103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0952 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0989  OpgC protein  100 
 
 		 379 aa  750    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal  0.503682 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0930  OpgC protein  95.24 
 
 		 381 aa  639    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.918852  normal  0.510158 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0952  OpgC protein  100 
 
 		 379 aa  750    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.242589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2375  OpgC protein  74.86 
 
 		 365 aa  512  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0332803  decreased coverage  0.00013342 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5561  OpgC protein  67.99 
 
 		 366 aa  432  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5409  OpgC protein  67.86 
 
 		 366 aa  429  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0814219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2190  OpgC protein  49.87 
 
 		 380 aa  338  9.999999999999999e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.013941  normal  0.776218 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2228  OpgC protein  49.04 
 
 		 366 aa  311  1e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.297426 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3041  OpgC protein  32.16 
 
 		 388 aa  186  7e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0128  OpgC protein  32.82 
 
 		 399 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.253754  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4163  putative OpgC protein, require for succinylation of osmoregulated periplasmic glucans  34.25 
 
 		 418 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1714  hypothetical protein  31.54 
 
 		 409 aa  162  9e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1706  opgC protein, putative  30.88 
 
 		 393 aa  161  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4266  OpgC protein, require for succinylation of osmoregulated periplasmic glucans  34.38 
 
 		 400 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1649  putative opgC protein  30.88 
 
 		 393 aa  161  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0845152  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1209  OpgC protein  32.11 
 
 		 407 aa  158  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1295  OpgC protein-like protein  32.45 
 
 		 416 aa  156  6e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333454  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1765  OpgC protein  31.77 
 
 		 399 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.411843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2532  putative OpgC protein  30.65 
 
 		 427 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.978745 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3154  hypothetical protein  32.96 
 
 		 385 aa  151  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0136  acyltransferase 3  32.16 
 
 		 415 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.909719 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2936  putative OpgC protein  30.71 
 
 		 430 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.224445  normal  0.376273 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3644  hypothetical protein  29.17 
 
 		 379 aa  146  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.82541  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0765  hypothetical protein  30.4 
 
 		 421 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.191126  hitchhiker  0.00877498 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2784  putative OpgC protein  31.59 
 
 		 415 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.537319  normal  0.276601 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0154  hypothetical protein  30.98 
 
 		 368 aa  144  3e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4912  putative OpgC protein  30.49 
 
 		 417 aa  143  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.563767 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4172  putative protein required for succinylation of osmoregulated periplasmic glucans  31.55 
 
 		 412 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0788  putative OpgC protein  29.64 
 
 		 421 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.904469  normal  0.107967 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1137  hypothetical protein  32.47 
 
 		 401 aa  140  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0899  putative OpgC protein  30.77 
 
 		 484 aa  139  7e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0222  acyltransferase 3  30.55 
 
 		 411 aa  138  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2806  hypothetical protein  29.57 
 
 		 424 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1997  hypothetical protein  31.87 
 
 		 368 aa  137  4e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4415  hypothetical protein  32.26 
 
 		 459 aa  136  6.0000000000000005e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.247797  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7260  putative opgC protein  30.52 
 
 		 365 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3844  putative protein required for succinylation of osmoregulated periplasmic glucans  30.46 
 
 		 412 aa  135  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3339  putative OpgC protein  30.17 
 
 		 375 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.523015 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5254  hypothetical protein  28.69 
 
 		 421 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.15377  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2146  putative OpgC protein  28.17 
 
 		 377 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.150059 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2302  putative OpgC protein  28.21 
 
 		 388 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3921  hypothetical protein  30.99 
 
 		 376 aa  126  6e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4043  hypothetical protein  28.35 
 
 		 385 aa  126  6e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0814624 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1064  putative membrane protein of unknown function  30.16 
 
 		 406 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4185  hypothetical protein  31.64 
 
 		 376 aa  125  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.534603  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1763  hypothetical protein  30.08 
 
 		 422 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0145  hypothetical protein  28.37 
 
 		 415 aa  120  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5813  hypothetical protein  30.35 
 
 		 385 aa  120  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.161405 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4886  hypothetical protein  29.74 
 
