90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3149 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3149  hypothetical protein  100 
 
 		 401 aa  806    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.717167  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3961  hypothetical protein  51.96 
 
 		 399 aa  358  8e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2399  hypothetical protein  38.92 
 
 		 365 aa  233  3e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0143  hypothetical protein  25.87 
 
 		 395 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.184746  normal  0.13553 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1530  hypothetical protein  27.25 
 
 		 431 aa  95.1  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1356  acyltransferase family protein  25.22 
 
 		 380 aa  78.6  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116907  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4726  hypothetical protein  30.37 
 
 		 374 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5546  hypothetical protein  29.11 
 
 		 374 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.753322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5314  hypothetical protein  29.11 
 
 		 374 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0258075  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0112  hypothetical protein  29.44 
 
 		 374 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1714  hypothetical protein  26.54 
 
 		 409 aa  73.2  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3260  hypothetical protein  29.44 
 
 		 374 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.117077 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1952  acyltransferase family protein  27.98 
 
 		 403 aa  72.8  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00838522 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4266  OpgC protein, require for succinylation of osmoregulated periplasmic glucans  25.39 
 
 		 400 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5254  hypothetical protein  24.53 
 
 		 421 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.15377  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4043  hypothetical protein  27.08 
 
 		 385 aa  71.2  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0814624 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0136  acyltransferase 3  23.26 
 
 		 415 aa  68.9  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.909719 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0765  hypothetical protein  26.12 
 
 		 421 aa  68.9  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.191126  hitchhiker  0.00877498 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0899  putative OpgC protein  23.86 
 
 		 484 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4912  putative OpgC protein  24.86 
 
 		 417 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.563767 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1295  OpgC protein-like protein  23.82 
 
 		 416 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333454  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4870  hypothetical protein  28.84 
 
 		 374 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3041  OpgC protein  30.59 
 
 		 388 aa  67.8  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4163  putative OpgC protein, require for succinylation of osmoregulated periplasmic glucans  23.82 
 
 		 418 aa  67.4  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0788  putative OpgC protein  23.85 
 
 		 421 aa  67.4  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.904469  normal  0.107967 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3201  hypothetical protein  22.89 
 
 		 429 aa  67  0.0000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0570955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2784  putative OpgC protein  28.74 
 
 		 415 aa  66.6  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.537319  normal  0.276601 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2806  hypothetical protein  26.55 
 
 		 424 aa  66.2  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1967  hypothetical protein  26.77 
 
 		 360 aa  66.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274953  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0145  hypothetical protein  28.16 
 
 		 415 aa  65.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1581  hypothetical protein  27.44 
 
 		 377 aa  65.5  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0181991 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1316  hypothetical protein  27.44 
 
 		 377 aa  65.5  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.893937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5417  hypothetical protein  28.04 
 
 		 375 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1064  putative membrane protein of unknown function  31.03 
 
 		 406 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7260  putative opgC protein  27.87 
 
 		 365 aa  64.7  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2532  putative OpgC protein  25.08 
 
 		 427 aa  64.3  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.978745 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0128  OpgC protein  28.76 
 
 		 399 aa  63.2  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.253754  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0222  acyltransferase 3  24.4 
 
 		 411 aa  63.2  0.000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1765  OpgC protein  29.2 
 
 		 399 aa  62.4  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.411843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2936  putative OpgC protein  23.84 
 
 		 430 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.224445  normal  0.376273 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3279  hypothetical protein  26.98 
 
 		 418 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2302  putative OpgC protein  26.64 
 
 		 388 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0354  hypothetical protein  25.82 
 
 		 396 aa  60.5  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0193  hypothetical protein  24.35 
 
 		 380 aa  60.5  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1533  hypothetical protein  27.03 
 
 		 435 aa  60.1  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.208932 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2146  putative OpgC protein  25.54 
 
 		 377 aa  60.1  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.150059 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4415  hypothetical protein  25.77 
 
 		 459 aa  57  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.247797  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0389  hypothetical protein  25.31 
 
 		 375 aa  57  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.187966  normal  0.347328 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3339  putative OpgC protein  23.79 
 
 		 375 aa  56.6  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.523015 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4608  hypothetical protein  27 
 
 		 365 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707127 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3760  hypothetical protein  27 
 
 		 365 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.500718  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1233  hypothetical protein  28.97 
 
 		 365 aa  55.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.376923  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1763  hypothetical protein  26.79 
 
 		 422 aa  54.7  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3644  hypothetical protein  23.58 
 
 		 379 aa  54.3  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.82541  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5696  hypothetical protein  26.67 
 
 		 365 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0138728 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1288  putative opgC protein  24.65 
 
 		 384 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1032  hypothetical protein  24.65 
 
 		 384 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.608592  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1455  opgC protein, putative  23.29 
 
 		 431 aa  52  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0928141  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0535  hypothetical protein  24.65 
 
 		 384 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.306001  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4886  hypothetical protein  25.11 
 
 		 383 aa  52  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00335271  normal  0.121358 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0265  hypothetical protein  24.65 
 
 		 384 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4947  hypothetical protein  26.42 
 
 		 369 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0337117  normal  0.0617497 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2545  hypothetical protein  24.65 
 
 		 435 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1292  hypothetical protein  24.65 
 
 		 388 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.721531  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4038  hypothetical protein  26.33 
 
 		 384 aa  51.2  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3154  hypothetical protein  29.8 
 
 		 385 aa  50.8  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1372  hypothetical protein  24.65 
 
 		 388 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4496  hypothetical protein  26 
 
 		 367 aa  50.1  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1277  hypothetical protein  27.44 
 
 		 450 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0971  putative OpgC protein  27.44 
 
 		 375 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.346061  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1997  hypothetical protein  23.88 
 
 		 368 aa  48.5  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1258  putative OpgC protein  27.44 
 
 		 375 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1700  hypothetical protein  26.54 
 
 		 369 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.646049  normal  0.417956 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2232  putative OpgC protein  27.44 
 
 		 375 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2919  hypothetical protein  27.44 
 
 		 375 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.329153  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1953.1  putative OpgC protein  27.44 
 
 		 375 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.584831  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3043  hypothetical protein  27.44 
 
 		 375 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0154  hypothetical protein  22.37 
 
 		 368 aa  47.8  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0075  hypothetical protein  27.36 
 
 		 373 aa  47.4  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2228  OpgC protein  25.22 
 
 		 366 aa  47  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.297426 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3921  hypothetical protein  24.57 
 
 		 376 aa  47  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4038  hypothetical protein  28.5 
 
 		 365 aa  46.2  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.372209 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5813  hypothetical protein  23.03 
 
 		 385 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.161405 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2238  OpgC protein, putative  26.89 
 
 		 366 aa  45.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4185  hypothetical protein  24.28 
 
 		 376 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.534603  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1649  putative opgC protein  23.11 
 
 		 393 aa  44.7  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0845152  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1706  opgC protein, putative  23.11 
 
 		 393 aa  44.7  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0127  hypothetical protein  23.71 
 
 		 369 aa  43.9  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1137  hypothetical protein  25 
 
 		 401 aa  43.5  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3730  hypothetical protein  24.79 
 
 		 681 aa  43.1  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>