More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1282 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1282  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
288 aa  560  1e-158  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.197551  normal  0.586305 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.77 
 
 
287 aa  357  9.999999999999999e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1883  polyamine ABC transporter, permease protein  61.21 
 
 
283 aa  334  9e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1011  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  58.25 
 
 
289 aa  330  1e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.263438 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0282  polyamine ABC-transporter, inner membrane subunit  53.55 
 
 
287 aa  290  3e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0914  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.86 
 
 
289 aa  273  2.0000000000000002e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4277  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 
290 aa  266  4e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2565  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.96 
 
 
291 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.96 
 
 
291 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.75974  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2604  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.61 
 
 
291 aa  253  3e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0914889  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.88 
 
 
291 aa  236  4e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.234012  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.88 
 
 
291 aa  227  2e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.298681  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7091  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.72 
 
 
319 aa  224  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.131737 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3227  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.9 
 
 
290 aa  208  9e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.331989  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1498  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.34 
 
 
308 aa  189  4e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1599  spermidine/putrescine transport system permease protein  36.88 
 
 
293 aa  167  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.120621  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4673  putrescine ABC transporter, permease protein  37.69 
 
 
317 aa  165  8e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3605  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.43 
 
 
295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0391464 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2914  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.69 
 
 
278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04240  putative permease of ABC transporter  37.19 
 
 
309 aa  159  6e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1110  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.69 
 
 
301 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000446726  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2038  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein PotB  32.23 
 
 
292 aa  157  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.478202  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3190  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.69 
 
 
301 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.90235  normal  0.0128197 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3007  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.19 
 
 
299 aa  158  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.360446  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.69 
 
 
301 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0492814  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1168  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.69 
 
 
301 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0126623  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1272  polyamine ABC transporter, permease protein  35.32 
 
 
301 aa  157  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.27 
 
 
295 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0510016  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0890  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.96 
 
 
275 aa  157  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00131219  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0948  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.57 
 
 
301 aa  156  4e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2916  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.32 
 
 
301 aa  156  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0057841  normal  0.437411 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.32 
 
 
301 aa  156  4e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0768287  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2224  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein PotB  35.16 
 
 
281 aa  155  8e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3095  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.94 
 
 
301 aa  155  8e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0587247  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2982  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.67 
 
 
293 aa  155  9e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.12997  normal  0.783486 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1016  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.6 
 
 
330 aa  154  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.725697  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.54 
 
 
296 aa  154  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.248217 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1133  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.2 
 
 
301 aa  154  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0017  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  39.82 
 
 
295 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.82 
 
 
295 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.257053  normal  0.557332 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1936  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein (potB)-like protein  35.16 
 
 
281 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2581  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.16 
 
 
274 aa  154  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000217072  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1096  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.94 
 
 
301 aa  152  4e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0511337  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.5 
 
 
293 aa  153  4e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.913053 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2285  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  34.44 
 
 
319 aa  151  8.999999999999999e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.688912  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3926  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.67 
 
 
303 aa  151  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.433095  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1542  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  37.5 
 
 
281 aa  151  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.412621 
 
 
-
 
NC_004310  BR1610  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  37.94 
 
 
303 aa  151  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0588164  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2804  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.09 
 
 
299 aa  150  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.22661  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.9 
 
 
305 aa  150  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0181159  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7450  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.32 
 
 
317 aa  151  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.118228 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.57 
 
 
302 aa  150  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0288  ABC transporter permease  34.49 
 
 
306 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2384  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  34.07 
 
 
319 aa  149  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0975  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.09 
 
 
301 aa  149  7e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.44 
 
 
303 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.696873  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.67 
 
 
285 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00751229  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2872  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.23 
 
 
323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.134658 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4068  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.78 
 
 
289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.270331  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0822  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.96 
 
 
307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003482  spermidine putrescine ABC transporter permease component PotB  33.59 
 
 
286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000668861  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2839  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.57 
 
 
302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1765  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.17 
 
 
308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.806732 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.17 
 
 
308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.508263  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.17 
 
 
308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2640  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.53 
 
 
303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0381119  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4709  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.66 
 
 
319 aa  147  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0125909 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2375  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.67 
 
 
304 aa  147  3e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.113051  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5048  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  37.79 
 
 
308 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145296  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3143  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.29 
 
 
305 aa  145  6e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138017  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2137  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.29 
 
 
267 aa  145  6e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.82 
 
 
269 aa  144  1e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000222411  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1929  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.07 
 
 
287 aa  144  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0521412  hitchhiker  0.0000000382912 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02288  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  33.59 
 
 
286 aa  144  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0165  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.52 
 
 
303 aa  144  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1158  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  33.99 
 
 
286 aa  144  1e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000395482  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.76 
 
 
290 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00509321 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4193  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.27 
 
 
331 aa  144  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.203836  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1038  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  33.2 
 
 
286 aa  144  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000702638  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.19 
 
 
275 aa  144  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00480798  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01123  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  33.46 
 
 
275 aa  143  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01131  hypothetical protein  33.46 
 
 
275 aa  143  3e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1638  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  34.75 
 
 
285 aa  143  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0371  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.55 
 
 
281 aa  143  3e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.88 
 
 
334 aa  143  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0706374 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4253  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.73 
 
 
301 aa  143  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0952  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  37.56 
 
 
317 aa  143  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0896  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.23 
 
 
297 aa  142  4e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1959  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  33.08 
 
 
277 aa  143  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.448664  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1013  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  37.56 
 
 
317 aa  143  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.905763  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0984  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  37.56 
 
 
317 aa  143  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.286943  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1511  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.79 
 
 
309 aa  143  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.35956 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1032  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  37.56 
 
 
317 aa  143  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0916  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  37.56 
 
 
317 aa  143  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5896  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38 
 
 
282 aa  143  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2522  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.59 
 
 
285 aa  142  6e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000172169  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1245  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  33.59 
 
 
285 aa  142  6e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.332009  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2141  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  33.21 
 
 
287 aa  142  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0242928 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2001  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  33.59 
 
 
285 aa  142  6e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.819816 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2278  putrescine ABC transporter, permease protein  35.88 
 
 
309 aa  142  6e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0728081  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>