More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0768 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0768  50S ribosomal protein L4  100 
 
 		 211 aa  429  1e-119  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000241518  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0490  50S ribosomal protein L4  55.56 
 
 		 209 aa  236  2e-61  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.789827  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0195  LSU ribosomal protein L4P  41.29 
 
 		 207 aa  173  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00135777  normal  0.0747506 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0868  50S ribosomal protein L4  43.07 
 
 		 206 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000685593  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0226  ribosomal protein L4/L1e  40 
 
 		 207 aa  167  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2459  50S ribosomal protein L4P  37.5 
 
 		 207 aa  162  3e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0863955 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0112  50S ribosomal protein L4  40 
 
 		 207 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000123482  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1744  50S ribosomal protein L4  36.95 
 
 		 208 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000318286  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0216  50S ribosomal protein L4  39 
 
 		 206 aa  161  7e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320704  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2063  50S ribosomal protein L4  41.46 
 
 		 208 aa  160  9e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000340203  normal  0.385687 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_418  ribosomal protein L4  38.35 
 
 		 210 aa  160  1e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00538527  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2276  50S ribosomal protein L4  38.61 
 
 		 207 aa  159  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000009811  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2317  50S ribosomal protein L4  38.61 
 
 		 207 aa  159  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000134967  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3666  50S ribosomal protein L4  37.44 
 
 		 206 aa  159  3e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000305367  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0105  50S ribosomal protein L4  38 
 
 		 207 aa  159  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000104823  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2422  50S ribosomal protein L4  37.5 
 
 		 208 aa  159  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00578828  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0452  50S ribosomal protein L4  37.86 
 
 		 210 aa  159  4e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000515236  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2228  50S ribosomal protein L4  38.94 
 
 		 208 aa  159  4e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169782  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0108  50S ribosomal protein L4  39.5 
 
 		 207 aa  159  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0475  50S ribosomal protein L4  37.5 
 
 		 210 aa  158  7e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00700158  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2904  50S ribosomal protein L4  40.39 
 
 		 208 aa  157  9e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000879055  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0106  50S ribosomal protein L4  37.5 
 
 		 207 aa  157  9e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000544936  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2332  ribosomal protein L4/L1e  38.61 
 
 		 207 aa  157  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000847375  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1830  50S ribosomal protein L4  38.19 
 
 		 207 aa  156  2e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0478396  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0111  50S ribosomal protein L4  37 
 
 		 207 aa  156  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000572324  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0111  50S ribosomal protein L4  37 
 
 		 207 aa  156  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000900585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0107  50S ribosomal protein L4  37 
 
 		 207 aa  156  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.56557e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0105  50S ribosomal protein L4  37 
 
 		 207 aa  156  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000256275  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0132  50S ribosomal protein L4  37 
 
 		 207 aa  156  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000136863  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0111  50S ribosomal protein L4  37 
 
 		 207 aa  156  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000163463  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0142  50S ribosomal protein L4  37 
 
 		 207 aa  156  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000690155  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0123  50S ribosomal protein L4  37 
 
 		 207 aa  156  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.21989e-61 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5194  50S ribosomal protein L4  37 
 
 		 207 aa  156  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000834057  unclonable  1.98377e-25 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01180  ribosomal protein L4/L1e  42 
 
 		 209 aa  155  4e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000715314  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0423  50S ribosomal protein L4  37.81 
 
 		 207 aa  155  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000203712  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0290  ribosomal protein L4/L1e  39.22 
 
 		 208 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00437959  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0181  50S ribosomal protein L4  38.94 
 
 		 208 aa  154  1e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000196789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1523  ribosomal protein L4/L1e  40.1 
 
 		 207 aa  154  1e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.790483  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1850  50S ribosomal protein L4  38.94 
 
 		 208 aa  153  2e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264817  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0292  50S ribosomal protein L4  38.27 
 
 		 205 aa  153  2e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000472593  unclonable  1.9716100000000001e-28 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4004  ribosomal protein L4/L1e  41.45 
 
 		 215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.070535  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0759  50S ribosomal protein L4  36.63 
 
 		 207 aa  152  4e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000566858  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1183  ribosomal protein L4/L1e  36.45 
 
 		 208 aa  152  5e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000599505  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1556  ribosomal protein L4/L1e  41.15 
 
 		 207 aa  151  5.9999999999999996e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427554  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1573  ribosomal protein L4/L1e  34.33 
 
 		 207 aa  149  2e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000791532  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1148  50S ribosomal protein L4  40.7 
 
 		 209 aa  150  2e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000671055  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0287  50S ribosomal protein L4  37 
 
 		 206 aa  149  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0371511  hitchhiker  0.00627174 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0709  50S ribosomal protein L4  38.46 
 
 		 205 aa  149  3e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0382078  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2713  50S ribosomal protein L4  35.64 
 
