More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2773 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2773  50S ribosomal protein L4  100 
 
 		 206 aa  420  1e-117  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0187174  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1764  50S ribosomal protein L4  61.17 
 
 		 206 aa  271  3e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00135584  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0080  50S ribosomal protein L4  60.19 
 
 		 206 aa  270  1e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.186923 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2256  50S ribosomal protein L4  59.22 
 
 		 206 aa  263  2e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000129639  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0661  50S ribosomal protein L4  54.37 
 
 		 210 aa  245  3e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000586581  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2064  50S ribosomal protein L4  52.68 
 
 		 206 aa  241  5e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000384651  normal  0.231159 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3666  50S ribosomal protein L4  49.26 
 
 		 206 aa  210  1e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000305367  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1556  ribosomal protein L4/L1e  47.32 
 
 		 207 aa  208  5e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427554  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0216  50S ribosomal protein L4  46.83 
 
 		 206 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320704  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0287  50S ribosomal protein L4  46.34 
 
 		 206 aa  192  3e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0371511  hitchhiker  0.00627174 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0868  50S ribosomal protein L4  45.81 
 
 		 206 aa  190  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000685593  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0848  50S ribosomal protein L4P  46.6 
 
 		 207 aa  190  1e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000392239  decreased coverage  0.0000122182 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2710  ribosomal protein L4/L1e  44.33 
 
 		 206 aa  184  5e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000254915  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1744  50S ribosomal protein L4  45.37 
 
 		 208 aa  184  9e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000318286  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2904  50S ribosomal protein L4  44.88 
 
 		 208 aa  183  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000879055  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2459  50S ribosomal protein L4P  45.15 
 
 		 207 aa  183  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0863955 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1347  50S ribosomal protein L4  43.43 
 
 		 206 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0106  50S ribosomal protein L4  45.15 
 
 		 207 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000544936  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2332  ribosomal protein L4/L1e  45.1 
 
 		 207 aa  182  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000847375  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0111  50S ribosomal protein L4  44.66 
 
 		 207 aa  181  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000572324  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0111  50S ribosomal protein L4  44.66 
 
 		 207 aa  181  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000900585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0107  50S ribosomal protein L4  44.66 
 
 		 207 aa  181  5.0000000000000004e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.56557e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0105  50S ribosomal protein L4  44.66 
 
 		 207 aa  181  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000256275  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0123  50S ribosomal protein L4  44.66 
 
 		 207 aa  181  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.21989e-61 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5194  50S ribosomal protein L4  44.66 
 
 		 207 aa  181  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000834057  unclonable  1.98377e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0111  50S ribosomal protein L4  44.66 
 
 		 207 aa  181  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000163463  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0142  50S ribosomal protein L4  44.66 
 
 		 207 aa  181  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000690155  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0132  50S ribosomal protein L4  44.66 
 
 		 207 aa  181  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000136863  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0702  50S ribosomal protein L4  43.56 
 
 		 206 aa  181  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000569503  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0627  50S ribosomal protein L4  43.69 
 
 		 220 aa  179  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000530014  hitchhiker  0.00000000000031805 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0105  50S ribosomal protein L4  44.17 
 
 		 207 aa  177  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000104823  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1183  ribosomal protein L4/L1e  43.63 
 
 		 208 aa  176  2e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000599505  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0226  ribosomal protein L4/L1e  42.23 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1068  50S ribosomal protein L4  42.93 
 
 		 207 aa  176  3e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000351414  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0112  50S ribosomal protein L4  43.2 
 
 		 207 aa  175  4e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000123482  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0681  50S ribosomal protein L4  41.58 
 
 		 207 aa  175  4e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.486374  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0108  50S ribosomal protein L4  43.69 
 
 		 207 aa  174  7e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0934  50S ribosomal protein L4  44.44 
 
 		 207 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000521211  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3327  50S ribosomal protein L4  44.44 
 
 		 207 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.78315e-16 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0709  50S ribosomal protein L4  44.39 
 
 		 205 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0382078  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1523  ribosomal protein L4/L1e  41.26 
 
 		 207 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.790483  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0195  LSU ribosomal protein L4P  39.71 
 
 		 207 aa  169  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00135777  normal  0.0747506 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01180  ribosomal protein L4/L1e  43.48 
 
 		 209 aa  169  3e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000715314  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0759  50S ribosomal protein L4  40.2 
 
 		 207 aa  168  5e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000566858  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0423  50S ribosomal protein L4  43.2 
 
 		 207 aa  167  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000203712  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0596  50S ribosomal protein L4P  42.11 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000475036  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2856  50S ribosomal protein L4  40.78 
 
 		 207 aa  164  6.9999999999999995e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400345  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3704  50S ribosomal protein L4  43.27 
 
 		 210 aa  164  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0193  ribosomal protein L4/L1e  41.63 
 
 		 214 aa  164  9e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2317  50S ribosomal protein L4  41.26 
 
 		 207 aa  162  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000134967  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1830  50S ribosomal protein L4  40.78 
 
