More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1883 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1883  polyamine ABC transporter, permease protein  100 
 
 
283 aa  561  1.0000000000000001e-159  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.11 
 
 
287 aa  410  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1011  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  64.29 
 
 
289 aa  381  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.263438 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0282  polyamine ABC-transporter, inner membrane subunit  61.7 
 
 
287 aa  352  4e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4277  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.33 
 
 
290 aa  293  1e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2604  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.07 
 
 
291 aa  292  4e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0914889  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.71 
 
 
291 aa  291  8e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.75974  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2565  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.71 
 
 
291 aa  291  8e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0914  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.79 
 
 
289 aa  290  1e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1282  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.06 
 
 
288 aa  279  3e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.197551  normal  0.586305 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.64 
 
 
291 aa  261  1e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.234012  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.29 
 
 
291 aa  259  3e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.298681  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7091  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.1 
 
 
319 aa  249  3e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.131737 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3227  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.8 
 
 
290 aa  238  5.999999999999999e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.331989  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1498  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.88 
 
 
308 aa  205  8e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.03 
 
 
293 aa  176  5e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.913053 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3605  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.31 
 
 
295 aa  171  9e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0391464 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2914  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39 
 
 
278 aa  171  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7450  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.98 
 
 
317 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.118228 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0017  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  39.82 
 
 
295 aa  166  4e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.82 
 
 
295 aa  166  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.257053  normal  0.557332 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2982  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.9 
 
 
293 aa  166  5e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.12997  normal  0.783486 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.21 
 
 
305 aa  165  6.9999999999999995e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.38 
 
 
295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0510016  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4673  putrescine ABC transporter, permease protein  34.53 
 
 
317 aa  163  3e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04240  putative permease of ABC transporter  36.53 
 
 
309 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.84 
 
 
305 aa  162  7e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.055919  normal  0.0738554 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
305 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0181159  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1272  polyamine ABC transporter, permease protein  33.7 
 
 
301 aa  162  9e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3095  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.84 
 
 
301 aa  161  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0587247  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1936  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein (potB)-like protein  36.19 
 
 
281 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2872  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.25 
 
 
323 aa  160  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.134658 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2916  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.84 
 
 
301 aa  160  3e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0057841  normal  0.437411 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.84 
 
 
301 aa  160  3e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0768287  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2038  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein PotB  33.45 
 
 
292 aa  159  4e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.478202  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.36 
 
 
296 aa  159  5e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.248217 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1599  spermidine/putrescine transport system permease protein  37.35 
 
 
293 aa  159  6e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.120621  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003482  spermidine putrescine ABC transporter permease component PotB  35.8 
 
 
286 aa  159  7e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000668861  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0371  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.92 
 
 
281 aa  158  8e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2918  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.71 
 
 
301 aa  157  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.596967 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1062  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
297 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.356506 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2399  ABC putrescine transporter, inner membrane subunit  33.21 
 
 
297 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1380  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.83 
 
 
296 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0764825  normal  0.0907135 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1929  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.56 
 
 
287 aa  157  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0521412  hitchhiker  0.0000000382912 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2907  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
331 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0348  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.42 
 
 
302 aa  157  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2224  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein PotB  35.41 
 
 
281 aa  157  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1096  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.47 
 
 
301 aa  156  3e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0511337  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1610  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  36.08 
 
 
303 aa  156  4e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0588164  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3190  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.62 
 
 
301 aa  156  4e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.90235  normal  0.0128197 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2812  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  32.5 
 
 
328 aa  156  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1168  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.62 
 
 
301 aa  156  4e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0126623  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1110  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.62 
 
 
301 aa  156  4e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000446726  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.62 
 
 
301 aa  156  4e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0492814  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6347  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  32.5 
 
 
328 aa  155  6e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.52 
 
 
334 aa  155  6e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0706374 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3045  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
331 aa  155  6e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5402  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.93 
 
 
306 aa  155  7e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.434189  decreased coverage  0.000259931 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4193  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.14 
 
 
331 aa  155  8e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.203836  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1038  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  34.63 
 
 
286 aa  155  8e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000702638  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3017  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.93 
 
 
328 aa  155  8e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2384  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.93 
 
 
328 aa  155  8e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.833701  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.93 
 
 
328 aa  155  8e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.131392  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0890  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.21 
 
 
275 aa  155  9e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00131219  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02288  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  35.41 
 
 
286 aa  155  9e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1950  putrescine ABC transporter, permease protein  33.93 
 
 
326 aa  154  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.443162  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3950  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.09 
 
 
295 aa  154  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.872266  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2285  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  35.34 
 
 
319 aa  154  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.688912  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4398  putrescine ABC transporter subunit inner membrane protein  39.71 
 
 
338 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.271562 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4862  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.27 
 
 
306 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4709  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.98 
 
 
319 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0125909 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0377  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.61 
 
 
303 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00142926  hitchhiker  0.00113268 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2097  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.28 
 
 
313 aa  153  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.036296  normal  0.0908673 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0632  putrescine ABC transporter, permease protein PotH  33.93 
 
 
326 aa  152  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0371718  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2804  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.95 
 
 
299 aa  153  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.22661  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5896  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.1 
 
 
282 aa  153  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3926  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.27 
 
 
303 aa  153  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.433095  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6067  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
323 aa  153  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0724  putrescine ABC transporter, permease protein PotH  33.93 
 
 
326 aa  152  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5302  putrescine ABC transporter, permease protein  35.27 
 
 
317 aa  152  5e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1734  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.32 
 
 
315 aa  152  5.9999999999999996e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000338727 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5238  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.19 
 
 
306 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.5 
 
 
303 aa  152  7e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.696873  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1016  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.81 
 
 
330 aa  152  7e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.725697  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5178  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.19 
 
 
306 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.542321  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
328 aa  151  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0285  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.76 
 
 
306 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.678954 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5085  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.19 
 
 
306 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358799  normal  0.347676 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0394  polyamine transport protein PotH  36.24 
 
 
303 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3007  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.59 
 
 
299 aa  151  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.360446  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03950  polyamine transport protein PotH  36.24 
 
 
293 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2375  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.44 
 
 
304 aa  150  2e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.113051  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2018  putrescine ABC transport system, permease protein  32.86 
 
 
326 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0288  ABC transporter permease  33.2 
 
 
306 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2137  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.78 
 
 
267 aa  150  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2384  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  35.34 
 
 
319 aa  150  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.3 
 
 
287 aa  150  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.18822  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0938  ABC putrescine transporter, inner membrane subunit PotH  32 
 
 
324 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123183  normal  0.465808 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1673  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.97 
 
 
309 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.97 
 
 
309 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0925484  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>