4300 genes were found for organism Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 43    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Tpau_0001  CDS  NC_014158  190  1662  +  1473  chromosomal replication initiator protein DnaA  YP_003644994  normal  0.428353  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0002  CDS  NC_014158  1699  2532  -  834  hypothetical protein  YP_003644995  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0003  CDS  NC_014158  2938  4128  +  1191  DNA polymerase III, beta subunit  YP_003644996  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0004  CDS  NC_014158  4169  5053  +  885  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  YP_003644997  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0005  CDS  NC_014158  5069  6274  +  1206  DNA replication and repair protein RecF  YP_003644998  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0006  CDS  NC_014158  6380  7675  +  1296  glycosyl transferase family 28  YP_003644999  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0007  CDS  NC_014158  7677  9272  +  1596  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  YP_003645000  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0008  CDS  NC_014158  9357  9899  +  543  protein of unknown function DUF721  YP_003645001  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0009  CDS  NC_014158  10151  12217  +  2067  DNA gyrase, B subunit  YP_003645002  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0010  CDS  NC_014158  12278  14791  +  2514  DNA gyrase, A subunit  YP_003645003  normal  0.783048  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0011  CDS  NC_014158  14819  15517  +  699  hypothetical protein  YP_003645004  normal  0.249948  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0012  CDS  NC_014158  15745  16197  -  453  hypothetical protein  YP_003645005  normal  0.160514  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0013  CDS  NC_014158  16298  16852  +  555  hypothetical protein  YP_003645006  normal  0.114755  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0014  CDS  NC_014158  16946  17272  +  327  hypothetical protein  YP_003645007  normal  0.226902  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0015  CDS  NC_014158  17428  18780  +  1353  protein of unknown function DUF21  YP_003645008  normal  0.309554  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0016  CDS  NC_014158  18773  19777  +  1005  protein of unknown function DUF21  YP_003645009  normal  0.430522  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0017  CDS  NC_014158  19774  21666  -  1893  hypothetical protein  YP_003645010  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0018  CDS  NC_014158  21868  22077  +  210  hypothetical protein  YP_003645011  normal  0.962598  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0019  CDS  NC_014158  22086  22838  +  753  hypothetical protein  YP_003645012  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0020  CDS  NC_014158  22874  23047  +  174  hypothetical protein  YP_003645013  normal  0.300374  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0021  CDS  NC_014158  23079  23600  -  522  hypothetical protein  YP_003645014  normal  0.447173  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0022  CDS  NC_014158  23704  24237  +  534  Peptidylprolyl isomerase  YP_003645015  normal  0.424958  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0023  CDS  NC_014158  24555  25049  +  495  NLP/P60 protein  YP_003645016  normal  0.371839  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0024  CDS  NC_014158  25056  25457  -  402  hypothetical protein  YP_003645017  normal  0.301664  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0025  CDS  NC_014158  25511  25804  -  294  protein of unknown function UPF0233  YP_003645018  normal  0.389435  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0026  CDS  NC_014158  25886  26527  +  642  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  YP_003645019  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0027  CDS  NC_014158  26548  28542  -  1995  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  YP_003645020  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0028  CDS  NC_014158  28563  29957  -  1395  serine/threonine protein kinase  YP_003645021  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0029  CDS  NC_014158  29957  31471  -  1515  penicillin-binding protein transpeptidase  YP_003645022  normal  0.851817  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0030  CDS  NC_014158  31468  32895  -  1428  cell cycle protein  YP_003645023  normal  0.36129  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0031  CDS  NC_014158  32892  34325  -  1434  protein serine/threonine phosphatase  YP_003645024  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0032  CDS  NC_014158  34322  34786  -  465  FHA domain containing protein  YP_003645025  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0033  CDS  NC_014158  34883  36169  -  1287  FHA domain containing protein  YP_003645026  normal  0.897494  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0034  CDS  NC_014158  36682  38145  +  1464  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  YP_003645027  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0035  CDS  NC_014158  38180  38713  -  534  hypothetical protein  YP_003645028  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0036  CDS  NC_014158  38890  39852  +  963  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  YP_003645029  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0037  CDS  NC_014158  39836  41014  -  1179  major facilitator superfamily MFS_1  YP_003645030  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0038  CDS  NC_014158  40993  41511  -  519  flavoprotein  YP_003645031  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0039  CDS  NC_014158  41508  42641  -  1134  transcriptional regulator, XRE family  YP_003645032  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0040  CDS  NC_014158  42899  43486  -  588  transcriptional regulator, TetR family  YP_003645033  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0041  CDS  NC_014158  43676  44668  +  993  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  YP_003645034  normal  0.5364  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0042  CDS  NC_014158  44811  45920  +  1110  hypothetical protein  YP_003645035  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0043  CDS  NC_014158  45949  47412  -  1464  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  YP_003645036  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0044  CDS  NC_014158  47409  48338  -  930  Patatin  YP_003645037  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0045  CDS  NC_014158  48335  49228  -  894  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_003645038  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0046  CDS  NC_014158  49326  49955  +  630  transcriptional regulator, TetR family  YP_003645039  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0047  CDS  NC_014158  49962  50105  -  144  hypothetical protein  YP_003645040  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0048  CDS  NC_014158  50270  51568  +  1299  Triacylglycerol lipase  YP_003645041  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0049  CDS  NC_014158  51608  52165  +  558  protein of unknown function DUF218  YP_003645042  normal  0.291592  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0050  CDS  NC_014158  52162  52539  -  378  camphor resistance CrcB protein  YP_003645043  normal  0.247076  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0051  CDS  NC_014158  52536  52976  -  441  camphor resistance protein CrcB  YP_003645044  normal  0.173223  