More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1341 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1341  ribosomal protein L4/L1e  100 
 
 		 210 aa  417  1e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16230  ribosomal protein L4  46.52 
 
 		 207 aa  171  7.999999999999999e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.308573  decreased coverage  0.0000000146284 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0197  50S ribosomal protein L4  44.92 
 
 		 207 aa  169  3e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00203095  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0963  ribosomal protein L4/L1e  48.65 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000403747  hitchhiker  0.0000000000267396 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1830  50S ribosomal protein L4  43.09 
 
 		 207 aa  162  3e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0478396  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2317  50S ribosomal protein L4  43.62 
 
 		 207 aa  162  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000134967  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2276  50S ribosomal protein L4  43.62 
 
 		 207 aa  162  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000009811  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0216  50S ribosomal protein L4  45.74 
 
 		 206 aa  160  9e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320704  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1523  ribosomal protein L4/L1e  45.74 
 
 		 207 aa  159  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.790483  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0287  50S ribosomal protein L4  46.32 
 
 		 206 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0371511  hitchhiker  0.00627174 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0226  ribosomal protein L4/L1e  43.62 
 
 		 207 aa  160  2e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3666  50S ribosomal protein L4  44.15 
 
 		 206 aa  159  3e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000305367  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2401  50S ribosomal protein L4  46.32 
 
 		 208 aa  159  3e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0195  LSU ribosomal protein L4P  40.96 
 
 		 207 aa  158  6e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00135777  normal  0.0747506 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10010  LSU ribosomal protein L4P  44.85 
 
 		 207 aa  157  8e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000045126  hitchhiker  0.00000000148432 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0112  50S ribosomal protein L4  42.55 
 
 		 207 aa  157  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000123482  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1482  50S ribosomal protein L4  42.33 
 
 		 207 aa  155  4e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000984788  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2459  50S ribosomal protein L4P  42.02 
 
 		 207 aa  155  5.0000000000000005e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0863955 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0108  50S ribosomal protein L4  41.49 
 
 		 207 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0868  50S ribosomal protein L4  42.29 
 
 		 206 aa  155  6e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000685593  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1837  ribosomal protein L4/L1e  40.49 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00300997  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1293  50S ribosomal protein L4  44.27 
 
 		 210 aa  151  8e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000205733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0292  50S ribosomal protein L4  42.02 
 
 		 205 aa  150  8.999999999999999e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000472593  unclonable  1.9716100000000001e-28 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01180  ribosomal protein L4/L1e  42.86 
 
 		 209 aa  150  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000715314  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2713  50S ribosomal protein L4  40.43 
 
 		 204 aa  150  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5125  ribosomal protein L4/L1e  41.88 
 
 		 223 aa  149  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3704  50S ribosomal protein L4  45.09 
 
 		 210 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2332  ribosomal protein L4/L1e  42.02 
 
 		 207 aa  149  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000847375  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0702  50S ribosomal protein L4  43.48 
 
 		 206 aa  149  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000569503  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2560  50S ribosomal protein L4/L1e  41.58 
 
 		 210 aa  149  4e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0559575  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2904  50S ribosomal protein L4  42.86 
 
 		 208 aa  149  4e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000879055  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2398  50S ribosomal protein L4  39.89 
 
 		 204 aa  148  5e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000730975  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3011  50S ribosomal protein L4  43.75 
 
 		 212 aa  148  7e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00787083 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0596  50S ribosomal protein L4P  42.02 
 
 		 207 aa  147  8e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000475036  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2645  50S ribosomal protein L4  42.79 
 
 		 222 aa  147  9e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264538  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1347  50S ribosomal protein L4  40.54 
 
 		 206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3142  ribosomal protein L4/L1e  43.46 
 
 		 221 aa  146  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.083105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0857  50S ribosomal protein L4  45.26 
 
 		 205 aa  146  2.0000000000000003e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0692  50S ribosomal protein L4  45.98 
 
 		 210 aa  146  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000477042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0106  50S ribosomal protein L4  40.74 
 
 		 207 aa  145  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000544936  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0132  50S ribosomal protein L4  40.74 
 
 		 207 aa  145  5e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000136863  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5194  50S ribosomal protein L4  40.74 
 
 		 207 aa  145  5e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000834057  unclonable  1.98377e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0111  50S ribosomal protein L4  40.74 
 
 		 207 aa  145  5e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000572324  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0142  50S ribosomal protein L4  40.74 
 
 		 207 aa  145  5e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000690155  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0111  50S ribosomal protein L4  40.74 
 
 		 207 aa  145  5e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000900585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0107  50S ribosomal protein L4  40.74 
 
 		 207 aa  145  5e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.56557e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0105  50S ribosomal protein L4  40.74 
 
 		 207 aa  145  5e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000256275  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0123  50S ribosomal protein L4  40.74 
 
 		 207 aa  145  5e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.21989e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0111  50S ribosomal protein L4  40.74 
 
 		 207 aa  145  5e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000163463  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1183  ribosomal protein L4/L1e  42.33 
 
