More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1830 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1830  50S ribosomal protein L4  100 
 
 		 207 aa  421  1e-117  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0478396  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2276  50S ribosomal protein L4  90.34 
 
 		 207 aa  392  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000009811  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2317  50S ribosomal protein L4  90.34 
 
 		 207 aa  392  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000134967  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0112  50S ribosomal protein L4  65.48 
 
 		 207 aa  275  4e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000123482  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0108  50S ribosomal protein L4  64.65 
 
 		 207 aa  274  9e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0106  50S ribosomal protein L4  63.29 
 
 		 207 aa  271  5.000000000000001e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000544936  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0111  50S ribosomal protein L4  63.29 
 
 		 207 aa  271  6e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000572324  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0132  50S ribosomal protein L4  63.29 
 
 		 207 aa  271  6e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000136863  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0111  50S ribosomal protein L4  63.29 
 
 		 207 aa  271  6e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000900585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0107  50S ribosomal protein L4  63.29 
 
 		 207 aa  271  6e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.56557e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0105  50S ribosomal protein L4  63.29 
 
 		 207 aa  271  6e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000256275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0111  50S ribosomal protein L4  63.29 
 
 		 207 aa  271  6e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000163463  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0142  50S ribosomal protein L4  63.29 
 
 		 207 aa  271  6e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000690155  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5194  50S ribosomal protein L4  63.29 
 
 		 207 aa  271  6e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000834057  unclonable  1.98377e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0123  50S ribosomal protein L4  63.29 
 
 		 207 aa  271  6e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.21989e-61 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0105  50S ribosomal protein L4  63.29 
 
 		 207 aa  268  2.9999999999999997e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000104823  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1482  50S ribosomal protein L4  60.39 
 
 		 207 aa  267  7e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000984788  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0197  50S ribosomal protein L4  58.94 
 
 		 207 aa  261  8e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00203095  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1906  50S ribosomal protein L4  60.87 
 
 		 207 aa  260  8.999999999999999e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000335339  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0059  50S ribosomal protein L4  60.39 
 
 		 207 aa  257  8e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0599605  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2401  50S ribosomal protein L4  60.1 
 
 		 208 aa  256  2e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0596  50S ribosomal protein L4P  58.25 
 
 		 207 aa  252  2.0000000000000002e-66  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000475036  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0292  50S ribosomal protein L4  57.97 
 
 		 205 aa  248  6e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000472593  unclonable  1.9716100000000001e-28 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0287  50S ribosomal protein L4  54.11 
 
 		 206 aa  226  1e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0371511  hitchhiker  0.00627174 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0216  50S ribosomal protein L4  53.62 
 
 		 206 aa  226  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320704  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0226  ribosomal protein L4/L1e  53.14 
 
 		 207 aa  224  6e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2459  50S ribosomal protein L4P  50.72 
 
 		 207 aa  222  4e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0863955 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0423  50S ribosomal protein L4  50.24 
 
 		 207 aa  216  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000203712  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0868  50S ribosomal protein L4  53.14 
 
 		 206 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000685593  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3666  50S ribosomal protein L4  48.79 
 
 		 206 aa  212  2.9999999999999995e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000305367  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2332  ribosomal protein L4/L1e  49.76 
 
 		 207 aa  209  2e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000847375  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2904  50S ribosomal protein L4  49.52 
 
 		 208 aa  207  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000879055  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0954  50S ribosomal protein L4  47.51 
 
 		 221 aa  206  2e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000111144  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16230  ribosomal protein L4  49.03 
 
 		 207 aa  205  4e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.308573  decreased coverage  0.0000000146284 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2710  ribosomal protein L4/L1e  52.88 
 
 		 206 aa  205  5e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000254915  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10010  LSU ribosomal protein L4P  51.21 
 
 		 207 aa  205  5e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000045126  hitchhiker  0.00000000148432 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0195  LSU ribosomal protein L4P  47.98 
 
 		 207 aa  204  6e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00135777  normal  0.0747506 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0963  ribosomal protein L4/L1e  49.28 
 
 		 207 aa  202  2e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000403747  hitchhiker  0.0000000000267396 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0695  50S ribosomal protein L4  51.47 
 
 		 208 aa  201  6e-51  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1573  ribosomal protein L4/L1e  50 
 
 		 207 aa  201  7e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000791532  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01180  ribosomal protein L4/L1e  48.56 
 
 		 209 aa  196  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000715314  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1744  50S ribosomal protein L4  47.6 
 
 		 208 aa  195  5.000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000318286  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0759  50S ribosomal protein L4  45.89 
 
 		 207 aa  194  6e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000566858  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0716  ribosomal protein L4/L1e  48.02 
 
 		 223 aa  192  3e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2398  50S ribosomal protein L4  49.49 
 
 		 204 aa  191  4e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000730975  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1523  ribosomal protein L4/L1e  47.83 
 
 		 207 aa  192  4e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.790483  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2713  50S ribosomal protein L4  49.49 
 
 		 204 aa  191  7e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl124  50S ribosomal protein L4  48.29 
 
 		 208 aa  191  9e-48  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000604234  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1160  ribosomal protein L4/L1e  46.63 
 
