More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0266 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0266  50S ribosomal protein L4  100 
 
 		 200 aa  407  1e-113  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000651042  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0290  ribosomal protein L4/L1e  48.22 
 
 		 208 aa  185  5e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00437959  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2618  50S ribosomal protein L4/L1e  47.25 
 
 		 206 aa  163  1.0000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0455519  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0112  50S ribosomal protein L4  46.6 
 
 		 207 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000123482  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0108  50S ribosomal protein L4  46.91 
 
 		 207 aa  161  7e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2219  50S ribosomal protein L4  43.52 
 
 		 206 aa  158  6e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.372251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0123  50S ribosomal protein L4  44.62 
 
 		 207 aa  155  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.21989e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0111  50S ribosomal protein L4  44.62 
 
 		 207 aa  155  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000572324  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0111  50S ribosomal protein L4  44.62 
 
 		 207 aa  155  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000900585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0107  50S ribosomal protein L4  44.62 
 
 		 207 aa  155  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.56557e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0105  50S ribosomal protein L4  44.62 
 
 		 207 aa  155  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000256275  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5194  50S ribosomal protein L4  44.62 
 
 		 207 aa  155  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000834057  unclonable  1.98377e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0111  50S ribosomal protein L4  44.62 
 
 		 207 aa  155  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000163463  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0132  50S ribosomal protein L4  44.62 
 
 		 207 aa  155  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000136863  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0142  50S ribosomal protein L4  44.62 
 
 		 207 aa  155  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000690155  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0584  50S ribosomal protein L4  44.9 
 
 		 206 aa  155  4e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.745098 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0106  50S ribosomal protein L4  44.62 
 
 		 207 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000544936  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1866  50S ribosomal protein L4  47.59 
 
 		 213 aa  154  7e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0257015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0362  50S ribosomal protein L4  44.33 
 
 		 206 aa  153  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2124  50S ribosomal protein L4  43.01 
 
 		 206 aa  154  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1717  50S ribosomal protein L4  44.33 
 
 		 206 aa  153  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.27266  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0105  50S ribosomal protein L4  43.81 
 
 		 207 aa  153  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000104823  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1841  50S ribosomal protein L4  44.56 
 
 		 206 aa  153  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00656496  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0287  50S ribosomal protein L4  45.88 
 
 		 206 aa  152  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0371511  hitchhiker  0.00627174 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1523  ribosomal protein L4/L1e  44.85 
 
 		 207 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.790483  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2163  50S ribosomal protein L4  43.01 
 
 		 206 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.591953 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3161  50S ribosomal protein L4  43.3 
 
 		 208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.614669 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2441  50S ribosomal protein L4  43.01 
 
 		 206 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.527594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1680  50S ribosomal protein L4  44.56 
 
 		 206 aa  152  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.097299  hitchhiker  0.0000499421 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2533  50S ribosomal protein L4  43.3 
 
 		 206 aa  152  5e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.202589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0277  50S ribosomal protein L4  46.15 
 
 		 205 aa  151  5.9999999999999996e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.187422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1794  50S ribosomal protein L4  41.71 
 
 		 211 aa  151  7e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.130776  normal  0.0731355 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0982  ribosomal protein L4/L1e  44.39 
 
 		 209 aa  151  8e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.532922  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0216  50S ribosomal protein L4  45.36 
 
 		 206 aa  150  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320704  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1909  50S ribosomal protein L4  43.52 
 
 		 206 aa  150  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00049189  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0702  50S ribosomal protein L4  44.68 
 
 		 206 aa  150  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000569503  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05720  50S ribosomal protein L4  41.8 
 
 		 208 aa  150  1e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.316206  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1677  50S ribosomal protein L4  40.62 
 
 		 206 aa  150  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375579  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2332  ribosomal protein L4/L1e  43.81 
 
 		 207 aa  150  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000847375  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4344  50S ribosomal protein L4  41.24 
 
 		 209 aa  149  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000409516  normal  0.126717 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0932  ribosomal protein L4/L1e  43.68 
 
 		 217 aa  148  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1124  ribosomal protein L4/L1e  46.03 
 
 		 248 aa  148  4e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2904  50S ribosomal protein L4  43.08 
 
 		 208 aa  148  5e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000879055  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2906  ribosomal protein L4/L1e  45.11 
 
 		 211 aa  148  5e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1333  50S ribosomal protein L4  40.62 
 
 		 206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.177589 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2276  50S ribosomal protein L4  43.46 
 
 		 207 aa  145  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000009811  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2317  50S ribosomal protein L4  43.46 
 
 		 207 aa  145  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000134967  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0181  50S ribosomal protein L4  38.22 
 
 		 208 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000196789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0247  50S ribosomal protein L4  41.75 
 
 		 205 aa  145  5e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.767965  normal  0.730186 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5786  ribosomal protein L4/L1e  40.74 
 
