More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0709 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0709  50S ribosomal protein L4  100 
 
 		 205 aa  412  1e-114  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0382078  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1556  ribosomal protein L4/L1e  52.2 
 
 		 207 aa  214  5.9999999999999996e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427554  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0216  50S ribosomal protein L4  50 
 
 		 206 aa  195  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320704  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1347  50S ribosomal protein L4  44.39 
 
 		 206 aa  192  4e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2459  50S ribosomal protein L4P  46.8 
 
 		 207 aa  192  4e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0863955 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0287  50S ribosomal protein L4  48.02 
 
 		 206 aa  191  4e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0371511  hitchhiker  0.00627174 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4004  ribosomal protein L4/L1e  50.49 
 
 		 215 aa  190  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.070535  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0702  50S ribosomal protein L4  43.9 
 
 		 206 aa  188  4e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000569503  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1068  50S ribosomal protein L4  45.37 
 
 		 207 aa  188  5e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000351414  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0868  50S ribosomal protein L4  47.03 
 
 		 206 aa  187  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000685593  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0681  50S ribosomal protein L4  44.39 
 
 		 207 aa  186  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.486374  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1744  50S ribosomal protein L4  44.61 
 
 		 208 aa  184  8e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000318286  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0759  50S ribosomal protein L4  46.31 
 
 		 207 aa  182  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000566858  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0108  50S ribosomal protein L4  46.31 
 
 		 207 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2856  50S ribosomal protein L4  45.37 
 
 		 207 aa  182  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400345  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3327  50S ribosomal protein L4  46.34 
 
 		 207 aa  182  3e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.78315e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0934  50S ribosomal protein L4  46.34 
 
 		 207 aa  182  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000521211  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0290  ribosomal protein L4/L1e  44.33 
 
 		 208 aa  181  9.000000000000001e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00437959  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0627  50S ribosomal protein L4  44.39 
 
 		 220 aa  180  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000530014  hitchhiker  0.00000000000031805 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1764  50S ribosomal protein L4  45.37 
 
 		 206 aa  180  1e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00135584  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3023  ribosomal protein L4/L1e  44.39 
 
 		 222 aa  180  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443321  normal  0.0189884 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0112  50S ribosomal protein L4  45.32 
 
 		 207 aa  179  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000123482  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0226  ribosomal protein L4/L1e  45.81 
 
 		 207 aa  178  4.999999999999999e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2904  50S ribosomal protein L4  43.63 
 
 		 208 aa  178  4.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000879055  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2710  ribosomal protein L4/L1e  44.83 
 
 		 206 aa  177  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000254915  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2332  ribosomal protein L4/L1e  44.83 
 
 		 207 aa  176  1e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000847375  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2276  50S ribosomal protein L4  44.83 
 
 		 207 aa  175  3e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000009811  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2317  50S ribosomal protein L4  44.83 
 
 		 207 aa  175  3e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000134967  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0106  50S ribosomal protein L4  43.35 
 
 		 207 aa  175  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000544936  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0105  50S ribosomal protein L4  43.35 
 
 		 207 aa  175  4e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000104823  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0080  50S ribosomal protein L4  45.85 
 
 		 206 aa  175  4e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.186923 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0111  50S ribosomal protein L4  42.86 
 
 		 207 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000572324  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0111  50S ribosomal protein L4  42.86 
 
 		 207 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000900585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0107  50S ribosomal protein L4  42.86 
 
 		 207 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.56557e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0105  50S ribosomal protein L4  42.86 
 
 		 207 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000256275  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2256  50S ribosomal protein L4  44.88 
 
 		 206 aa  173  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000129639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0111  50S ribosomal protein L4  42.86 
 
 		 207 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000163463  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0123  50S ribosomal protein L4  42.86 
 
 		 207 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.21989e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0142  50S ribosomal protein L4  42.86 
 
 		 207 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000690155  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5194  50S ribosomal protein L4  42.86 
 
 		 207 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000834057  unclonable  1.98377e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0132  50S ribosomal protein L4  42.86 
 
 		 207 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000136863  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2773  50S ribosomal protein L4  44.39 
 
 		 206 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0187174  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1830  50S ribosomal protein L4  43.35 
 
 		 207 aa  171  5e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0478396  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0848  50S ribosomal protein L4P  43.2 
 
 		 207 aa  171  5e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000392239  decreased coverage  0.0000122182 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3666  50S ribosomal protein L4  44.55 
 
 		 206 aa  170  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000305367  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2124  50S ribosomal protein L4  43.84 
 
 		 206 aa  170  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0423  50S ribosomal protein L4  42.36 
 
 		 207 aa  169  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000203712  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2687  50S ribosomal protein L4  45.1 
 
 		 206 aa  168  5e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0662732  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2441  50S ribosomal protein L4  42.86 
 
 		 206 aa  168  6e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.527594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2163  50S ribosomal protein L4  42.86 
 
 		 206 aa  168  6e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.591953 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1184  ribosomal protein L4/L1e  39.3 
 
