More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0025 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0025  Rare lipoprotein A  100 
 
 		 279 aa  552  1e-156  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.674451  normal  0.0342057 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  35.46 
 
 		 339 aa  127  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0969  rare lipoprotein A  36.2 
 
 		 295 aa  107  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  42.35 
 
 		 367 aa  105  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0496  rare lipoprotein A, putative  39.13 
 
 		 224 aa  97.1  3e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1255  rare lipoprotein A  33.59 
 
 		 320 aa  94.7  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.994921  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1995  rare lipoprotein A  41.41 
 
 		 364 aa  93.2  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.359065  normal  0.0392025 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1807  rare lipoprotein A  41.41 
 
 		 364 aa  92.8  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206051  hitchhiker  0.00189733 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1294  rare lipoprotein A  42.97 
 
 		 346 aa  91.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1579  rare lipoprotein A  47.22 
 
 		 408 aa  90.1  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00357969  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0482  rare lipoprotein A  42.28 
 
 		 303 aa  87.8  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.241212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0823  rare lipoprotein A  45.54 
 
 		 281 aa  87  3e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0647438  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2700  rare lipoprotein A  32.11 
 
 		 318 aa  84.7  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  31 
 
 		 282 aa  82.8  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2676  rare lipoprotein A  34.6 
 
 		 314 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.36166  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2712  rare lipoprotein A  43.31 
 
 		 314 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.824805 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4106  hypothetical protein  43.59 
 
 		 283 aa  80.9  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322542  normal  0.202617 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1943  sporulation related protein  30.47 
 
 		 303 aa  80.1  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.932522  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2701  rare lipoprotein A  40.8 
 
 		 312 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1466  rare lipoprotein A  39.55 
 
 		 279 aa  79.3  0.00000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.515787 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1851  rare lipoprotein A  42.37 
 
 		 360 aa  79  0.00000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000580444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1268  rare lipoprotein A  30.99 
 
 		 284 aa  79.3  0.00000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149494  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0990  rare lipoprotein A family protein  41.74 
 
 		 421 aa  79  0.00000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0958  rare lipoprotein A family protein  41.74 
 
 		 419 aa  79  0.00000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.138105  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2951  rare lipoprotein A  42.37 
 
 		 360 aa  78.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078058  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3023  rare lipoprotein A  42.37 
 
 		 360 aa  78.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000107975  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  30.8 
 
 		 341 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2075  rare lipoprotein A  41.53 
 
 		 424 aa  77.4  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2012  rare lipoprotein A  42.52 
 
 		 312 aa  76.6  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127741  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  32.94 
 
 		 337 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  42.62 
 
 		 322 aa  76.3  0.0000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  34.57 
 
 		 322 aa  75.9  0.0000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  37.01 
 
 		 275 aa  75.5  0.0000000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  37.01 
 
 		 275 aa  75.5  0.0000000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  37.01 
 
 		 266 aa  75.5  0.0000000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3111  rare lipoprotein A  41.03 
 
 		 315 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0545  rare lipoprotein A  38.97 
 
 		 341 aa  74.7  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3300  rare lipoprotein A  29.46 
 
 		 259 aa  75.1  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  37.82 
 
 		 239 aa  75.5  0.000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4323  rare lipoprotein A  39.71 
 
 		 314 aa  74.3  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0458  30S ribosomal protein S16 (BS17)  30.82 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1056  rare lipoprotein A  41.73 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0387657  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1179  rare lipoprotein A  42.86 
 
 		 375 aa  73.2  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00815633  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  31.11 
 
 		 321 aa  73.2  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0301  rare lipoprotein A rlpa  37.21 
 
 		 240 aa  73.2  0.000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.665029  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  29.79 
 
 		 342 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  30 
 
 		 342 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  48.72 
 
 		 360 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2153  rare lipoprotein A  41.18 
 
 		 382 aa  71.6  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0655  rare lipoprotein A  40.35 
 
