More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4277 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4277  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
290 aa  575  1.0000000000000001e-163  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0914  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  74.82 
 
 
289 aa  434  1e-121  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2604  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.52 
 
 
291 aa  308  9e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0914889  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.16 
 
 
291 aa  306  3e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.75974  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2565  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.16 
 
 
291 aa  306  3e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1011  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  49.13 
 
 
289 aa  296  2e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.263438 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1883  polyamine ABC transporter, permease protein  52.14 
 
 
283 aa  295  5e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.89 
 
 
287 aa  294  1e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.8 
 
 
291 aa  287  2e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.234012  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.45 
 
 
291 aa  285  5e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.298681  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3227  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.69 
 
 
290 aa  281  9e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.331989  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7091  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.62 
 
 
319 aa  265  5.999999999999999e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.131737 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0282  polyamine ABC-transporter, inner membrane subunit  47.64 
 
 
287 aa  263  2e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1498  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.96 
 
 
308 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1282  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.6 
 
 
288 aa  223  3e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.197551  normal  0.586305 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2914  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.51 
 
 
278 aa  188  8e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2038  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein PotB  39.77 
 
 
292 aa  188  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.478202  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0948  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.3 
 
 
301 aa  186  3e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3007  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.66 
 
 
299 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.360446  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.78 
 
 
301 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0492814  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3190  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.78 
 
 
301 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.90235  normal  0.0128197 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7450  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.13 
 
 
317 aa  181  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.118228 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1110  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.78 
 
 
301 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000446726  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1168  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.78 
 
 
301 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0126623  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04240  putative permease of ABC transporter  40.22 
 
 
309 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3095  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.07 
 
 
301 aa  181  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0587247  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.14 
 
 
305 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0181159  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.95 
 
 
305 aa  179  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2916  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.73 
 
 
301 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0057841  normal  0.437411 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.73 
 
 
301 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0768287  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1905  putrescine ABC transporter, permease protein  40.57 
 
 
322 aa  178  7e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.862589  normal  0.408626 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1272  polyamine ABC transporter, permease protein  39.03 
 
 
301 aa  178  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2375  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.06 
 
 
304 aa  177  2e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.113051  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4673  putrescine ABC transporter, permease protein  40.66 
 
 
317 aa  176  3e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3950  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.91 
 
 
295 aa  176  5e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.872266  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1133  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.96 
 
 
301 aa  176  6e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3605  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.76 
 
 
295 aa  175  7e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0391464 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4006  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  37.08 
 
 
282 aa  175  8e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  hitchhiker  0.00000000961653 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1338  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  37.08 
 
 
282 aa  175  8e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.727492  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0975  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.27 
 
 
301 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1096  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.21 
 
 
301 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0511337  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1936  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein (potB)-like protein  35.5 
 
 
281 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5896  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.93 
 
 
282 aa  172  5e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2918  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.65 
 
 
301 aa  172  5.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.596967 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1200  spermidine/putrescine ABC transporter permease  36.7 
 
 
282 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.163674  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1298  spermidine/putrescine ABC transporter permease  36.7 
 
 
282 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.78 
 
 
305 aa  170  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.055919  normal  0.0738554 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2224  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein PotB  34.69 
 
 
281 aa  170  3e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01123  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  37.12 
 
 
275 aa  169  4e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2522  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.12 
 
 
285 aa  169  4e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000172169  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2478  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  37.12 
 
 
285 aa  169  4e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.165165  normal  0.578338 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2001  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  37.12 
 
 
285 aa  169  4e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.819816 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1245  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  37.12 
 
 
285 aa  169  4e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.332009  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1288  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  37.12 
 
 
287 aa  169  4e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01131  hypothetical protein  37.12 
 
 
275 aa  169  4e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.35 
 
 
275 aa  169  5e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00480798  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4193  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.7 
 
 
331 aa  169  6e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.203836  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.7 
 
 
334 aa  169  6e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0706374 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.31 
 
 
293 aa  169  7e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.913053 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4709  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.92 
 
 
319 aa  169  7e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0125909 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1342  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  37.12 
 
 
287 aa  168  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.377668 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1303  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  37.12 
 
 
287 aa  168  8e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1304  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  37.12 
 
 
287 aa  168  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2872  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.2 
 
 
323 aa  168  8e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.134658 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2141  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  37.12 
 
 
287 aa  168  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0242928 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1959  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  37.12 
 
 
277 aa  168  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.448664  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.98 
 
 
302 aa  168  9e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1063  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.73 
 
 
301 aa  167  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1950  putrescine ABC transporter, permease protein  36.57 
 
 
326 aa  168  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.443162  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1326  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  37.12 
 
 
287 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0226525 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2097  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.6 
 
 
313 aa  167  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.036296  normal  0.0908673 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2982  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.25 
 
 
293 aa  168  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.12997  normal  0.783486 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1861  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  35.74 
 
 
286 aa  168  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.317879  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1550  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.11 
 
 
305 aa  167  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.167031  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2839  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.98 
 
 
302 aa  167  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4638  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.62 
 
 
304 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1016  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.66 
 
 
330 aa  167  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.725697  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.52 
 
 
290 aa  167  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00509321 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1566  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  36.74 
 
 
287 aa  167  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000236366 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.84 
 
 
328 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2018  putrescine ABC transport system, permease protein  36.19 
 
 
326 aa  166  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0348  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.24 
 
 
302 aa  166  4e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3143  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.05 
 
 
305 aa  166  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138017  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2812  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  35.56 
 
 
328 aa  166  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.78 
 
 
296 aa  166  5.9999999999999996e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.248217 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0724  putrescine ABC transporter, permease protein PotH  36.19 
 
 
326 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7681  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  39.37 
 
 
297 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.962209  normal  0.12531 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6347  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  35.56 
 
 
328 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0632  putrescine ABC transporter, permease protein PotH  36.19 
 
 
326 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0371718  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6837  putrescine ABC transporter membrane protein  39.13 
 
 
304 aa  165  9e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.350264  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2146  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  36.08 
 
 
286 aa  165  9e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3017  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.82 
 
 
328 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1062  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.57 
 
 
297 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.356506 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1638  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  36.65 
 
 
285 aa  164  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2384  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.82 
 
 
328 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.833701  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1158  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  36.36 
 
 
286 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000395482  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.82 
 
 
328 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.131392  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2640  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.36 
 
 
303 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0381119  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2399  ABC putrescine transporter, inner membrane subunit  33.57 
 
 
297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0938  ABC putrescine transporter, inner membrane subunit PotH  35.56 
 
 
324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123183  normal  0.465808 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>