More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1523 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1523  ribosomal protein L4/L1e  100 
 
 
207 aa  410  1e-114  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.790483  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0226  ribosomal protein L4/L1e  61.84 
 
 
207 aa  254  8e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0216  50S ribosomal protein L4  60.39 
 
 
206 aa  253  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320704  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0868  50S ribosomal protein L4  60 
 
 
206 aa  248  3e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000685593  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0287  50S ribosomal protein L4  58.25 
 
 
206 aa  242  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0371511  hitchhiker  0.00627174 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2459  50S ribosomal protein L4P  55.56 
 
 
207 aa  243  1.9999999999999999e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0863955 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2904  50S ribosomal protein L4  55.83 
 
 
208 aa  237  6.999999999999999e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000879055  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0111  50S ribosomal protein L4  56.52 
 
 
207 aa  233  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000572324  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0111  50S ribosomal protein L4  56.52 
 
 
207 aa  233  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000900585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0107  50S ribosomal protein L4  56.52 
 
 
207 aa  233  1.0000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.56557e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0105  50S ribosomal protein L4  56.52 
 
 
207 aa  233  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000256275  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0142  50S ribosomal protein L4  56.52 
 
 
207 aa  233  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000690155  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0111  50S ribosomal protein L4  56.52 
 
 
207 aa  233  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000163463  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0106  50S ribosomal protein L4  56.52 
 
 
207 aa  233  1.0000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000544936  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0112  50S ribosomal protein L4  55.07 
 
 
207 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000123482  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0123  50S ribosomal protein L4  56.52 
 
 
207 aa  233  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.21989e-61 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5194  50S ribosomal protein L4  56.52 
 
 
207 aa  233  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000834057  unclonable  1.98377e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0132  50S ribosomal protein L4  56.52 
 
 
207 aa  233  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000136863  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0105  50S ribosomal protein L4  56.04 
 
 
207 aa  231  6e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000104823  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2332  ribosomal protein L4/L1e  55.07 
 
 
207 aa  231  7.000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000847375  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0108  50S ribosomal protein L4  54.59 
 
 
207 aa  231  8.000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2713  50S ribosomal protein L4  53.66 
 
 
204 aa  230  1e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2398  50S ribosomal protein L4  53.66 
 
 
204 aa  230  1e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000730975  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0195  LSU ribosomal protein L4P  52.91 
 
 
207 aa  228  5e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00135777  normal  0.0747506 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0423  50S ribosomal protein L4  53.62 
 
 
207 aa  225  3e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000203712  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0759  50S ribosomal protein L4  52.2 
 
 
207 aa  222  3e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000566858  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1744  50S ribosomal protein L4  51.94 
 
 
208 aa  219  3e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000318286  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2710  ribosomal protein L4/L1e  53.14 
 
 
206 aa  213  1.9999999999999998e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000254915  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0292  50S ribosomal protein L4  50.24 
 
 
205 aa  211  4.9999999999999996e-54  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000472593  unclonable  1.9716100000000001e-28 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1573  ribosomal protein L4/L1e  52.43 
 
 
207 aa  211  9e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000791532  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1183  ribosomal protein L4/L1e  53.14 
 
 
208 aa  210  1e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000599505  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01180  ribosomal protein L4/L1e  53.37 
 
 
209 aa  205  3e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000715314  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0596  50S ribosomal protein L4P  48.79 
 
 
207 aa  202  2e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000475036  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1556  ribosomal protein L4/L1e  49.76 
 
 
207 aa  202  4e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427554  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3666  50S ribosomal protein L4  45.37 
 
 
206 aa  200  9e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000305367  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0789  50S ribosomal protein L4  47.51 
 
 
221 aa  200  9.999999999999999e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0982  ribosomal protein L4/L1e  49.76 
 
 
209 aa  195  3e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.532922  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1906  50S ribosomal protein L4  46.38 
 
 
207 aa  195  4.0000000000000005e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000335339  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0193  ribosomal protein L4/L1e  52.17 
 
 
214 aa  195  5.000000000000001e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0059  50S ribosomal protein L4  46.38 
 
 
207 aa  194  6e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0599605  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2401  50S ribosomal protein L4  46.63 
 
 
208 aa  194  7e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2317  50S ribosomal protein L4  48.31 
 
 
207 aa  193  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000134967  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2231  50S ribosomal protein L4  47.39 
 
 
210 aa  194  1e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.402946 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2276  50S ribosomal protein L4  48.31 
 
 
207 aa  193  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000009811  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0716  ribosomal protein L4/L1e  48.51 
 
 
223 aa  194  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0954  50S ribosomal protein L4  47.96 
 
 
221 aa  194  1e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000111144  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1830  50S ribosomal protein L4  47.83 
 
 
207 aa  192  4e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0478396  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1482  50S ribosomal protein L4  44.44 
 
 
207 aa  189  2e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000984788  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4916  ribosomal protein L4/L1e  48.31 
 
 
209 aa  186  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.1186  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2560  50S ribosomal protein L4/L1e  47.85 
 
