More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0196 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010830  Aasi_0196  50S ribosomal protein L4  100 
 
 		 210 aa  425  1e-118  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.371225 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4344  50S ribosomal protein L4  62.5 
 
 		 209 aa  276  1e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000409516  normal  0.126717 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05720  50S ribosomal protein L4  58.94 
 
 		 208 aa  265  5e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.316206  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0603  ribosomal protein L4/L1e  60.87 
 
 		 209 aa  264  8e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3161  50S ribosomal protein L4  59.62 
 
 		 208 aa  262  2e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.614669 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0396  50S ribosomal protein L4  56.52 
 
 		 209 aa  253  1.0000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1148  50S ribosomal protein L4  54.68 
 
 		 209 aa  249  1e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000671055  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1937  50S ribosomal protein L4  56.52 
 
 		 209 aa  249  2e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5786  ribosomal protein L4/L1e  57.21 
 
 		 209 aa  246  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.116422 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0843  ribosomal protein L4/L1e  50.48 
 
 		 214 aa  211  5.999999999999999e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1850  50S ribosomal protein L4  49.76 
 
 		 208 aa  206  2e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264817  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0290  50S ribosomal protein L4  48.79 
 
 		 212 aa  203  1e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2422  50S ribosomal protein L4  47.83 
 
 		 208 aa  204  1e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00578828  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2295  50S ribosomal protein L4  49.76 
 
 		 208 aa  202  3e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0333756  hitchhiker  0.00351228 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2228  50S ribosomal protein L4  48.31 
 
 		 208 aa  201  5e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169782  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1616  ribosomal protein L4/L1e  45.41 
 
 		 212 aa  201  8e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0181  50S ribosomal protein L4  49.28 
 
 		 208 aa  199  1.9999999999999998e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000196789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2063  50S ribosomal protein L4  44.44 
 
 		 208 aa  198  6e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000340203  normal  0.385687 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0112  50S ribosomal protein L4  42.65 
 
 		 207 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000123482  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0287  50S ribosomal protein L4  44.83 
 
 		 206 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0371511  hitchhiker  0.00627174 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0108  50S ribosomal protein L4  43.88 
 
 		 207 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0868  50S ribosomal protein L4  42.23 
 
 		 206 aa  170  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000685593  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0105  50S ribosomal protein L4  41.87 
 
 		 207 aa  167  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000104823  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5194  50S ribosomal protein L4  41.87 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000834057  unclonable  1.98377e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0111  50S ribosomal protein L4  41.87 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000572324  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0111  50S ribosomal protein L4  41.87 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000900585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0107  50S ribosomal protein L4  41.87 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.56557e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0105  50S ribosomal protein L4  41.87 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000256275  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0123  50S ribosomal protein L4  41.87 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.21989e-61 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0132  50S ribosomal protein L4  41.87 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000136863  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0111  50S ribosomal protein L4  41.87 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000163463  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0142  50S ribosomal protein L4  41.87 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000690155  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3666  50S ribosomal protein L4  40.98 
 
 		 206 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000305367  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0106  50S ribosomal protein L4  41.38 
 
 		 207 aa  165  4e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000544936  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1482  50S ribosomal protein L4  42.86 
 
 		 207 aa  163  1.0000000000000001e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000984788  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0290  ribosomal protein L4/L1e  42.44 
 
 		 208 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00437959  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16230  ribosomal protein L4  43.16 
 
 		 207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.308573  decreased coverage  0.0000000146284 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2459  50S ribosomal protein L4P  41.33 
 
 		 207 aa  162  4.0000000000000004e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0863955 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2317  50S ribosomal protein L4  40.3 
 
 		 207 aa  162  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000134967  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2276  50S ribosomal protein L4  40.3 
 
 		 207 aa  162  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000009811  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0195  LSU ribosomal protein L4P  43.23 
 
 		 207 aa  161  8.000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00135777  normal  0.0747506 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1523  ribosomal protein L4/L1e  42.57 
 
 		 207 aa  160  9e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.790483  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01180  ribosomal protein L4/L1e  43.15 
 
 		 209 aa  160  9e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000715314  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2332  ribosomal protein L4/L1e  39.32 
 
 		 207 aa  159  3e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000847375  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0216  50S ribosomal protein L4  42.65 
 
 		 206 aa  159  4e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320704  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0423  50S ribosomal protein L4  40.89 
 
 		 207 aa  157  8e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000203712  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1830  50S ribosomal protein L4  38.81 
 
 		 207 aa  157  1e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0478396  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10010  LSU ribosomal protein L4P  44.9 
 
 		 207 aa  157  1e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000045126  hitchhiker  0.00000000148432 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1183  ribosomal protein L4/L1e  40.59 
 
 		 208 aa  157  1e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000599505  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0226  ribosomal protein L4/L1e  41.58 
 
 		 207 aa  157  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0197  50S ribosomal protein L4  40.1 
 
