More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3994 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_3994  ribosomal protein L4/L1e  100 
 
 		 212 aa  431  1e-120  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0193  ribosomal protein L4/L1e  61.72 
 
 		 214 aa  276  2e-73  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0868  50S ribosomal protein L4  49.06 
 
 		 206 aa  202  3e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000685593  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2904  50S ribosomal protein L4  45.28 
 
 		 208 aa  195  4.0000000000000005e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000879055  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0216  50S ribosomal protein L4  48.11 
 
 		 206 aa  194  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320704  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1183  ribosomal protein L4/L1e  46.7 
 
 		 208 aa  190  1e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000599505  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0108  50S ribosomal protein L4  47.17 
 
 		 207 aa  189  4e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0963  ribosomal protein L4/L1e  47.64 
 
 		 207 aa  188  5e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000403747  hitchhiker  0.0000000000267396 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0226  ribosomal protein L4/L1e  46.7 
 
 		 207 aa  187  9e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0195  LSU ribosomal protein L4P  44.34 
 
 		 207 aa  187  1e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00135777  normal  0.0747506 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01180  ribosomal protein L4/L1e  48.11 
 
 		 209 aa  187  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000715314  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1573  ribosomal protein L4/L1e  45.97 
 
 		 207 aa  186  2e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000791532  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16230  ribosomal protein L4  45.5 
 
 		 207 aa  186  3e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.308573  decreased coverage  0.0000000146284 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2459  50S ribosomal protein L4P  44.8 
 
 		 207 aa  185  4e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0863955 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2332  ribosomal protein L4/L1e  44.81 
 
 		 207 aa  185  4e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000847375  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0112  50S ribosomal protein L4  46.7 
 
 		 207 aa  184  7e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000123482  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0954  50S ribosomal protein L4  44.39 
 
 		 221 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000111144  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1482  50S ribosomal protein L4  41.98 
 
 		 207 aa  182  2.0000000000000003e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000984788  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2710  ribosomal protein L4/L1e  45.28 
 
 		 206 aa  181  5.0000000000000004e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000254915  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4916  ribosomal protein L4/L1e  46.6 
 
 		 209 aa  181  6e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.1186  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1523  ribosomal protein L4/L1e  46.23 
 
 		 207 aa  181  8.000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.790483  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0106  50S ribosomal protein L4  46.23 
 
 		 207 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000544936  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0111  50S ribosomal protein L4  46.23 
 
 		 207 aa  180  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000572324  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0132  50S ribosomal protein L4  46.23 
 
 		 207 aa  180  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000136863  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0142  50S ribosomal protein L4  46.23 
 
 		 207 aa  180  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000690155  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0111  50S ribosomal protein L4  46.23 
 
 		 207 aa  180  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000900585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0107  50S ribosomal protein L4  46.23 
 
 		 207 aa  180  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.56557e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0105  50S ribosomal protein L4  46.23 
 
 		 207 aa  180  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000256275  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5194  50S ribosomal protein L4  46.23 
 
 		 207 aa  180  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000834057  unclonable  1.98377e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0111  50S ribosomal protein L4  46.23 
 
 		 207 aa  180  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000163463  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0123  50S ribosomal protein L4  46.23 
 
 		 207 aa  180  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.21989e-61 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0287  50S ribosomal protein L4  44.34 
 
 		 206 aa  179  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0371511  hitchhiker  0.00627174 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0596  50S ribosomal protein L4P  45.97 
 
 		 207 aa  179  2e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000475036  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0789  50S ribosomal protein L4  42.15 
 
 		 221 aa  178  4e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3666  50S ribosomal protein L4  43.4 
 
 		 206 aa  179  4e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000305367  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4314  ribosomal protein L4/L1e  43.9 
 
 		 216 aa  177  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1830  50S ribosomal protein L4  44.6 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0478396  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0105  50S ribosomal protein L4  45.28 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000104823  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2398  50S ribosomal protein L4  44.34 
 
 		 204 aa  176  2e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000730975  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2713  50S ribosomal protein L4  44.34 
 
 		 204 aa  176  3e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10010  LSU ribosomal protein L4P  45.28 
 
 		 207 aa  176  3e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000045126  hitchhiker  0.00000000148432 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3142  ribosomal protein L4/L1e  41.18 
 
 		 221 aa  174  6e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.083105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3922  ribosomal protein L4/L1e  43.27 
 
 		 216 aa  173  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1087  50S ribosomal protein L4  42.31 
 
 		 215 aa  173  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10489 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0563  50S ribosomal protein L4/L1e  42.44 
 
 		 216 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1160  ribosomal protein L4/L1e  40.57 
 
 		 208 aa  173  1.9999999999999998e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000738717  hitchhiker  0.000000590673 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1137  50S ribosomal protein L4  42.48 
 
 		 223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000824266  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0759  50S ribosomal protein L4  43.4 
 
 		 207 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000566858  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5048  50S ribosomal protein L4  45.81 
 
 		 218 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.5122  normal  0.277146 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2401  50S ribosomal protein L4  41.59 
 
