More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl0370 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl0370  50S ribosomal protein L4  100 
 
 
201 aa  417  1e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0395  50S ribosomal protein L4  99 
 
 
201 aa  414  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0470  50S ribosomal protein L4  57.5 
 
 
201 aa  244  4.9999999999999997e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000163865  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0961  50S ribosomal protein L4  59.39 
 
 
204 aa  244  6e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000392469  hitchhiker  0.00000164794 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0720  50S ribosomal protein L4  57.5 
 
 
201 aa  239  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000427281  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00731  50S ribosomal protein L4  57.67 
 
 
200 aa  236  1e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0185  50S ribosomal protein L4  55 
 
 
201 aa  235  3e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000178875  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001741  LSU ribosomal protein L4p (L1e)  57.14 
 
 
200 aa  235  4e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000116803  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2173  50S ribosomal protein L4  56.61 
 
 
200 aa  234  9e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000174601  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0321  50S ribosomal protein L4  56.54 
 
 
200 aa  232  3e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0789186  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0159  50S ribosomal protein L4  54 
 
 
201 aa  232  3e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000107057  decreased coverage  0.0000448668 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3523  50S ribosomal protein L4  54 
 
 
201 aa  232  3e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.0000000876425  hitchhiker  0.00000726358 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00446  50S ribosomal protein L4  54.5 
 
 
201 aa  231  6e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000113118  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4275  50S ribosomal protein L4  52.5 
 
 
201 aa  229  2e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000159231  unclonable  0.00000000000448849 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3821  50S ribosomal protein L4  53 
 
 
201 aa  229  2e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000757079  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4689  50S ribosomal protein L4  53.5 
 
 
201 aa  229  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000512006  unclonable  0.0000000221603 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4316  50S ribosomal protein L4  53.5 
 
 
201 aa  229  2e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000585754  unclonable  0.0000000000669948 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0872  50S ribosomal protein L4  53.81 
 
 
201 aa  228  3e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.299152  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5078  50S ribosomal protein L4  53.5 
 
 
200 aa  228  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000647229  normal  0.290105 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0455  50S ribosomal protein L4  54 
 
 
200 aa  228  4e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.035261  unclonable  0.000000191468 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0838  50S ribosomal protein L4  55.38 
 
 
200 aa  228  4e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33315  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4748  50S ribosomal protein L4  54 
 
 
200 aa  228  4e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000074471  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0406  50S ribosomal protein L4  53 
 
 
201 aa  228  4e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00340494  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0485  50S ribosomal protein L4  54 
 
 
200 aa  228  4e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00632251  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08860  50S ribosomal protein L4  55.38 
 
 
200 aa  228  4e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00776029  normal  0.0237616 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0324  50S ribosomal protein L4  53 
 
 
201 aa  228  4e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000187067  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0488  50S ribosomal protein L4  54 
 
 
200 aa  228  4e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000114619  normal  0.070368 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0232  50S ribosomal protein L4  53.5 
 
 
201 aa  228  5e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0200  50S ribosomal protein L4  53.5 
 
 
201 aa  228  5e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000634413  hitchhiker  0.00000000166621 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03170  50S ribosomal protein L4  53 
 
 
201 aa  227  7e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000977912  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0394  ribosomal protein L4/L1e  53 
 
 
201 aa  227  7e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000162947  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3802  50S ribosomal protein L4  53 
 
 
201 aa  227  7e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166287  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3704  50S ribosomal protein L4  53 
 
 
201 aa  227  7e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112699  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3614  50S ribosomal protein L4  53 
 
 
201 aa  227  7e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000161283  hitchhiker  0.00352553 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03121  hypothetical protein  53 
 
 
201 aa  227  7e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000877437  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3708  50S ribosomal protein L4  53 
 
 
201 aa  227  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00180602  normal  0.838559 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4642  50S ribosomal protein L4  53 
 
 
201 aa  227  7e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0120541  normal  0.0370586 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3635  50S ribosomal protein L4  53 
 
 
201 aa  227  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00226471  normal  0.236826 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3743  50S ribosomal protein L4  53 
 
 
201 aa  227  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.521499  normal  0.0176443 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3635  50S ribosomal protein L4  53 
 
 
201 aa  227  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871014  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3513  50S ribosomal protein L4  53 
 
 
201 aa  227  7e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000109628  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3750  50S ribosomal protein L4  53 
 
 
201 aa  227  7e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000124791  hitchhiker  0.00429034 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0394  50S ribosomal protein L4  53 
 
 
201 aa  227  7e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000249214  hitchhiker  0.00337068 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3806  50S ribosomal protein L4  53 
 
 
201 aa  227  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000172532  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0201  50S ribosomal protein L4  53 
 
 
201 aa  227  8e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000483773  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4055  50S ribosomal protein L4  53 
 
 
201 aa  227  8e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000789198  unclonable  0.00000000000665609 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4169  50S ribosomal protein L4  53 
 
 
201 aa  227  8e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170676  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3758  50S ribosomal protein L4  53 
 
 
201 aa  227  8e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000815073  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0197  50S ribosomal protein L4  53 
 
 
201 aa  227  8e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000174855  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0171  50S ribosomal protein L4  53 
 
 
201 aa  227  8e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000251  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0200  50S ribosomal protein L4  53 
 
 
201 aa  227  9e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000425276  unclonable  0.0000000000211023 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0195  50S ribosomal protein L4  53 
 