 
210 aa  186  2e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0559575  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1137  50S ribosomal protein L4  46.15 
 
 
223 aa  186  3e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000824266  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3011  50S ribosomal protein L4  45.5 
 
 
212 aa  185  3e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00787083 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3704  50S ribosomal protein L4  47.85 
 
 
210 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0475  50S ribosomal protein L4  45.05 
 
 
210 aa  182  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00700158  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10010  LSU ribosomal protein L4P  49.03 
 
 
207 aa  182  3e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000045126  hitchhiker  0.00000000148432 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_418  ribosomal protein L4  45.05 
 
 
210 aa  182  3e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00538527  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0452  50S ribosomal protein L4  45.05 
 
 
210 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000515236  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1293  50S ribosomal protein L4  47.35 
 
 
235 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000803665  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1393  50S ribosomal protein L4  47.35 
 
 
235 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000162338  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16230  ribosomal protein L4  46.12 
 
 
207 aa  181  7e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.308573  decreased coverage  0.0000000146284 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0692  50S ribosomal protein L4  45.93 
 
 
210 aa  181  9.000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000477042  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1293  50S ribosomal protein L4  46.45 
 
 
210 aa  180  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000205733  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0251  50S ribosomal protein L4  45.93 
 
 
211 aa  180  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0248  50S ribosomal protein L4  45.93 
 
 
211 aa  180  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.890563  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0963  ribosomal protein L4/L1e  46.86 
 
 
207 aa  179  2e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000403747  hitchhiker  0.0000000000267396 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2064  50S ribosomal protein L4  43.48 
 
 
206 aa  178  4.999999999999999e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000384651  normal  0.231159 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0197  50S ribosomal protein L4  43.48 
 
 
207 aa  177  9e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00203095  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2019  50S ribosomal protein L4  44.29 
 
 
206 aa  176  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0080  50S ribosomal protein L4  44.83 
 
 
206 aa  175  4e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.186923 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2422  50S ribosomal protein L4  42.65 
 
 
208 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00578828  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0695  50S ribosomal protein L4  43.9 
 
 
208 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2773  50S ribosomal protein L4  41.26 
 
 
206 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0187174  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1417  ribosomal protein L4/L1e  42.93 
 
 
211 aa  172  3.9999999999999995e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.977567  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3994  ribosomal protein L4/L1e  47.17 
 
 
212 aa  171  6.999999999999999e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0689  ribosomal protein L4/L1e  47.31 
 
 
234 aa  169  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.443511 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1306  50S ribosomal protein L4  47.12 
 
 
219 aa  170  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.265076  normal  0.163333 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1764  50S ribosomal protein L4  42.23 
 
 
206 aa  170  2e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00135584  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4004  ribosomal protein L4/L1e  45.45 
 
 
215 aa  169  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.070535  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0961  50S ribosomal protein L4  46.35 
 
 
204 aa  169  3e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000392469  hitchhiker  0.00000164794 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2228  50S ribosomal protein L4  42.65 
 
 
208 aa  169  4e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169782  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3023  ribosomal protein L4/L1e  44.98 
 
 
222 aa  168  5e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443321  normal  0.0189884 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl124  50S ribosomal protein L4  43.07 
 
 
208 aa  168  5e-41  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000604234  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0290  ribosomal protein L4/L1e  47.06 
 
 
208 aa  168  5e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00437959  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0470  50S ribosomal protein L4  48.19 
 
 
201 aa  167  7e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000163865  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4275  50S ribosomal protein L4  44.5 
 
 
201 aa  167  8e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000159231  unclonable  0.00000000000448849 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0585  50S ribosomal protein L4  45.6 
 
 
201 aa  167  9e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000207865  normal  0.110437 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0284  50S ribosomal protein L4  45.6 
 
 
201 aa  167  9e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000222015  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3914  50S ribosomal protein L4  45.6 
 
 
201 aa  167  9e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  8.05295e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0225  ribosomal protein L4/L1e  46.7 
 
 
210 aa  167  9e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1677  50S ribosomal protein L4  40.7 
 
 
206 aa  167  9e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375579  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20860  LSU ribosomal protein L4P  45 
 
 
223 aa  167  1e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.699759  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1041  50S ribosomal protein L4  46.6 
 
 
219 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1014  50S ribosomal protein L4  46.6 
 
 
219 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1031  50S ribosomal protein L4  46.6 
 
 
219 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.658773 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0709  50S ribosomal protein L4  43.35 
 
 
205 aa  166  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0382078  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0324  50S ribosomal protein L4  45.55 
 
 
201 aa  166  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000187067  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3821  50S ribosomal protein L4  45.55 
 
 
201 aa  166  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000757079  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0406  50S ribosomal protein L4  45.55 
 
 
201 aa  166  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00340494  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4543  50S ribosomal protein L4  45.55 
 
 
201 aa  166  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000261898  hitchhiker  0.00202926 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3806  50S ribosomal protein L4  45.03 
 
 
201 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000172532  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>