107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0389 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0389  hypothetical protein  100 
 
 		 375 aa  755    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.187966  normal  0.347328 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0765  hypothetical protein  29.92 
 
 		 421 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.191126  hitchhiker  0.00877498 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0788  putative OpgC protein  27.1 
 
 		 421 aa  95.9  9e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.904469  normal  0.107967 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0222  acyltransferase 3  26.04 
 
 		 411 aa  94  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0899  putative OpgC protein  27.17 
 
 		 484 aa  92.8  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0136  acyltransferase 3  28.37 
 
 		 415 aa  92.4  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.909719 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3921  hypothetical protein  28.5 
 
 		 376 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2784  putative OpgC protein  28.4 
 
 		 415 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.537319  normal  0.276601 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4912  putative OpgC protein  26.2 
 
 		 417 aa  90.1  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.563767 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2532  putative OpgC protein  27.59 
 
 		 427 aa  90.5  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.978745 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3041  OpgC protein  29.36 
 
 		 388 aa  87  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5254  hypothetical protein  26.93 
 
 		 421 aa  87  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.15377  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4185  hypothetical protein  27.75 
 
 		 376 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.534603  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1763  hypothetical protein  28.06 
 
 		 422 aa  85.1  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4266  OpgC protein, require for succinylation of osmoregulated periplasmic glucans  27.58 
 
 		 400 aa  84  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1295  OpgC protein-like protein  26.69 
 
 		 416 aa  84  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333454  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0145  hypothetical protein  28.82 
 
 		 415 aa  83.6  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4163  putative OpgC protein, require for succinylation of osmoregulated periplasmic glucans  26.94 
 
 		 418 aa  83.6  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1137  hypothetical protein  32.52 
 
 		 401 aa  83.2  0.000000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2936  putative OpgC protein  26.86 
 
 		 430 aa  82.8  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.224445  normal  0.376273 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2146  putative OpgC protein  26.98 
 
 		 377 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.150059 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2806  hypothetical protein  26.5 
 
 		 424 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2302  putative OpgC protein  26.98 
 
 		 388 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4043  hypothetical protein  27.01 
 
 		 385 aa  80.1  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0814624 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1997  hypothetical protein  29.08 
 
 		 368 aa  75.5  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3154  hypothetical protein  26.15 
 
 		 385 aa  74.3  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1233  hypothetical protein  25.56 
 
 		 365 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.376923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3644  hypothetical protein  28.95 
 
 		 379 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.82541  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4415  hypothetical protein  27.79 
 
 		 459 aa  72.4  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.247797  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7260  putative opgC protein  26.74 
 
 		 365 aa  72.8  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3339  putative OpgC protein  26.87 
 
 		 375 aa  70.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.523015 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4886  hypothetical protein  26.89 
 
 		 383 aa  69.3  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00335271  normal  0.121358 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4038  hypothetical protein  24.79 
 
 		 365 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.372209 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1316  hypothetical protein  30.08 
 
 		 377 aa  68.6  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.893937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1581  hypothetical protein  30.08 
 
 		 377 aa  68.6  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0181991 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4496  hypothetical protein  26.28 
 
 		 367 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5561  OpgC protein  29.24 
 
 		 366 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1706  opgC protein, putative  26.12 
 
 		 393 aa  67  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1649  putative opgC protein  26.12 
 
 		 393 aa  67  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0845152  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3760  hypothetical protein  25.3 
 
 		 365 aa  67  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.500718  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4608  hypothetical protein  25.3 
 
 		 365 aa  67  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707127 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5696  hypothetical protein  26.11 
 
 		 365 aa  67  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0138728 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3279  hypothetical protein  23.98 
 
 		 418 aa  67  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0127  hypothetical protein  26.78 
 
 		 369 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4038  hypothetical protein  25.98 
 
 		 384 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1455  opgC protein, putative  23.4 
 
 		 431 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0928141  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1952  acyltransferase family protein  30.81 
 
 		 403 aa  63.5  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00838522 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1714  hypothetical protein  27.27 
 
 		 409 aa  63.2  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1356  acyltransferase family protein  32.05 
 
 		 380 aa  63.2  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116907  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0989  OpgC protein  27.08 
 
