More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3011 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_3011  50S ribosomal protein L4  100 
 
 		 212 aa  433  1e-120  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00787083 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0251  50S ribosomal protein L4  69.52 
 
 		 211 aa  317  1e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0248  50S ribosomal protein L4  69.52 
 
 		 211 aa  317  1e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.890563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1293  50S ribosomal protein L4  69.86 
 
 		 210 aa  310  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000205733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0692  50S ribosomal protein L4  70.19 
 
 		 210 aa  309  2e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000477042  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2560  50S ribosomal protein L4/L1e  69.71 
 
 		 210 aa  307  9e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0559575  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3704  50S ribosomal protein L4  65.24 
 
 		 210 aa  299  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2231  50S ribosomal protein L4  63.64 
 
 		 210 aa  290  1e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.402946 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16771  50S ribosomal protein L4  53.08 
 
 		 211 aa  245  4e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23031  50S ribosomal protein L4  52.61 
 
 		 211 aa  245  4.9999999999999997e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1956  50S ribosomal protein L4  53.55 
 
 		 211 aa  242  3e-63  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0375  50S ribosomal protein L4  53.08 
 
 		 211 aa  240  1e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20021  50S ribosomal protein L4  52.13 
 
 		 212 aa  234  6e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1128  50S ribosomal protein L4  52.13 
 
 		 211 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17391  50S ribosomal protein L4  53.96 
 
 		 210 aa  233  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1649  50S ribosomal protein L4  52.97 
 
 		 210 aa  224  1e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17641  50S ribosomal protein L4  52.48 
 
 		 210 aa  224  1e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17481  50S ribosomal protein L4  51.98 
 
 		 210 aa  221  4.9999999999999996e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.533381  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0868  50S ribosomal protein L4  48.57 
 
 		 206 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000685593  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3666  50S ribosomal protein L4  48.34 
 
 		 206 aa  196  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000305367  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40690  Plastid ribosomal protein L4 large ribosomal subunit  46.63 
 
 		 251 aa  195  5.000000000000001e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0108  50S ribosomal protein L4  46.41 
 
 		 207 aa  191  6e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0195  LSU ribosomal protein L4P  44.29 
 
 		 207 aa  187  1e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00135777  normal  0.0747506 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0216  50S ribosomal protein L4  45.93 
 
 		 206 aa  186  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320704  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2459  50S ribosomal protein L4P  43.54 
 
 		 207 aa  186  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0863955 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2713  50S ribosomal protein L4  46.04 
 
 		 204 aa  186  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2398  50S ribosomal protein L4  46.04 
 
 		 204 aa  186  2e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000730975  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0789  50S ribosomal protein L4  42.86 
 
 		 221 aa  186  3e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1523  ribosomal protein L4/L1e  45.5 
 
 		 207 aa  185  3e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.790483  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0423  50S ribosomal protein L4  47.37 
 
 		 207 aa  184  6e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000203712  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01180  ribosomal protein L4/L1e  46.73 
 
 		 209 aa  183  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000715314  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0112  50S ribosomal protein L4  44.02 
 
 		 207 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000123482  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1744  50S ribosomal protein L4  44.13 
 
 		 208 aa  181  7e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000318286  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0954  50S ribosomal protein L4  45.09 
 
 		 221 aa  181  8.000000000000001e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000111144  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0106  50S ribosomal protein L4  44.02 
 
 		 207 aa  179  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000544936  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0287  50S ribosomal protein L4  44.5 
 
 		 206 aa  179  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0371511  hitchhiker  0.00627174 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2904  50S ribosomal protein L4  46.6 
 
 		 208 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000879055  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0142  50S ribosomal protein L4  43.54 
 
 		 207 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000690155  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0111  50S ribosomal protein L4  43.54 
 
 		 207 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000572324  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0111  50S ribosomal protein L4  43.54 
 
 		 207 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000900585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0107  50S ribosomal protein L4  43.54 
 
 		 207 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.56557e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0105  50S ribosomal protein L4  43.54 
 
 		 207 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000256275  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0123  50S ribosomal protein L4  43.54 
 
 		 207 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.21989e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0111  50S ribosomal protein L4  43.54 
 
 		 207 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000163463  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5194  50S ribosomal protein L4  43.54 
 
 		 207 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000834057  unclonable  1.98377e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0132  50S ribosomal protein L4  43.54 
 
 		 207 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000136863  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0226  ribosomal protein L4/L1e  44.02 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1573  ribosomal protein L4/L1e  46.8 
 
 		 207 aa  176  3e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000791532  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2332  ribosomal protein L4/L1e  41.9 
 
 		 207 aa  173  9.999999999999999e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000847375  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0105  50S ribosomal protein L4  43.06 
 
 		 207 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000104823  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16230  ribosomal protein L4  42.58 
 
 		 207 aa  172  1.9999999999999998e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.308573  decreased coverage  0.0000000146284 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1137  50S ribosomal protein L4  43.5 
 
 		 223 aa  171  5.999999999999999e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000824266  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2710  ribosomal protein L4/L1e  42.38 
 
