38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0075 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0075  hypothetical protein  100 
 
 		 373 aa  732    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1987  hypothetical protein  41.21 
 
 		 427 aa  253  5.000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.233249  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0389  hypothetical protein  25.5 
 
 		 375 aa  65.5  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.187966  normal  0.347328 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1997  hypothetical protein  29.61 
 
 		 368 aa  60.8  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1581  hypothetical protein  27.52 
 
 		 377 aa  56.6  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0181991 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1316  hypothetical protein  27.52 
 
 		 377 aa  56.6  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.893937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1952  acyltransferase family protein  26.69 
 
 		 403 aa  52  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00838522 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0765  hypothetical protein  26.19 
 
 		 421 aa  51.2  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.191126  hitchhiker  0.00877498 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0143  hypothetical protein  22.25 
 
 		 395 aa  50.1  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.184746  normal  0.13553 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1356  acyltransferase family protein  28.49 
 
 		 380 aa  50.1  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116907  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0145  hypothetical protein  25.68 
 
 		 415 aa  50.1  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0899  putative OpgC protein  27.62 
 
 		 484 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3201  hypothetical protein  24.46 
 
 		 429 aa  48.1  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0570955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0788  putative OpgC protein  30.39 
 
 		 421 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.904469  normal  0.107967 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3279  hypothetical protein  26.57 
 
 		 418 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0354  hypothetical protein  31.97 
 
 		 396 aa  47.8  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4886  hypothetical protein  27.5 
 
 		 383 aa  47.4  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00335271  normal  0.121358 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6048  hypothetical protein  26.85 
 
 		 377 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.983197  normal  0.374141 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1292  hypothetical protein  27.83 
 
 		 388 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.721531  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1032  hypothetical protein  27.83 
 
 		 384 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.608592  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2545  hypothetical protein  27.83 
 
 		 435 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0193  hypothetical protein  32.65 
 
 		 380 aa  45.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1104  hypothetical protein  27.57 
 
 		 392 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.984943  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0265  hypothetical protein  27.83 
 
 		 384 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0535  hypothetical protein  27.83 
 
 		 384 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.306001  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1372  hypothetical protein  27.83 
 
 		 388 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1288  putative opgC protein  27.83 
 
 		 384 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3961  hypothetical protein  25.68 
 
 		 399 aa  44.3  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3154  hypothetical protein  26.7 
 
 		 385 aa  44.7  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0222  acyltransferase 3  27.03 
 
 		 411 aa  44.3  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3149  hypothetical protein  25.71 
 
 		 401 aa  44.3  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.717167  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1455  opgC protein, putative  25.47 
 
 		 431 aa  44.3  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0928141  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1233  hypothetical protein  26.44 
 
 		 365 aa  44.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.376923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1137  hypothetical protein  27.32 
 
 		 401 aa  43.9  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2280  hypothetical protein  24.52 
 
 		 377 aa  43.5  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0956808  normal  0.124268 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4038  hypothetical protein  27.88 
 
 		 365 aa  43.1  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.372209 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1064  putative membrane protein of unknown function  26.61 
 
 		 406 aa  43.5  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4912  putative OpgC protein  28.41 
 
 		 417 aa  42.7  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.563767 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>