e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000738717  hitchhiker  0.000000590673 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1293  50S ribosomal protein L4  45.37 
 
 		 210 aa  170  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000205733  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0475  50S ribosomal protein L4  40.2 
 
 		 210 aa  170  2e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00700158  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2231  50S ribosomal protein L4  43.41 
 
 		 210 aa  169  2e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.402946 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0563  50S ribosomal protein L4/L1e  42 
 
 		 216 aa  169  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0452  50S ribosomal protein L4  40.2 
 
 		 210 aa  168  4e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000515236  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0692  50S ribosomal protein L4  44.33 
 
 		 210 aa  168  5e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000477042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0695  50S ribosomal protein L4  43.96 
 
 		 208 aa  168  5e-41  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1068  50S ribosomal protein L4  40.89 
 
 		 207 aa  167  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000351414  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0603  ribosomal protein L4/L1e  42.23 
 
 		 209 aa  167  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3704  50S ribosomal protein L4  46.8 
 
 		 210 aa  166  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0290  50S ribosomal protein L4  43.69 
 
 		 212 aa  165  4e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0709  50S ribosomal protein L4  42.86 
 
 		 205 aa  165  4e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0382078  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0716  ribosomal protein L4/L1e  40.29 
 
 		 223 aa  164  5.9999999999999996e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0181  50S ribosomal protein L4  41.26 
 
 		 208 aa  164  6.9999999999999995e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000196789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0251  50S ribosomal protein L4  42.86 
 
 		 211 aa  164  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0248  50S ribosomal protein L4  42.86 
 
 		 211 aa  164  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.890563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2295  50S ribosomal protein L4  43.69 
 
 		 208 aa  164  8e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0333756  hitchhiker  0.00351228 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1087  50S ribosomal protein L4  41.71 
 
 		 215 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10489 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1014  50S ribosomal protein L4  42.64 
 
 		 219 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1031  50S ribosomal protein L4  42.64 
 
 		 219 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.658773 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1041  50S ribosomal protein L4  42.64 
 
 		 219 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10716  50S ribosomal protein L4  42.93 
 
 		 223 aa  162  3e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.311364 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0681  50S ribosomal protein L4  36.41 
 
 		 207 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.486374  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3142  ribosomal protein L4/L1e  40.2 
 
 		 221 aa  161  6e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.083105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1347  50S ribosomal protein L4  38.42 
 
 		 206 aa  161  6e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2063  50S ribosomal protein L4  42.23 
 
 		 208 aa  161  7e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000340203  normal  0.385687 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3327  50S ribosomal protein L4  40.89 
 
 		 207 aa  160  9e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.78315e-16 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>