 		 207 aa  162  3e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0478396  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2276  50S ribosomal protein L4  41.26 
 
 		 207 aa  162  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000009811  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2398  50S ribosomal protein L4  41.38 
 
 		 204 aa  160  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000730975  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1906  50S ribosomal protein L4  40.29 
 
 		 207 aa  160  1e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000335339  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1482  50S ribosomal protein L4  39.81 
 
 		 207 aa  159  2e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000984788  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2713  50S ribosomal protein L4  41.38 
 
 		 204 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1137  50S ribosomal protein L4  39.82 
 
 		 223 aa  159  3e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000824266  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0954  50S ribosomal protein L4  39.09 
 
 		 221 aa  158  5e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000111144  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0059  50S ribosomal protein L4  39.9 
 
 		 207 aa  158  6e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0599605  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1293  50S ribosomal protein L4  41.83 
 
 		 210 aa  156  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000205733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0716  ribosomal protein L4/L1e  39.6 
 
 		 223 aa  155  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3011  50S ribosomal protein L4  40.87 
 
 		 212 aa  155  4e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00787083 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2019  50S ribosomal protein L4  43.52 
 
 		 206 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0292  50S ribosomal protein L4  38.05 
 
 		 205 aa  154  9e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000472593  unclonable  1.9716100000000001e-28 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16230  ribosomal protein L4  38.16 
 
 		 207 aa  153  2e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.308573  decreased coverage  0.0000000146284 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0251  50S ribosomal protein L4  40.87 
 
 		 211 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0248  50S ribosomal protein L4  40.87 
 
 		 211 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.890563  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2560  50S ribosomal protein L4/L1e  39.9 
 
 		 210 aa  152  2.9999999999999998e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0559575  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0296  ribosomal protein L4/L1e  41.75 
 
 		 206 aa  151  5e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000410441  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1945  50S ribosomal protein L4  43.52 
 
 		 206 aa  151  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1841  50S ribosomal protein L4  42.56 
 
 		 206 aa  152  5e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00656496  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0197  50S ribosomal protein L4  39.41 
 
 		 207 aa  151  7e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00203095  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1934  50S ribosomal protein L4  43.52 
 
 		 206 aa  150  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2422  50S ribosomal protein L4  40.69 
 
 		 208 aa  150  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00578828  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0963  ribosomal protein L4/L1e  38.35 
 
 		 207 aa  150  1e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000403747  hitchhiker  0.0000000000267396 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2231  50S ribosomal protein L4  38.94 
 
 		 210 aa  150  2e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.402946 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0982  ribosomal protein L4/L1e  38.54 
 
 		 209 aa  150  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.532922  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1333  50S ribosomal protein L4  41.33 
 
 		 206 aa  149  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.177589 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0857  50S ribosomal protein L4  38.31 
 
 		 205 aa  149  3e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1573  ribosomal protein L4/L1e  38.86 
 
 		 207 aa  149  3e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000791532  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2401  50S ribosomal protein L4  37.68 
 
 		 208 aa  149  3e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1912  50S ribosomal protein L4  45.08 
 
 		 206 aa  149  4e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.224726 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1431  50S ribosomal protein L4  40.82 
 
 		 206 aa  148  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.112454  normal  0.0117604 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0987  50S ribosomal protein L4  41.33 
 
 		 206 aa  148  6e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114211  normal  0.0168487 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1850  50S ribosomal protein L4  41.18 
 
 		 208 aa  147  8e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264817  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10010  LSU ribosomal protein L4P  38.83 
 
 		 207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000045126  hitchhiker  0.00000000148432 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2228  50S ribosomal protein L4  39.71 
 
 		 208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169782  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0338  50S ribosomal protein L4  39.29 
 
 		 205 aa  146  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000059568  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0395  50S ribosomal protein L4  39.27 
 
 		 201 aa  145  3e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4916  ribosomal protein L4/L1e  38.58 
 
 		 209 aa  145  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.1186  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4275  50S ribosomal protein L4  39.79 
 
 		 201 aa  145  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000159231  unclonable  0.00000000000448849 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2063  50S ribosomal protein L4  41.18 
 
 		 208 aa  145  4.0000000000000006e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000340203  normal  0.385687 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0370  50S ribosomal protein L4  39.27 
 
 		 201 aa  145  5e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1677  50S ribosomal protein L4  40.82 
 
 		 206 aa  145  5e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375579  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0396  50S ribosomal protein L4  38.73 
 
 		 209 aa  145  6e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl124  50S ribosomal protein L4  38.81 
 
 		 208 aa  144  1e-33  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000604234  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2687  50S ribosomal protein L4  40.82 
 
 		 206 aa  143  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0662732  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1853  50S ribosomal protein L4  38.78 
 
 		 206 aa  144  1e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000203721  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3142  ribosomal protein L4/L1e  40.61 
 
 		 221 aa  144  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.083105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0692  50S ribosomal protein L4  37.5 
 
 		 210 aa  142  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000477042  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>