 		 209 aa  145  6e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.116422 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1431  50S ribosomal protein L4  40.93 
 
 		 206 aa  144  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.112454  normal  0.0117604 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4916  ribosomal protein L4/L1e  43.16 
 
 		 209 aa  144  8.000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.1186  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2228  50S ribosomal protein L4  38.74 
 
 		 208 aa  143  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169782  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2686  ribosomal protein L4/L1e  43.62 
 
 		 206 aa  143  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.751145 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0716  ribosomal protein L4/L1e  40 
 
 		 223 aa  143  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1744  50S ribosomal protein L4  42.78 
 
 		 208 aa  143  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000318286  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0987  50S ribosomal protein L4  40.62 
 
 		 206 aa  142  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114211  normal  0.0168487 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0709  50S ribosomal protein L4  40.82 
 
 		 205 aa  142  3e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0382078  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1556  ribosomal protein L4/L1e  44.1 
 
 		 207 aa  142  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427554  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1830  50S ribosomal protein L4  42.93 
 
 		 207 aa  142  4e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0478396  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2974  50S ribosomal protein L4P  43.09 
 
 		 205 aa  141  5e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2422  50S ribosomal protein L4  40.21 
 
 		 208 aa  141  5e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00578828  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1957  50S ribosomal protein L4  39.38 
 
 		 206 aa  141  7e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0135033  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0352  50S ribosomal protein L4  40.62 
 
 		 206 aa  140  8e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1615  50S ribosomal protein L4  43.81 
 
 		 212 aa  140  9e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.140901 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1250  50S ribosomal protein L4  44.62 
 
 		 207 aa  140  9e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.919527  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0290  50S ribosomal protein L4  39.79 
 
 		 212 aa  140  9.999999999999999e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1232  50S ribosomal protein L4  39.06 
 
 		 206 aa  140  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.24642  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1365  50S ribosomal protein L4  40.93 
 
 		 206 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.65413  normal  0.580974 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4004  ribosomal protein L4/L1e  42.86 
 
 		 215 aa  140  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.070535  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17150  LSU ribosomal protein L4P  42.25 
 
 		 211 aa  140  9.999999999999999e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1546  50S ribosomal protein L4  40.62 
 
 		 206 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0760  50S ribosomal protein L4  42.27 
 
 		 206 aa  140  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.536286  normal  0.490567 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1195  50S ribosomal protein L4  39.06 
 
 		 206 aa  140  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.280242  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0226  ribosomal protein L4/L1e  43.3 
 
 		 207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3447  50S ribosomal protein L4  40.1 
 
 		 206 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.628566 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1087  50S ribosomal protein L4  41.24 
 
 		 215 aa  139  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10489 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0681  50S ribosomal protein L4  40.93 
 
 		 207 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.486374  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0563  50S ribosomal protein L4/L1e  40.21 
 
 		 216 aa  139  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0868  50S ribosomal protein L4  42.86 
 
 		 206 aa  139  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000685593  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0196  50S ribosomal protein L4  42.35 
 
 		 210 aa  139  3e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.371225 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0843  ribosomal protein L4/L1e  39.57 
 
 		 214 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0396  50S ribosomal protein L4  40.93 
 
 		 209 aa  138  4.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1306  50S ribosomal protein L4  41.71 
 
 		 219 aa  138  4.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.265076  normal  0.163333 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2817  50S ribosomal protein L4  39.39 
 
 		 208 aa  138  6e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.477285 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2710  ribosomal protein L4/L1e  40.72 
 
 		 206 aa  138  6e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000254915  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0399  ribosomal protein L4/L1e  41.54 
 
 		 214 aa  137  8.999999999999999e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1850  50S ribosomal protein L4  39.27 
 
 		 208 aa  137  1e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264817  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0583  50S ribosomal protein L4  43.01 
 
 		 245 aa  137  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20860  LSU ribosomal protein L4P  41.05 
 
 		 223 aa  137  1e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.699759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3922  ribosomal protein L4/L1e  42.33 
 
 		 216 aa  137  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2658  ribosomal protein L4/L1e  43.85 
 
 		 228 aa  137  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6048  50S ribosomal protein L4  41.24 
 
 		 247 aa  137  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.239817 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0759  50S ribosomal protein L4  42.56 
 
 		 207 aa  137  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000566858  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0307  50S ribosomal protein L4P  41.45 
 
 		 220 aa  137  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00224676 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0954  50S ribosomal protein L4  41.55 
 
 		 221 aa  137  2e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000111144  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1616  ribosomal protein L4/L1e  39.57 
 
 		 212 aa  136  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1148  50S ribosomal protein L4  39.25 
 
 		 209 aa  136  3.0000000000000003e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000671055  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0667  50S ribosomal protein L4  39.06 
 
 		 206 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000764856  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0699  50S ribosomal protein L4  39.06 
 
 		 206 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000231924  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>