 		 383 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00335271  normal  0.121358 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0208  hypothetical protein  30.81 
 
 		 371 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.66956 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3760  hypothetical protein  28.27 
 
 		 365 aa  99.4  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.500718  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4608  hypothetical protein  28.27 
 
 		 365 aa  99.4  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707127 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4038  hypothetical protein  27.92 
 
 		 384 aa  99  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5696  hypothetical protein  28.27 
 
 		 365 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0138728 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1233  hypothetical protein  27.67 
 
 		 365 aa  98.2  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.376923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4496  hypothetical protein  27.49 
 
 		 367 aa  97.8  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1533  hypothetical protein  32.43 
 
 		 435 aa  97.1  5e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.208932 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2280  hypothetical protein  29.41 
 
 		 377 aa  94.4  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0956808  normal  0.124268 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3201  hypothetical protein  31.44 
 
 		 429 aa  92  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0570955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1700  hypothetical protein  32.85 
 
 		 369 aa  92.4  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.646049  normal  0.417956 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4038  hypothetical protein  28.21 
 
 		 365 aa  92  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.372209 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6048  hypothetical protein  29.28 
 
 		 377 aa  90.1  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.983197  normal  0.374141 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0127  hypothetical protein  28.78 
 
 		 369 aa  89  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4947  hypothetical protein  32.37 
 
 		 369 aa  89.4  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0337117  normal  0.0617497 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5417  hypothetical protein  27.27 
 
 		 375 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4870  hypothetical protein  26.9 
 
 		 374 aa  87.8  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1292  hypothetical protein  27.38 
 
 		 388 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.721531  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3260  hypothetical protein  26.09 
 
 		 374 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.117077 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3279  hypothetical protein  28.02 
 
 		 418 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1288  putative opgC protein  27.38 
 
 		 384 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2545  hypothetical protein  27.38 
 
 		 435 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0265  hypothetical protein  27.38 
 
 		 384 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0535  hypothetical protein  27.38 
 
 		 384 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.306001  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1372  hypothetical protein  27.38 
 
 		 388 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1032  hypothetical protein  27.38 
 
 		 384 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.608592  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0112  hypothetical protein  26.09 
 
 		 374 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1277  hypothetical protein  27.19 
 
 		 450 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1455  opgC protein, putative  27.51 
 
 		 431 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0928141  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1953.1  putative OpgC protein  27.19 
 
 		 375 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.584831  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0971  putative OpgC protein  27.19 
 
 		 375 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.346061  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1258  putative OpgC protein  27.19 
 
 		 375 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2919  hypothetical protein  27.19 
 
 		 375 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.329153  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2232  putative OpgC protein  27.19 
 
 		 375 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3043  hypothetical protein  27.19 
 
 		 375 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3465  hypothetical protein  26.49 
 
 		 397 aa  79.3  0.00000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.604718  normal  0.972852 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4726  hypothetical protein  24.53 
 
 		 374 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5314  hypothetical protein  24.26 
 
 		 374 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0258075  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5546  hypothetical protein  24.26 
 
 		 374 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.753322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2238  OpgC protein, putative  29.38 
 
 		 366 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0389  hypothetical protein  27.86 
 
 		 375 aa  72.8  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.187966  normal  0.347328 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1316  hypothetical protein  29.05 
 
 		 377 aa  72.4  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.893937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1581  hypothetical protein  29.05 
 
 		 377 aa  72.4  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0181991 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0143  hypothetical protein  24.25 
 
 		 395 aa  66.2  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.184746  normal  0.13553 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0193  hypothetical protein  26.79 
 
 		 380 aa  65.5  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1952  acyltransferase family protein  27.55 
 
 		 403 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00838522 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1104  hypothetical protein  25.09 
 
 		 392 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.984943  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1356  acyltransferase family protein  24.63 
 
 		 380 aa  53.9  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116907  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3730  hypothetical protein  26.8 
 
 		 681 aa  53.1  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0354  hypothetical protein  27.08 
 
 		 396 aa  53.1  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3961  hypothetical protein  23.04 
 
 		 399 aa  51.2  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>