105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0143 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0143  hypothetical protein  100 
 
 		 395 aa  793    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.184746  normal  0.13553 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1530  hypothetical protein  28.15 
 
 		 431 aa  124  4e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3961  hypothetical protein  30.43 
 
 		 399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0193  hypothetical protein  31.29 
 
 		 380 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2399  hypothetical protein  28.75 
 
 		 365 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1356  acyltransferase family protein  29.77 
 
 		 380 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116907  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1952  acyltransferase family protein  27.03 
 
 		 403 aa  104  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00838522 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3149  hypothetical protein  25.87 
 
 		 401 aa  99.8  7e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.717167  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0222  acyltransferase 3  27.43 
 
 		 411 aa  99  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4912  putative OpgC protein  27.84 
 
 		 417 aa  97.4  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.563767 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0136  acyltransferase 3  26.92 
 
 		 415 aa  96.7  6e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.909719 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1967  hypothetical protein  27.6 
 
 		 360 aa  94  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274953  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0899  putative OpgC protein  27.27 
 
 		 484 aa  94  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2146  putative OpgC protein  26.89 
 
 		 377 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.150059 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2302  putative OpgC protein  26.89 
 
 		 388 aa  90.1  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0765  hypothetical protein  28.61 
 
 		 421 aa  89.4  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.191126  hitchhiker  0.00877498 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1714  hypothetical protein  27.83 
 
 		 409 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5254  hypothetical protein  26.55 
 
 		 421 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.15377  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4163  putative OpgC protein, require for succinylation of osmoregulated periplasmic glucans  29.71 
 
 		 418 aa  88.2  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0788  putative OpgC protein  26.25 
 
 		 421 aa  87.4  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.904469  normal  0.107967 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2784  putative OpgC protein  25.22 
 
 		 415 aa  87  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.537319  normal  0.276601 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3339  putative OpgC protein  27.46 
 
 		 375 aa  87  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.523015 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0354  hypothetical protein  26.91 
 
 		 396 aa  86.7  7e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3260  hypothetical protein  24.92 
 
 		 374 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.117077 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3644  hypothetical protein  27.52 
 
 		 379 aa  84  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.82541  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1997  hypothetical protein  29.48 
 
 		 368 aa  84  0.000000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3154  hypothetical protein  27.16 
 
 		 385 aa  83.6  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1295  OpgC protein-like protein  27.89 
 
 		 416 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333454  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2806  hypothetical protein  25.68 
 
 		 424 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4043  hypothetical protein  25.83 
 
 		 385 aa  81.6  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0814624 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4172  putative protein required for succinylation of osmoregulated periplasmic glucans  28.45 
 
 		 412 aa  82  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3921  hypothetical protein  27.38 
 
 		 376 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0112  hypothetical protein  25.38 
 
 		 374 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2532  putative OpgC protein  24.48 
 
 		 427 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.978745 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1765  OpgC protein  27.3 
 
 		 399 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.411843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7260  putative opgC protein  25.08 
 
 		 365 aa  80.9  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4870  hypothetical protein  24.16 
 
 		 374 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5417  hypothetical protein  24.46 
 
 		 375 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0128  OpgC protein  27.01 
 
 		 399 aa  79.7  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.253754  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0145  hypothetical protein  27.6 
 
 		 415 aa  79  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2936  putative OpgC protein  24.71 
 
 		 430 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.224445  normal  0.376273 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4266  OpgC protein, require for succinylation of osmoregulated periplasmic glucans  28.28 
 
 		 400 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5314  hypothetical protein  24.46 
 
 		 374 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0258075  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5546  hypothetical protein  24.46 
 
 		 374 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.753322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4415  hypothetical protein  26.69 
 
 		 459 aa  77  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.247797  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1137  hypothetical protein  27.07 
 
 		 401 aa  77  0.0000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1706  opgC protein, putative  26.73 
 
 		 393 aa  76.6  0.0000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1649  putative opgC protein  26.73 
 
 		 393 aa  76.6  0.0000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0845152  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4185  hypothetical protein  27.46 
 
