More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_17150 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_17150  LSU ribosomal protein L4P  100 
 
 
211 aa  426  1e-118  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2686  ribosomal protein L4/L1e  80.39 
 
 
206 aa  332  3e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.751145 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2974  50S ribosomal protein L4P  80.39 
 
 
205 aa  328  3e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1041  50S ribosomal protein L4  70.15 
 
 
219 aa  282  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1014  50S ribosomal protein L4  70.15 
 
 
219 aa  282  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1031  50S ribosomal protein L4  70.15 
 
 
219 aa  282  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.658773 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10716  50S ribosomal protein L4  70.2 
 
 
223 aa  280  2e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.311364 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0932  ribosomal protein L4/L1e  70.62 
 
 
217 aa  280  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106023  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2658  ribosomal protein L4/L1e  69 
 
 
228 aa  278  6e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0689  ribosomal protein L4/L1e  72.11 
 
 
234 aa  276  2e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.443511 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3142  ribosomal protein L4/L1e  69.12 
 
 
221 aa  275  3e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.083105  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29730  LSU ribosomal protein L4P  71.96 
 
 
234 aa  275  3e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.379343 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1306  50S ribosomal protein L4  69.47 
 
 
219 aa  275  4e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.265076  normal  0.163333 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1087  50S ribosomal protein L4  67.16 
 
 
215 aa  274  8e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.10489 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03990  LSU ribosomal protein L4P  72.63 
 
 
228 aa  273  1.0000000000000001e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4314  ribosomal protein L4/L1e  67.17 
 
 
216 aa  271  6e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5048  50S ribosomal protein L4  67.68 
 
 
218 aa  270  8.000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.5122  normal  0.277146 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3922  ribosomal protein L4/L1e  69.84 
 
 
216 aa  270  8.000000000000001e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6048  50S ribosomal protein L4  70.47 
 
 
247 aa  270  9e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.239817 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4320  ribosomal protein L4/L1e  65.64 
 
 
204 aa  269  2e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20860  LSU ribosomal protein L4P  66.32 
 
 
223 aa  270  2e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.699759  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23800  50S ribosomal protein L4  69.54 
 
 
312 aa  268  5.9999999999999995e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0628  ribosomal protein L4/L1e  69.7 
 
 
232 aa  268  5.9999999999999995e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0307  50S ribosomal protein L4P  67.88 
 
 
220 aa  267  7e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00224676 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1124  ribosomal protein L4/L1e  69.31 
 
 
248 aa  266  2e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0563  50S ribosomal protein L4/L1e  64.73 
 
 
216 aa  262  3e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4506  ribosomal protein L4/L1e  70.53 
 
 
292 aa  262  3e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0583  50S ribosomal protein L4  66.5 
 
 
245 aa  260  1e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3904  50S ribosomal protein L4P  69.31 
 
 
259 aa  254  8e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3434  ribosomal protein L4/L1e  61.5 
 
 
217 aa  249  2e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2645  50S ribosomal protein L4  59.42 
 
 
222 aa  244  6e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264538  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6613  ribosomal protein L4/L1e  63.18 
 
 
231 aa  239  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1186  50S ribosomal protein L4/L1e  62.75 
 
 
217 aa  233  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1708  50S ribosomal protein L4  61.88 
 
 
218 aa  232  2.0000000000000002e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00274066  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3757  ribosomal protein L4/L1e  64.65 
 
 
221 aa  232  3e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.221063  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5125  ribosomal protein L4/L1e  61.78 
 
 
223 aa  229  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0588  ribosomal protein L4/L1e  62.91 
 
 
228 aa  229  2e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.290054  normal  0.451966 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0256  ribosomal protein L4/L1 family protein  57.44 
 
 
221 aa  216  1e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0868  50S ribosomal protein L4  48.65 
 
 
206 aa  180  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000685593  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0399  ribosomal protein L4/L1e  55.43 
 
 
214 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1183  ribosomal protein L4/L1e  49.19 
 
 
208 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000599505  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1184  ribosomal protein L4/L1e  48.65 
 
 
223 aa  164  9e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0108  50S ribosomal protein L4  45.99 
 
 
207 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4025  ribosomal protein L4/L1e  50.54 
 
 
221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000717748 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0112  50S ribosomal protein L4  45.45 
 
 
207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000123482  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0716  ribosomal protein L4/L1e  47.03 
 
 
223 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2710  ribosomal protein L4/L1e  47.59 
 
 
206 aa  162  4.0000000000000004e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000254915  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0105  50S ribosomal protein L4  44.39 
 
 
207 aa  161  9e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000104823  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4916  ribosomal protein L4/L1e  46.49 
 
 
209 aa  160  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.1186  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2276  50S ribosomal protein L4  45.74 
 
 
207 aa  159  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000009811  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0226  ribosomal protein L4/L1e  47.57 
 
