More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0969 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0969  rare lipoprotein A  100 
 
 
295 aa  558  1e-158  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  34.67 
 
 
339 aa  151  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  33.44 
 
 
367 aa  138  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0025  Rare lipoprotein A  38 
 
 
279 aa  135  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.674451  normal  0.0342057 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1294  rare lipoprotein A  43.88 
 
 
346 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1995  rare lipoprotein A  43.59 
 
 
364 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.359065  normal  0.0392025 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1807  rare lipoprotein A  42.74 
 
 
364 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206051  hitchhiker  0.00189733 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0823  rare lipoprotein A  39.06 
 
 
281 aa  106  5e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0647438  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1579  rare lipoprotein A  44.44 
 
 
408 aa  103  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00357969  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0990  rare lipoprotein A family protein  42.31 
 
 
421 aa  102  8e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0958  rare lipoprotein A family protein  42.31 
 
 
419 aa  102  8e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.138105  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0496  rare lipoprotein A, putative  35.48 
 
 
224 aa  101  1e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2012  rare lipoprotein A  46.83 
 
 
312 aa  100  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127741  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2676  rare lipoprotein A  46.03 
 
 
314 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.36166  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4106  hypothetical protein  46.03 
 
 
283 aa  99.8  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322542  normal  0.202617 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2701  rare lipoprotein A  44.44 
 
 
312 aa  99  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2712  rare lipoprotein A  46.03 
 
 
314 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.824805 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3111  rare lipoprotein A  44.44 
 
 
315 aa  97.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1466  rare lipoprotein A  44.44 
 
 
279 aa  97.1  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.515787 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2075  rare lipoprotein A  39.32 
 
 
424 aa  96.7  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2700  rare lipoprotein A  46.43 
 
 
318 aa  96.7  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1506  rare lipoprotein A  45.97 
 
 
442 aa  96.3  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0428333  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2153  rare lipoprotein A  41.03 
 
 
382 aa  94.4  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1538  rare lipoprotein A  43.65 
 
 
383 aa  93.6  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.516723  normal  0.739937 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0545  rare lipoprotein A  42.86 
 
 
341 aa  94  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0482  rare lipoprotein A  43.97 
 
 
303 aa  92.4  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.241212  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  30.04 
 
 
322 aa  92.4  7e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3581  rare lipoprotein A  44.53 
 
 
468 aa  92.4  8e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0743436  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6925  rare lipoprotein A  42.54 
 
 
398 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0552998  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3390  rare lipoprotein A  43.97 
 
 
474 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.728179 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3699  rare lipoprotein A  43.97 
 
 
455 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  28.36 
 
 
321 aa  89.4  7e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1255  rare lipoprotein A  31.87 
 
 
320 aa  88.6  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.994921  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6276  rare lipoprotein A  44.92 
 
 
394 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.314639 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  37.93 
 
 
259 aa  87.4  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4323  rare lipoprotein A  41.38 
 
 
314 aa  86.3  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  32.79 
 
 
341 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  32.51 
 
 
342 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  33.5 
 
 
342 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  33.33 
 
 
335 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  32.02 
 
 
285 aa  83.6  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0655  rare lipoprotein A  35.38 
 
 
279 aa  82.8  0.000000000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0270867  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2921  rare lipoprotein A, putative  39.47 
 
 
361 aa  82.4  0.000000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.303868  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2535  rare lipoprotein A  39.47 
 
 
361 aa  82.4  0.000000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.456339  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  30.34 
 
 
324 aa  82  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  44.58 
 
 
170 aa  81.3  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  43.01 
 
 
360 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  43.01 
 
 
360 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  36.28 
 
 
266 aa  80.5  0.00000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  36.28 
 
 
239 aa  80.5  0.00000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  36.28 
 
 
275 aa  80.1  0.00000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  36.28 
 
 
275 aa  80.1  0.00000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  42.86 
 
 
150 aa  79.7  0.00000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1056  rare lipoprotein A  39.58 
 
 
185 aa  79.3  0.00000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0387657  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0301  rare lipoprotein A rlpa  35.94 
 
 
240 aa  79  0.00000000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.665029  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  29.2 
 
 
332 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  32.21 
 
 
267 aa  79  0.00000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  41.94 
 
 
267 aa  79  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1133  rare lipoprotein A  38.41 
 
 
260 aa  78.2  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  24.82 
 
 
322 aa  78.2  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0458  30S ribosomal protein S16 (BS17)  27.47 
 
 
270 aa  78.6  0.0000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  37.4 
 
 
282 aa  77.8  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2697  rare lipoprotein A  35.04 
 
 
169 aa  77.4  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  44.21 
 
 
124 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  44.3 
 
 
263 aa  77  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  35.96 
 
 
265 aa  77  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3300  rare lipoprotein A  35.56 
 
 
259 aa  76.3  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  35.25 
 
 
265 aa  75.9  0.0000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  37.39 
 
 
238 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58210  hypothetical protein  49.35 
 
 
125 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  38.74 
 
 
342 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4804  rare lipoprotein A family  28.83 
 
 
333 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  47.31 
 
 
358 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  41.56 
 
 
163 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0114  rare lipoprotein A  50.65 
 
 
142 aa  74.3  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5099  hypothetical protein  49.35 
 
 
125 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.637831  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  40.74 
 
 
163 aa  74.7  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1179  rare lipoprotein A  32.34 
 
 
375 aa  74.3  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00815633  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3152  rare lipoprotein A  32.34 
 
 
370 aa  74.7  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00554597  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  45.45 
 
 
278 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4679  rare lipoprotein A  28.1 
 
 
333 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362563  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4167  rare lipoprotein A  45.26 
 
 
145 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0618  rare lipoprotein A  34.1 
 
 
362 aa  73.6  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00356673  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1509  rare lipoprotein A  51.35 
 
 
114 aa  73.9  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04283  rare lipoprotein A  37.5 
 
 
471 aa  73.9  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  44.74 
 
 
270 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1386  rare lipoprotein A  45 
 
 
415 aa  73.6  0.000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.166682  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1316  rare lipoprotein A  45 
 
 
417 aa  73.6  0.000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.250086  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2020  rare lipoprotein A  44.3 
 
 
139 aa  73.2  0.000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.451852 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  48.1 
 
 
199 aa  73.2  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1152  rare lipoprotein A  38.71 
 
 
335 aa  73.6  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1548  rare lipoprotein A  29.26 
 
 
290 aa  73.6  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4857  rare lipoprotein A  28.36 
 
 
333 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292191  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  25 
 
 
293 aa  73.2  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  42.86 
 
 
165 aa  73.2  0.000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2367  rare lipoprotein A  41.56 
 
 
128 aa  73.2  0.000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1940  rare lipoprotein A  35.94 
 
 
163 aa  73.2  0.000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1060  rare lipoprotein A  32.72 
 
 
265 aa  72.8  0.000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1199  rare lipoprotein A  36.65 
 
 
361 aa  72.8  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.670363  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0685  rare lipoprotein A  33.64 
 
 
362 aa  72.8  0.000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.7076e-18  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>