More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0225 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0225  ribosomal protein L4/L1e  100 
 
 		 210 aa  421  1e-117  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1523  ribosomal protein L4/L1e  46.7 
 
 		 207 aa  169  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.790483  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0226  ribosomal protein L4/L1e  44.33 
 
 		 207 aa  164  1.0000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0692  50S ribosomal protein L4  45.18 
 
 		 210 aa  159  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000477042  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2560  50S ribosomal protein L4/L1e  47.12 
 
 		 210 aa  157  1e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0559575  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2231  50S ribosomal protein L4  51.52 
 
 		 210 aa  156  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.402946 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1183  ribosomal protein L4/L1e  43.32 
 
 		 208 aa  152  2e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000599505  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3142  ribosomal protein L4/L1e  42.31 
 
 		 221 aa  152  4e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.083105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2228  50S ribosomal protein L4  44.12 
 
 		 208 aa  151  8.999999999999999e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169782  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0868  50S ribosomal protein L4  42.93 
 
 		 206 aa  150  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000685593  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0216  50S ribosomal protein L4  40.5 
 
 		 206 aa  149  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320704  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0303  ribosomal protein L4/L1e  44.13 
 
 		 202 aa  149  2e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0138909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3011  50S ribosomal protein L4  51.52 
 
 		 212 aa  149  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00787083 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1293  50S ribosomal protein L4  51.16 
 
 		 210 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000205733  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0111  50S ribosomal protein L4  40.5 
 
 		 207 aa  147  8e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000572324  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0111  50S ribosomal protein L4  40.5 
 
 		 207 aa  147  8e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000900585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0107  50S ribosomal protein L4  40.5 
 
 		 207 aa  147  8e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.56557e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0105  50S ribosomal protein L4  40.5 
 
 		 207 aa  147  8e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000256275  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0123  50S ribosomal protein L4  40.5 
 
 		 207 aa  147  8e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.21989e-61 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0106  50S ribosomal protein L4  40.5 
 
 		 207 aa  147  8e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000544936  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0111  50S ribosomal protein L4  40.5 
 
 		 207 aa  147  8e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000163463  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0132  50S ribosomal protein L4  40.5 
 
 		 207 aa  147  8e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000136863  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5194  50S ribosomal protein L4  40.5 
 
 		 207 aa  147  8e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000834057  unclonable  1.98377e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0142  50S ribosomal protein L4  40.5 
 
 		 207 aa  147  8e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000690155  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0287  50S ribosomal protein L4  45.03 
 
 		 206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0371511  hitchhiker  0.00627174 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0105  50S ribosomal protein L4  40.5 
 
 		 207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000104823  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2645  50S ribosomal protein L4  44.2 
 
 		 222 aa  145  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264538  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3704  50S ribosomal protein L4  48.8 
 
 		 210 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29730  LSU ribosomal protein L4P  40.98 
 
 		 234 aa  145  5e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.379343 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2422  50S ribosomal protein L4  47.27 
 
 		 208 aa  145  5e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00578828  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0759  50S ribosomal protein L4  43.33 
 
 		 207 aa  145  6e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000566858  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0112  50S ribosomal protein L4  43.45 
 
 		 207 aa  144  6e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000123482  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0108  50S ribosomal protein L4  37.5 
 
 		 207 aa  145  6e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0195  LSU ribosomal protein L4P  38 
 
 		 207 aa  144  7.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00135777  normal  0.0747506 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0290  50S ribosomal protein L4  43.14 
 
 		 212 aa  144  1e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3922  ribosomal protein L4/L1e  42.21 
 
 		 216 aa  144  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2658  ribosomal protein L4/L1e  41.18 
 
 		 228 aa  144  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1087  50S ribosomal protein L4  40 
 
 		 215 aa  143  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10489 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2401  50S ribosomal protein L4  39.8 
 
 		 208 aa  143  2e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0197  50S ribosomal protein L4  36 
 
 		 207 aa  143  2e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00203095  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0248  50S ribosomal protein L4  47.13 
 
 		 211 aa  142  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.890563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0080  50S ribosomal protein L4  38.31 
 
 		 206 aa  142  3e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.186923 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0251  50S ribosomal protein L4  47.13 
 
 		 211 aa  142  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0227  50S ribosomal protein L4  42.29 
 
 		 211 aa  142  4e-33  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.102029  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1850  50S ribosomal protein L4  46.67 
 
 		 208 aa  142  4e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264817  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1482  50S ribosomal protein L4  38.69 
 
 		 207 aa  141  6e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000984788  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1573  ribosomal protein L4/L1e  41.94 
 
 		 207 aa  141  9e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000791532  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10716  50S ribosomal protein L4  40.69 
 
 		 223 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.311364 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2256  50S ribosomal protein L4  37.31 
 
 		 206 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000129639  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4314  ribosomal protein L4/L1e  41.21 
 