 		 376 aa  76.3  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.534603  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4726  hypothetical protein  24.16 
 
 		 374 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3844  putative protein required for succinylation of osmoregulated periplasmic glucans  27.7 
 
 		 412 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3041  OpgC protein  29.11 
 
 		 388 aa  74.3  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0208  hypothetical protein  25 
 
 		 371 aa  70.9  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.66956 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3279  hypothetical protein  26.08 
 
 		 418 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1455  opgC protein, putative  27.85 
 
 		 431 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0928141  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4886  hypothetical protein  25.79 
 
 		 383 aa  69.7  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00335271  normal  0.121358 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0154  hypothetical protein  26.72 
 
 		 368 aa  69.3  0.0000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1209  OpgC protein  25.45 
 
 		 407 aa  68.2  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1064  putative membrane protein of unknown function  26.78 
 
 		 406 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3730  hypothetical protein  27.31 
 
 		 681 aa  67  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6048  hypothetical protein  24.42 
 
 		 377 aa  67  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.983197  normal  0.374141 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1763  hypothetical protein  25.31 
 
 		 422 aa  65.9  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0127  hypothetical protein  26.7 
 
 		 369 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1233  hypothetical protein  25 
 
 		 365 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.376923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2280  hypothetical protein  25.93 
 
 		 377 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0956808  normal  0.124268 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3043  hypothetical protein  25.83 
 
 		 375 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1953.1  putative OpgC protein  25.83 
 
 		 375 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.584831  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0971  putative OpgC protein  25.83 
 
 		 375 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.346061  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1258  putative OpgC protein  25.83 
 
 		 375 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2232  putative OpgC protein  25.83 
 
 		 375 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2238  OpgC protein, putative  26.75 
 
 		 366 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2919  hypothetical protein  25.83 
 
 		 375 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.329153  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4038  hypothetical protein  25.68 
 
 		 384 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4947  hypothetical protein  28.44 
 
 		 369 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0337117  normal  0.0617497 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1288  putative opgC protein  25.57 
 
 		 384 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0265  hypothetical protein  25.57 
 
 		 384 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0535  hypothetical protein  25.57 
 
 		 384 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.306001  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1032  hypothetical protein  25.57 
 
 		 384 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.608592  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2545  hypothetical protein  25.57 
 
 		 435 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1372  hypothetical protein  25.57 
 
 		 388 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1277  hypothetical protein  25.83 
 
 		 450 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1292  hypothetical protein  24.88 
 
 		 388 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.721531  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1700  hypothetical protein  28.77 
 
 		 369 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.646049  normal  0.417956 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3760  hypothetical protein  25.34 
 
 		 365 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.500718  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4608  hypothetical protein  25.34 
 
 		 365 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707127 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5696  hypothetical protein  25.34 
 
 		 365 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0138728 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4496  hypothetical protein  25.68 
 
 		 367 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5561  OpgC protein  26.1 
 
 		 366 aa  62  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3201  hypothetical protein  28.02 
 
 		 429 aa  60.5  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0570955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2375  OpgC protein  24.49 
 
 		 365 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0332803  decreased coverage  0.00013342 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1533  hypothetical protein  25.79 
 
 		 435 aa  58.9  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.208932 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3642  hypothetical protein  27.15 
 
 		 826 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0930  OpgC protein  24.89 
 
 		 381 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.918852  normal  0.510158 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4038  hypothetical protein  24.07 
 
 		 365 aa  55.8  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.372209 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0989  OpgC protein  25.88 
 
 		 379 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal  0.503682 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5409  OpgC protein  24.19 
 
 		 366 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0814219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0952  OpgC protein  25.88 
 
 		 379 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.242589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5813  hypothetical protein  23.44 
 
 		 385 aa  53.9  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.161405 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2190  OpgC protein  25.44 
 
 		 380 aa  53.9  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.013941  normal  0.776218 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2228  OpgC protein  25.51 
 
 		 366 aa  53.5  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.297426 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>