More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1498 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1498  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
308 aa  590  1e-167  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3227  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.86 
 
 
290 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.331989  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2565  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.62 
 
 
291 aa  249  4e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.62 
 
 
291 aa  249  4e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.75974  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2604  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.28 
 
 
291 aa  249  6e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0914889  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4277  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.91 
 
 
290 aa  238  8e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.18 
 
 
291 aa  238  9e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.234012  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0914  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.02 
 
 
289 aa  237  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7091  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.79 
 
 
319 aa  231  8.000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.131737 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.38 
 
 
291 aa  228  9e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.298681  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1011  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  42.96 
 
 
289 aa  224  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.263438 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.96 
 
 
287 aa  218  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1883  polyamine ABC transporter, permease protein  41.88 
 
 
283 aa  206  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0282  polyamine ABC-transporter, inner membrane subunit  40.07 
 
 
287 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.71 
 
 
293 aa  180  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.913053 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0948  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.57 
 
 
301 aa  176  4e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3605  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.84 
 
 
295 aa  175  7e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0391464 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2872  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.68 
 
 
323 aa  175  8e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.134658 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.81 
 
 
328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2982  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.64 
 
 
293 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.12997  normal  0.783486 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2914  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.07 
 
 
278 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0975  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.29 
 
 
301 aa  172  5e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1511  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.93 
 
 
309 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.35956 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.64 
 
 
309 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0925484  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2907  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.67 
 
 
331 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6347  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  40.29 
 
 
328 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2812  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  39.93 
 
 
328 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1016  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.05 
 
 
330 aa  171  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.725697  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1673  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.64 
 
 
309 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2375  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.16 
 
 
304 aa  171  2e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.113051  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5048  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  39.01 
 
 
308 aa  170  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145296  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3017  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.93 
 
 
328 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2278  putrescine ABC transporter, permease protein  37.63 
 
 
309 aa  171  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0728081  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.89 
 
 
305 aa  171  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0181159  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4193  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.67 
 
 
331 aa  171  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.203836  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2384  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.93 
 
 
328 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.833701  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.93 
 
 
328 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.131392  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1905  putrescine ABC transporter, permease protein  40.73 
 
 
322 aa  170  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.862589  normal  0.408626 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2916  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.19 
 
 
301 aa  170  3e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0057841  normal  0.437411 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.19 
 
 
301 aa  170  3e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0768287  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3095  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.19 
 
 
301 aa  170  3e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0587247  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2137  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.78 
 
 
267 aa  169  4e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3190  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.67 
 
 
301 aa  169  5e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.90235  normal  0.0128197 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1765  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.01 
 
 
308 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.806732 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.67 
 
 
301 aa  169  5e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0492814  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1950  putrescine ABC transporter, permease protein  40.07 
 
 
326 aa  169  5e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.443162  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1168  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.67 
 
 
301 aa  169  5e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0126623  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1110  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.67 
 
 
301 aa  169  5e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000446726  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.01 
 
 
308 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.508263  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3007  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.33 
 
 
299 aa  169  5e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.360446  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.01 
 
 
308 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1272  polyamine ABC transporter, permease protein  42.86 
 
 
301 aa  168  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0724  putrescine ABC transporter, permease protein PotH  46.8 
 
 
326 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0632  putrescine ABC transporter, permease protein PotH  46.8 
 
 
326 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0371718  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1096  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.46 
 
 
301 aa  167  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0511337  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.92 
 
 
334 aa  168  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0706374 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2018  putrescine ABC transport system, permease protein  46.31 
 
 
326 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3045  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.71 
 
 
331 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7681  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  40.61 
 
 
297 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.962209  normal  0.12531 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2097  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.59 
 
 
313 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.036296  normal  0.0908673 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.93 
 
 
296 aa  166  4e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.248217 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6067  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.93 
 
 
323 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2640  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.27 
 
 
303 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0381119  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2285  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  33.75 
 
 
319 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.688912  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1133  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.9 
 
 
301 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.93 
 
 
305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.055919  normal  0.0738554 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1277  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.13 
 
 
309 aa  163  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.197627  normal  0.200022 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4673  putrescine ABC transporter, permease protein  40.08 
 
 
317 aa  163  4.0000000000000004e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4862  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.93 
 
 
306 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2384  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  33.33 
 
 
319 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4709  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.44 
 
 
319 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0125909 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0823  ABC transporter membrane spanning protein  38.7 
 
 
286 aa  162  5.0000000000000005e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4662  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.33 
 
 
324 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.93633  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0938  ABC putrescine transporter, inner membrane subunit PotH  44.33 
 
 
324 aa  162  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123183  normal  0.465808 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2121  putrescine ABC transporter, permease protein PotH  37.63 
 
 
309 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.466504  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5302  putrescine ABC transporter, permease protein  40.93 
 
 
317 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2308  putrescine transport system permease protein  37.63 
 
 
309 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1056  putrescine ABC transporter, permease protein PotH  37.63 
 
 
309 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.230048  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1786  putrescine ABC transporter, permease protein PotH  37.63 
 
 
309 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.720486  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2177  putrescine ABC transporter, permease protein PotH  37.63 
 
 
309 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.499843  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0109  putrescine ABC transporter, permease protein PotH  37.63 
 
 
309 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.691991  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.52 
 
 
309 aa  162  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622  normal  0.150857 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1952  ABC polyamine transporter, inner membrane subunit  42.99 
 
 
309 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00258406  normal  0.610972 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.13 
 
 
285 aa  161  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00751229  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1282  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.8 
 
 
288 aa  161  1e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.197551  normal  0.586305 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7450  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.55 
 
 
317 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.118228 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0394  polyamine transport protein PotH  40.93 
 
 
303 aa  159  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1370  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  37.96 
 
 
317 aa  159  4e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5238  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.53 
 
 
306 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1694  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  37.7 
 
 
321 aa  159  4e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03950  polyamine transport protein PotH  41.4 
 
 
293 aa  159  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0285  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.47 
 
 
306 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.678954 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.24 
 
 
293 aa  159  6e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282728  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5178  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.53 
 
 
306 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.542321  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1013  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  37.74 
 
 
317 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.905763  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0984  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  37.74 
 
 
317 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.286943  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5085  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.53 
 
 
306 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358799  normal  0.347676 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1032  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  37.74 
 
 
317 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3926  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.31 
 
 
303 aa  158  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.433095  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0916  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  37.74 
 
 
317 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>