More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1866 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1866  50S ribosomal protein L4  100 
 
 		 213 aa  432  1e-120  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0257015  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2906  ribosomal protein L4/L1e  61.81 
 
 		 211 aa  244  8e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2618  50S ribosomal protein L4/L1e  57.58 
 
 		 206 aa  217  1e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0455519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0709  50S ribosomal protein L4  46.27 
 
 		 205 aa  159  4e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0382078  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0266  50S ribosomal protein L4  47.59 
 
 		 200 aa  154  8e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000651042  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0290  ribosomal protein L4/L1e  44.32 
 
 		 208 aa  149  4e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00437959  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1680  50S ribosomal protein L4  47.09 
 
 		 206 aa  148  6e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.097299  hitchhiker  0.0000499421 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1909  50S ribosomal protein L4  46.49 
 
 		 206 aa  146  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00049189  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4004  ribosomal protein L4/L1e  46.5 
 
 		 215 aa  143  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.070535  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1615  50S ribosomal protein L4  42.08 
 
 		 212 aa  143  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.140901 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0579  50S ribosomal protein L4  45.05 
 
 		 206 aa  143  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0287  50S ribosomal protein L4  43.89 
 
 		 206 aa  143  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0371511  hitchhiker  0.00627174 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0112  50S ribosomal protein L4  45.3 
 
 		 207 aa  143  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000123482  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0352  50S ribosomal protein L4  46.67 
 
 		 206 aa  142  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1677  50S ribosomal protein L4  44.51 
 
 		 206 aa  142  4e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375579  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2904  50S ribosomal protein L4  41.11 
 
 		 208 aa  142  4e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000879055  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2124  50S ribosomal protein L4  41.46 
 
 		 206 aa  142  5e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1250  50S ribosomal protein L4  42.08 
 
 		 207 aa  141  7e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.919527  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0108  50S ribosomal protein L4  41.06 
 
 		 207 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3447  50S ribosomal protein L4  46.07 
 
 		 206 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.628566 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2163  50S ribosomal protein L4  40.98 
 
 		 206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.591953 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2441  50S ribosomal protein L4  40.98 
 
 		 206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.527594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1523  ribosomal protein L4/L1e  43.58 
 
 		 207 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.790483  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0584  50S ribosomal protein L4  42.79 
 
 		 206 aa  139  3.9999999999999997e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.745098 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3666  50S ribosomal protein L4  46.89 
 
 		 206 aa  138  7e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0303  ribosomal protein L4/L1e  40.51 
 
 		 202 aa  137  7.999999999999999e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0138909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0247  50S ribosomal protein L4  40.5 
 
 		 205 aa  137  8.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.767965  normal  0.730186 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1546  50S ribosomal protein L4  46.51 
 
 		 206 aa  137  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2219  50S ribosomal protein L4  44.89 
 
 		 206 aa  137  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.372251  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0563  50S ribosomal protein L4/L1e  41.41 
 
 		 216 aa  136  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3183  50S ribosomal protein L4  46.51 
 
 		 206 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.611189 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2817  50S ribosomal protein L4  39.71 
 
 		 208 aa  136  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.477285 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0759  50S ribosomal protein L4  41.34 
 
 		 207 aa  136  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000566858  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2296  50S ribosomal protein L4  46.51 
 
 		 206 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.214587 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1794  50S ribosomal protein L4  40 
 
 		 211 aa  136  3.0000000000000003e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.130776  normal  0.0731355 
 
 
-
 
NC_004310  BR1232  50S ribosomal protein L4  43.93 
 
 		 206 aa  135  5e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.24642  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1195  50S ribosomal protein L4  43.93 
 
 		 206 aa  135  5e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.280242  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0423  50S ribosomal protein L4  38.65 
 
 		 207 aa  134  7.000000000000001e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000203712  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0982  ribosomal protein L4/L1e  37.56 
 
 		 209 aa  134  7.000000000000001e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.532922  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0105  50S ribosomal protein L4  39.13 
 
 		 207 aa  134  7.000000000000001e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000104823  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0226  ribosomal protein L4/L1e  43.78 
 
 		 207 aa  134  8e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1841  50S ribosomal protein L4  45.66 
 
 		 206 aa  134  8e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00656496  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1957  50S ribosomal protein L4  44.32 
 
 		 206 aa  134  8e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0135033  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1482  50S ribosomal protein L4  38.16 
 
 		 207 aa  134  9.999999999999999e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000984788  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1365  50S ribosomal protein L4  43.6 
 
 		 206 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.65413  normal  0.580974 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0106  50S ribosomal protein L4  39.13 
 
 		 207 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000544936  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5069  50S ribosomal protein L4  44.38 
 
 		 206 aa  134  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.312873  normal  0.444752 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1573  ribosomal protein L4/L1e  38.61 
 
