More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1183 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_1183  ribosomal protein L4/L1e  100 
 
 		 208 aa  424  1e-118  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000599505  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0868  50S ribosomal protein L4  53.14 
 
 		 206 aa  234  8e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000685593  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0226  ribosomal protein L4/L1e  55.83 
 
 		 207 aa  232  3e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0112  50S ribosomal protein L4  51.69 
 
 		 207 aa  222  3e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000123482  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0108  50S ribosomal protein L4  51.69 
 
 		 207 aa  222  3e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0759  50S ribosomal protein L4  50.72 
 
 		 207 aa  221  6e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000566858  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0216  50S ribosomal protein L4  53.62 
 
 		 206 aa  218  5e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320704  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0287  50S ribosomal protein L4  53.88 
 
 		 206 aa  217  8.999999999999998e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0371511  hitchhiker  0.00627174 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0105  50S ribosomal protein L4  52.17 
 
 		 207 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000104823  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0142  50S ribosomal protein L4  51.21 
 
 		 207 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000690155  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0111  50S ribosomal protein L4  51.21 
 
 		 207 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000572324  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0106  50S ribosomal protein L4  51.21 
 
 		 207 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000544936  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0111  50S ribosomal protein L4  51.21 
 
 		 207 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000900585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0107  50S ribosomal protein L4  51.21 
 
 		 207 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.56557e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0105  50S ribosomal protein L4  51.21 
 
 		 207 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000256275  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2904  50S ribosomal protein L4  50.48 
 
 		 208 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000879055  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0111  50S ribosomal protein L4  51.21 
 
 		 207 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000163463  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5194  50S ribosomal protein L4  51.21 
 
 		 207 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000834057  unclonable  1.98377e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0123  50S ribosomal protein L4  51.21 
 
 		 207 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.21989e-61 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0132  50S ribosomal protein L4  51.21 
 
 		 207 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000136863  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2710  ribosomal protein L4/L1e  53.4 
 
 		 206 aa  211  3.9999999999999995e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000254915  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2459  50S ribosomal protein L4P  50 
 
 		 207 aa  211  5.999999999999999e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0863955 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2332  ribosomal protein L4/L1e  49.28 
 
 		 207 aa  211  7e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000847375  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0195  LSU ribosomal protein L4P  49.03 
 
 		 207 aa  211  7.999999999999999e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00135777  normal  0.0747506 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2713  50S ribosomal protein L4  51.21 
 
 		 204 aa  211  7.999999999999999e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2398  50S ribosomal protein L4  51.21 
 
 		 204 aa  211  9e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000730975  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0716  ribosomal protein L4/L1e  49.01 
 
 		 223 aa  210  1e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1523  ribosomal protein L4/L1e  53.14 
 
 		 207 aa  210  1e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.790483  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0423  50S ribosomal protein L4  52.43 
 
 		 207 aa  209  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000203712  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1556  ribosomal protein L4/L1e  49.28 
 
 		 207 aa  207  6e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427554  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1744  50S ribosomal protein L4  48.08 
 
 		 208 aa  206  2e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000318286  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01180  ribosomal protein L4/L1e  49.28 
 
 		 209 aa  204  8e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000715314  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0954  50S ribosomal protein L4  48.42 
 
 		 221 aa  201  7e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000111144  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2317  50S ribosomal protein L4  47.83 
 
 		 207 aa  199  3e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000134967  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2276  50S ribosomal protein L4  47.83 
 
 		 207 aa  199  3e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000009811  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2064  50S ribosomal protein L4  48.31 
 
 		 206 aa  197  9e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000384651  normal  0.231159 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1573  ribosomal protein L4/L1e  47.57 
 
 		 207 aa  196  3e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000791532  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3666  50S ribosomal protein L4  46.86 
 
 		 206 aa  195  4.0000000000000005e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000305367  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0193  ribosomal protein L4/L1e  48.33 
 
 		 214 aa  191  6e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0695  50S ribosomal protein L4  43.48 
 
 		 208 aa  187  1e-46  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1830  50S ribosomal protein L4  47.47 
 
 		 207 aa  186  2e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0478396  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2019  50S ribosomal protein L4  46.31 
 
 		 206 aa  186  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0248  50S ribosomal protein L4  46.8 
 
 		 211 aa  185  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.890563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0251  50S ribosomal protein L4  46.8 
 
 		 211 aa  185  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl124  50S ribosomal protein L4  44.66 
 
 		 208 aa  185  4e-46  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000604234  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4916  ribosomal protein L4/L1e  45.37 
 
 		 209 aa  185  4e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.1186  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3704  50S ribosomal protein L4  49.02 
 
 		 210 aa  184  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16230  ribosomal protein L4  45.15 
 
 		 207 aa  184  9e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.308573  decreased coverage  0.0000000146284 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0963  ribosomal protein L4/L1e  45.15 
 
 		 207 aa  183  1.0000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000403747  hitchhiker  0.0000000000267396 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2560  50S ribosomal protein L4/L1e  47.06 
 
