More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1417 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_1417  ribosomal protein L4/L1e  100 
 
 		 211 aa  429  1e-119  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.977567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0226  ribosomal protein L4/L1e  45.81 
 
 		 207 aa  182  5.0000000000000004e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0287  50S ribosomal protein L4  44.33 
 
 		 206 aa  180  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0371511  hitchhiker  0.00627174 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2459  50S ribosomal protein L4P  43.84 
 
 		 207 aa  177  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0863955 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0216  50S ribosomal protein L4  46.31 
 
 		 206 aa  177  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320704  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1573  ribosomal protein L4/L1e  44.06 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000791532  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0105  50S ribosomal protein L4  45.32 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000104823  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0106  50S ribosomal protein L4  45.32 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000544936  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0123  50S ribosomal protein L4  45.32 
 
 		 207 aa  175  4e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.21989e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0111  50S ribosomal protein L4  45.32 
 
 		 207 aa  175  4e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000572324  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0132  50S ribosomal protein L4  45.32 
 
 		 207 aa  175  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000136863  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0111  50S ribosomal protein L4  45.32 
 
 		 207 aa  175  4e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000900585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0107  50S ribosomal protein L4  45.32 
 
 		 207 aa  175  4e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.56557e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0105  50S ribosomal protein L4  45.32 
 
 		 207 aa  175  4e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000256275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0111  50S ribosomal protein L4  45.32 
 
 		 207 aa  175  4e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000163463  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0142  50S ribosomal protein L4  45.32 
 
 		 207 aa  175  4e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000690155  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5194  50S ribosomal protein L4  45.32 
 
 		 207 aa  175  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000834057  unclonable  1.98377e-25 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0108  50S ribosomal protein L4  43.35 
 
 		 207 aa  175  5e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2398  50S ribosomal protein L4  43.35 
 
 		 204 aa  175  6e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000730975  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2713  50S ribosomal protein L4  43.35 
 
 		 204 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2332  ribosomal protein L4/L1e  43.84 
 
 		 207 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000847375  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0195  LSU ribosomal protein L4P  39.9 
 
 		 207 aa  173  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00135777  normal  0.0747506 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2710  ribosomal protein L4/L1e  44.33 
 
 		 206 aa  172  3.9999999999999995e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000254915  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1523  ribosomal protein L4/L1e  42.93 
 
 		 207 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.790483  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0423  50S ribosomal protein L4  43.69 
 
 		 207 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000203712  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0112  50S ribosomal protein L4  43.35 
 
 		 207 aa  171  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000123482  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2904  50S ribosomal protein L4  42.36 
 
 		 208 aa  169  3e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000879055  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0868  50S ribosomal protein L4  42.36 
 
 		 206 aa  165  5e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000685593  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1183  ribosomal protein L4/L1e  41.46 
 
 		 208 aa  162  3e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000599505  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3666  50S ribosomal protein L4  39.02 
 
 		 206 aa  159  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000305367  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0059  50S ribosomal protein L4  40.98 
 
 		 207 aa  156  2e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0599605  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1744  50S ribosomal protein L4  40.29 
 
 		 208 aa  155  3e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000318286  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3704  50S ribosomal protein L4  45.15 
 
 		 210 aa  155  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0759  50S ribosomal protein L4  38.35 
 
 		 207 aa  154  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000566858  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1906  50S ribosomal protein L4  40.49 
 
 		 207 aa  153  2e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000335339  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1830  50S ribosomal protein L4  40.39 
 
 		 207 aa  152  4e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0478396  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1482  50S ribosomal protein L4  39.41 
 
 		 207 aa  152  4e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000984788  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2276  50S ribosomal protein L4  42.27 
 
 		 207 aa  152  4e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000009811  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2317  50S ribosomal protein L4  42.27 
 
 		 207 aa  152  4e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000134967  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0789  50S ribosomal protein L4  37.44 
 
 		 221 aa  151  5.9999999999999996e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl124  50S ribosomal protein L4  36.06 
 
 		 208 aa  151  7e-36  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000604234  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0716  ribosomal protein L4/L1e  39.13 
 
 		 223 aa  151  8.999999999999999e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0292  50S ribosomal protein L4  36.27 
 
 		 205 aa  150  1e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000472593  unclonable  1.9716100000000001e-28 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0193  ribosomal protein L4/L1e  39.42 
 
 		 214 aa  150  2e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2560  50S ribosomal protein L4/L1e  40.67 
 
 		 210 aa  150  2e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0559575  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01180  ribosomal protein L4/L1e  39.41 
 
 		 209 aa  149  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000715314  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0603  ribosomal protein L4/L1e  39.42 
 
 		 209 aa  149  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1137  50S ribosomal protein L4  35.45 
 
 		 223 aa  148  5e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000824266  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0954  50S ribosomal protein L4  36.57 
 
 		 221 aa  148  6e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000111144  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1293  50S ribosomal protein L4  41.83 
 
