105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_4163 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4266  OpgC protein, require for succinylation of osmoregulated periplasmic glucans  86.28 
 
 		 400 aa  714    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4163  putative OpgC protein, require for succinylation of osmoregulated periplasmic glucans  100 
 
 		 418 aa  843    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1295  OpgC protein-like protein  87.12 
 
 		 416 aa  709    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333454  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0788  putative OpgC protein  46.93 
 
 		 421 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.904469  normal  0.107967 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4912  putative OpgC protein  44.1 
 
 		 417 aa  343  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.563767 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5254  hypothetical protein  45.88 
 
 		 421 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.15377  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0765  hypothetical protein  46.65 
 
 		 421 aa  341  1e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.191126  hitchhiker  0.00877498 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0899  putative OpgC protein  45.43 
 
 		 484 aa  335  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0222  acyltransferase 3  45.33 
 
 		 411 aa  335  1e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0136  acyltransferase 3  45.15 
 
 		 415 aa  333  4e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.909719 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2532  putative OpgC protein  44.59 
 
 		 427 aa  329  6e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.978745 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2936  putative OpgC protein  47.9 
 
 		 430 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.224445  normal  0.376273 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2806  hypothetical protein  45.88 
 
 		 424 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2784  putative OpgC protein  46.58 
 
 		 415 aa  324  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.537319  normal  0.276601 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0145  hypothetical protein  45.01 
 
 		 415 aa  315  7e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4415  hypothetical protein  42 
 
 		 459 aa  315  9.999999999999999e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.247797  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4043  hypothetical protein  44.82 
 
 		 385 aa  312  6.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0814624 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1064  putative membrane protein of unknown function  42.21 
 
 		 406 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3644  hypothetical protein  40.9 
 
 		 379 aa  297  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.82541  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7260  putative opgC protein  43.45 
 
 		 365 aa  297  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3339  putative OpgC protein  40.53 
 
 		 375 aa  296  3e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.523015 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2302  putative OpgC protein  40.33 
 
 		 388 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2146  putative OpgC protein  39.78 
 
 		 377 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.150059 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5813  hypothetical protein  40.33 
 
 		 385 aa  267  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.161405 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0208  hypothetical protein  37.33 
 
 		 371 aa  228  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.66956 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1997  hypothetical protein  37.6 
 
 		 368 aa  218  1e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3921  hypothetical protein  38.42 
 
 		 376 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4185  hypothetical protein  38.42 
 
 		 376 aa  195  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.534603  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1763  hypothetical protein  33.68 
 
 		 422 aa  162  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1104  hypothetical protein  33.11 
 
 		 392 aa  162  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.984943  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3154  hypothetical protein  31.87 
 
 		 385 aa  159  6e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1714  hypothetical protein  33.24 
 
 		 409 aa  159  9e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0930  OpgC protein  33.06 
 
 		 381 aa  153  4e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.918852  normal  0.510158 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2375  OpgC protein  35.15 
 
 		 365 aa  153  5e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0332803  decreased coverage  0.00013342 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0989  OpgC protein  33.06 
 
 		 379 aa  151  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal  0.503682 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0952  OpgC protein  33.06 
 
 		 379 aa  151  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.242589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0128  OpgC protein  31.47 
 
 		 399 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.253754  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3041  OpgC protein  32.87 
 
 		 388 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2190  OpgC protein  33.43 
 
 		 380 aa  147  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.013941  normal  0.776218 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3844  putative protein required for succinylation of osmoregulated periplasmic glucans  33.43 
 
 		 412 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5561  OpgC protein  35.2 
 
 		 366 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1137  hypothetical protein  33.8 
 
 		 401 aa  141  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1765  OpgC protein  31.88 
 
 		 399 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.411843  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4172  putative protein required for succinylation of osmoregulated periplasmic glucans  32.25 
 
 		 412 aa  137  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1706  opgC protein, putative  29.03 
 
 		 393 aa  136  7.000000000000001e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1649  putative opgC protein  29.03 
 
 		 393 aa  136  7.000000000000001e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0845152  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2228  OpgC protein  31.68 
 
 		 366 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.297426 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0154  hypothetical protein  27.67 
 
