More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0605 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010830  Aasi_0605  hypothetical protein  100 
 
 
426 aa  865    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1822  transcriptional regulator  57.74 
 
 
423 aa  489  1e-137  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2728  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  54.79 
 
 
431 aa  466  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0990  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  54.51 
 
 
460 aa  464  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1848  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  54.87 
 
 
419 aa  440  9.999999999999999e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1203  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  54.27 
 
 
417 aa  434  1e-120  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.477797  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5917  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  52.71 
 
 
419 aa  434  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000432262  normal  0.978022 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00695  transcriptional regulator  53.49 
 
 
420 aa  424  1e-117  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.195355  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0248  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  52.72 
 
 
411 aa  419  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0148  sigma-54-dependent transcriptional regulator  47.06 
 
 
417 aa  406  1.0000000000000001e-112  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2061  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  42.76 
 
 
442 aa  342  9e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1886  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  40.38 
 
 
379 aa  296  4e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0843  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  41.71 
 
 
398 aa  296  6e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1061  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  40.53 
 
 
383 aa  294  2e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.406887  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1702  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  40.91 
 
 
386 aa  294  2e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0294499  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1331  Fis family transcriptional regulator  39.67 
 
 
415 aa  293  3e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.373385  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1498  Fis family transcriptional regulator  39.95 
 
 
395 aa  291  2e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1593  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  40.34 
 
 
378 aa  268  1e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1152  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  40.62 
 
 
534 aa  262  1e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0929318 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0884  transcriptional regulator FleQ  49.82 
 
 
471 aa  262  1e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0915  transcriptional regulator FleQ  49.46 
 
 
471 aa  260  3e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3404  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  44.83 
 
 
455 aa  259  5.0000000000000005e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.235439  normal  0.675632 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1311  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  40.34 
 
 
538 aa  259  8e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0530064  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4669  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  48.26 
 
 
533 aa  251  1e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3671  Sigma 54 interacting domain protein  54.31 
 
 
657 aa  250  4e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3833  putative sigma54 specific transcriptional regulator  50.59 
 
 
450 aa  249  7e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.859471 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3020  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  47.43 
 
 
499 aa  249  8e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4003  putative sigma54 specific transcriptional regulator  50.4 
 
 
451 aa  249  9e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.731384  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0476  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  50 
 
 
451 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3599  two component Fis family transcriptional regulator  51.67 
 
 
459 aa  248  2e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2942  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  48.59 
 
 
451 aa  248  2e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2381  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  50.42 
 
 
505 aa  247  3e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0433  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  48.59 
 
 
472 aa  247  3e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4638  putative sigma54 specific transcriptional regulator  49 
 
 
592 aa  247  4e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.335351  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3562  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  49 
 
 
592 aa  247  4e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.705523 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1305  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  51.29 
 
 
379 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.314792  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3226  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  49.58 
 
 
335 aa  246  6e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2959  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  37.41 
 
 
513 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2972  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  50.62 
 
 
562 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1324  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  47.79 
 
 
350 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.02567 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0930  helix-turn-helix, Fis-type  50.64 
 
 
436 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179515  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0769  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  49.19 
 
 
453 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.165448  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4752  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  49.4 
 
 
477 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.102519  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3302  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  47.66 
 
 
469 aa  244  3e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.498619  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2606  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  49.79 
 
 
501 aa  243  3e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.955687 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1319  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  46.95 
 
 
452 aa  243  5e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2162  putative sigma54 specific transcriptional regulator  54.55 
 
 
366 aa  243  5e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332569  normal  0.224007 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1805  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  36.77 
 
 
602 aa  243  6e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.80823  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1563  Fis family transcriptional regulator  49.58 
 
 
348 aa  242  7e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.290119  normal  0.356277 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02780  vanadium nitrogenase sigma54-dependent transcriptional activator, VnfA  48.61 
 
 
522 aa  242  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274487  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51000  Nif-specific sigma54-dependent transcriptional activator protein, NifA  50.21 
 
 
522 aa  241  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.519777  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1639  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  50 
 