 		 210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000205733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1708  50S ribosomal protein L4  42.86 
 
 		 218 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00274066  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2256  50S ribosomal protein L4  40.2 
 
 		 206 aa  145  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000129639  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0584  50S ribosomal protein L4  40.29 
 
 		 206 aa  145  4.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.745098 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1837  ribosomal protein L4/L1e  38.6 
 
 		 215 aa  145  5e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00300997  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4916  ribosomal protein L4/L1e  39.61 
 
 		 209 aa  144  7.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.1186  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1616  ribosomal protein L4/L1e  40.59 
 
 		 212 aa  144  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0692  50S ribosomal protein L4  40 
 
 		 210 aa  144  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000477042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1227  50S ribosomal protein L4  39.11 
 
 		 217 aa  144  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150568  unclonable  0.0000101553 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0080  50S ribosomal protein L4  42.57 
 
 		 206 aa  143  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.186923 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0695  50S ribosomal protein L4  35.1 
 
 		 208 aa  142  4e-33  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1293  50S ribosomal protein L4  35.24 
 
 		 235 aa  142  5e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000803665  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1393  50S ribosomal protein L4  35.24 
 
 		 235 aa  142  5e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000162338  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2422  50S ribosomal protein L4  39.9 
 
 		 208 aa  142  5e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00578828  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0563  50S ribosomal protein L4/L1e  41.21 
 
 		 216 aa  142  5e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2686  ribosomal protein L4/L1e  44.92 
 
 		 206 aa  141  6e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.751145 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2231  50S ribosomal protein L4  39.32 
 
 		 210 aa  141  6e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.402946 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2228  50S ribosomal protein L4  39.61 
 
 		 208 aa  141  7e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169782  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1148  50S ribosomal protein L4  37.68 
 
 		 209 aa  141  7e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000671055  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3922  ribosomal protein L4/L1e  42.93 
 
 		 216 aa  141  8e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29730  LSU ribosomal protein L4P  40.5 
 
 		 234 aa  141  8e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.379343 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5048  50S ribosomal protein L4  41.05 
 
 		 218 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.5122  normal  0.277146 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3142  ribosomal protein L4/L1e  41.15 
 
 		 221 aa  140  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.083105  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2658  ribosomal protein L4/L1e  40.5 
 
 		 228 aa  140  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3183  50S ribosomal protein L4  38.83 
 
 		 206 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.611189 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0251  50S ribosomal protein L4  38.54 
 
 		 211 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3994  ribosomal protein L4/L1e  38.16 
 
 		 212 aa  140  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0248  50S ribosomal protein L4  38.54 
 
 		 211 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.890563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10010  LSU ribosomal protein L4P  41.95 
 
 		 207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000045126  hitchhiker  0.00000000148432 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0628  ribosomal protein L4/L1e  38.86 
 
 		 232 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3011  50S ribosomal protein L4  38.39 
 
 		 212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00787083 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1556  ribosomal protein L4/L1e  36.45 
 
 		 207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427554  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1853  50S ribosomal protein L4  36.71 
 
 		 206 aa  139  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000203721  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0963  ribosomal protein L4/L1e  38.73 
 
 		 207 aa  139  3e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000403747  hitchhiker  0.0000000000267396 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0396  50S ribosomal protein L4  35.1 
 
 		 209 aa  139  3.9999999999999997e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3447  50S ribosomal protein L4  38.83 
 
 		 206 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.628566 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2773  50S ribosomal protein L4  39 
 
 		 206 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0187174  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3666  50S ribosomal protein L4  38.83 
 
 		 206 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4314  ribosomal protein L4/L1e  40.78 
 
 		 216 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2974  50S ribosomal protein L4P  43.85 
 
 		 205 aa  138  4.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2064  50S ribosomal protein L4  37.82 
 
 		 206 aa  138  6e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000384651  normal  0.231159 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0338  50S ribosomal protein L4  36.71 
 
 		 205 aa  138  6e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000059568  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0399  ribosomal protein L4/L1e  41.5 
 
 		 214 aa  138  7e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2401  50S ribosomal protein L4  36.45 
 
 		 208 aa  137  8.999999999999999e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17150  LSU ribosomal protein L4P  41.33 
 
 		 211 aa  137  1e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0579  50S ribosomal protein L4  36.89 
 
 		 206 aa  137  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5069  50S ribosomal protein L4  37.38 
 
 		 206 aa  137  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.312873  normal  0.444752 
 
 
-
 
NC_002936  DET0475  50S ribosomal protein L4  35.07 
 
 		 210 aa  136  2e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00700158  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0181  50S ribosomal protein L4  38.16 
 
 		 208 aa  137  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000196789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1087  50S ribosomal protein L4  39.42 
 
 		 215 aa  136  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10489 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3708  50S ribosomal protein L4  39.47 
 
 		 201 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00180602  normal  0.838559 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>