More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0692 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_0692  50S ribosomal protein L4  100 
 
 		 210 aa  427  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000477042  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2560  50S ribosomal protein L4/L1e  86.19 
 
 		 210 aa  370  1e-102  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0559575  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0248  50S ribosomal protein L4  74.64 
 
 		 211 aa  330  1e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.890563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0251  50S ribosomal protein L4  74.64 
 
 		 211 aa  330  1e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3704  50S ribosomal protein L4  71.77 
 
 		 210 aa  312  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1293  50S ribosomal protein L4  71.43 
 
 		 210 aa  311  4.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000205733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3011  50S ribosomal protein L4  70.19 
 
 		 212 aa  309  2e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00787083 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2231  50S ribosomal protein L4  68.57 
 
 		 210 aa  308  4e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.402946 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23031  50S ribosomal protein L4  60.1 
 
 		 211 aa  270  1e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16771  50S ribosomal protein L4  59.62 
 
 		 211 aa  266  1e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0375  50S ribosomal protein L4  59.62 
 
 		 211 aa  264  8.999999999999999e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17391  50S ribosomal protein L4  59.5 
 
 		 210 aa  255  4e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1956  50S ribosomal protein L4  56.25 
 
 		 211 aa  254  5e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20021  50S ribosomal protein L4  56.25 
 
 		 212 aa  251  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1649  50S ribosomal protein L4  59.5 
 
 		 210 aa  251  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17641  50S ribosomal protein L4  58.5 
 
 		 210 aa  251  6e-66  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1128  50S ribosomal protein L4  56.25 
 
 		 211 aa  250  9.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17481  50S ribosomal protein L4  58 
 
 		 210 aa  249  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.533381  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40690  Plastid ribosomal protein L4 large ribosomal subunit  48.5 
 
 		 251 aa  191  5e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0108  50S ribosomal protein L4  45.93 
 
 		 207 aa  191  6e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0216  50S ribosomal protein L4  49.28 
 
 		 206 aa  190  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320704  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2459  50S ribosomal protein L4P  46.89 
 
 		 207 aa  189  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0863955 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0868  50S ribosomal protein L4  46.67 
 
 		 206 aa  189  4e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000685593  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3666  50S ribosomal protein L4  46.15 
 
 		 206 aa  187  7e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000305367  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0106  50S ribosomal protein L4  45.93 
 
 		 207 aa  186  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000544936  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2713  50S ribosomal protein L4  45.77 
 
 		 204 aa  186  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0423  50S ribosomal protein L4  48.53 
 
 		 207 aa  186  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000203712  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2398  50S ribosomal protein L4  45.77 
 
 		 204 aa  186  3e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000730975  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0142  50S ribosomal protein L4  45.45 
 
 		 207 aa  185  5e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000690155  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0111  50S ribosomal protein L4  45.45 
 
 		 207 aa  185  5e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000572324  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0111  50S ribosomal protein L4  45.45 
 
 		 207 aa  185  5e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000900585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0107  50S ribosomal protein L4  45.45 
 
 		 207 aa  185  5e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.56557e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0105  50S ribosomal protein L4  45.45 
 
 		 207 aa  185  5e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000256275  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5194  50S ribosomal protein L4  45.45 
 
 		 207 aa  185  5e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000834057  unclonable  1.98377e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0111  50S ribosomal protein L4  45.45 
 
 		 207 aa  185  5e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000163463  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0123  50S ribosomal protein L4  45.45 
 
 		 207 aa  185  5e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.21989e-61 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0132  50S ribosomal protein L4  45.45 
 
 		 207 aa  185  5e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000136863  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0105  50S ribosomal protein L4  45.45 
 
 		 207 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000104823  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1523  ribosomal protein L4/L1e  45.93 
 
 		 207 aa  181  9.000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.790483  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0112  50S ribosomal protein L4  43.06 
 
 		 207 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000123482  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0287  50S ribosomal protein L4  45.59 
 
 		 206 aa  178  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0371511  hitchhiker  0.00627174 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0226  ribosomal protein L4/L1e  44.44 
 
 		 207 aa  177  8e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2710  ribosomal protein L4/L1e  46.19 
 
 		 206 aa  177  9e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000254915  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1744  50S ribosomal protein L4  42.86 
 
 		 208 aa  176  3e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000318286  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1183  ribosomal protein L4/L1e  47.32 
 
 		 208 aa  176  3e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000599505  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0789  50S ribosomal protein L4  44.59 
 
 		 221 aa  175  5e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01180  ribosomal protein L4/L1e  47.24 
 
 		 209 aa  173  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000715314  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0195  LSU ribosomal protein L4P  42.38 
 
 		 207 aa  172  2.9999999999999996e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00135777  normal  0.0747506 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0716  ribosomal protein L4/L1e  45.81 
 
 		 223 aa  169  4e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0193  ribosomal protein L4/L1e  46.15 
 
 		 214 aa  169  4e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1573  ribosomal protein L4/L1e  44.33 
 
 		 207 aa  168  6e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000791532  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16230  ribosomal protein L4  42.65 
 