 		 279 aa  71.6  0.00000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0270867  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  48.72 
 
 		 360 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3152  rare lipoprotein A  40.98 
 
 		 370 aa  72  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00554597  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2322  rare lipoprotein A  31.44 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.260351  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  29.43 
 
 		 342 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2535  rare lipoprotein A  39.64 
 
 		 361 aa  71.2  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.456339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2921  rare lipoprotein A, putative  39.64 
 
 		 361 aa  71.2  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.303868  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1509  rare lipoprotein A  52.7 
 
 		 114 aa  71.2  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1199  rare lipoprotein A  38.46 
 
 		 361 aa  70.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.670363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2228  rare lipoprotein A  39.68 
 
 		 194 aa  71.2  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1090  rare lipoprotein A  49.25 
 
 		 388 aa  70.5  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.499967  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1081  rare lipoprotein A  32.21 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.95704  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08420  Rare lipoprotein, RlpA family  40.77 
 
 		 325 aa  70.5  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.108645  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  30.11 
 
 		 332 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0114  rare lipoprotein A  51.35 
 
 		 142 aa  70.1  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  31.42 
 
 		 285 aa  70.1  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0618  rare lipoprotein A  42.57 
 
 		 362 aa  69.7  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00356673  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  51.52 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4857  rare lipoprotein A  44.95 
 
 		 333 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292191  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00602  minor lipoprotein  41.58 
 
 		 362 aa  68.9  0.00000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0208162  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4804  rare lipoprotein A family  44.95 
 
 		 333 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0685  rare lipoprotein A  41.58 
 
 		 362 aa  68.9  0.00000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.7076e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  38.64 
 
 		 335 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0658  rare lipoprotein A  41.58 
 
 		 362 aa  68.9  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302889  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0653  rare lipoprotein A  41.58 
 
 		 362 aa  68.9  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000226966  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00591  hypothetical protein  41.58 
 
 		 362 aa  68.9  0.00000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0164207  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2993  rare lipoprotein A  41.58 
 
 		 362 aa  68.9  0.00000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000212264  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0680  rare lipoprotein A  39.83 
 
 		 377 aa  68.9  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000202974  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3012  rare lipoprotein A  41.58 
 
 		 362 aa  68.9  0.00000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000245758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0754  rare lipoprotein A  39.83 
 
 		 377 aa  68.9  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.169021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0740  rare lipoprotein A  39.83 
 
 		 377 aa  68.9  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.012679  normal  0.997721 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2966  rare lipoprotein A  38.33 
 
 		 381 aa  68.9  0.00000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.508447  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0965  rare lipoprotein A  47.44 
 
 		 371 aa  68.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1988  drug/metabolite exporter (DME) family protein  27.95 
 
 		 286 aa  68.6  0.0000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0721  rare lipoprotein A  41.58 
 
 		 362 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000475341  normal  0.474734 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  34.62 
 
 		 265 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1465  hypothetical protein  27.43 
 
 		 273 aa  67.8  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1518  hypothetical protein  27.88 
 
 		 273 aa  67.4  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4679  rare lipoprotein A  29.6 
 
 		 333 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2450  rare lipoprotein A  39.67 
 
 		 171 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0060097  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2474  rare lipoprotein A  40.37 
 
 		 195 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.379574  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4283  rare lipoprotein A  50 
 
 		 367 aa  68.2  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0852  rare lipoprotein A  50 
 
 		 297 aa  67  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569682  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0760  rare lipoprotein A  43.53 
 
 		 262 aa  67.4  0.0000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0798  rare lipoprotein A  39.83 
 
 		 377 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00108325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  48.72 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0694  rare lipoprotein A  38.98 
 
 		 377 aa  66.6  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1133  rare lipoprotein A  39.8 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1168  rare lipoprotein A  29.73 
 
 		 365 aa  66.2  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.107629  normal  0.276647 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  30.57 
 
 		 324 aa  66.2  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  36.17 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>