98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1104 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1104  hypothetical protein  100 
 
 		 392 aa  795    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.984943  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0208  hypothetical protein  49.01 
 
 		 371 aa  271  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.66956 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0136  acyltransferase 3  36.88 
 
 		 415 aa  187  4e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.909719 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0788  putative OpgC protein  38.87 
 
 		 421 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.904469  normal  0.107967 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4912  putative OpgC protein  38.26 
 
 		 417 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.563767 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0765  hypothetical protein  37.09 
 
 		 421 aa  179  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.191126  hitchhiker  0.00877498 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5254  hypothetical protein  38.13 
 
 		 421 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.15377  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0222  acyltransferase 3  36.42 
 
 		 411 aa  177  3e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0899  putative OpgC protein  38.14 
 
 		 484 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1295  OpgC protein-like protein  34.11 
 
 		 416 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333454  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5813  hypothetical protein  37.75 
 
 		 385 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.161405 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2532  putative OpgC protein  35.19 
 
 		 427 aa  166  8e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.978745 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2784  putative OpgC protein  34.49 
 
 		 415 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.537319  normal  0.276601 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4163  putative OpgC protein, require for succinylation of osmoregulated periplasmic glucans  33.11 
 
 		 418 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2806  hypothetical protein  32.89 
 
 		 424 aa  156  6e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4266  OpgC protein, require for succinylation of osmoregulated periplasmic glucans  31.53 
 
 		 400 aa  156  6e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2936  putative OpgC protein  33.45 
 
 		 430 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.224445  normal  0.376273 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2146  putative OpgC protein  34.43 
 
 		 377 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.150059 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2302  putative OpgC protein  34.1 
 
 		 388 aa  152  8e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4043  hypothetical protein  31.71 
 
 		 385 aa  152  8.999999999999999e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0814624 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4415  hypothetical protein  32.39 
 
 		 459 aa  152  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.247797  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0145  hypothetical protein  32.29 
 
 		 415 aa  151  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3644  hypothetical protein  35.67 
 
 		 379 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.82541  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1064  putative membrane protein of unknown function  33.12 
 
 		 406 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3339  putative OpgC protein  33.22 
 
 		 375 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.523015 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7260  putative opgC protein  34.55 
 
 		 365 aa  139  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3921  hypothetical protein  35.22 
 
 		 376 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4185  hypothetical protein  33.67 
 
 		 376 aa  119  7e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.534603  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1997  hypothetical protein  30.07 
 
 		 368 aa  103  5e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1763  hypothetical protein  33.94 
 
 		 422 aa  99  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3154  hypothetical protein  29.94 
 
 		 385 aa  85.5  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1533  hypothetical protein  27.45 
 
 		 435 aa  79.7  0.00000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.208932 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4886  hypothetical protein  28.62 
 
 		 383 aa  79.3  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00335271  normal  0.121358 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3844  putative protein required for succinylation of osmoregulated periplasmic glucans  27.79 
 
 		 412 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1706  opgC protein, putative  28.71 
 
 		 393 aa  78.6  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1649  putative opgC protein  28.71 
 
 		 393 aa  78.6  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0845152  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3041  OpgC protein  28.72 
 
 		 388 aa  78.2  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1952  acyltransferase family protein  28.11 
 
 		 403 aa  75.9  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00838522 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1137  hypothetical protein  32.38 
 
 		 401 aa  74.3  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3279  hypothetical protein  30.58 
 
 		 418 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1714  hypothetical protein  29.01 
 
 		 409 aa  72  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1209  OpgC protein  26.95 
 
 		 407 aa  70.5  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4172  putative protein required for succinylation of osmoregulated periplasmic glucans  26.92 
 
 		 412 aa  68.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4947  hypothetical protein  33.17 
 
 		 369 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0337117  normal  0.0617497 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0128  OpgC protein  31.13 
 
 		 399 aa  68.2  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.253754  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2545  hypothetical protein  28.57 
 
 		 435 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0265  hypothetical protein  28.57 
 