 		 368 aa  133  5e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3465  hypothetical protein  33.42 
 
 		 397 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.604718  normal  0.972852 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1209  OpgC protein  29.2 
 
 		 407 aa  127  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5409  OpgC protein  35.25 
 
 		 366 aa  127  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0814219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4886  hypothetical protein  29.57 
 
 		 383 aa  120  6e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00335271  normal  0.121358 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3279  hypothetical protein  27.9 
 
 		 418 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4870  hypothetical protein  28.42 
 
 		 374 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5417  hypothetical protein  28.61 
 
 		 375 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0112  hypothetical protein  28.22 
 
 		 374 aa  116  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1533  hypothetical protein  29.47 
 
 		 435 aa  116  6e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.208932 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3760  hypothetical protein  30.27 
 
 		 365 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.500718  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4038  hypothetical protein  29.67 
 
 		 384 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4608  hypothetical protein  30.27 
 
 		 365 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707127 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3260  hypothetical protein  28.65 
 
 		 374 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.117077 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5696  hypothetical protein  30.27 
 
 		 365 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0138728 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5314  hypothetical protein  28.16 
 
 		 374 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0258075  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5546  hypothetical protein  28.16 
 
 		 374 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.753322  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1953.1  putative OpgC protein  29.65 
 
 		 375 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.584831  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1233  hypothetical protein  30.46 
 
 		 365 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.376923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0971  putative OpgC protein  29.65 
 
 		 375 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.346061  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1258  putative OpgC protein  29.65 
 
 		 375 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2232  putative OpgC protein  29.65 
 
 		 375 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4726  hypothetical protein  28.16 
 
 		 374 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4496  hypothetical protein  29.67 
 
 		 367 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1277  hypothetical protein  29.8 
 
 		 450 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3043  hypothetical protein  29.8 
 
 		 375 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2919  hypothetical protein  29.8 
 
 		 375 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.329153  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1455  opgC protein, putative  36.02 
 
 		 431 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0928141  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1292  hypothetical protein  35.55 
 
 		 388 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.721531  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1288  putative opgC protein  35.55 
 
 		 384 aa  110  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2545  hypothetical protein  35.55 
 
 		 435 aa  110  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0265  hypothetical protein  35.55 
 
 		 384 aa  110  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0535  hypothetical protein  35.55 
 
 		 384 aa  110  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.306001  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1372  hypothetical protein  35.55 
 
 		 388 aa  110  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1032  hypothetical protein  35.55 
 
 		 384 aa  110  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.608592  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4038  hypothetical protein  29.46 
 
 		 365 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.372209 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2238  OpgC protein, putative  28.19 
 
 		 366 aa  104  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4947  hypothetical protein  28.7 
 
 		 369 aa  102  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0337117  normal  0.0617497 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1700  hypothetical protein  27.79 
 
 		 369 aa  99.8  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.646049  normal  0.417956 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0127  hypothetical protein  31.1 
 
 		 369 aa  97.1  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6048  hypothetical protein  33.81 
 
 		 377 aa  94.4  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.983197  normal  0.374141 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1952  acyltransferase family protein  28.53 
 
 		 403 aa  94.4  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00838522 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3201  hypothetical protein  31.44 
 
 		 429 aa  92  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0570955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2280  hypothetical protein  33.01 
 
 		 377 aa  89  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0956808  normal  0.124268 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0143  hypothetical protein  29.71 
 
 		 395 aa  88.2  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.184746  normal  0.13553 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1316  hypothetical protein  29.89 
 
 		 377 aa  86.3  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.893937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1581  hypothetical protein  29.89 
 
 		 377 aa  86.3  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0181991 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1356  acyltransferase family protein  28.18 
 
 		 380 aa  86.3  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116907  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0389  hypothetical protein  26.94 
 
 		 375 aa  83.6  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.187966  normal  0.347328 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0193  hypothetical protein  29.48 
 
 		 380 aa  78.2  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0354  hypothetical protein  27.71 
 
 		 396 aa  77  0.0000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1530  hypothetical protein  27.03 
 
 		 431 aa  77  0.0000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3730  hypothetical protein  30.9 
 
 		 681 aa  72.4  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>