More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2645 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2645  50S ribosomal protein L4  100 
 
 		 222 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264538  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5125  ribosomal protein L4/L1e  79.82 
 
 		 223 aa  355  3.9999999999999996e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0563  50S ribosomal protein L4/L1e  66.34 
 
 		 216 aa  282  2.0000000000000002e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4506  ribosomal protein L4/L1e  64.79 
 
 		 292 aa  280  1e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1087  50S ribosomal protein L4  66.99 
 
 		 215 aa  278  4e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10489 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03990  LSU ribosomal protein L4P  63.43 
 
 		 228 aa  273  2.0000000000000002e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4320  ribosomal protein L4/L1e  67.51 
 
 		 204 aa  272  3e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4314  ribosomal protein L4/L1e  63.21 
 
 		 216 aa  272  3e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0628  ribosomal protein L4/L1e  62.1 
 
 		 232 aa  271  5.000000000000001e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3142  ribosomal protein L4/L1e  63.16 
 
 		 221 aa  271  6e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.083105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3922  ribosomal protein L4/L1e  64.08 
 
 		 216 aa  270  1e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6048  50S ribosomal protein L4  63.94 
 
 		 247 aa  269  2e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.239817 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20860  LSU ribosomal protein L4P  62.61 
 
 		 223 aa  268  4e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.699759  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2658  ribosomal protein L4/L1e  60.73 
 
 		 228 aa  267  1e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0583  50S ribosomal protein L4  64.88 
 
 		 245 aa  265  4e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1124  ribosomal protein L4/L1e  62.62 
 
 		 248 aa  261  4.999999999999999e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1041  50S ribosomal protein L4  63.73 
 
 		 219 aa  260  8.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1014  50S ribosomal protein L4  63.73 
 
 		 219 aa  260  8.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1031  50S ribosomal protein L4  63.73 
 
 		 219 aa  260  8.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.658773 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0932  ribosomal protein L4/L1e  63.46 
 
 		 217 aa  256  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29730  LSU ribosomal protein L4P  61.95 
 
 		 234 aa  254  9e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.379343 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10716  50S ribosomal protein L4  61.27 
 
 		 223 aa  253  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.311364 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0689  ribosomal protein L4/L1e  60.98 
 
 		 234 aa  253  1.0000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.443511 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23800  50S ribosomal protein L4  63.29 
 
 		 312 aa  253  2.0000000000000002e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0307  50S ribosomal protein L4P  62.2 
 
 		 220 aa  251  5.000000000000001e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00224676 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2686  ribosomal protein L4/L1e  60.78 
 
 		 206 aa  251  5.000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.751145 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2974  50S ribosomal protein L4P  62.3 
 
 		 205 aa  249  3e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1306  50S ribosomal protein L4  60.78 
 
 		 219 aa  248  4e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.265076  normal  0.163333 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17150  LSU ribosomal protein L4P  59.42 
 
 		 211 aa  244  6.999999999999999e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3434  ribosomal protein L4/L1e  59.62 
 
 		 217 aa  243  9.999999999999999e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5048  50S ribosomal protein L4  59.13 
 
 		 218 aa  242  3e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.5122  normal  0.277146 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3904  50S ribosomal protein L4P  61.58 
 
 		 259 aa  238  4e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1186  50S ribosomal protein L4/L1e  59.35 
 
 		 217 aa  234  6e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6613  ribosomal protein L4/L1e  57.85 
 
 		 231 aa  233  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3757  ribosomal protein L4/L1e  60.98 
 
 		 221 aa  232  3e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.221063  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1708  50S ribosomal protein L4  55.24 
 
 		 218 aa  223  1e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00274066  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0256  ribosomal protein L4/L1 family protein  54.29 
 
 		 221 aa  223  1e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0588  ribosomal protein L4/L1e  58.57 
 
 		 228 aa  222  4e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.290054  normal  0.451966 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0399  ribosomal protein L4/L1e  51.92 
 
 		 214 aa  195  4.0000000000000005e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0868  50S ribosomal protein L4  47.24 
 
 		 206 aa  189  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000685593  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0963  ribosomal protein L4/L1e  49.25 
 
 		 207 aa  178  4e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000403747  hitchhiker  0.0000000000267396 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1830  50S ribosomal protein L4  45.71 
 
 		 207 aa  178  7e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0478396  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3666  50S ribosomal protein L4  44.22 
 
 		 206 aa  177  8e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000305367  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2317  50S ribosomal protein L4  46 
 
 		 207 aa  175  4e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000134967  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16230  ribosomal protein L4  45.96 
 
 		 207 aa  175  4e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.308573  decreased coverage  0.0000000146284 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2276  50S ribosomal protein L4  46 
 
 		 207 aa  175  4e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000009811  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0111  50S ribosomal protein L4  40.98 
 
 		 207 aa  171  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000572324  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0111  50S ribosomal protein L4  40.98 
 
 		 207 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000900585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0107  50S ribosomal protein L4  40.98 
 
 		 207 aa  171  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.56557e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0105  50S ribosomal protein L4  40.98 
 