 
207 aa  159  2e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2317  50S ribosomal protein L4  45.74 
 
 
207 aa  159  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000134967  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0106  50S ribosomal protein L4  43.85 
 
 
207 aa  159  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000544936  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0111  50S ribosomal protein L4  43.85 
 
 
207 aa  159  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000572324  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0111  50S ribosomal protein L4  43.85 
 
 
207 aa  159  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000900585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0107  50S ribosomal protein L4  43.85 
 
 
207 aa  159  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.56557e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0105  50S ribosomal protein L4  43.85 
 
 
207 aa  159  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000256275  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5194  50S ribosomal protein L4  43.85 
 
 
207 aa  159  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000834057  unclonable  1.98377e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0111  50S ribosomal protein L4  43.85 
 
 
207 aa  159  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000163463  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0132  50S ribosomal protein L4  43.85 
 
 
207 aa  159  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000136863  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0123  50S ribosomal protein L4  43.85 
 
 
207 aa  159  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.21989e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0142  50S ribosomal protein L4  43.85 
 
 
207 aa  159  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000690155  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0193  ribosomal protein L4/L1e  46.74 
 
 
214 aa  157  8e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01180  ribosomal protein L4/L1e  47.28 
 
 
209 aa  157  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000715314  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0963  ribosomal protein L4/L1e  50.56 
 
 
207 aa  156  2e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000403747  hitchhiker  0.0000000000267396 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3023  ribosomal protein L4/L1e  44.72 
 
 
222 aa  155  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443321  normal  0.0189884 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3666  50S ribosomal protein L4  44.02 
 
 
206 aa  155  6e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000305367  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1830  50S ribosomal protein L4  44.15 
 
 
207 aa  152  2e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0478396  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0423  50S ribosomal protein L4  44.32 
 
 
207 aa  153  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000203712  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2459  50S ribosomal protein L4P  45.41 
 
 
207 aa  152  4e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0863955 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1523  ribosomal protein L4/L1e  46.49 
 
 
207 aa  152  4e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.790483  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1160  ribosomal protein L4/L1e  43.78 
 
 
208 aa  152  5e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000738717  hitchhiker  0.000000590673 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0287  50S ribosomal protein L4  44.86 
 
 
206 aa  150  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0371511  hitchhiker  0.00627174 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16230  ribosomal protein L4  44.62 
 
 
207 aa  148  5e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.308573  decreased coverage  0.0000000146284 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2422  50S ribosomal protein L4  42.39 
 
 
208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00578828  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0059  50S ribosomal protein L4  42.39 
 
 
207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0599605  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1137  50S ribosomal protein L4  41.92 
 
 
223 aa  146  2.0000000000000003e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000824266  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0197  50S ribosomal protein L4  42.25 
 
 
207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00203095  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0954  50S ribosomal protein L4  42.21 
 
 
221 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000111144  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0702  50S ribosomal protein L4  44.09 
 
 
206 aa  145  5e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000569503  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3994  ribosomal protein L4/L1e  42.55 
 
 
212 aa  144  7.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2228  50S ribosomal protein L4  44.09 
 
 
208 aa  144  1e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169782  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0195  LSU ribosomal protein L4P  42.16 
 
 
207 aa  144  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00135777  normal  0.0747506 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0596  50S ribosomal protein L4P  42.7 
 
 
207 aa  144  1e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000475036  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2064  50S ribosomal protein L4  42.25 
 
 
206 aa  144  1e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000384651  normal  0.231159 
 
 
-
 
NC_002950  PG1937  50S ribosomal protein L4  43.72 
 
 
209 aa  143  2e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0759  50S ribosomal protein L4  41.4 
 
 
207 aa  143  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000566858  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2904  50S ribosomal protein L4  38.38 
 
 
208 aa  142  3e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000879055  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1744  50S ribosomal protein L4  42.16 
 
 
208 aa  141  6e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000318286  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1616  ribosomal protein L4/L1e  41.24 
 
 
212 aa  141  8e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0266  50S ribosomal protein L4  42.25 
 
 
200 aa  140  9.999999999999999e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000651042  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1573  ribosomal protein L4/L1e  42.39 
 
 
207 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000791532  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2019  50S ribosomal protein L4  45.41 
 
 
206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10010  LSU ribosomal protein L4P  45.55 
 
 
207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000045126  hitchhiker  0.00000000148432 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0681  50S ribosomal protein L4  40.43 
 
 
207 aa  139  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.486374  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1347  50S ribosomal protein L4  41.88 
 
 
206 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2231  50S ribosomal protein L4  46.07 
 
 
210 aa  139  3.9999999999999997e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.402946 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0225  ribosomal protein L4/L1e  41.75 
 
 
210 aa  139  4.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0603  ribosomal protein L4/L1e  42.7 
 
 
209 aa  138  4.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2560  50S ribosomal protein L4/L1e  41.95 
 
 
210 aa  138  6e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0559575  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>