More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3227 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_3227  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
290 aa  580  1e-164  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.331989  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0914  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.82 
 
 
289 aa  284  1.0000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2604  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.12 
 
 
291 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0914889  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2565  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.78 
 
 
291 aa  282  5.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.78 
 
 
291 aa  282  5.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.75974  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4277  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.11 
 
 
290 aa  278  6e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7091  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.86 
 
 
319 aa  263  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.131737 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1011  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  47.06 
 
 
289 aa  259  3e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.263438 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 
291 aa  255  6e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.234012  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1498  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.86 
 
 
308 aa  254  8e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 
291 aa  248  7e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.298681  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.58 
 
 
287 aa  248  8e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1883  polyamine ABC transporter, permease protein  44.8 
 
 
283 aa  238  5.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0282  polyamine ABC-transporter, inner membrane subunit  41.58 
 
 
287 aa  225  6e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7450  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.66 
 
 
317 aa  196  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.118228 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3605  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.99 
 
 
295 aa  192  6e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0391464 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.97 
 
 
293 aa  190  2.9999999999999997e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.913053 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2914  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.23 
 
 
278 aa  182  7e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1272  polyamine ABC transporter, permease protein  36.8 
 
 
301 aa  176  3e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04240  putative permease of ABC transporter  38.27 
 
 
309 aa  175  8e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1096  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.88 
 
 
301 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0511337  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3095  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.27 
 
 
301 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0587247  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2916  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.27 
 
 
301 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0057841  normal  0.437411 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.27 
 
 
301 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0768287  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.18 
 
 
302 aa  172  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3007  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.67 
 
 
299 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.360446  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2839  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.45 
 
 
302 aa  172  6.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1282  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.53 
 
 
288 aa  171  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.197551  normal  0.586305 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.25 
 
 
305 aa  170  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0181159  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0948  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.15 
 
 
301 aa  171  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.43 
 
 
301 aa  170  3e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0492814  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3190  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.43 
 
 
301 aa  170  3e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.90235  normal  0.0128197 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1110  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.43 
 
 
301 aa  170  3e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000446726  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3926  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.67 
 
 
303 aa  170  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.433095  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1168  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.43 
 
 
301 aa  170  3e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0126623  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.43 
 
 
293 aa  169  4e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282728  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.04 
 
 
305 aa  169  5e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.055919  normal  0.0738554 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0975  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.46 
 
 
301 aa  168  8e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1610  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  38.34 
 
 
303 aa  168  9e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0588164  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2872  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.04 
 
 
323 aa  168  9e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.134658 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1734  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.36 
 
 
315 aa  167  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000338727 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0377  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.4 
 
 
303 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00142926  hitchhiker  0.00113268 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4851  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.59 
 
 
285 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.418617  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2137  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.06 
 
 
267 aa  167  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1905  putrescine ABC transporter, permease protein  36 
 
 
322 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.862589  normal  0.408626 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2038  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein PotB  32.63 
 
 
292 aa  166  4e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.478202  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5402  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.4 
 
 
306 aa  166  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.434189  decreased coverage  0.000259931 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17630  polyamine transport protein PotB  37.68 
 
 
297 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4673  putrescine ABC transporter, permease protein  35.48 
 
 
317 aa  165  8e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2918  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.69 
 
 
301 aa  164  1.0000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.596967 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.52 
 
 
296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.248217 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1533  polyamine transport protein PotB  37.32 
 
 
297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.8542  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2003  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.91 
 
 
301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02288  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  36.54 
 
 
286 aa  163  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2285  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  31.18 
 
 
319 aa  162  6e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.688912  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003482  spermidine putrescine ABC transporter permease component PotB  36.15 
 
 
286 aa  162  7e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000668861  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.14 
 
 
285 aa  162  7e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00751229  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1262  ABC-type spermidine/putrescine transport system  37.39 
 
 
322 aa  162  8.000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2581  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.9 
 
 
274 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000217072  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0871  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein PotB  41.7 
 
 
284 aa  161  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4862  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.1 
 
 
306 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2384  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  31.39 
 
 
319 aa  161  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1848  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.23 
 
 
283 aa  161  1e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11898  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1038  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  34.88 
 
 
286 aa  161  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000702638  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1158  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  34.89 
 
 
286 aa  161  1e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000395482  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6067  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.93 
 
 
323 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.04 
 
 
287 aa  160  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.18822  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.23 
 
 
275 aa  160  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00480798  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1511  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.18 
 
 
309 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.35956 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0285  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.56 
 
 
306 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.678954 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1133  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.4 
 
 
301 aa  160  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2375  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.03 
 
 
304 aa  160  3e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.113051  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0348  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.39 
 
 
302 aa  160  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2982  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.57 
 
 
293 aa  160  3e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.12997  normal  0.783486 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5178  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.98 
 
 
306 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.542321  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5085  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.98 
 
 
306 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358799  normal  0.347676 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.76 
 
 
303 aa  159  7e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.696873  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1765  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.55 
 
 
308 aa  158  8e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.806732 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7681  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  36.5 
 
 
297 aa  158  8e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.962209  normal  0.12531 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1016  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.33 
 
 
330 aa  158  8e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.725697  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1950  putrescine ABC transporter, permease protein  34.15 
 
 
326 aa  158  8e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.443162  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.55 
 
 
308 aa  158  8e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.508263  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.55 
 
 
308 aa  158  8e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0822  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.67 
 
 
307 aa  158  9e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0724  putrescine ABC transporter, permease protein PotH  34.51 
 
 
326 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5302  putrescine ABC transporter, permease protein  35.68 
 
 
317 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2728  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  36.24 
 
 
321 aa  158  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0632  putrescine ABC transporter, permease protein PotH  34.51 
 
 
326 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0371718  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2018  putrescine ABC transport system, permease protein  35.21 
 
 
326 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.34 
 
 
305 aa  158  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3950  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.64 
 
 
295 aa  158  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.872266  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5238  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.15 
 
 
306 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2643  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  36.24 
 
 
321 aa  158  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.204712  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1565  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  36.24 
 
 
321 aa  158  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0165  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.22 
 
 
303 aa  158  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.82 
 
 
309 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0925484  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1277  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.38 
 
 
309 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.197627  normal  0.200022 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1370  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  34.58 
 
 
317 aa  157  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2097  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 
313 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.036296  normal  0.0908673 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.59 
 
 
328 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>