 		 207 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000791532  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0667  50S ribosomal protein L4  42.61 
 
 		 206 aa  134  9.999999999999999e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000764856  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0699  50S ribosomal protein L4  42.61 
 
 		 206 aa  134  9.999999999999999e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000231924  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0111  50S ribosomal protein L4  38.65 
 
 		 207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000572324  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0111  50S ribosomal protein L4  38.65 
 
 		 207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000900585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0107  50S ribosomal protein L4  38.65 
 
 		 207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.56557e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0105  50S ribosomal protein L4  38.65 
 
 		 207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000256275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0111  50S ribosomal protein L4  38.65 
 
 		 207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000163463  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0142  50S ribosomal protein L4  38.65 
 
 		 207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000690155  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0132  50S ribosomal protein L4  38.65 
 
 		 207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000136863  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5194  50S ribosomal protein L4  38.65 
 
 		 207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000834057  unclonable  1.98377e-25 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0760  50S ribosomal protein L4  41.5 
 
 		 206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.536286  normal  0.490567 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0123  50S ribosomal protein L4  38.65 
 
 		 207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.21989e-61 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2710  ribosomal protein L4/L1e  39.61 
 
 		 206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000254915  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0193  ribosomal protein L4/L1e  41.85 
 
 		 214 aa  132  3e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2459  50S ribosomal protein L4P  40.89 
 
 		 207 aa  132  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0863955 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0987  50S ribosomal protein L4  44.32 
 
 		 206 aa  131  6.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114211  normal  0.0168487 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0277  50S ribosomal protein L4  41.12 
 
 		 205 aa  131  9e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.187422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1333  50S ribosomal protein L4  42.61 
 
 		 206 aa  131  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.177589 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1431  50S ribosomal protein L4  42.61 
 
 		 206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.112454  normal  0.0117604 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0702  50S ribosomal protein L4  38.81 
 
 		 206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000569503  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1744  50S ribosomal protein L4  35.44 
 
 		 208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000318286  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0868  50S ribosomal protein L4  41.95 
 
 		 206 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000685593  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3666  50S ribosomal protein L4  40.59 
 
 		 206 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000305367  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01180  ribosomal protein L4/L1e  40.78 
 
 		 209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000715314  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0768  50S ribosomal protein L4  40.11 
 
 		 211 aa  129  3e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000241518  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0689  ribosomal protein L4/L1e  39.06 
 
 		 234 aa  129  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.443511 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1556  ribosomal protein L4/L1e  43.11 
 
 		 207 aa  129  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427554  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29730  LSU ribosomal protein L4P  38.89 
 
 		 234 aa  129  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.379343 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2317  50S ribosomal protein L4  38.65 
 
 		 207 aa  129  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000134967  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0681  50S ribosomal protein L4  37.99 
 
 		 207 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.486374  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2276  50S ribosomal protein L4  38.65 
 
 		 207 aa  129  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000009811  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2256  50S ribosomal protein L4  40.69 
 
 		 206 aa  128  6e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000129639  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1355  50S ribosomal protein L4  40.5 
 
 		 206 aa  128  6e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.700981  normal  0.0533022 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0195  LSU ribosomal protein L4P  37.57 
 
 		 207 aa  128  7.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00135777  normal  0.0747506 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2737  ribosomal protein L4/L1e  45.93 
 
 		 206 aa  127  9.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.508185  normal  0.224795 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2856  50S ribosomal protein L4  40 
 
 		 207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400345  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0080  50S ribosomal protein L4  42.44 
 
 		 206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.186923 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2687  50S ribosomal protein L4  41.71 
 
 		 206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0662732  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1417  ribosomal protein L4/L1e  39 
 
 		 211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.977567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3161  50S ribosomal protein L4  35.23 
 
 		 208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.614669 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5125  ribosomal protein L4/L1e  39.09 
 
 		 223 aa  125  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1347  50S ribosomal protein L4  40.59 
 
 		 206 aa  125  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1352  50S ribosomal protein L4  42.61 
 
 		 208 aa  126  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.149539 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17391  50S ribosomal protein L4  40 
 
 		 210 aa  126  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2658  ribosomal protein L4/L1e  36.53 
 
 		 228 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1945  50S ribosomal protein L4  42.13 
 
 		 216 aa  125  4.0000000000000003e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1087  50S ribosomal protein L4  39.59 
 
 		 215 aa  125  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10489 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3327  50S ribosomal protein L4  36.82 
 
 		 207 aa  125  5e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.78315e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0934  50S ribosomal protein L4  36.82 
 
 		 207 aa  125  5e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000521211  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0216  50S ribosomal protein L4  42.61 
 
 		 206 aa  125  5e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320704  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1014  50S ribosomal protein L4  40 
 
 		 219 aa  125  6e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1031  50S ribosomal protein L4  40 
 
 		 219 aa  125  6e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.658773 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>