More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_0868 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_0868  50S ribosomal protein L4  100 
 
 
206 aa  415  9.999999999999999e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000685593  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0759  50S ribosomal protein L4  67.63 
 
 
207 aa  284  7e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000566858  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2904  50S ribosomal protein L4  62.98 
 
 
208 aa  282  2.0000000000000002e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000879055  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0216  50S ribosomal protein L4  67.96 
 
 
206 aa  281  5.000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320704  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1744  50S ribosomal protein L4  64.42 
 
 
208 aa  276  2e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000318286  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0287  50S ribosomal protein L4  63.59 
 
 
206 aa  270  2e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0371511  hitchhiker  0.00627174 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0108  50S ribosomal protein L4  65.7 
 
 
207 aa  268  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0112  50S ribosomal protein L4  65.22 
 
 
207 aa  266  2e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000123482  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2459  50S ribosomal protein L4P  59.9 
 
 
207 aa  266  2e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0863955 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0226  ribosomal protein L4/L1e  63.29 
 
 
207 aa  266  2e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0195  LSU ribosomal protein L4P  58.45 
 
 
207 aa  265  4e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00135777  normal  0.0747506 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3666  50S ribosomal protein L4  59.22 
 
 
206 aa  261  6.999999999999999e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000305367  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2332  ribosomal protein L4/L1e  60.87 
 
 
207 aa  258  3e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000847375  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0106  50S ribosomal protein L4  61.35 
 
 
207 aa  256  1e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000544936  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0132  50S ribosomal protein L4  60.87 
 
 
207 aa  255  3e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000136863  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0142  50S ribosomal protein L4  60.87 
 
 
207 aa  255  3e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000690155  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0111  50S ribosomal protein L4  60.87 
 
 
207 aa  255  3e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000572324  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0111  50S ribosomal protein L4  60.87 
 
 
207 aa  255  3e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000900585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0107  50S ribosomal protein L4  60.87 
 
 
207 aa  255  3e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.56557e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0105  50S ribosomal protein L4  60.87 
 
 
207 aa  255  3e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000256275  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0123  50S ribosomal protein L4  60.87 
 
 
207 aa  255  3e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.21989e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0111  50S ribosomal protein L4  60.87 
 
 
207 aa  255  3e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000163463  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5194  50S ribosomal protein L4  60.87 
 
 
207 aa  255  3e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000834057  unclonable  1.98377e-25 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2710  ribosomal protein L4/L1e  59.71 
 
 
206 aa  254  6e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000254915  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1523  ribosomal protein L4/L1e  60 
 
 
207 aa  248  3e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.790483  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0105  50S ribosomal protein L4  60.39 
 
 
207 aa  248  4e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000104823  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2713  50S ribosomal protein L4  55.83 
 
 
204 aa  240  1e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2398  50S ribosomal protein L4  55.83 
 
 
204 aa  240  1e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000730975  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0423  50S ribosomal protein L4  56.52 
 
 
207 aa  237  6.999999999999999e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000203712  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1183  ribosomal protein L4/L1e  53.14 
 
 
208 aa  234  8e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000599505  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01180  ribosomal protein L4/L1e  58.17 
 
 
209 aa  233  2.0000000000000002e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000715314  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4916  ribosomal protein L4/L1e  54.23 
 
 
209 aa  231  6e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.1186  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1573  ribosomal protein L4/L1e  54.37 
 
 
207 aa  228  4e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000791532  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0982  ribosomal protein L4/L1e  53.14 
 
 
209 aa  222  4e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.532922  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1830  50S ribosomal protein L4  53.14 
 
 
207 aa  216  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0478396  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2317  50S ribosomal protein L4  53.17 
 
 
207 aa  213  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000134967  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2276  50S ribosomal protein L4  53.17 
 
 
207 aa  213  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000009811  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0292  50S ribosomal protein L4  48.54 
 
 
205 aa  212  2.9999999999999995e-54  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000472593  unclonable  1.9716100000000001e-28 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0954  50S ribosomal protein L4  50.68 
 
 
221 aa  211  3.9999999999999995e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000111144  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1482  50S ribosomal protein L4  50.72 
 
 
207 aa  211  7.999999999999999e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000984788  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1556  ribosomal protein L4/L1e  47.09 
 
 
207 aa  208  4e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427554  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1906  50S ribosomal protein L4  47.34 
 
 
207 aa  207  8e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000335339  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0716  ribosomal protein L4/L1e  46.57 
 
 
223 aa  206  2e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0059  50S ribosomal protein L4  45.89 
 
 
207 aa  205  4e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0599605  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16230  ribosomal protein L4  47.8 
 
 
207 aa  205  4e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.308573  decreased coverage  0.0000000146284 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0702  50S ribosomal protein L4  48.51 
 
 
206 aa  205  5e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000569503  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2401  50S ribosomal protein L4  48.08 
 
 
208 aa  204  6e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0596  50S ribosomal protein L4P  50.24 
 
 
207 aa  204  8e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000475036  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4025  ribosomal protein L4/L1e  49.49 
 