 
201 aa  227  9e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00202265  decreased coverage  0.000317476 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4543  50S ribosomal protein L4  52 
 
 
201 aa  227  9e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000261898  hitchhiker  0.00202926 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0585  50S ribosomal protein L4  52 
 
 
201 aa  226  1e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000207865  normal  0.110437 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4000  50S ribosomal protein L4  52.5 
 
 
201 aa  227  1e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000185721  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3914  50S ribosomal protein L4  52 
 
 
201 aa  226  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  8.05295e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0060  50S ribosomal protein L4  53.5 
 
 
200 aa  226  1e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000107913  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0149  50S ribosomal protein L4  53 
 
 
201 aa  226  1e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000510494  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0284  50S ribosomal protein L4  52 
 
 
201 aa  226  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000222015  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0214  50S ribosomal protein L4  53.5 
 
 
201 aa  226  2e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000322212  unclonable  0.00000755245 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0627  ribosomal protein L4  53 
 
 
200 aa  224  4e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000698865  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4547  50S ribosomal protein L4  53 
 
 
200 aa  224  4e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0714588  normal  0.0640617 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2323  ribosomal protein L4/L1e  54 
 
 
201 aa  222  3e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00000658885  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3908  50S ribosomal protein L4  53.33 
 
 
200 aa  221  7e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0610127  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0296  ribosomal protein L4/L1e  50.5 
 
 
206 aa  218  3.9999999999999997e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000410441  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06260  50S ribosomal protein L4  51.79 
 
 
200 aa  215  4e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00260309  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0857  50S ribosomal protein L4  50 
 
 
205 aa  211  3.9999999999999995e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2168  ribosomal protein L4/L1e  50 
 
 
201 aa  210  1e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00358872  normal  0.2798 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0485  50S ribosomal protein L4  48 
 
 
200 aa  210  1e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000238586  normal  0.0299035 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0490  50S ribosomal protein L4  47.5 
 
 
200 aa  209  3e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000109229  normal  0.0102301 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0422  50S ribosomal protein L4  53.44 
 
 
202 aa  209  3e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00655238  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0329  ribosomal protein L4  51.5 
 
 
201 aa  207  1e-52  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0324  ribosomal protein L4/L1e  49.5 
 
 
202 aa  206  3e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000330589  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0338  50S ribosomal protein L4  48.02 
 
 
205 aa  203  1e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000059568  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0459  50S ribosomal protein L4  48.7 
 
 
205 aa  203  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1853  50S ribosomal protein L4  47.52 
 
 
206 aa  201  7e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000203721  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0427  50S ribosomal protein L4  46 
 
 
200 aa  198  3.9999999999999996e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000154423  decreased coverage  0.00000614317 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0054  50S ribosomal protein L4  51.31 
 
 
206 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000793849  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0051  50S ribosomal protein L4  52.15 
 
 
206 aa  195  4.0000000000000005e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.000000000000062417  hitchhiker  3.36643e-25 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2371  50S ribosomal protein L4  49.74 
 
 
205 aa  192  2e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.456645  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2323  ribosomal protein L4/L1e  48.4 
 
 
206 aa  187  7e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0012561  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3316  50S ribosomal protein L4  50.54 
 
 
206 aa  185  5e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000298046  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3178  50S ribosomal protein L4  50.54 
 
 
206 aa  184  7e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000016876  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3794  50S ribosomal protein L4  47.37 
 
 
206 aa  184  8e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020741  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0320  50S ribosomal protein L4  47.06 
 
 
207 aa  182  3e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.18695e-20  hitchhiker  0.00000667461 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2949  50S ribosomal protein L4  49.46 
 
 
206 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0000339858  decreased coverage  0.000000135415 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3296  50S ribosomal protein L4  49.46 
 
 
206 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.00000000157529  hitchhiker  0.0000757839 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3018  50S ribosomal protein L4  49.46 
 
 
206 aa  181  5.0000000000000004e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000207388  decreased coverage  0.000710925 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0768  50S ribosomal protein L4  43.9 
 
 
206 aa  179  2e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.294909  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3337  50S ribosomal protein L4  46.11 
 
 
206 aa  179  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000000330441  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4912  50S ribosomal protein L4  46.35 
 
 
206 aa  179  4e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000142333  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3448  50S ribosomal protein L4  50.54 
 
 
206 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.00000000000741082  normal  0.0132127 
 
 
 
NC_010508  Bcenmc03_0328  50S ribosomal protein L4  50.54 
 
 
206 aa  177  8e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000930223  normal  0.0206029 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0277  50S ribosomal protein L4  50.54 
 
 
206 aa  177  8e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.00000000000696788  normal  0.0754371 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2758  50S ribosomal protein L4  50.54 
 
 
206 aa  177  8e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00000017353  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0268  50S ribosomal protein L4  50.54 
 
 
206 aa  177  8e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000119907  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0349  50S ribosomal protein L4  50.54 
 
 
206 aa  177  8e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000000688148  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0406  50S ribosomal protein L4  43.41 
 
 
205 aa  177  9e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159199  normal  0.149553 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2839  50S ribosomal protein L4  48.37 
 
 
206 aa  177  9e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000000169968  normal  0.198819 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0257  50S ribosomal protein L4  45.83 
 
 
206 aa  177  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000112537  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>