12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0059 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0059  hypothetical protein  100 
 
 		 341 aa  668    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.239478  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1067  hypothetical protein  56.54 
 
 		 347 aa  323  2e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0410891  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1498  glycosyl transferase, group 1  37.5 
 
 		 392 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0168  glycosyl transferase  42.67 
 
 		 374 aa  48.5  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.627515 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2385  glycosyl transferase group 1  26.11 
 
 		 385 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2830  glycosyl transferase group 1  27.42 
 
 		 380 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0420061 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2436  glycosyl transferase group 1  26.11 
 
 		 385 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.830296 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0365  glycosyl transferase group 1  25.76 
 
 		 387 aa  45.1  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5248  glycosyl transferase, group 1  36.11 
 
 		 393 aa  44.3  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.663702 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2306  glycosyl transferase group 1  24.92 
 
 		 379 aa  43.5  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.455622  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.67 
 
 		 409 aa  43.1  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2081  glycosyl transferase group 1  30.71 
 
 		 381 aa  43.1  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.212135  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>