 		 208 aa  145  6e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000599505  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1906  50S ribosomal protein L4  41.94 
 
 		 207 aa  144  8.000000000000001e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000335339  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2154  50S ribosomal protein L4P  43.98 
 
 		 211 aa  144  9e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0120405  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0059  50S ribosomal protein L4  41.4 
 
 		 207 aa  143  2e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0599605  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2231  50S ribosomal protein L4  44.83 
 
 		 210 aa  143  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.402946 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0423  50S ribosomal protein L4  39.57 
 
 		 207 aa  143  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000203712  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0720  50S ribosomal protein L4  42.33 
 
 		 201 aa  142  4e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000427281  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0563  50S ribosomal protein L4/L1e  42.79 
 
 		 216 aa  142  5e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0256  ribosomal protein L4/L1 family protein  42.47 
 
 		 221 aa  141  6e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1850  50S ribosomal protein L4  42.11 
 
 		 208 aa  141  7e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264817  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0105  50S ribosomal protein L4  39.68 
 
 		 207 aa  141  8e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000104823  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1764  50S ribosomal protein L4  41.41 
 
 		 206 aa  141  8e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00135584  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0427  50S ribosomal protein L4  42.33 
 
 		 200 aa  141  9e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000154423  decreased coverage  0.00000614317 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2773  50S ribosomal protein L4  39.27 
 
 		 206 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0187174  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4506  ribosomal protein L4/L1e  44.56 
 
 		 292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1708  50S ribosomal protein L4  44.83 
 
 		 218 aa  139  3e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00274066  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2063  50S ribosomal protein L4  41.58 
 
 		 208 aa  139  3e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000340203  normal  0.385687 
 
 
-
 
NC_002936  DET0475  50S ribosomal protein L4  37.5 
 
 		 210 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00700158  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20860  LSU ribosomal protein L4P  43.55 
 
 		 223 aa  139  3.9999999999999997e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.699759  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl124  50S ribosomal protein L4  40.76 
 
 		 208 aa  138  4.999999999999999e-32  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000604234  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2856  50S ribosomal protein L4  39.67 
 
 		 207 aa  138  6e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400345  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0452  50S ribosomal protein L4  37.5 
 
 		 210 aa  138  6e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000515236  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0422  50S ribosomal protein L4  48.72 
 
 		 202 aa  138  6e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00655238  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0080  50S ribosomal protein L4  40.31 
 
 		 206 aa  138  7e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.186923 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2064  50S ribosomal protein L4  39.27 
 
 		 206 aa  137  7.999999999999999e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000384651  normal  0.231159 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2323  ribosomal protein L4/L1e  41.18 
 
 		 206 aa  137  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0012561  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0338  50S ribosomal protein L4  40 
 
 		 205 aa  137  1e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000059568  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1573  ribosomal protein L4/L1e  39.89 
 
 		 207 aa  137  1e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000791532  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1087  50S ribosomal protein L4  41.67 
 
 		 215 aa  137  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10489 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0689  ribosomal protein L4/L1e  43.01 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.443511 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0248  50S ribosomal protein L4  46.2 
 
 		 211 aa  136  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.890563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0490  50S ribosomal protein L4  40.74 
 
 		 200 aa  136  2e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000109229  normal  0.0102301 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2256  50S ribosomal protein L4  39.79 
 
 		 206 aa  136  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000129639  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2658  ribosomal protein L4/L1e  43.02 
 
 		 228 aa  136  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2710  ribosomal protein L4/L1e  39.89 
 
 		 206 aa  136  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000254915  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0251  50S ribosomal protein L4  46.2 
 
 		 211 aa  136  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1556  ribosomal protein L4/L1e  39.36 
 
 		 207 aa  136  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427554  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0627  ribosomal protein L4  42.02 
 
 		 200 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000698865  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4547  50S ribosomal protein L4  42.02 
 
 		 200 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0714588  normal  0.0640617 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_418  ribosomal protein L4  36.46 
 
 		 210 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00538527  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0759  50S ribosomal protein L4  38.3 
 
 		 207 aa  135  5e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000566858  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0627  50S ribosomal protein L4  38.07 
 
 		 220 aa  135  5e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000530014  hitchhiker  0.00000000000031805 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0661  50S ribosomal protein L4  42.49 
 
 		 210 aa  135  5e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000586581  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0459  50S ribosomal protein L4  42.55 
 
 		 205 aa  135  5e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2422  50S ribosomal protein L4  39.47 
 
 		 208 aa  135  5e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00578828  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1853  50S ribosomal protein L4  39.46 
 
 		 206 aa  135  6.0000000000000005e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000203721  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3994  ribosomal protein L4/L1e  43.52 
 
 		 212 aa  134  7.000000000000001e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2228  50S ribosomal protein L4  41.05 
 
 		 208 aa  134  9e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169782  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1306  50S ribosomal protein L4  44.92 
 
 		 219 aa  134  9e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.265076  normal  0.163333 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0934  50S ribosomal protein L4  37.56 
 
 		 207 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000521211  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0290  50S ribosomal protein L4  42.11 
 
 		 212 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>