More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2618 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2618  50S ribosomal protein L4/L1e  100 
 
 
206 aa  421  1e-117  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0455519  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2906  ribosomal protein L4/L1e  72.64 
 
 
211 aa  303  1.0000000000000001e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1866  50S ribosomal protein L4  57.58 
 
 
213 aa  217  8.999999999999998e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0257015  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0266  50S ribosomal protein L4  47.25 
 
 
200 aa  163  1.0000000000000001e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000651042  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0290  ribosomal protein L4/L1e  42.64 
 
 
208 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00437959  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0709  50S ribosomal protein L4  46.88 
 
 
205 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0382078  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4004  ribosomal protein L4/L1e  46.56 
 
 
215 aa  153  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.070535  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2124  50S ribosomal protein L4  43.23 
 
 
206 aa  149  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2441  50S ribosomal protein L4  43.23 
 
 
206 aa  149  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.527594  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1909  50S ribosomal protein L4  43.23 
 
 
206 aa  149  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00049189  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2163  50S ribosomal protein L4  43.23 
 
 
206 aa  149  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.591953 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0352  50S ribosomal protein L4  41.62 
 
 
206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1556  ribosomal protein L4/L1e  39.59 
 
 
207 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427554  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2967  50S ribosomal protein L4  42.08 
 
 
204 aa  145  5e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.191884  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2219  50S ribosomal protein L4  43.26 
 
 
206 aa  142  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.372251  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2459  50S ribosomal protein L4P  43.33 
 
 
207 aa  142  5e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0863955 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0702  50S ribosomal protein L4  42.78 
 
 
206 aa  141  7e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000569503  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2019  50S ribosomal protein L4  42.71 
 
 
206 aa  140  9e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1945  50S ribosomal protein L4  43.23 
 
 
206 aa  140  9e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1232  50S ribosomal protein L4  41.67 
 
 
206 aa  139  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.24642  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1195  50S ribosomal protein L4  41.67 
 
 
206 aa  139  3e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.280242  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1680  50S ribosomal protein L4  42.78 
 
 
206 aa  139  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.097299  hitchhiker  0.0000499421 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1934  50S ribosomal protein L4  42.71 
 
 
206 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0423  50S ribosomal protein L4  42.35 
 
 
207 aa  138  6e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000203712  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0226  ribosomal protein L4/L1e  42.78 
 
 
207 aa  137  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0287  50S ribosomal protein L4  41.9 
 
 
206 aa  137  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0371511  hitchhiker  0.00627174 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1912  50S ribosomal protein L4  42.19 
 
 
206 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.224726 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0934  50S ribosomal protein L4  39.46 
 
 
207 aa  136  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000521211  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3327  50S ribosomal protein L4  39.46 
 
 
207 aa  136  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.78315e-16 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1957  50S ribosomal protein L4  41.01 
 
 
206 aa  136  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0135033  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0106  50S ribosomal protein L4  44.63 
 
 
207 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000544936  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17340  Putative mitochondrial ribosomal protein L4  43.33 
 
 
224 aa  135  4e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000952824  normal  0.0986734 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0563  50S ribosomal protein L4/L1e  44.33 
 
 
216 aa  135  4e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0111  50S ribosomal protein L4  44.07 
 
 
207 aa  134  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000572324  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0111  50S ribosomal protein L4  44.07 
 
 
207 aa  134  7.000000000000001e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000900585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0107  50S ribosomal protein L4  44.07 
 
 
207 aa  134  7.000000000000001e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.56557e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0105  50S ribosomal protein L4  44.07 
 
 
207 aa  134  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000256275  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5194  50S ribosomal protein L4  44.07 
 
 
207 aa  134  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000834057  unclonable  1.98377e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0142  50S ribosomal protein L4  44.07 
 
 
207 aa  134  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000690155  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0111  50S ribosomal protein L4  44.07 
 
 
207 aa  134  7.000000000000001e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000163463  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0132  50S ribosomal protein L4  44.07 
 
 
207 aa  134  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000136863  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0123  50S ribosomal protein L4  44.07 
 
 
207 aa  134  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.21989e-61 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2064  50S ribosomal protein L4  38.89 
 
 
206 aa  134  7.000000000000001e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000384651  normal  0.231159 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0868  50S ribosomal protein L4  41.18 
 
 
206 aa  134  8e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000685593  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0768  50S ribosomal protein L4  39.34 
 
 
211 aa  134  9e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000241518  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1041  50S ribosomal protein L4  44.12 
 
 
219 aa  134  9e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1014  50S ribosomal protein L4  44.12 
 
 
219 aa  134  9e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1031  50S ribosomal protein L4  44.12 
 
 
219 aa  134  9e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.658773 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1945  50S ribosomal protein L4  40.8 
 
 
216 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2687  50S ribosomal protein L4  39.59 
 