 		 207 aa  165  4e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.308573  decreased coverage  0.0000000146284 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2904  50S ribosomal protein L4  42.86 
 
 		 208 aa  165  5e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000879055  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0759  50S ribosomal protein L4  41.87 
 
 		 207 aa  164  8e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000566858  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0961  50S ribosomal protein L4  48.31 
 
 		 204 aa  164  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000392469  hitchhiker  0.00000164794 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2332  ribosomal protein L4/L1e  43.54 
 
 		 207 aa  164  1.0000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000847375  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0954  50S ribosomal protein L4  44.44 
 
 		 221 aa  160  9e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000111144  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1830  50S ribosomal protein L4  47.19 
 
 		 207 aa  160  1e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0478396  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0197  50S ribosomal protein L4  44.32 
 
 		 207 aa  160  1e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00203095  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0292  50S ribosomal protein L4  44.69 
 
 		 205 aa  160  2e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000472593  unclonable  1.9716100000000001e-28 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2064  50S ribosomal protein L4  40.91 
 
 		 206 aa  158  5e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000384651  normal  0.231159 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0695  50S ribosomal protein L4  44.69 
 
 		 208 aa  157  7e-38  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0596  50S ribosomal protein L4P  43.82 
 
 		 207 aa  158  7e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000475036  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl124  50S ribosomal protein L4  42.45 
 
 		 208 aa  157  9e-38  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000604234  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0059  50S ribosomal protein L4  44.69 
 
 		 207 aa  156  3e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0599605  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0485  50S ribosomal protein L4  47.46 
 
 		 200 aa  155  3e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000238586  normal  0.0299035 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1556  ribosomal protein L4/L1e  41.71 
 
 		 207 aa  155  3e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427554  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0490  50S ribosomal protein L4  46.89 
 
 		 200 aa  155  4e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000109229  normal  0.0102301 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1764  50S ribosomal protein L4  43.35 
 
 		 206 aa  154  7e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00135584  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0838  50S ribosomal protein L4  44.94 
 
 		 200 aa  154  8e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33315  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08860  50S ribosomal protein L4  44.94 
 
 		 200 aa  154  8e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00776029  normal  0.0237616 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0080  50S ribosomal protein L4  47.64 
 
 		 206 aa  154  9e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.186923 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0225  ribosomal protein L4/L1e  45.18 
 
 		 210 aa  154  9e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2317  50S ribosomal protein L4  45.51 
 
 		 207 aa  154  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000134967  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2276  50S ribosomal protein L4  45.51 
 
 		 207 aa  154  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000009811  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2401  50S ribosomal protein L4  41.29 
 
 		 208 aa  154  1e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10010  LSU ribosomal protein L4P  41.15 
 
 		 207 aa  152  2e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000045126  hitchhiker  0.00000000148432 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4916  ribosomal protein L4/L1e  41.83 
 
 		 209 aa  153  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.1186  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0627  ribosomal protein L4  43.26 
 
 		 200 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000698865  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4547  50S ribosomal protein L4  43.26 
 
 		 200 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0714588  normal  0.0640617 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2256  50S ribosomal protein L4  43.54 
 
 		 206 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000129639  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1906  50S ribosomal protein L4  43.58 
 
 		 207 aa  152  4e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000335339  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00446  50S ribosomal protein L4  44.07 
 
 		 201 aa  151  5e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000113118  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0370  50S ribosomal protein L4  44.07 
 
 		 201 aa  151  5.9999999999999996e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1137  50S ribosomal protein L4  41.7 
 
 		 223 aa  151  7e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000824266  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0395  50S ribosomal protein L4  44.07 
 
 		 201 aa  151  8e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05720  50S ribosomal protein L4  39.13 
 
 		 208 aa  150  8.999999999999999e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.316206  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3994  ribosomal protein L4/L1e  48.35 
 
 		 212 aa  150  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1837  ribosomal protein L4/L1e  40.38 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00300997  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5078  50S ribosomal protein L4  41.57 
 
 		 200 aa  149  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000647229  normal  0.290105 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0321  50S ribosomal protein L4  42.31 
 
 		 200 aa  150  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0789186  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0603  ribosomal protein L4/L1e  38.57 
 
 		 209 aa  150  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3821  50S ribosomal protein L4  45.51 
 
 		 201 aa  150  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000757079  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0963  ribosomal protein L4/L1e  40.69 
 
 		 207 aa  149  2e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000403747  hitchhiker  0.0000000000267396 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1482  50S ribosomal protein L4  41.24 
 
 		 207 aa  149  4e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000984788  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0394  ribosomal protein L4/L1e  44.94 
 
 		 201 aa  148  5e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000162947  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03121  hypothetical protein  44.94 
 
 		 201 aa  148  5e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000877437  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3802  50S ribosomal protein L4  44.94 
 
 		 201 aa  148  5e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166287  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3704  50S ribosomal protein L4  44.94 
 
 		 201 aa  148  5e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112699  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3635  50S ribosomal protein L4  44.94 
 
 		 201 aa  148  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871014  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>