 		 379 aa  63.2  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal  0.503682 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1064  putative membrane protein of unknown function  29.18 
 
 		 406 aa  62.8  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0952  OpgC protein  27.08 
 
 		 379 aa  63.2  0.000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.242589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2375  OpgC protein  26.58 
 
 		 365 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0332803  decreased coverage  0.00013342 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5314  hypothetical protein  26.11 
 
 		 374 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0258075  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0075  hypothetical protein  28.18 
 
 		 373 aa  61.6  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5546  hypothetical protein  26.11 
 
 		 374 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.753322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1209  OpgC protein  25.79 
 
 		 407 aa  61.6  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4726  hypothetical protein  25.62 
 
 		 374 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5409  OpgC protein  27.44 
 
 		 366 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0814219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0193  hypothetical protein  29.14 
 
 		 380 aa  60.5  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3642  hypothetical protein  40.66 
 
 		 826 aa  60.5  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3730  hypothetical protein  27.73 
 
 		 681 aa  60.5  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1288  putative opgC protein  24.17 
 
 		 384 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0128  OpgC protein  29.87 
 
 		 399 aa  59.7  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.253754  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0265  hypothetical protein  24.17 
 
 		 384 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0535  hypothetical protein  24.17 
 
 		 384 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.306001  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1032  hypothetical protein  24.17 
 
 		 384 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.608592  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2545  hypothetical protein  24.17 
 
 		 435 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1372  hypothetical protein  24.17 
 
 		 388 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0354  hypothetical protein  32.03 
 
 		 396 aa  58.9  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1292  hypothetical protein  24.17 
 
 		 388 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.721531  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0112  hypothetical protein  25.1 
 
 		 374 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1765  OpgC protein  28.99 
 
 		 399 aa  57.8  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.411843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3465  hypothetical protein  38.3 
 
 		 397 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.604718  normal  0.972852 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5417  hypothetical protein  27.27 
 
 		 375 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1953.1  putative OpgC protein  25.11 
 
 		 375 aa  57  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.584831  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4172  putative protein required for succinylation of osmoregulated periplasmic glucans  31.19 
 
 		 412 aa  57  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0971  putative OpgC protein  25.11 
 
 		 375 aa  57  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.346061  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1258  putative OpgC protein  25.11 
 
 		 375 aa  57  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2232  putative OpgC protein  25.11 
 
 		 375 aa  57  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5813  hypothetical protein  24.11 
 
 		 385 aa  57.4  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.161405 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3260  hypothetical protein  24.8 
 
 		 374 aa  57  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.117077 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2228  OpgC protein  27.27 
 
 		 366 aa  56.2  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.297426 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0154  hypothetical protein  30.23 
 
 		 368 aa  55.8  0.000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0930  OpgC protein  25.92 
 
 		 381 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.918852  normal  0.510158 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2238  OpgC protein, putative  25.23 
 
 		 366 aa  55.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1530  hypothetical protein  29.72 
 
 		 431 aa  54.7  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6048  hypothetical protein  28.37 
 
 		 377 aa  54.7  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.983197  normal  0.374141 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3844  putative protein required for succinylation of osmoregulated periplasmic glucans  29.17 
 
 		 412 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4870  hypothetical protein  25.69 
 
 		 374 aa  53.9  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4947  hypothetical protein  26.05 
 
 		 369 aa  53.9  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0337117  normal  0.0617497 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3149  hypothetical protein  25.31 
 
 		 401 aa  53.5  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.717167  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1700  hypothetical protein  25.31 
 
 		 369 aa  53.1  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.646049  normal  0.417956 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2280  hypothetical protein  27.88 
 
 		 377 aa  53.1  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0956808  normal  0.124268 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3043  hypothetical protein  24.67 
 
 		 375 aa  53.1  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2919  hypothetical protein  24.67 
 
 		 375 aa  53.1  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.329153  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1277  hypothetical protein  25 
 
 		 450 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3201  hypothetical protein  24.05 
 
 		 429 aa  52  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0570955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1987  hypothetical protein  25.75 
 
 		 427 aa  52  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.233249  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0208  hypothetical protein  28.91 
 
 		 371 aa  50.8  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.66956 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>