 		 208 aa  191  9e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000738717  hitchhiker  0.000000590673 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2856  50S ribosomal protein L4  46.6 
 
 		 207 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400345  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2019  50S ribosomal protein L4  46.38 
 
 		 206 aa  188  4e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0627  50S ribosomal protein L4  45.15 
 
 		 220 aa  187  7e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000530014  hitchhiker  0.00000000000031805 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1183  ribosomal protein L4/L1e  47.47 
 
 		 208 aa  186  1e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000599505  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0934  50S ribosomal protein L4  47.09 
 
 		 207 aa  187  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000521211  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3327  50S ribosomal protein L4  47.09 
 
 		 207 aa  187  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.78315e-16 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1137  50S ribosomal protein L4  44.59 
 
 		 223 aa  186  2e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000824266  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0789  50S ribosomal protein L4  41.18 
 
 		 221 aa  186  3e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2231  50S ribosomal protein L4  46.89 
 
 		 210 aa  185  4e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.402946 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1068  50S ribosomal protein L4  47.12 
 
 		 207 aa  185  5e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000351414  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4916  ribosomal protein L4/L1e  49.24 
 
 		 209 aa  184  9e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.1186  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4025  ribosomal protein L4/L1e  47.34 
 
 		 221 aa  183  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000717748 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5048  50S ribosomal protein L4  47.25 
 
 		 218 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.5122  normal  0.277146 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1945  50S ribosomal protein L4  45.41 
 
 		 206 aa  182  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1912  50S ribosomal protein L4  47.34 
 
 		 206 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.224726 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1556  ribosomal protein L4/L1e  46.38 
 
 		 207 aa  183  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427554  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1184  ribosomal protein L4/L1e  46.81 
 
 		 223 aa  182  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1934  50S ribosomal protein L4  44.93 
 
 		 206 aa  181  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0848  50S ribosomal protein L4P  48.96 
 
 		 207 aa  181  5.0000000000000004e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000392239  decreased coverage  0.0000122182 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0628  ribosomal protein L4/L1e  47.69 
 
 		 232 aa  180  1e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2645  50S ribosomal protein L4  45.71 
 
 		 222 aa  178  5.999999999999999e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264538  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0702  50S ribosomal protein L4  44.66 
 
 		 206 aa  178  5.999999999999999e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000569503  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2064  50S ribosomal protein L4  46.88 
 
 		 206 aa  177  1e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000384651  normal  0.231159 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1306  50S ribosomal protein L4  45.85 
 
 		 219 aa  175  4e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.265076  normal  0.163333 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3142  ribosomal protein L4/L1e  44.83 
 
 		 221 aa  175  5e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.083105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4506  ribosomal protein L4/L1e  49.23 
 
 		 292 aa  175  5e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4004  ribosomal protein L4/L1e  41.63 
 
 		 215 aa  174  7e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.070535  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3023  ribosomal protein L4/L1e  46 
 
 		 222 aa  174  9e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443321  normal  0.0189884 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1393  50S ribosomal protein L4  43.81 
 
 		 235 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000162338  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1293  50S ribosomal protein L4  43.81 
 
 		 235 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000803665  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1148  50S ribosomal protein L4  45.32 
 
 		 209 aa  172  1.9999999999999998e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000671055  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1227  50S ribosomal protein L4  42.72 
 
 		 217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150568  unclonable  0.0000101553 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0709  50S ribosomal protein L4  43.35 
 
 		 205 aa  171  5e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0382078  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0251  50S ribosomal protein L4  44.81 
 
 		 211 aa  170  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4344  50S ribosomal protein L4  44.33 
 
 		 209 aa  170  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000409516  normal  0.126717 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0248  50S ribosomal protein L4  44.81 
 
 		 211 aa  170  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.890563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3922  ribosomal protein L4/L1e  44.93 
 
 		 216 aa  170  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05720  50S ribosomal protein L4  43.14 
 
 		 208 aa  169  2e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.316206  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1837  ribosomal protein L4/L1e  41.95 
 
 		 215 aa  169  2e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00300997  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3434  ribosomal protein L4/L1e  44.5 
 
 		 217 aa  169  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0422  50S ribosomal protein L4  46.5 
 
 		 202 aa  170  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00655238  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1764  50S ribosomal protein L4  42.31 
 
 		 206 aa  169  3e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00135584  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5125  ribosomal protein L4/L1e  45 
 
 		 223 aa  168  4e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3011  50S ribosomal protein L4  44.29 
 
 		 212 aa  167  7e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00787083 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0689  ribosomal protein L4/L1e  45.26 
 
 		 234 aa  167  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.443511 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3523  50S ribosomal protein L4  46.07 
 
 		 201 aa  167  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.0000000876425  hitchhiker  0.00000726358 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0396  50S ribosomal protein L4  42.16 
 
 		 209 aa  166  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6048  50S ribosomal protein L4  46.56 
 
 		 247 aa  166  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.239817 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0961  50S ribosomal protein L4  45.31 
 
 		 204 aa  166  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000392469  hitchhiker  0.00000164794 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29730  LSU ribosomal protein L4P  45.13 
 
 		 234 aa  166  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.379343 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4547  50S ribosomal protein L4  45.31 
 
 		 200 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0714588  normal  0.0640617 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>