 
221 aa  202  3e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000717748 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0681  50S ribosomal protein L4  46.57 
 
 
207 aa  199  3e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.486374  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1137  50S ribosomal protein L4  47.75 
 
 
223 aa  197  7e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000824266  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3704  50S ribosomal protein L4  48.34 
 
 
210 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1184  ribosomal protein L4/L1e  48.48 
 
 
223 aa  197  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0695  50S ribosomal protein L4  49.52 
 
 
208 aa  196  1.0000000000000001e-49  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3011  50S ribosomal protein L4  48.57 
 
 
212 aa  197  1.0000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00787083 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0963  ribosomal protein L4/L1e  47.83 
 
 
207 aa  196  2.0000000000000003e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000403747  hitchhiker  0.0000000000267396 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0248  50S ribosomal protein L4  47.39 
 
 
211 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.890563  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0251  50S ribosomal protein L4  47.39 
 
 
211 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2560  50S ribosomal protein L4/L1e  47.87 
 
 
210 aa  195  3e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0559575  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3023  ribosomal protein L4/L1e  49.03 
 
 
222 aa  196  3e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443321  normal  0.0189884 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0197  50S ribosomal protein L4  48.24 
 
 
207 aa  196  3e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00203095  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0789  50S ribosomal protein L4  46.12 
 
 
221 aa  194  7e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1347  50S ribosomal protein L4  45.05 
 
 
206 aa  194  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0603  ribosomal protein L4/L1e  48.1 
 
 
209 aa  194  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1293  50S ribosomal protein L4  51.34 
 
 
235 aa  193  2e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000803665  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3994  ribosomal protein L4/L1e  49.06 
 
 
212 aa  193  2e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1393  50S ribosomal protein L4  51.34 
 
 
235 aa  193  2e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000162338  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20860  LSU ribosomal protein L4P  49 
 
 
223 aa  192  3e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.699759  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl124  50S ribosomal protein L4  49.27 
 
 
208 aa  192  4e-48  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000604234  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0193  ribosomal protein L4/L1e  48.78 
 
 
214 aa  192  4e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1087  50S ribosomal protein L4  49.25 
 
 
215 aa  191  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.10489 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2231  50S ribosomal protein L4  45.24 
 
 
210 aa  191  6e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.402946 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3142  ribosomal protein L4/L1e  47.96 
 
 
221 aa  191  8e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.083105  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2773  50S ribosomal protein L4  45.81 
 
 
206 aa  190  1e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0187174  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2064  50S ribosomal protein L4  44.83 
 
 
206 aa  190  1e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000384651  normal  0.231159 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2645  50S ribosomal protein L4  47.24 
 
 
222 aa  189  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264538  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0452  50S ribosomal protein L4  47.55 
 
 
210 aa  189  2e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000515236  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0475  50S ribosomal protein L4  46.57 
 
 
210 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00700158  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2856  50S ribosomal protein L4  46.08 
 
 
207 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400345  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6048  50S ribosomal protein L4  50.51 
 
 
247 aa  189  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.239817 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0692  50S ribosomal protein L4  46.67 
 
 
210 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000477042  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_418  ribosomal protein L4  47.06 
 
 
210 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00538527  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1124  ribosomal protein L4/L1e  47.5 
 
 
248 aa  188  5.999999999999999e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0709  50S ribosomal protein L4  47.03 
 
 
205 aa  187  1e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0382078  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1293  50S ribosomal protein L4  46.67 
 
 
210 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000205733  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1708  50S ribosomal protein L4  46.97 
 
 
218 aa  186  2e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00274066  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0627  50S ribosomal protein L4  44.06 
 
 
220 aa  186  3e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000530014  hitchhiker  0.00000000000031805 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2422  50S ribosomal protein L4  47.03 
 
 
208 aa  185  4e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00578828  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0628  ribosomal protein L4/L1e  47.72 
 
 
232 aa  185  5e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1306  50S ribosomal protein L4  48.48 
 
 
219 aa  184  6e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.265076  normal  0.163333 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29730  LSU ribosomal protein L4P  49 
 
 
234 aa  184  8e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.379343 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1764  50S ribosomal protein L4  45.32 
 
 
206 aa  184  8e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00135584  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1068  50S ribosomal protein L4  46.04 
 
 
207 aa  183  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000351414  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2019  50S ribosomal protein L4  44.06 
 
 
206 aa  183  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3434  ribosomal protein L4/L1e  46.27 
 
 
217 aa  183  2.0000000000000003e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10010  LSU ribosomal protein L4P  46.38 
 
 
207 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000045126  hitchhiker  0.00000000148432 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0583  50S ribosomal protein L4  47.21 
 
 
245 aa  182  3e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3327  50S ribosomal protein L4  46.53 
 
 
207 aa  182  3e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.78315e-16 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0563  50S ribosomal protein L4/L1e  47.45 
 
 
216 aa  182  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0934  50S ribosomal protein L4  46.53 
 
 
207 aa  182  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000521211  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>