 		 208 aa  172  3.9999999999999995e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2276  50S ribosomal protein L4  41.78 
 
 		 207 aa  171  6.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000009811  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2317  50S ribosomal protein L4  41.78 
 
 		 207 aa  171  6.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000134967  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0423  50S ribosomal protein L4  42.45 
 
 		 207 aa  171  9e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000203712  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20860  LSU ribosomal protein L4P  42.44 
 
 		 223 aa  170  1e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.699759  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl124  50S ribosomal protein L4  43.33 
 
 		 208 aa  169  4e-41  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000604234  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3434  ribosomal protein L4/L1e  42.23 
 
 		 217 aa  168  7e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2228  50S ribosomal protein L4  45.28 
 
 		 208 aa  167  7e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169782  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1744  50S ribosomal protein L4  41.59 
 
 		 208 aa  167  8e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000318286  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0292  50S ribosomal protein L4  42.92 
 
 		 205 aa  167  9e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000472593  unclonable  1.9716100000000001e-28 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10716  50S ribosomal protein L4  44.55 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.311364 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1306  50S ribosomal protein L4  43.56 
 
 		 219 aa  167  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.265076  normal  0.163333 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1041  50S ribosomal protein L4  42.86 
 
 		 219 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1014  50S ribosomal protein L4  42.86 
 
 		 219 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1031  50S ribosomal protein L4  42.86 
 
 		 219 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.658773 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29730  LSU ribosomal protein L4P  42.36 
 
 		 234 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.379343 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03990  LSU ribosomal protein L4P  42.86 
 
 		 228 aa  166  2.9999999999999998e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2658  ribosomal protein L4/L1e  41.75 
 
 		 228 aa  165  4e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0716  ribosomal protein L4/L1e  42.31 
 
 		 223 aa  164  6.9999999999999995e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2422  50S ribosomal protein L4  44.81 
 
 		 208 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00578828  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0689  ribosomal protein L4/L1e  42 
 
 		 234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.443511 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1906  50S ribosomal protein L4  41.51 
 
 		 207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000335339  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2856  50S ribosomal protein L4  40.76 
 
 		 207 aa  162  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400345  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3023  ribosomal protein L4/L1e  41.55 
 
 		 222 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443321  normal  0.0189884 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2686  ribosomal protein L4/L1e  45.5 
 
 		 206 aa  160  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.751145 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0692  50S ribosomal protein L4  48.35 
 
 		 210 aa  160  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000477042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0628  ribosomal protein L4/L1e  39.71 
 
 		 232 aa  160  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1184  ribosomal protein L4/L1e  41.79 
 
 		 223 aa  160  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1124  ribosomal protein L4/L1e  39.9 
 
 		 248 aa  159  4e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2645  50S ribosomal protein L4  40.47 
 
 		 222 aa  159  4e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264538  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0695  50S ribosomal protein L4  41.43 
 
 		 208 aa  159  4e-38  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1850  50S ribosomal protein L4  42.45 
 
 		 208 aa  158  7e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264817  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4025  ribosomal protein L4/L1e  40.3 
 
 		 221 aa  158  7e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000717748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0932  ribosomal protein L4/L1e  42.13 
 
 		 217 aa  158  7e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0290  ribosomal protein L4/L1e  43.43 
 
 		 208 aa  157  8e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00437959  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0427  50S ribosomal protein L4  41.63 
 
 		 200 aa  157  8e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000154423  decreased coverage  0.00000614317 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0059  50S ribosomal protein L4  41.04 
 
 		 207 aa  157  9e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0599605  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4506  ribosomal protein L4/L1e  39.02 
 
 		 292 aa  157  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6048  50S ribosomal protein L4  38.31 
 
 		 247 aa  156  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.239817 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1764  50S ribosomal protein L4  40.76 
 
 		 206 aa  157  2e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00135584  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2560  50S ribosomal protein L4/L1e  47.57 
 
 		 210 aa  155  3e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0559575  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0197  50S ribosomal protein L4  37.75 
 
 		 207 aa  155  3e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00203095  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1556  ribosomal protein L4/L1e  39.91 
 
 		 207 aa  156  3e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427554  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0181  50S ribosomal protein L4  41.51 
 
 		 208 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000196789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0627  50S ribosomal protein L4  38.86 
 
 		 220 aa  154  8e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000530014  hitchhiker  0.00000000000031805 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0982  ribosomal protein L4/L1e  41.26 
 
 		 209 aa  154  9e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.532922  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0702  50S ribosomal protein L4  36.49 
 
 		 206 aa  154  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000569503  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1347  50S ribosomal protein L4  40.76 
 
 		 206 aa  154  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0681  50S ribosomal protein L4  37.91 
 
 		 207 aa  154  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.486374  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6613  ribosomal protein L4/L1e  39.22 
 
 		 231 aa  153  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0588  ribosomal protein L4/L1e  41.35 
 
 		 228 aa  153  2e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.290054  normal  0.451966 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>