 
473 aa  242  1e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.701414  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0471  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  48.54 
 
 
349 aa  242  1e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0982753 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3672  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  45.45 
 
 
504 aa  242  1e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0002131  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49020  sigma54-dependent transcriptional activator for the iron only nitrogenase, AnfA  42.04 
 
 
537 aa  241  2e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2200  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  47.49 
 
 
459 aa  241  2e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4389  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  43.9 
 
 
495 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.205713  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3798  helix-turn-helix, Fis-type  47.62 
 
 
558 aa  241  2e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.852136  hitchhiker  0.00299193 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5673  helix-turn-helix, Fis-type  46.59 
 
 
592 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450699  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1405  two component Fis family transcriptional regulator  49.78 
 
 
477 aa  241  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0781313  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2959  Fis family transcriptional regulator  49.14 
 
 
341 aa  241  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3364  putative sigma54 specific transcriptional regulator  49.78 
 
 
585 aa  240  2.9999999999999997e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1157  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  51.29 
 
 
502 aa  240  2.9999999999999997e-62  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0259  two component signal transduction response regulator  47.22 
 
 
513 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0110  anaerobic nitric oxide reductase transcription regulator  46.28 
 
 
536 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0168  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  47.1 
 
 
459 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.564625  normal  0.730975 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3338  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  46.28 
 
 
453 aa  241  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.693368  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3483  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  47.01 
 
 
455 aa  240  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0480061  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1756  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  49.39 
 
 
450 aa  240  4e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.562134  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1577  transcriptional regulator, NifA, Fis Family  48.57 
 
 
581 aa  240  4e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0437  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  48.61 
 
 
490 aa  240  4e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0093  anaerobic nitric oxide reductase transcription regulator  46.28 
 
 
540 aa  240  4e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2966  transcriptional regulator NifA  47.97 
 
 
515 aa  240  4e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0776  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  49.19 
 
 
454 aa  240  5e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0356  putative two component response regulator  45.88 
 
 
492 aa  239  5.999999999999999e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43900  Sigma54-dependent transcriptional activator protein  50.68 
 
 
367 aa  239  5.999999999999999e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1981  two-component response regulator, sigma-54 related  48.22 
 
 
448 aa  239  5.999999999999999e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.472322  normal  0.614669 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0085  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  48.77 
 
 
452 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0127  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  49.01 
 
 
604 aa  239  6.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2116  Fis family transcriptional regulator  50.65 
 
 
579 aa  239  8e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0884  NifA subfamily transcriptional regulator  48.08 
 
 
539 aa  239  8e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.871675 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2771  sigma-54 dependent transcriptional regulator  46.59 
 
 
367 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05195  putative phenol-degradative gene regulator transcription regulator protein  50 
 
 
623 aa  238  1e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000454847  normal  0.120965 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2908  putative transcriptional regulator  52.04 
 
 
376 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.259707  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06173  transcriptional regulator  36.19 
 
 
494 aa  238  1e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.97776  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3151  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  35.2 
 
 
539 aa  238  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.845155 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1136  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  49.79 
 
 
466 aa  238  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4307  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  50.62 
 
 
635 aa  239  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.056389 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34210  putative transcriptional regulator  52.04 
 
 
376 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0247085  normal  0.0127418 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00993  transcriptional regulator  36.19 
 
 
494 aa  238  1e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.656224  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2982  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  46.59 
 
 
367 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.165911  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1624  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  46.82 
 
 
561 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.714408  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1182  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis Family  45.76 
 
 
502 aa  237  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.135546  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1089  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis Family  45.76 
 
 
502 aa  237  2e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4406  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  49.34 
 
 
483 aa  237  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.378923  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2114  Fis family transcriptional regulator  50.65 
 
 
573 aa  238  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3419  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  46.58 
 
 
455 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.683267  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0187  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  45.7 
 
 
457 aa  237  2e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4383  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  49.34 
 
 
483 aa  237  2e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.246116  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0670  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  48.03 
 
 
464 aa  238  2e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>