 		 207 aa  155  3e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00203095  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4916  ribosomal protein L4/L1e  42.29 
 
 		 209 aa  155  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.1186  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2560  50S ribosomal protein L4/L1e  42.54 
 
 		 210 aa  155  4e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0559575  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0768  50S ribosomal protein L4  41.06 
 
 		 211 aa  155  5.0000000000000005e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000241518  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0059  50S ribosomal protein L4  41.03 
 
 		 207 aa  154  9e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0599605  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2710  ribosomal protein L4/L1e  40 
 
 		 206 aa  154  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000254915  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2904  50S ribosomal protein L4  39.32 
 
 		 208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000879055  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0266  50S ribosomal protein L4  42.35 
 
 		 200 aa  151  5.9999999999999996e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000651042  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1906  50S ribosomal protein L4  41.12 
 
 		 207 aa  151  7e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000335339  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0702  50S ribosomal protein L4  40.54 
 
 		 206 aa  151  8e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000569503  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0193  ribosomal protein L4/L1e  40.58 
 
 		 214 aa  150  8.999999999999999e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1137  50S ribosomal protein L4  39.8 
 
 		 223 aa  150  8.999999999999999e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000824266  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1573  ribosomal protein L4/L1e  41.46 
 
 		 207 aa  150  1e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000791532  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3447  50S ribosomal protein L4  41.15 
 
 		 206 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.628566 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2713  50S ribosomal protein L4  42.86 
 
 		 204 aa  150  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2398  50S ribosomal protein L4  42.86 
 
 		 204 aa  149  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000730975  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0789  50S ribosomal protein L4  41 
 
 		 221 aa  149  2e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1744  50S ribosomal protein L4  37.86 
 
 		 208 aa  149  3e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000318286  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0596  50S ribosomal protein L4P  40 
 
 		 207 aa  149  4e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000475036  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5069  50S ribosomal protein L4  41.83 
 
 		 206 aa  148  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.312873  normal  0.444752 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0695  50S ribosomal protein L4  38.46 
 
 		 208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1677  50S ribosomal protein L4  38.94 
 
 		 206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375579  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1680  50S ribosomal protein L4  39.71 
 
 		 206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.097299  hitchhiker  0.0000499421 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3011  50S ribosomal protein L4  40.66 
 
 		 212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00787083 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1556  ribosomal protein L4/L1e  37.31 
 
 		 207 aa  145  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427554  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3666  50S ribosomal protein L4  41.83 
 
 		 206 aa  145  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl124  50S ribosomal protein L4  39 
 
 		 208 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000604234  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3183  50S ribosomal protein L4  40.87 
 
 		 206 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.611189 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2401  50S ribosomal protein L4  36.59 
 
 		 208 aa  145  4.0000000000000006e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0982  ribosomal protein L4/L1e  39.58 
 
 		 209 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.532922  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0579  50S ribosomal protein L4  41.15 
 
 		 206 aa  145  5e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0759  50S ribosomal protein L4  41.8 
 
 		 207 aa  145  5e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000566858  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0963  ribosomal protein L4/L1e  40.64 
 
 		 207 aa  144  1e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000403747  hitchhiker  0.0000000000267396 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2231  50S ribosomal protein L4  44.12 
 
 		 210 aa  144  1e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.402946 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1293  50S ribosomal protein L4  39.38 
 
 		 235 aa  143  1e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000803665  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1393  50S ribosomal protein L4  39.38 
 
 		 235 aa  143  1e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000162338  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0954  50S ribosomal protein L4  37.62 
 
 		 221 aa  144  1e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000111144  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3704  50S ribosomal protein L4  41.21 
 
 		 210 aa  143  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0692  50S ribosomal protein L4  37.44 
 
 		 210 aa  143  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000477042  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1837  ribosomal protein L4/L1e  37.14 
 
 		 215 aa  143  2e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00300997  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2296  50S ribosomal protein L4  39.42 
 
 		 206 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.214587 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1341  ribosomal protein L4/L1e  40.84 
 
 		 210 aa  142  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4025  ribosomal protein L4/L1e  37.5 
 
 		 221 aa  142  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000717748 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1184  ribosomal protein L4/L1e  38 
 
 		 223 aa  142  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3023  ribosomal protein L4/L1e  36.49 
 
 		 222 aa  142  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443321  normal  0.0189884 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1365  50S ribosomal protein L4  40.38 
 
 		 206 aa  142  4e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.65413  normal  0.580974 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0490  50S ribosomal protein L4  39.32 
 
 		 209 aa  141  9e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.789827  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1232  50S ribosomal protein L4  37.5 
 
 		 206 aa  140  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.24642  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0716  ribosomal protein L4/L1e  37.07 
 
 		 223 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1195  50S ribosomal protein L4  37.5 
 
 		 206 aa  140  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.280242  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>