More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_17340 on replicon NC_009365
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009365  OSTLU_17340  Putative mitochondrial ribosomal protein L4  100 
 
 		 224 aa  443  1e-123  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000952824  normal  0.0986734 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2687  50S ribosomal protein L4  48.77 
 
 		 206 aa  180  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0662732  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0584  50S ribosomal protein L4  48.28 
 
 		 206 aa  177  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.745098 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1677  50S ribosomal protein L4  48.28 
 
 		 206 aa  176  3e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375579  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0277  50S ribosomal protein L4  49.75 
 
 		 205 aa  174  9e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.187422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1909  50S ribosomal protein L4  48.76 
 
 		 206 aa  174  9e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00049189  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1945  50S ribosomal protein L4  48.77 
 
 		 216 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1680  50S ribosomal protein L4  46.8 
 
 		 206 aa  173  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.097299  hitchhiker  0.0000499421 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1333  50S ribosomal protein L4  46.27 
 
 		 206 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.177589 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1365  50S ribosomal protein L4  47.29 
 
 		 206 aa  171  7.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.65413  normal  0.580974 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2533  50S ribosomal protein L4  48.26 
 
 		 206 aa  171  9e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.202589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0987  50S ribosomal protein L4  46.8 
 
 		 206 aa  170  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114211  normal  0.0168487 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1615  50S ribosomal protein L4  45.1 
 
 		 212 aa  170  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.140901 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0667  50S ribosomal protein L4  43.28 
 
 		 206 aa  170  2e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000764856  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0699  50S ribosomal protein L4  43.28 
 
 		 206 aa  170  2e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000231924  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1431  50S ribosomal protein L4  45.27 
 
 		 206 aa  169  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.112454  normal  0.0117604 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1957  50S ribosomal protein L4  44.83 
 
 		 206 aa  169  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0135033  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1841  50S ribosomal protein L4  46.77 
 
 		 206 aa  169  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00656496  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0579  50S ribosomal protein L4  45.81 
 
 		 206 aa  169  4e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0362  50S ribosomal protein L4  48.76 
 
 		 206 aa  168  7e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1717  50S ribosomal protein L4  48.76 
 
 		 206 aa  168  7e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.27266  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2967  50S ribosomal protein L4  48.5 
 
 		 204 aa  168  7e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.191884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1546  50S ribosomal protein L4  47.29 
 
 		 206 aa  167  1e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1232  50S ribosomal protein L4  43.84 
 
 		 206 aa  166  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.24642  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0352  50S ribosomal protein L4  47.76 
 
 		 206 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1195  50S ribosomal protein L4  43.84 
 
 		 206 aa  166  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.280242  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2124  50S ribosomal protein L4  46.31 
 
 		 206 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3447  50S ribosomal protein L4  46.8 
 
 		 206 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.628566 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2441  50S ribosomal protein L4  46.31 
 
 		 206 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.527594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2163  50S ribosomal protein L4  46.31 
 
 		 206 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.591953 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1355  50S ribosomal protein L4  42.86 
 
 		 206 aa  161  7e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.700981  normal  0.0533022 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1794  50S ribosomal protein L4  43.69 
 
 		 211 aa  159  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.130776  normal  0.0731355 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2710  ribosomal protein L4/L1e  44.95 
 
 		 206 aa  159  3e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000254915  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0247  50S ribosomal protein L4  44.83 
 
 		 205 aa  159  4e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.767965  normal  0.730186 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2737  ribosomal protein L4/L1e  48.77 
 
 		 206 aa  158  5e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.508185  normal  0.224795 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0760  50S ribosomal protein L4  48.77 
 
 		 206 aa  157  9e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.536286  normal  0.490567 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5069  50S ribosomal protein L4  44.83 
 
 		 206 aa  157  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.312873  normal  0.444752 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2296  50S ribosomal protein L4  45.81 
 
 		 206 aa  155  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.214587 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2219  50S ribosomal protein L4  43.84 
 
 		 206 aa  155  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.372251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3183  50S ribosomal protein L4  45.32 
 
 		 206 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.611189 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0112  50S ribosomal protein L4  43.22 
 
 		 207 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000123482  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0108  50S ribosomal protein L4  43.22 
 
 		 207 aa  153  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3666  50S ribosomal protein L4  44.83 
 
 		 206 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4314  ribosomal protein L4/L1e  43.07 
 
 		 216 aa  150  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_002978  WD0680  50S ribosomal protein L4  40.91 
 
 		 204 aa  150  1e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0323983  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3922  ribosomal protein L4/L1e  43.56 
 
 		 216 aa  149  3e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0111  50S ribosomal protein L4  43.22 
 
 		 207 aa  148  8e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000572324  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0111  50S ribosomal protein L4  43.22 
 
 		 207 aa  148  8e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000900585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0107  50S ribosomal protein L4  43.22 
 
 		 207 aa  148  8e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.56557e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0105  50S ribosomal protein L4  43.22 
 