 
206 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0662732  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0603  ribosomal protein L4/L1e  36.68 
 
 
209 aa  134  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0105  50S ribosomal protein L4  44.07 
 
 
207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000104823  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0247  50S ribosomal protein L4  40.44 
 
 
205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.767965  normal  0.730186 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1573  ribosomal protein L4/L1e  40.86 
 
 
207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000791532  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0112  50S ribosomal protein L4  42.19 
 
 
207 aa  132  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000123482  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01180  ribosomal protein L4/L1e  38.78 
 
 
209 aa  132  3e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000715314  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10716  50S ribosomal protein L4  44.71 
 
 
223 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.311364 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0108  50S ribosomal protein L4  43.58 
 
 
207 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0584  50S ribosomal protein L4  39.09 
 
 
206 aa  132  5e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.745098 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1677  50S ribosomal protein L4  41.67 
 
 
206 aa  132  5e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375579  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1794  50S ribosomal protein L4  41.49 
 
 
211 aa  131  5e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.130776  normal  0.0731355 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2422  50S ribosomal protein L4  38.46 
 
 
208 aa  131  6e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00578828  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5048  50S ribosomal protein L4  43.6 
 
 
218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.5122  normal  0.277146 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2317  50S ribosomal protein L4  42.05 
 
 
207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000134967  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2276  50S ribosomal protein L4  42.05 
 
 
207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000009811  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0680  50S ribosomal protein L4  38.58 
 
 
204 aa  130  2.0000000000000002e-29  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0323983  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0277  50S ribosomal protein L4  39.09 
 
 
205 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.187422  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0579  50S ribosomal protein L4  41.57 
 
 
206 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17150  LSU ribosomal protein L4P  41.12 
 
 
211 aa  128  7.000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2256  50S ribosomal protein L4  40.22 
 
 
206 aa  128  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000129639  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1717  50S ribosomal protein L4  38.07 
 
 
206 aa  127  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.27266  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2710  ribosomal protein L4/L1e  40.57 
 
 
206 aa  127  8.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000254915  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1523  ribosomal protein L4/L1e  43.26 
 
 
207 aa  127  8.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.790483  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0362  50S ribosomal protein L4  38.07 
 
 
206 aa  127  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4320  ribosomal protein L4/L1e  42.33 
 
 
204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3447  50S ribosomal protein L4  41.81 
 
 
206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.628566 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0195  LSU ribosomal protein L4P  36.52 
 
 
207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00135777  normal  0.0747506 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0611  50S ribosomal protein L4  38.64 
 
 
205 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.937443  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0303  ribosomal protein L4/L1e  38.58 
 
 
202 aa  126  2.0000000000000002e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0138909  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5125  ribosomal protein L4/L1e  39.89 
 
 
223 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3161  50S ribosomal protein L4  36.87 
 
 
208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.614669 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1183  ribosomal protein L4/L1e  36.5 
 
 
208 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000599505  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16230  ribosomal protein L4  43.11 
 
 
207 aa  127  2.0000000000000002e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.308573  decreased coverage  0.0000000146284 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1830  50S ribosomal protein L4  40 
 
 
207 aa  125  3e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0478396  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1841  50S ribosomal protein L4  39.89 
 
 
206 aa  126  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00656496  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1482  50S ribosomal protein L4  38.64 
 
 
207 aa  126  3e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000984788  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1306  50S ribosomal protein L4  41.71 
 
 
219 aa  125  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.265076  normal  0.163333 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4916  ribosomal protein L4/L1e  39.33 
 
 
209 aa  125  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.1186  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0982  ribosomal protein L4/L1e  39.18 
 
 
209 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.532922  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2533  50S ribosomal protein L4  38.25 
 
 
206 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.202589  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3023  ribosomal protein L4/L1e  37.57 
 
 
222 aa  125  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443321  normal  0.0189884 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1250  50S ribosomal protein L4  41.67 
 
 
207 aa  125  5e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.919527  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1355  50S ribosomal protein L4  40.57 
 
 
206 aa  125  5e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.700981  normal  0.0533022 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0667  50S ribosomal protein L4  37.93 
 
 
206 aa  125  6e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000764856  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2817  50S ribosomal protein L4  41.11 
 
 
208 aa  125  6e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.477285 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0699  50S ribosomal protein L4  37.93 
 
 
206 aa  125  6e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000231924  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0080  50S ribosomal protein L4  40.78 
 
 
206 aa  124  7e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.186923 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1764  50S ribosomal protein L4  39.66 
 
 
206 aa  124  7e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00135584  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0987  50S ribosomal protein L4  40.45 
 
 
206 aa  124  9e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114211  normal  0.0168487 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0216  50S ribosomal protein L4  40.45 
 
 
206 aa  124  9e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320704  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>