 		 207 aa  171  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000256275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0111  50S ribosomal protein L4  40.98 
 
 		 207 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000163463  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0123  50S ribosomal protein L4  40.98 
 
 		 207 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.21989e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0142  50S ribosomal protein L4  40.98 
 
 		 207 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000690155  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5194  50S ribosomal protein L4  40.98 
 
 		 207 aa  171  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000834057  unclonable  1.98377e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0132  50S ribosomal protein L4  40.98 
 
 		 207 aa  171  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000136863  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2710  ribosomal protein L4/L1e  45.1 
 
 		 206 aa  170  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000254915  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0106  50S ribosomal protein L4  40.49 
 
 		 207 aa  169  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000544936  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0226  ribosomal protein L4/L1e  43.81 
 
 		 207 aa  168  5e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2904  50S ribosomal protein L4  43.22 
 
 		 208 aa  167  9e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000879055  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0112  50S ribosomal protein L4  40.49 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000123482  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0108  50S ribosomal protein L4  40.69 
 
 		 207 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2064  50S ribosomal protein L4  42.13 
 
 		 206 aa  165  4e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000384651  normal  0.231159 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1160  ribosomal protein L4/L1e  45.16 
 
 		 208 aa  165  4e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000738717  hitchhiker  0.000000590673 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10010  LSU ribosomal protein L4P  46.46 
 
 		 207 aa  165  4e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000045126  hitchhiker  0.00000000148432 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1837  ribosomal protein L4/L1e  39.72 
 
 		 215 aa  165  5.9999999999999996e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00300997  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0702  50S ribosomal protein L4  44.39 
 
 		 206 aa  164  9e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000569503  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0287  50S ribosomal protein L4  44.72 
 
 		 206 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0371511  hitchhiker  0.00627174 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1744  50S ribosomal protein L4  41 
 
 		 208 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000318286  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0105  50S ribosomal protein L4  39.51 
 
 		 207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000104823  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1183  ribosomal protein L4/L1e  40.91 
 
 		 208 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000599505  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4916  ribosomal protein L4/L1e  44.39 
 
 		 209 aa  161  6e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.1186  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0195  LSU ribosomal protein L4P  41.21 
 
 		 207 aa  161  6e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00135777  normal  0.0747506 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3704  50S ribosomal protein L4  41.06 
 
 		 210 aa  159  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0759  50S ribosomal protein L4  41.21 
 
 		 207 aa  158  6e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000566858  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2459  50S ribosomal protein L4P  40.48 
 
 		 207 aa  158  6e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0863955 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2713  50S ribosomal protein L4  41.29 
 
 		 204 aa  158  8e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0716  ribosomal protein L4/L1e  42.08 
 
 		 223 aa  157  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4025  ribosomal protein L4/L1e  39.63 
 
 		 221 aa  157  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000717748 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2398  50S ribosomal protein L4  40.8 
 
 		 204 aa  156  3e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000730975  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0193  ribosomal protein L4/L1e  40.91 
 
 		 214 aa  155  3e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2401  50S ribosomal protein L4  39.34 
 
 		 208 aa  155  5.0000000000000005e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01180  ribosomal protein L4/L1e  44.27 
 
 		 209 aa  154  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000715314  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2231  50S ribosomal protein L4  38.16 
 
 		 210 aa  154  1e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.402946 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1137  50S ribosomal protein L4  41.59 
 
 		 223 aa  154  1e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000824266  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1573  ribosomal protein L4/L1e  39.2 
 
 		 207 aa  153  2e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000791532  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1523  ribosomal protein L4/L1e  42.42 
 
 		 207 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.790483  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0292  50S ribosomal protein L4  40.2 
 
 		 205 aa  152  4e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000472593  unclonable  1.9716100000000001e-28 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0197  50S ribosomal protein L4  38.54 
 
 		 207 aa  152  4e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00203095  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1912  50S ribosomal protein L4  43.43 
 
 		 206 aa  151  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.224726 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3994  ribosomal protein L4/L1e  40.47 
 
 		 212 aa  151  7e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1184  ribosomal protein L4/L1e  41.45 
 
 		 223 aa  151  8.999999999999999e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2856  50S ribosomal protein L4  40.5 
 
 		 207 aa  150  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400345  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0059  50S ribosomal protein L4  38.19 
 
 		 207 aa  150  1e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0599605  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4004  ribosomal protein L4/L1e  43 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.070535  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1764  50S ribosomal protein L4  41.09 
 
 		 206 aa  150  1e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00135584  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1347  50S ribosomal protein L4  42.21 
 
 		 206 aa  149  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0596  50S ribosomal protein L4P  38.24 
 
 		 207 aa  150  2e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000475036  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0423  50S ribosomal protein L4  38.57 
 
 		 207 aa  149  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000203712  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2422  50S ribosomal protein L4  42.56 
 
 		 208 aa  149  4e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00578828  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2332  ribosomal protein L4/L1e  40.4 
 
 		 207 aa  148  5e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000847375  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>