More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3136 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
291 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.298681  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  95.19 
 
 
291 aa  532  1e-150  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.234012  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2604  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  84.54 
 
 
291 aa  491  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0914889  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2565  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  84.19 
 
 
291 aa  489  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  84.19 
 
 
291 aa  489  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.75974  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4277  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.68 
 
 
290 aa  286  2e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0914  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.76 
 
 
289 aa  283  2.0000000000000002e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1011  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  48.41 
 
 
289 aa  279  4e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.263438 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.35 
 
 
287 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1883  polyamine ABC transporter, permease protein  49.46 
 
 
283 aa  265  8e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3227  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 
290 aa  256  3e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.331989  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0282  polyamine ABC-transporter, inner membrane subunit  48.94 
 
 
287 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7091  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.58 
 
 
319 aa  252  5.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.131737 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1498  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.6 
 
 
308 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7450  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.45 
 
 
317 aa  192  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.118228 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4673  putrescine ABC transporter, permease protein  40.88 
 
 
317 aa  192  6e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1282  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.66 
 
 
288 aa  186  4e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.197551  normal  0.586305 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.49 
 
 
293 aa  181  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.913053 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3605  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.19 
 
 
295 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0391464 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2872  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.37 
 
 
323 aa  178  8e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.134658 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2914  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.88 
 
 
278 aa  177  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3007  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.11 
 
 
299 aa  176  5e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.360446  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1272  polyamine ABC transporter, permease protein  38.89 
 
 
301 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4193  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.31 
 
 
331 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.203836  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.31 
 
 
334 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0706374 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1168  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.52 
 
 
301 aa  172  5e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0126623  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3190  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.52 
 
 
301 aa  172  5e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.90235  normal  0.0128197 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1110  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.52 
 
 
301 aa  172  5e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000446726  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.52 
 
 
301 aa  172  5e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0492814  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2916  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.52 
 
 
301 aa  172  5e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0057841  normal  0.437411 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.52 
 
 
301 aa  172  5e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0768287  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.75 
 
 
296 aa  172  5.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.248217 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1096  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.15 
 
 
301 aa  171  9e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0511337  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4709  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.53 
 
 
319 aa  171  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0125909 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3095  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.15 
 
 
301 aa  171  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0587247  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0348  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.76 
 
 
302 aa  170  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2137  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.35 
 
 
267 aa  169  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2375  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.53 
 
 
304 aa  169  5e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.113051  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2982  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.77 
 
 
293 aa  169  5e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.12997  normal  0.783486 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2285  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  36.13 
 
 
319 aa  167  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.688912  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1016  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.9 
 
 
330 aa  167  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.725697  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2097  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.5 
 
 
313 aa  168  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.036296  normal  0.0908673 
 
 
-
 
NC_004310  BR1610  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  39.63 
 
 
303 aa  167  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0588164  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02288  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  39.69 
 
 
286 aa  167  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04240  putative permease of ABC transporter  39.85 
 
 
309 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003482  spermidine putrescine ABC transporter permease component PotB  39.31 
 
 
286 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000668861  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1905  putrescine ABC transporter, permease protein  37.08 
 
 
322 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.862589  normal  0.408626 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.66 
 
 
305 aa  166  4e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.055919  normal  0.0738554 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1200  spermidine/putrescine ABC transporter permease  34.94 
 
 
282 aa  166  5e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.163674  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1298  spermidine/putrescine ABC transporter permease  34.94 
 
 
282 aa  166  5e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.88 
 
 
305 aa  166  5e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0181159  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0724  putrescine ABC transporter, permease protein PotH  38.79 
 
 
326 aa  166  5e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0632  putrescine ABC transporter, permease protein PotH  38.79 
 
 
326 aa  166  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0371718  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17630  polyamine transport protein PotB  39.24 
 
 
297 aa  166  5e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0975  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.27 
 
 
301 aa  166  5e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2018  putrescine ABC transport system, permease protein  38.71 
 
 
326 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3926  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.41 
 
 
303 aa  165  8e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.433095  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1950  putrescine ABC transporter, permease protein  39.1 
 
 
326 aa  165  8e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.443162  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4862  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.98 
 
 
306 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2384  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  34.14 
 
 
319 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0165  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
303 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0948  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.13 
 
 
301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5302  putrescine ABC transporter, permease protein  38.98 
 
 
317 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1133  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.55 
 
 
301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1038  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  40.69 
 
 
286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000702638  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1008  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.07 
 
 
281 aa  163  3e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.57 
 
 
302 aa  163  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1734  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.02 
 
 
315 aa  163  4.0000000000000004e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000338727 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2918  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.01 
 
 
301 aa  163  4.0000000000000004e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.596967 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0822  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.01 
 
 
307 aa  163  4.0000000000000004e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5178  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.64 
 
 
306 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.542321  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0981  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.5 
 
 
299 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5085  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.64 
 
 
306 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358799  normal  0.347676 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1370  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  38.78 
 
 
317 aa  162  5.0000000000000005e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5402  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.96 
 
 
306 aa  162  7e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.434189  decreased coverage  0.000259931 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5238  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.18 
 
 
306 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.57 
 
 
303 aa  162  8.000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.696873  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1959  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.18 
 
 
322 aa  161  1e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4006  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  34.07 
 
 
282 aa  161  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  hitchhiker  0.00000000961653 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2839  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.67 
 
 
302 aa  161  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1533  polyamine transport protein PotB  37.85 
 
 
297 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.8542  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1338  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  34.07 
 
 
282 aa  161  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.727492  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0871  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein PotB  45.85 
 
 
284 aa  160  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1929  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.74 
 
 
287 aa  160  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0521412  hitchhiker  0.0000000382912 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5896  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.4 
 
 
282 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1765  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
308 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.806732 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
308 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.508263  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
308 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03950  polyamine transport protein PotH  41.23 
 
 
293 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1861  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  36.5 
 
 
286 aa  159  4e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.317879  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0394  polyamine transport protein PotH  41.23 
 
 
303 aa  159  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.61 
 
 
287 aa  159  4e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.18822  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5048  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  36.07 
 
 
308 aa  159  6e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145296  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1647  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  37.71 
 
 
321 aa  159  6e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.16764 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1936  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein (potB)-like protein  34.6 
 
 
281 aa  159  6e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0377  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.32 
 
 
303 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00142926  hitchhiker  0.00113268 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0285  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.27 
 
 
306 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.678954 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2640  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.8 
 
 
303 aa  158  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0381119  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0952  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  36.08 
 
 
317 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.65 
 
 
285 aa  157  2e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00751229  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>