 		 210 aa  183  2.0000000000000003e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0559575  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0059  50S ribosomal protein L4  44.93 
 
 		 207 aa  182  3e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0599605  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1137  50S ribosomal protein L4  43.05 
 
 		 223 aa  182  3e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000824266  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0596  50S ribosomal protein L4P  41.06 
 
 		 207 aa  182  4.0000000000000006e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000475036  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4025  ribosomal protein L4/L1e  47.18 
 
 		 221 aa  181  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000717748 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1184  ribosomal protein L4/L1e  46.88 
 
 		 223 aa  180  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0789  50S ribosomal protein L4  40.72 
 
 		 221 aa  180  2e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1393  50S ribosomal protein L4  46.02 
 
 		 235 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000162338  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1293  50S ribosomal protein L4  46.02 
 
 		 235 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000803665  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1945  50S ribosomal protein L4  45.32 
 
 		 206 aa  178  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0848  50S ribosomal protein L4P  43.59 
 
 		 207 aa  178  4e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000392239  decreased coverage  0.0000122182 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1934  50S ribosomal protein L4  45.81 
 
 		 206 aa  178  4e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1912  50S ribosomal protein L4  44.83 
 
 		 206 aa  178  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.224726 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0563  50S ribosomal protein L4/L1e  46.31 
 
 		 216 aa  177  7e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1906  50S ribosomal protein L4  43.96 
 
 		 207 aa  177  7e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000335339  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2231  50S ribosomal protein L4  44.12 
 
 		 210 aa  177  8e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.402946 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3434  ribosomal protein L4/L1e  46.6 
 
 		 217 aa  177  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2773  50S ribosomal protein L4  43.63 
 
 		 206 aa  176  2e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0187174  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1347  50S ribosomal protein L4  42.36 
 
 		 206 aa  176  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2422  50S ribosomal protein L4  47.57 
 
 		 208 aa  176  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00578828  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3142  ribosomal protein L4/L1e  45.23 
 
 		 221 aa  176  3e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.083105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0692  50S ribosomal protein L4  47.32 
 
 		 210 aa  176  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000477042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0982  ribosomal protein L4/L1e  44.44 
 
 		 209 aa  176  3e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.532922  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10716  50S ribosomal protein L4  47.89 
 
 		 223 aa  175  4e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.311364 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03990  LSU ribosomal protein L4P  50 
 
 		 228 aa  175  4e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0857  50S ribosomal protein L4  43.28 
 
 		 205 aa  174  7e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3994  ribosomal protein L4/L1e  46.7 
 
 		 212 aa  174  9e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1124  ribosomal protein L4/L1e  45.81 
 
 		 248 aa  173  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3023  ribosomal protein L4/L1e  45.1 
 
 		 222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443321  normal  0.0189884 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5048  50S ribosomal protein L4  47.89 
 
 		 218 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.5122  normal  0.277146 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1293  50S ribosomal protein L4  46.57 
 
 		 210 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000205733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_418  ribosomal protein L4  42.79 
 
 		 210 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00538527  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0603  ribosomal protein L4/L1e  43.48 
 
 		 209 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0702  50S ribosomal protein L4  43.96 
 
 		 206 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000569503  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1041  50S ribosomal protein L4  46.32 
 
 		 219 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1014  50S ribosomal protein L4  46.32 
 
 		 219 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1031  50S ribosomal protein L4  46.32 
 
 		 219 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.658773 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4344  50S ribosomal protein L4  47.24 
 
 		 209 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000409516  normal  0.126717 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4506  ribosomal protein L4/L1e  48.42 
 
 		 292 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0475  50S ribosomal protein L4  42.29 
 
 		 210 aa  171  5e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00700158  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0459  50S ribosomal protein L4  44.16 
 
 		 205 aa  171  5e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0452  50S ribosomal protein L4  41.79 
 
 		 210 aa  171  6.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000515236  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0290  ribosomal protein L4/L1e  45.73 
 
 		 208 aa  171  7.999999999999999e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00437959  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10010  LSU ribosomal protein L4P  45.63 
 
 		 207 aa  171  7.999999999999999e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000045126  hitchhiker  0.00000000148432 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1306  50S ribosomal protein L4  46.32 
 
 		 219 aa  171  7.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.265076  normal  0.163333 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0681  50S ribosomal protein L4  39.42 
 
 		 207 aa  171  9e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.486374  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3922  ribosomal protein L4/L1e  45.19 
 
 		 216 aa  171  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1087  50S ribosomal protein L4  44.33 
 
 		 215 aa  169  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10489 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0307  50S ribosomal protein L4P  49.23 
 
 		 220 aa  169  2e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00224676 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1764  50S ribosomal protein L4  45.59 
 
 		 206 aa  169  3e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00135584  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0292  50S ribosomal protein L4  39.81 
 
 		 205 aa  168  7e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000472593  unclonable  1.9716100000000001e-28 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>