 		 204 aa  149  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2295  50S ribosomal protein L4  38.94 
 
 		 208 aa  148  8e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0333756  hitchhiker  0.00351228 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1837  ribosomal protein L4/L1e  39.05 
 
 		 215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00300997  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2398  50S ribosomal protein L4  35.15 
 
 		 204 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000730975  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2710  ribosomal protein L4/L1e  36.82 
 
 		 206 aa  145  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000254915  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0290  50S ribosomal protein L4  37.02 
 
 		 212 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0196  50S ribosomal protein L4  41.06 
 
 		 210 aa  145  4.0000000000000006e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.371225 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4025  ribosomal protein L4/L1e  36.97 
 
 		 221 aa  145  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000717748 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1184  ribosomal protein L4/L1e  36.55 
 
 		 223 aa  145  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05720  50S ribosomal protein L4  38.69 
 
 		 208 aa  145  4.0000000000000006e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.316206  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0603  ribosomal protein L4/L1e  37.98 
 
 		 209 aa  145  5e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1482  50S ribosomal protein L4  34.67 
 
 		 207 aa  144  1e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000984788  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4916  ribosomal protein L4/L1e  35.89 
 
 		 209 aa  143  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.1186  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1937  50S ribosomal protein L4  36.23 
 
 		 209 aa  142  4e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0681  50S ribosomal protein L4  36.04 
 
 		 207 aa  142  4e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.486374  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl124  50S ribosomal protein L4  37.8 
 
 		 208 aa  141  6e-33  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000604234  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2560  50S ribosomal protein L4/L1e  35.55 
 
 		 210 aa  141  6e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0559575  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0848  50S ribosomal protein L4P  33.67 
 
 		 207 aa  141  8e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000392239  decreased coverage  0.0000122182 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0059  50S ribosomal protein L4  31.82 
 
 		 207 aa  141  9e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0599605  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0843  ribosomal protein L4/L1e  39.81 
 
 		 214 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0716  ribosomal protein L4/L1e  35.12 
 
 		 223 aa  139  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1906  50S ribosomal protein L4  32 
 
 		 207 aa  139  3e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000335339  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0954  50S ribosomal protein L4  36.11 
 
 		 221 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000111144  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0702  50S ribosomal protein L4  35.15 
 
 		 206 aa  138  4.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000569503  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2687  50S ribosomal protein L4  37.44 
 
 		 206 aa  138  6e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0662732  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0375  50S ribosomal protein L4  37.38 
 
 		 211 aa  138  7.999999999999999e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17391  50S ribosomal protein L4  36.95 
 
 		 210 aa  137  8.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0193  ribosomal protein L4/L1e  36.06 
 
 		 214 aa  137  1e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0427  50S ribosomal protein L4  39.89 
 
 		 200 aa  137  1e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000154423  decreased coverage  0.00000614317 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1616  ribosomal protein L4/L1e  37.2 
 
 		 212 aa  137  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0982  ribosomal protein L4/L1e  37.62 
 
 		 209 aa  137  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.532922  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0695  50S ribosomal protein L4  35.89 
 
 		 208 aa  136  2e-31  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2256  50S ribosomal protein L4  35 
 
 		 206 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000129639  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0789  50S ribosomal protein L4  33.8 
 
 		 221 aa  135  3.0000000000000003e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0396  50S ribosomal protein L4  35.61 
 
 		 209 aa  136  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16771  50S ribosomal protein L4  38.35 
 
 		 211 aa  135  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0857  50S ribosomal protein L4  36.76 
 
 		 205 aa  135  4e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1347  50S ribosomal protein L4  32.31 
 
 		 206 aa  135  5e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3011  50S ribosomal protein L4  36.41 
 
 		 212 aa  135  5e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00787083 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0197  50S ribosomal protein L4  34.01 
 
 		 207 aa  135  5e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00203095  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2645  50S ribosomal protein L4  35.5 
 
 		 222 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264538  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3447  50S ribosomal protein L4  36.32 
 
 		 206 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.628566 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17641  50S ribosomal protein L4  37.44 
 
 		 210 aa  134  9e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2401  50S ribosomal protein L4  31 
 
 		 208 aa  134  9e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17481  50S ribosomal protein L4  37.44 
 
 		 210 aa  134  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.533381  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5125  ribosomal protein L4/L1e  37.3 
 
 		 223 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2618  50S ribosomal protein L4/L1e  39.34 
 
 		 206 aa  134  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0455519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1956  50S ribosomal protein L4  36.89 
 
 		 211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1649  50S ribosomal protein L4  37.44 
 
 		 210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23031  50S ribosomal protein L4  36.41 
 
 		 211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0692  50S ribosomal protein L4  37.32 
 
 		 210 aa  132  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000477042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16230  ribosomal protein L4  34.5 
 
 		 207 aa  132  3e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.308573  decreased coverage  0.0000000146284 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>