 		 384 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1288  putative opgC protein  28.57 
 
 		 384 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0535  hypothetical protein  28.57 
 
 		 384 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.306001  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1032  hypothetical protein  28.57 
 
 		 384 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.608592  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1765  OpgC protein  31.13 
 
 		 399 aa  67  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.411843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1292  hypothetical protein  28.57 
 
 		 388 aa  67  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.721531  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1372  hypothetical protein  28.57 
 
 		 388 aa  67  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0154  hypothetical protein  24.88 
 
 		 368 aa  66.2  0.0000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1455  opgC protein, putative  28.44 
 
 		 431 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0928141  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1700  hypothetical protein  34.76 
 
 		 369 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.646049  normal  0.417956 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1581  hypothetical protein  26.71 
 
 		 377 aa  65.1  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0181991 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1316  hypothetical protein  26.71 
 
 		 377 aa  65.1  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.893937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3201  hypothetical protein  24.84 
 
 		 429 aa  63.9  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0570955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5314  hypothetical protein  31.8 
 
 		 374 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0258075  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4726  hypothetical protein  31.8 
 
 		 374 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5546  hypothetical protein  31.8 
 
 		 374 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.753322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0112  hypothetical protein  30.41 
 
 		 374 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3260  hypothetical protein  29.57 
 
 		 374 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.117077 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1356  acyltransferase family protein  26.94 
 
 		 380 aa  60.1  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116907  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1987  hypothetical protein  27.4 
 
 		 427 aa  59.3  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.233249  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2280  hypothetical protein  26.24 
 
 		 377 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0956808  normal  0.124268 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6048  hypothetical protein  25.37 
 
 		 377 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.983197  normal  0.374141 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5417  hypothetical protein  31.16 
 
 		 375 aa  57  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4870  hypothetical protein  30.52 
 
 		 374 aa  57  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1233  hypothetical protein  25.77 
 
 		 365 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.376923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4608  hypothetical protein  27.15 
 
 		 365 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707127 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3760  hypothetical protein  27.15 
 
 		 365 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.500718  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5561  OpgC protein  27.7 
 
 		 366 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4038  hypothetical protein  27.33 
 
 		 384 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0127  hypothetical protein  26.11 
 
 		 369 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1953.1  putative OpgC protein  29.72 
 
 		 375 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.584831  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2238  OpgC protein, putative  29.86 
 
 		 366 aa  55.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1277  hypothetical protein  29.72 
 
 		 450 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5696  hypothetical protein  27.46 
 
 		 365 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0138728 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2232  putative OpgC protein  29.72 
 
 		 375 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0971  putative OpgC protein  29.72 
 
 		 375 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.346061  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1258  putative OpgC protein  29.72 
 
 		 375 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4496  hypothetical protein  29.52 
 
 		 367 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2228  OpgC protein  25.99 
 
 		 366 aa  54.7  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.297426 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3043  hypothetical protein  29.72 
 
 		 375 aa  54.3  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2919  hypothetical protein  29.72 
 
 		 375 aa  54.3  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.329153  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3465  hypothetical protein  36.59 
 
 		 397 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.604718  normal  0.972852 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2375  OpgC protein  26.74 
 
 		 365 aa  52  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0332803  decreased coverage  0.00013342 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4038  hypothetical protein  29.52 
 
 		 365 aa  51.6  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.372209 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0354  hypothetical protein  31.65 
 
 		 396 aa  52  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0989  OpgC protein  24.91 
 
 		 379 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal  0.503682 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0952  OpgC protein  24.91 
 
 		 379 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.242589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0930  OpgC protein  25.61 
 
 		 381 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.918852  normal  0.510158 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3730  hypothetical protein  29.34 
 
 		 681 aa  50.1  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2190  OpgC protein  25.85 
 
 		 380 aa  48.9  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.013941  normal  0.776218 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0389  hypothetical protein  27.44 
 
 		 375 aa  47.8  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.187966  normal  0.347328 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0075  hypothetical protein  27.57 
 
 		 373 aa  45.4  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>