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0052  CDS  NC_014158  52982  54580  -  1599  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  YP_003645045  normal  0.444086  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0053  CDS  NC_014158  54737  55291  -  555  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  YP_003645046  normal  0.0537465  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0054  CDS  NC_014158  55306  56325  +  1020  glycosyl transferase group 1  YP_003645047  normal  0.025543  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0055  CDS  NC_014158  56326  57198  +  873  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  YP_003645048  normal  0.0829752  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0056  CDS  NC_014158  57143  57829  -  687  protein of unknown function DUF1361  YP_003645049  normal  0.16852  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0057  CDS  NC_014158  57964  58539  +  576  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  YP_003645050  normal  0.19755  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0058  CDS  NC_014158  58574  59674  +  1101  glycosyl transferase group 1  YP_003645051  normal  0.145995  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0059  CDS  NC_014158  59652  60677  -  1026  hypothetical protein  YP_003645052  normal  0.239478  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0060  CDS  NC_014158  60674  62644  -  1971  glycosyl transferase group 1  YP_003645053  normal  0.19162  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0061  CDS  NC_014158  62641  64212  -  1572  polysaccharide biosynthesis protein  YP_003645054  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0062  CDS  NC_014158  64248  65309  +  1062  glycosyl transferase group 1  YP_003645055  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0063  CDS  NC_014158  65269  66063  -  795  glycosyl transferase, WecB/TagA/CpsF family  YP_003645056  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0064  CDS  NC_014158  66371  67345  +  975  hypothetical protein  YP_003645057  normal  0.325026  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0065  CDS  NC_014158  67342  68091  +  750  lipopolysaccharide biosynthesis protein  YP_003645058  normal  0.15873  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0066  CDS  NC_014158  68178  69494  +  1317  O-antigen polymerase  YP_003645059  normal  0.059458  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0067  CDS  NC_014158  69641  70882  +  1242  C-methyltransferase  YP_003645060  normal  0.0480856  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0068  CDS  NC_014158  70896  71678  +  783  Glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  YP_003645061  normal  0.0882879  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0069  CDS  NC_014158  71675  72328  +  654  LmbE family protein  YP_003645062  normal  0.337748  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0070  CDS  NC_014158  72325  73341  +  1017  NAD-dependent epimerase/dehydratase  YP_003645063  normal  0.214439  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0071  CDS  NC_014158  73344  75797  +  2454  aminotransferase class-III  YP_003645064  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0072  CDS  NC_014158  75862  76335  +  474  hypothetical protein  YP_003645065  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0073  CDS  NC_014158  76388  77113  +  726  hypothetical protein  YP_003645066  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0074  CDS  NC_014158  77116  78957  +  1842  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  YP_003645067  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0075  CDS  NC_014158  79012  80133  -  1122  hypothetical protein  YP_003645068  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0076  CDS  NC_014158  80455  82071  +  1617  hypothetical protein  YP_003645069  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0077  CDS  NC_014158  82495  83697  +  1203  glycoside hydrolase family 5  YP_003645070  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0078  CDS  NC_014158  83839  85104  -  1266  hypothetical protein  YP_003645071  normal  0.656506  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0079  CDS  NC_014158  85384  86559  -  1176  glycoside hydrolase family 5  YP_003645072  normal  0.265461  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0080  CDS  NC_014158  86828  87277  +  450  surface-exposed protein  YP_003645073  normal  0.520503  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0081  CDS  NC_014158  87293  89548  -  2256  heavy metal translocating P-type ATPase  YP_003645074  normal  0.768822  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0082  CDS  NC_014158  89785  90867  -  1083  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  YP_003645075  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0083  CDS  NC_014158  90889  91491  -  603  FMN-binding negative transcriptional regulator  YP_003645076  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0084  CDS  NC_014158  91502  91891  -  390  hypothetical protein  YP_003645077  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0085  CDS  NC_014158  92044  92703  +  660  transcriptional regulator, TetR family  YP_003645078  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0086  CDS  NC_014158  92700  93197  +  498  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_003645079  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0087  CDS  NC_014158  93197  93838  +  642  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  YP_003645080  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0088  CDS  NC_014158  93866  95221  +  1356  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  YP_003645081  normal  0.919516  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0089  CDS  NC_014158  95218  96444  -  1227  major facilitator superfamily MFS_1  YP_003645082  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0090  CDS  NC_014158  96544  96873  +  330  putative transcriptional regulator, ArsR family  YP_003645083  normal  0.885774  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0091  CDS  NC_014158  96809  97504  -  696  hypothetical protein  YP_003645084  normal  0.708971  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0092  CDS  NC_014158  97515  98438  -  924  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  YP_003645085  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0093  CDS  NC_014158  98459  99157  +  699  two component transcriptional regulator, winged helix family  YP_003645086  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0094  CDS  NC_014158  99157  100284  +  1128  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  YP_003645087  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0095  CDS  NC_014158  100379  102559  +  2181  Carbonate dehydratase  YP_003645088  normal  0.431657  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0096  CDS  NC_014158  102709  103356  +  648  hypothetical protein  YP_003645089  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0097  CDS  NC_014158  103328  104035  +  708  two component transcriptional regulator, winged helix family  YP_003645090  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0098  CDS  NC_014158  104035  105387  +  1353  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  YP_003645091  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0099  CDS  NC_014158  105399  106196  +  798  Glutamate racemase  YP_003645092  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_0100  CDS  NC_014158  106398  107978  -  1581  anibiotic ABC transporter efflux pump  YP_003645093  normal  0.995514  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 43    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>