 		 216 aa  140  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5125  ribosomal protein L4/L1e  47.06 
 
 		 223 aa  140  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2064  50S ribosomal protein L4  39.04 
 
 		 206 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000384651  normal  0.231159 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1041  50S ribosomal protein L4  40.8 
 
 		 219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1014  50S ribosomal protein L4  40.8 
 
 		 219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2398  50S ribosomal protein L4  43.27 
 
 		 204 aa  139  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000730975  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1031  50S ribosomal protein L4  40.8 
 
 		 219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.658773 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1830  50S ribosomal protein L4  38.61 
 
 		 207 aa  139  3e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0478396  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4320  ribosomal protein L4/L1e  42.93 
 
 		 204 aa  139  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20860  LSU ribosomal protein L4P  41.87 
 
 		 223 aa  139  3e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.699759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3666  50S ribosomal protein L4  42.77 
 
 		 206 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000305367  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0563  50S ribosomal protein L4/L1e  40.38 
 
 		 216 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17150  LSU ribosomal protein L4P  41.75 
 
 		 211 aa  139  3.9999999999999997e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2713  50S ribosomal protein L4  43.27 
 
 		 204 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1306  50S ribosomal protein L4  42.49 
 
 		 219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.265076  normal  0.163333 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0596  50S ribosomal protein L4P  37 
 
 		 207 aa  138  4.999999999999999e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000475036  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2276  50S ribosomal protein L4  38.86 
 
 		 207 aa  138  6e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000009811  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2317  50S ribosomal protein L4  38.86 
 
 		 207 aa  138  6e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000134967  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4506  ribosomal protein L4/L1e  43.52 
 
 		 292 aa  138  6e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1906  50S ribosomal protein L4  42.35 
 
 		 207 aa  138  6e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000335339  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0181  50S ribosomal protein L4  44.24 
 
 		 208 aa  137  8.999999999999999e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000196789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0689  ribosomal protein L4/L1e  42.62 
 
 		 234 aa  137  8.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.443511 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0059  50S ribosomal protein L4  42.35 
 
 		 207 aa  137  1e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0599605  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0961  50S ribosomal protein L4  38.81 
 
 		 204 aa  137  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000392469  hitchhiker  0.00000164794 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1744  50S ribosomal protein L4  36.32 
 
 		 208 aa  136  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000318286  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1708  50S ribosomal protein L4  45.35 
 
 		 218 aa  137  2e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00274066  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2459  50S ribosomal protein L4P  36.04 
 
 		 207 aa  137  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0863955 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3821  50S ribosomal protein L4  40.56 
 
 		 201 aa  136  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000757079  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0628  ribosomal protein L4/L1e  38.73 
 
 		 232 aa  136  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0661  50S ribosomal protein L4  38 
 
 		 210 aa  137  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000586581  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0423  50S ribosomal protein L4  37.56 
 
 		 207 aa  136  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000203712  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1764  50S ribosomal protein L4  36.82 
 
 		 206 aa  136  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00135584  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5048  50S ribosomal protein L4  39.11 
 
 		 218 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.5122  normal  0.277146 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1341  ribosomal protein L4/L1e  47.27 
 
 		 210 aa  136  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10010  LSU ribosomal protein L4P  41.94 
 
 		 207 aa  135  4e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000045126  hitchhiker  0.00000000148432 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16771  50S ribosomal protein L4  43.68 
 
 		 211 aa  135  5e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2710  ribosomal protein L4/L1e  41.92 
 
 		 206 aa  135  6.0000000000000005e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000254915  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0716  ribosomal protein L4/L1e  36.63 
 
 		 223 aa  134  8e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl124  50S ribosomal protein L4  41.38 
 
 		 208 aa  134  8e-31  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000604234  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00446  50S ribosomal protein L4  42.35 
 
 		 201 aa  134  9e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000113118  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0585  50S ribosomal protein L4  40 
 
 		 201 aa  134  9e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000207865  normal  0.110437 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0284  50S ribosomal protein L4  40 
 
 		 201 aa  134  9e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000222015  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3914  50S ribosomal protein L4  40 
 
 		 201 aa  134  9e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  8.05295e-19  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0394  ribosomal protein L4/L1e  39.44 
 
 		 201 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000162947  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3750  50S ribosomal protein L4  39.44 
 
 		 201 aa  134  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000124791  hitchhiker  0.00429034 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0394  50S ribosomal protein L4  39.44 
 
 		 201 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000249214  hitchhiker  0.00337068 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0932  ribosomal protein L4/L1e  39.8 
 
 		 217 aa  134  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4642  50S ribosomal protein L4  39.44 
 
 		 201 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0120541  normal  0.0370586 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3513  50S ribosomal protein L4  39.44 
 
 		 201 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000109628  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0406  50S ribosomal protein L4  40 
 
 		 201 aa  134  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00340494  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23031  50S ribosomal protein L4  46.39 
 
 		 211 aa  134  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>