 		 206 aa  171  6.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000254915  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0759  50S ribosomal protein L4  44.83 
 
 		 207 aa  169  4e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000566858  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0716  ribosomal protein L4/L1e  44.12 
 
 		 223 aa  168  6e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2064  50S ribosomal protein L4  43 
 
 		 206 aa  168  7e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000384651  normal  0.231159 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1830  50S ribosomal protein L4  44.29 
 
 		 207 aa  167  8e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0478396  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1183  ribosomal protein L4/L1e  43.63 
 
 		 208 aa  167  1e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000599505  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2295  50S ribosomal protein L4  44.44 
 
 		 208 aa  165  4e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0333756  hitchhiker  0.00351228 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2401  50S ribosomal protein L4  43.5 
 
 		 208 aa  165  4e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0059  50S ribosomal protein L4  42.58 
 
 		 207 aa  164  8e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0599605  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0193  ribosomal protein L4/L1e  44.02 
 
 		 214 aa  163  2.0000000000000002e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0292  50S ribosomal protein L4  42.38 
 
 		 205 aa  163  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000472593  unclonable  1.9716100000000001e-28 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2317  50S ribosomal protein L4  42.92 
 
 		 207 aa  162  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000134967  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2276  50S ribosomal protein L4  42.92 
 
 		 207 aa  162  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000009811  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1906  50S ribosomal protein L4  42.11 
 
 		 207 aa  162  5.0000000000000005e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000335339  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0603  ribosomal protein L4/L1e  40.58 
 
 		 209 aa  161  7e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0197  50S ribosomal protein L4  39.61 
 
 		 207 aa  161  7e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00203095  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10010  LSU ribosomal protein L4P  42.58 
 
 		 207 aa  160  2e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000045126  hitchhiker  0.00000000148432 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2422  50S ribosomal protein L4  42.18 
 
 		 208 aa  160  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00578828  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0596  50S ribosomal protein L4P  37.91 
 
 		 207 aa  159  3e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000475036  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1764  50S ribosomal protein L4  42.31 
 
 		 206 aa  159  3e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00135584  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1148  50S ribosomal protein L4  39.23 
 
 		 209 aa  158  7e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000671055  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2063  50S ribosomal protein L4  44.12 
 
 		 208 aa  158  7e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000340203  normal  0.385687 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1837  ribosomal protein L4/L1e  40.57 
 
 		 215 aa  157  1e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00300997  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0961  50S ribosomal protein L4  43.82 
 
 		 204 aa  157  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000392469  hitchhiker  0.00000164794 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1293  50S ribosomal protein L4  41.63 
 
 		 235 aa  156  2e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000803665  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1393  50S ribosomal protein L4  41.63 
 
 		 235 aa  156  2e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000162338  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0982  ribosomal protein L4/L1e  39.05 
 
 		 209 aa  155  3e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.532922  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl124  50S ribosomal protein L4  42.03 
 
 		 208 aa  155  4e-37  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000604234  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2773  50S ribosomal protein L4  40.87 
 
 		 206 aa  155  4e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0187174  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0181  50S ribosomal protein L4  40.76 
 
 		 208 aa  155  4e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000196789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2256  50S ribosomal protein L4  40.87 
 
 		 206 aa  155  4e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000129639  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0963  ribosomal protein L4/L1e  40.67 
 
 		 207 aa  155  4e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000403747  hitchhiker  0.0000000000267396 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0290  ribosomal protein L4/L1e  42.86 
 
 		 208 aa  154  6e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00437959  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0695  50S ribosomal protein L4  42.36 
 
 		 208 aa  154  8e-37  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1937  50S ribosomal protein L4  39.62 
 
 		 209 aa  152  2e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1850  50S ribosomal protein L4  41.83 
 
 		 208 aa  153  2e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264817  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0848  50S ribosomal protein L4P  38.94 
 
 		 207 aa  152  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000392239  decreased coverage  0.0000122182 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0720  50S ribosomal protein L4  43.65 
 
 		 201 aa  153  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000427281  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0490  50S ribosomal protein L4  39.6 
 
 		 209 aa  152  2.9999999999999998e-36  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.789827  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0627  ribosomal protein L4  40.56 
 
 		 200 aa  152  5e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000698865  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4547  50S ribosomal protein L4  40.56 
 
 		 200 aa  152  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0714588  normal  0.0640617 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1556  ribosomal protein L4/L1e  38.68 
 
 		 207 aa  152  5e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427554  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05720  50S ribosomal protein L4  38.65 
 
 		 208 aa  151  5.9999999999999996e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.316206  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2228  50S ribosomal protein L4  40.28 
 
 		 208 aa  151  8e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169782  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1482  50S ribosomal protein L4  39.2 
 
 		 207 aa  150  1e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000984788  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4344  50S ribosomal protein L4  39.61 
 
 		 209 aa  150  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000409516  normal  0.126717 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0490  50S ribosomal protein L4  44.63 
 
 		 200 aa  149  2e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000109229  normal  0.0102301 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0838  50S ribosomal protein L4  42.78 
 
 		 200 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33315  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>