 		 223 aa  167  7e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1546  50S ribosomal protein L4  40.69 
 
 		 206 aa  167  8e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2219  50S ribosomal protein L4  42.65 
 
 		 206 aa  167  8e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.372251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0716  ribosomal protein L4/L1e  40.89 
 
 		 223 aa  167  9e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0680  50S ribosomal protein L4  41.58 
 
 		 204 aa  167  1e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0323983  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2064  50S ribosomal protein L4  42.44 
 
 		 206 aa  166  2e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000384651  normal  0.231159 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1355  50S ribosomal protein L4  40.2 
 
 		 206 aa  166  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.700981  normal  0.0533022 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1523  ribosomal protein L4/L1e  43.35 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.790483  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1573  ribosomal protein L4/L1e  42.86 
 
 		 207 aa  165  4e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000791532  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1365  50S ribosomal protein L4  40.2 
 
 		 206 aa  164  5.9999999999999996e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.65413  normal  0.580974 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1677  50S ribosomal protein L4  41.09 
 
 		 206 aa  164  6.9999999999999995e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375579  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4025  ribosomal protein L4/L1e  39.3 
 
 		 221 aa  164  9e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000717748 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2618  50S ribosomal protein L4/L1e  46.88 
 
 		 206 aa  163  1.0000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0455519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2296  50S ribosomal protein L4  41.09 
 
 		 206 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.214587 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0603  ribosomal protein L4/L1e  41.09 
 
 		 209 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0987  50S ribosomal protein L4  41.09 
 
 		 206 aa  161  6e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114211  normal  0.0168487 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0579  50S ribosomal protein L4  42.16 
 
 		 206 aa  161  7e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2398  50S ribosomal protein L4  43.07 
 
 		 204 aa  160  9e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000730975  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4916  ribosomal protein L4/L1e  41.21 
 
 		 209 aa  160  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.1186  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3183  50S ribosomal protein L4  40.59 
 
 		 206 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.611189 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2713  50S ribosomal protein L4  43.07 
 
 		 204 aa  160  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1909  50S ribosomal protein L4  40.59 
 
 		 206 aa  160  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00049189  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3666  50S ribosomal protein L4  41.58 
 
 		 206 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5069  50S ribosomal protein L4  40.59 
 
 		 206 aa  159  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.312873  normal  0.444752 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0789  50S ribosomal protein L4  39.17 
 
 		 221 aa  160  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0195  LSU ribosomal protein L4P  39.9 
 
 		 207 aa  159  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00135777  normal  0.0747506 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3447  50S ribosomal protein L4  40.59 
 
 		 206 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.628566 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1866  50S ribosomal protein L4  46.27 
 
 		 213 aa  159  3e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0257015  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2906  ribosomal protein L4/L1e  43.98 
 
 		 211 aa  159  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1841  50S ribosomal protein L4  41.18 
 
 		 206 aa  159  4e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00656496  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16230  ribosomal protein L4  41.87 
 
 		 207 aa  158  4e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.308573  decreased coverage  0.0000000146284 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0352  50S ribosomal protein L4  40.59 
 
 		 206 aa  158  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1183  ribosomal protein L4/L1e  41.33 
 
 		 208 aa  158  5e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000599505  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0982  ribosomal protein L4/L1e  41.35 
 
 		 209 aa  158  5e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.532922  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1482  50S ribosomal protein L4  39.41 
 
 		 207 aa  158  6e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000984788  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1957  50S ribosomal protein L4  40.1 
 
 		 206 aa  157  7e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0135033  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0661  50S ribosomal protein L4  39.51 
 
 		 210 aa  157  7e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000586581  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0292  50S ribosomal protein L4  41.58 
 
 		 205 aa  157  8e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000472593  unclonable  1.9716100000000001e-28 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1680  50S ribosomal protein L4  41.18 
 
 		 206 aa  156  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.097299  hitchhiker  0.0000499421 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0954  50S ribosomal protein L4  39.63 
 
 		 221 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000111144  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0059  50S ribosomal protein L4  41.26 
 
 		 207 aa  154  7e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0599605  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1794  50S ribosomal protein L4  41.18 
 
 		 211 aa  154  9e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.130776  normal  0.0731355 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1333  50S ribosomal protein L4  38.24 
 
 		 206 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.177589 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0667  50S ribosomal protein L4  39.11 
 
 		 206 aa  152  2e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000764856  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0699  50S ribosomal protein L4  39.11 
 
 		 206 aa  152  2e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000231924  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2560  50S ribosomal protein L4/L1e  41.09 
 
 		 210 aa  153  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0559575  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1232  50S ribosomal protein L4  38.61 
 
 		 206 aa  153  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.24642  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0452  50S ribosomal protein L4  40.5 
 
 		 210 aa  153  2e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000515236  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0197  50S ribosomal protein L4  39.32 
 
 		 207 aa  152  2e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00203095  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1431  50S ribosomal protein L4  37.75 
 
 		 206 aa  153  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.112454  normal  0.0117604 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>