 		 207 aa  148  8e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000256275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0111  50S ribosomal protein L4  43.22 
 
 		 207 aa  148  8e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000163463  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0123  50S ribosomal protein L4  43.22 
 
 		 207 aa  148  8e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.21989e-61 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5194  50S ribosomal protein L4  43.22 
 
 		 207 aa  148  8e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000834057  unclonable  1.98377e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0106  50S ribosomal protein L4  43.22 
 
 		 207 aa  148  8e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000544936  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2817  50S ribosomal protein L4  42.51 
 
 		 208 aa  148  8e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.477285 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0142  50S ribosomal protein L4  43.22 
 
 		 207 aa  148  8e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000690155  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0132  50S ribosomal protein L4  43.22 
 
 		 207 aa  148  8e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000136863  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0105  50S ribosomal protein L4  42.71 
 
 		 207 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000104823  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0611  50S ribosomal protein L4  40.59 
 
 		 205 aa  145  5e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.937443  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0410  50S ribosomal protein L4  41.09 
 
 		 205 aa  145  5e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.498861  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0709  50S ribosomal protein L4  40.39 
 
 		 205 aa  145  6e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0382078  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4916  ribosomal protein L4/L1e  43.88 
 
 		 209 aa  145  6e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.1186  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0868  50S ribosomal protein L4  41.54 
 
 		 206 aa  144  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000685593  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1556  ribosomal protein L4/L1e  42.56 
 
 		 207 aa  142  4e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427554  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6048  50S ribosomal protein L4  42.38 
 
 		 247 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.239817 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2645  50S ribosomal protein L4  38.83 
 
 		 222 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264538  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2276  50S ribosomal protein L4  41.12 
 
 		 207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000009811  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1352  50S ribosomal protein L4  40.98 
 
 		 208 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.149539 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1087  50S ribosomal protein L4  38.83 
 
 		 215 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10489 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2317  50S ribosomal protein L4  41.12 
 
 		 207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000134967  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03990  LSU ribosomal protein L4P  42.18 
 
 		 228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4025  ribosomal protein L4/L1e  39.71 
 
 		 221 aa  136  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000717748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0932  ribosomal protein L4/L1e  41.58 
 
 		 217 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106023  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0563  50S ribosomal protein L4/L1e  39.51 
 
 		 216 aa  136  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4506  ribosomal protein L4/L1e  41.46 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1184  ribosomal protein L4/L1e  39.22 
 
 		 223 aa  136  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1250  50S ribosomal protein L4  43.69 
 
 		 207 aa  135  4e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.919527  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0216  50S ribosomal protein L4  41.92 
 
 		 206 aa  135  5e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320704  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0287  50S ribosomal protein L4  40.4 
 
 		 206 aa  135  5e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0371511  hitchhiker  0.00627174 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2618  50S ribosomal protein L4/L1e  43.33 
 
 		 206 aa  135  5e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0455519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0689  ribosomal protein L4/L1e  38.35 
 
 		 234 aa  135  6.0000000000000005e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.443511 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1183  ribosomal protein L4/L1e  42.05 
 
 		 208 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000599505  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0290  ribosomal protein L4/L1e  41.12 
 
 		 208 aa  134  9.999999999999999e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00437959  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1830  50S ribosomal protein L4  39.6 
 
 		 207 aa  134  9.999999999999999e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0478396  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0059  50S ribosomal protein L4  40.3 
 
 		 207 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0599605  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10010  LSU ribosomal protein L4P  42.16 
 
 		 207 aa  134  9.999999999999999e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000045126  hitchhiker  0.00000000148432 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0716  ribosomal protein L4/L1e  39 
 
 		 223 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0583  50S ribosomal protein L4  40.38 
 
 		 245 aa  133  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0475  50S ribosomal protein L4  37.69 
 
 		 210 aa  132  3e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00700158  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17150  LSU ribosomal protein L4P  40.84 
 
 		 211 aa  133  3e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4320  ribosomal protein L4/L1e  41.88 
 
 		 204 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0226  ribosomal protein L4/L1e  40.72 
 
 		 207 aa  131  6.999999999999999e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10716  50S ribosomal protein L4  40 
 
 		 223 aa  131  7.999999999999999e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.311364 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_418  ribosomal protein L4  36.68 
 
 		 210 aa  131  9e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00538527  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1482  50S ribosomal protein L4  35.68 
 
 		 207 aa  131  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000984788  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2401  50S ribosomal protein L4  39.6 
 
 		 208 aa  130  2.0000000000000002e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2658  ribosomal protein L4/L1e  39.05 
 
 		 228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2906  ribosomal protein L4/L1e  44.57 
 
 		 211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1306  50S ribosomal protein L4  37.86 
 
 		 219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.265076  normal  0.163333 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0452  50S ribosomal protein L4  36.18 
 
 		 210 aa  129  3e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000515236  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>